MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 7607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	CGGTT	2	10	24	33	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014172	T	6	6	63	68	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014172	ATT	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014172	AATAA	2	10	90	99	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014172	TGT	3	9	150	158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014172	AAT	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014172	CAT	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506383
8	NC_014172	TAGT	2	8	200	207	25 %	50 %	25 %	0 %	296506383
9	NC_014172	TGA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
10	NC_014172	AAAG	2	8	285	292	75 %	0 %	25 %	0 %	296506383
11	NC_014172	TTA	2	6	313	318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506383
12	NC_014172	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506383
13	NC_014172	GA	3	6	336	341	50 %	0 %	50 %	0 %	296506383
14	NC_014172	ATG	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
15	NC_014172	GCAAA	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	296506383
16	NC_014172	ATG	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
17	NC_014172	TA	4	8	431	438	50 %	50 %	0 %	0 %	296506383
18	NC_014172	CTT	2	6	512	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506383
19	NC_014172	GTG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506383
20	NC_014172	A	6	6	555	560	100 %	0 %	0 %	0 %	296506383
21	NC_014172	GAATTA	2	12	622	633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506383
22	NC_014172	ATTA	2	8	639	646	50 %	50 %	0 %	0 %	296506383
23	NC_014172	ATA	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506383
24	NC_014172	TAT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014172	AAAT	2	8	714	721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014172	T	7	7	758	764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014172	T	7	7	779	785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014172	TGA	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014172	CAA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014172	ATA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014172	CTT	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014172	TTAT	2	8	949	956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014172	A	7	7	963	969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014172	AGG	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014172	A	6	6	1059	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	296506384
36	NC_014172	TATT	2	8	1082	1089	25 %	75 %	0 %	0 %	296506384
37	NC_014172	AGA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506384
38	NC_014172	TGC	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506384
39	NC_014172	GTG	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506384
40	NC_014172	A	7	7	1259	1265	100 %	0 %	0 %	0 %	296506384
41	NC_014172	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506384
42	NC_014172	TCC	2	6	1321	1326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296506384
43	NC_014172	AGC	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506384
44	NC_014172	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506384
45	NC_014172	CT	3	6	1438	1443	0 %	50 %	0 %	50 %	296506384
46	NC_014172	AGGA	2	8	1449	1456	50 %	0 %	50 %	0 %	296506384
47	NC_014172	AGA	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506384
48	NC_014172	TCGC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	25 %	50 %	296506384
49	NC_014172	TTCTT	2	10	1504	1513	0 %	80 %	0 %	20 %	296506384
50	NC_014172	GGAG	2	8	1525	1532	25 %	0 %	75 %	0 %	296506384
51	NC_014172	TAT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506384
52	NC_014172	ATA	2	6	1560	1565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506384
53	NC_014172	CAT	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506384
54	NC_014172	GCT	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014172	AAG	2	6	1687	1692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014172	A	6	6	1761	1766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014172	CTT	2	6	1782	1787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014172	A	6	6	1923	1928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014172	TTA	2	6	1943	1948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014172	CTT	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014172	TTTAA	2	10	1980	1989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014172	G	6	6	2018	2023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014172	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506385
64	NC_014172	A	7	7	2100	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	296506385
65	NC_014172	GAA	2	6	2114	2119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506385
66	NC_014172	CT	3	6	2224	2229	0 %	50 %	0 %	50 %	296506385
67	NC_014172	TAA	2	6	2255	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506385
68	NC_014172	AGTTA	2	10	2269	2278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014172	A	6	6	2298	2303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014172	A	6	6	2319	2324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014172	A	6	6	2338	2343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014172	TA	3	6	2479	2484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014172	TCT	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014172	A	7	7	2535	2541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014172	AT	4	8	2555	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014172	AT	3	6	2610	2615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014172	ATT	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014172	ATCTT	2	10	2699	2708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014172	TA	3	6	2723	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014172	A	7	7	2754	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014172	TAT	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014172	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	296506386
83	NC_014172	TGA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014172	AT	4	8	3107	3114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014172	CTT	2	6	3130	3135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014172	AT	3	6	3144	3149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014172	TGT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014172	A	6	6	3210	3215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014172	T	6	6	3227	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014172	TAAA	2	8	3255	3262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014172	TGG	2	6	3299	3304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014172	A	7	7	3327	3333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014172	TAC	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014172	T	7	7	3415	3421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014172	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014172	CTA	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014172	AAG	3	9	3550	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014172	ACT	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014172	CTTG	2	8	3657	3664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014172	AACG	2	8	3718	3725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014172	CAAA	2	8	3758	3765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014172	TTA	2	6	3794	3799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014172	TTGA	2	8	3868	3875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014172	ATA	2	6	3983	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014172	GA	3	6	4007	4012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014172	AATT	2	8	4017	4024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014172	CAT	2	6	4049	4054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014172	ATT	2	6	4100	4105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
109	NC_014172	T	7	7	4104	4110	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
110	NC_014172	AATA	2	8	4123	4130	75 %	25 %	0 %	0 %	296506387
111	NC_014172	AT	4	8	4176	4183	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
112	NC_014172	AAT	2	6	4215	4220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
113	NC_014172	TTA	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
114	NC_014172	AAT	2	6	4263	4268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
115	NC_014172	ATC	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
116	NC_014172	TCA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
117	NC_014172	TTG	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
118	NC_014172	TAA	2	6	4599	4604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
119	NC_014172	A	6	6	4632	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	296506387
120	NC_014172	TAA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
121	NC_014172	TTC	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
122	NC_014172	TGA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506387
123	NC_014172	AGAT	2	8	4748	4755	50 %	25 %	25 %	0 %	296506387
124	NC_014172	TGT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
125	NC_014172	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
126	NC_014172	GAA	2	6	4886	4891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506387
127	NC_014172	TAAT	2	8	4919	4926	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
128	NC_014172	AT	3	6	4931	4936	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
129	NC_014172	TTG	2	6	5043	5048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
130	NC_014172	T	6	6	5127	5132	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
131	NC_014172	ACT	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
132	NC_014172	TC	3	6	5236	5241	0 %	50 %	0 %	50 %	296506387
133	NC_014172	TCA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
134	NC_014172	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
135	NC_014172	ATT	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
136	NC_014172	TCA	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
137	NC_014172	TTA	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
138	NC_014172	T	6	6	5542	5547	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
139	NC_014172	TCT	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
140	NC_014172	TTAC	2	8	5620	5627	25 %	50 %	0 %	25 %	296506387
141	NC_014172	GAA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506387
142	NC_014172	AT	3	6	5645	5650	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
143	NC_014172	ACT	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
144	NC_014172	CAT	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
145	NC_014172	CTT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
146	NC_014172	ATTT	2	8	5745	5752	25 %	75 %	0 %	0 %	296506387
147	NC_014172	ACT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
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149	NC_014172	TTA	2	6	5798	5803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
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151	NC_014172	TGA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506387
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153	NC_014172	TCG	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506387
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159	NC_014172	GCT	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506387
160	NC_014172	TAAA	2	8	6137	6144	75 %	25 %	0 %	0 %	296506387
161	NC_014172	CTTT	2	8	6289	6296	0 %	75 %	0 %	25 %	296506387
162	NC_014172	TAA	2	6	6318	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
163	NC_014172	T	7	7	6353	6359	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
164	NC_014172	ATT	2	6	6428	6433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014172	T	7	7	6432	6438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014172	GCT	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506388
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168	NC_014172	TCT	2	6	6534	6539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506388
169	NC_014172	AT	3	6	6561	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	296506388
170	NC_014172	TAA	2	6	6665	6670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506388
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172	NC_014172	TCC	2	6	6723	6728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NC_014172	T	7	7	10369	10375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_014172	A	6	6	10448	10453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014172	TA	3	6	10454	10459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_014172	A	6	6	10508	10513	100 %	0 %	0 %	0 %	296506393
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266	NC_014172	TTAG	2	8	10850	10857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014172	GTA	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014172	CTAA	2	8	10872	10879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
269	NC_014172	ATT	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_014172	TAATG	2	10	11082	11091	40 %	40 %	20 %	0 %	296506394
274	NC_014172	A	6	6	11253	11258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014172	T	7	7	11273	11279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014172	T	6	6	11286	11291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014172	TTCT	2	8	11308	11315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
278	NC_014172	AGAA	2	8	11329	11336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014172	T	6	6	11342	11347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_014172	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014172	GGA	2	6	11522	11527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014172	G	6	6	11601	11606	0 %	0 %	100 %	0 %	296506395
284	NC_014172	TC	3	6	11691	11696	0 %	50 %	0 %	50 %	296506395
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