MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 3

Total Repeats: 31152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_014119	CGCC	2	8	1235428	1235435	0 %	0 %	25 %	75 %	295681493
30002	NC_014119	GCG	2	6	1235443	1235448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681493
30003	NC_014119	GGC	2	6	1235478	1235483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681493
30004	NC_014119	GCC	2	6	1235502	1235507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681493
30005	NC_014119	CAT	2	6	1235519	1235524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681493
30006	NC_014119	TCG	2	6	1235550	1235555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30007	NC_014119	CGGC	2	8	1235563	1235570	0 %	0 %	50 %	50 %	295681493
30008	NC_014119	AGC	2	6	1235571	1235576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30009	NC_014119	CGC	2	6	1235588	1235593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681493
30010	NC_014119	CTG	2	6	1235600	1235605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30011	NC_014119	GTC	2	6	1235642	1235647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30012	NC_014119	TTC	2	6	1235688	1235693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295681493
30013	NC_014119	CTC	2	6	1235705	1235710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295681493
30014	NC_014119	TGC	2	6	1235761	1235766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30015	NC_014119	CGT	2	6	1235783	1235788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30016	NC_014119	TGA	2	6	1235791	1235796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295681493
30017	NC_014119	GCC	2	6	1235822	1235827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681493
30018	NC_014119	CTG	2	6	1235843	1235848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681493
30019	NC_014119	GAA	2	6	1235873	1235878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295681493
30020	NC_014119	TCA	2	6	1235893	1235898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681493
30021	NC_014119	CGCC	2	8	1235949	1235956	0 %	0 %	25 %	75 %	295681493
30022	NC_014119	GCG	2	6	1236032	1236037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681493
30023	NC_014119	CGGG	2	8	1236112	1236119	0 %	0 %	75 %	25 %	295681493
30024	NC_014119	CGG	2	6	1236145	1236150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681493
30025	NC_014119	AGT	2	6	1236218	1236223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295681494
30026	NC_014119	GC	4	8	1236338	1236345	0 %	0 %	50 %	50 %	295681494
30027	NC_014119	GCA	2	6	1236356	1236361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681494
30028	NC_014119	GCG	2	6	1236371	1236376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681494
30029	NC_014119	GCC	2	6	1236396	1236401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681494
30030	NC_014119	GCG	2	6	1236416	1236421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681494
30031	NC_014119	CG	3	6	1236446	1236451	0 %	0 %	50 %	50 %	295681494
30032	NC_014119	GGT	2	6	1236471	1236476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295681494
30033	NC_014119	GC	3	6	1236608	1236613	0 %	0 %	50 %	50 %	295681494
30034	NC_014119	ACC	2	6	1236664	1236669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295681494
30035	NC_014119	CGGGT	2	10	1236678	1236687	0 %	20 %	60 %	20 %	295681494
30036	NC_014119	GGT	2	6	1236729	1236734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295681494
30037	NC_014119	GGT	2	6	1236738	1236743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295681494
30038	NC_014119	GCG	2	6	1236769	1236774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681494
30039	NC_014119	GTC	2	6	1236781	1236786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681494
30040	NC_014119	GC	3	6	1236820	1236825	0 %	0 %	50 %	50 %	295681495
30041	NC_014119	CAGCGT	2	12	1236913	1236924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30042	NC_014119	GC	3	6	1236941	1236946	0 %	0 %	50 %	50 %	295681495
30043	NC_014119	CGT	2	6	1236948	1236953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30044	NC_014119	GGCC	2	8	1236993	1237000	0 %	0 %	50 %	50 %	295681495
30045	NC_014119	GCG	2	6	1237001	1237006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681495
30046	NC_014119	GAA	2	6	1237033	1237038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295681495
30047	NC_014119	GC	3	6	1237077	1237082	0 %	0 %	50 %	50 %	295681495
30048	NC_014119	TCG	2	6	1237094	1237099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30049	NC_014119	CTCG	2	8	1237126	1237133	0 %	25 %	25 %	50 %	295681495
30050	NC_014119	TCG	2	6	1237193	1237198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30051	NC_014119	TCA	2	6	1237230	1237235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681495
30052	NC_014119	CTGCGC	2	12	1237282	1237293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295681495
30053	NC_014119	GTC	2	6	1237375	1237380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30054	NC_014119	CGCTG	2	10	1237383	1237392	0 %	20 %	40 %	40 %	295681495
30055	NC_014119	GCT	2	6	1237404	1237409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681495
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30057	NC_014119	GC	3	6	1237441	1237446	0 %	0 %	50 %	50 %	295681495
30058	NC_014119	CAC	2	6	1237514	1237519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295681495
30059	NC_014119	GCA	2	6	1237563	1237568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681495
30060	NC_014119	GC	3	6	1237610	1237615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30061	NC_014119	TCG	2	6	1237632	1237637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681496
30062	NC_014119	CGCC	2	8	1237675	1237682	0 %	0 %	25 %	75 %	295681496
30063	NC_014119	TCG	2	6	1237704	1237709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681496
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30067	NC_014119	TGCT	2	8	1237854	1237861	0 %	50 %	25 %	25 %	295681496
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30069	NC_014119	GC	4	8	1237954	1237961	0 %	0 %	50 %	50 %	295681497
30070	NC_014119	GCT	2	6	1237966	1237971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681497
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30072	NC_014119	CG	3	6	1238122	1238127	0 %	0 %	50 %	50 %	295681497
30073	NC_014119	CGA	2	6	1238197	1238202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681497
30074	NC_014119	GTC	2	6	1238216	1238221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681497
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30084	NC_014119	GCT	2	6	1238599	1238604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681497
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30087	NC_014119	GGCC	2	8	1238653	1238660	0 %	0 %	50 %	50 %	295681497
30088	NC_014119	GC	4	8	1238707	1238714	0 %	0 %	50 %	50 %	295681497
30089	NC_014119	GCA	2	6	1238734	1238739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681497
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30096	NC_014119	TCGA	2	8	1239010	1239017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30097	NC_014119	ATCC	2	8	1239086	1239093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30101	NC_014119	ACCG	2	8	1239249	1239256	25 %	0 %	25 %	50 %	295681498
30102	NC_014119	CCGG	2	8	1239279	1239286	0 %	0 %	50 %	50 %	295681498
30103	NC_014119	GGC	2	6	1239299	1239304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681498
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30109	NC_014119	GC	3	6	1239508	1239513	0 %	0 %	50 %	50 %	295681498
30110	NC_014119	GTC	2	6	1239549	1239554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681498
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30114	NC_014119	GCC	2	6	1239675	1239680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681498
30115	NC_014119	GACG	2	8	1239692	1239699	25 %	0 %	50 %	25 %	295681498
30116	NC_014119	CGG	2	6	1239770	1239775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681498
30117	NC_014119	GC	3	6	1239835	1239840	0 %	0 %	50 %	50 %	295681498
30118	NC_014119	CGA	2	6	1239842	1239847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681498
30119	NC_014119	ACG	2	6	1239855	1239860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681498
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30123	NC_014119	CGA	2	6	1240022	1240027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681498
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30127	NC_014119	CG	3	6	1240180	1240185	0 %	0 %	50 %	50 %	295681499
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30145	NC_014119	CG	3	6	1240759	1240764	0 %	0 %	50 %	50 %	295681499
30146	NC_014119	CG	3	6	1240813	1240818	0 %	0 %	50 %	50 %	295681499
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30152	NC_014119	CGA	2	6	1241017	1241022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681499
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30170	NC_014119	CGCA	2	8	1242012	1242019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30171	NC_014119	TCG	2	6	1242092	1242097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30174	NC_014119	ACGA	2	8	1242192	1242199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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30179	NC_014119	CGG	2	6	1242467	1242472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681501
30180	NC_014119	TGC	2	6	1242564	1242569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681501
30181	NC_014119	CGA	2	6	1242597	1242602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681501
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30210	NC_014119	GC	3	6	1243841	1243846	0 %	0 %	50 %	50 %	295681501
30211	NC_014119	TCGGC	2	10	1243886	1243895	0 %	20 %	40 %	40 %	295681501
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30214	NC_014119	GCG	2	6	1243952	1243957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30215	NC_014119	CG	3	6	1243966	1243971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30216	NC_014119	GC	3	6	1244044	1244049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30217	NC_014119	CG	3	6	1244210	1244215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30218	NC_014119	AGC	2	6	1244221	1244226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30219	NC_014119	GC	3	6	1244272	1244277	0 %	0 %	50 %	50 %	295681502
30220	NC_014119	GCT	2	6	1244345	1244350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30221	NC_014119	CG	3	6	1244355	1244360	0 %	0 %	50 %	50 %	295681502
30222	NC_014119	ATC	2	6	1244467	1244472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681502
30223	NC_014119	GAC	2	6	1244507	1244512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30224	NC_014119	GCT	2	6	1244546	1244551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30225	NC_014119	GGT	2	6	1244591	1244596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295681502
30226	NC_014119	GCC	2	6	1244637	1244642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681502
30227	NC_014119	TGCG	2	8	1244645	1244652	0 %	25 %	50 %	25 %	295681502
30228	NC_014119	CGA	2	6	1244666	1244671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30229	NC_014119	CCAG	2	8	1244744	1244751	25 %	0 %	25 %	50 %	295681502
30230	NC_014119	TGC	2	6	1244815	1244820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30231	NC_014119	CGG	2	6	1244880	1244885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681502
30232	NC_014119	TTC	2	6	1244908	1244913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295681502
30233	NC_014119	CGC	2	6	1244918	1244923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681502
30234	NC_014119	TCG	2	6	1244959	1244964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30235	NC_014119	ACG	2	6	1244966	1244971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681502
30236	NC_014119	CGGC	2	8	1245001	1245008	0 %	0 %	50 %	50 %	295681502
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30244	NC_014119	TCG	2	6	1245222	1245227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30246	NC_014119	GGCC	2	8	1245256	1245263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30247	NC_014119	ATC	2	6	1245305	1245310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30250	NC_014119	CGAG	2	8	1245380	1245387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30251	NC_014119	TGCC	2	8	1245458	1245465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30252	NC_014119	GCAGC	2	10	1245480	1245489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30253	NC_014119	CAT	2	6	1245525	1245530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681503
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30262	NC_014119	CGC	2	6	1245827	1245832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681503
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30273	NC_014119	GTCAC	2	10	1246276	1246285	20 %	20 %	20 %	40 %	295681504
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30346	NC_014119	ATGAG	2	10	1249248	1249257	40 %	20 %	40 %	0 %	295681508
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30351	NC_014119	CCG	2	6	1249635	1249640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681509
30352	NC_014119	CGTTC	2	10	1249688	1249697	0 %	40 %	20 %	40 %	295681509
30353	NC_014119	CG	3	6	1249782	1249787	0 %	0 %	50 %	50 %	295681509
30354	NC_014119	TGC	2	6	1249810	1249815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681509
30355	NC_014119	CATCC	2	10	1249816	1249825	20 %	20 %	0 %	60 %	295681509
30356	NC_014119	CGA	2	6	1249837	1249842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681509
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30360	NC_014119	CCG	2	6	1249944	1249949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681509
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30366	NC_014119	TTGC	2	8	1250232	1250239	0 %	50 %	25 %	25 %	295681509
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30373	NC_014119	CGGCG	2	10	1250686	1250695	0 %	0 %	60 %	40 %	295681509
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30381	NC_014119	GGGT	2	8	1250938	1250945	0 %	25 %	75 %	0 %	295681509
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30386	NC_014119	ATCG	2	8	1251057	1251064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30387	NC_014119	GCA	2	6	1251092	1251097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30388	NC_014119	GC	4	8	1251113	1251120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30389	NC_014119	GCAG	2	8	1251146	1251153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30390	NC_014119	AGT	2	6	1251194	1251199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30391	NC_014119	CG	3	6	1251216	1251221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30392	NC_014119	CG	3	6	1251248	1251253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30393	NC_014119	AAG	2	6	1251263	1251268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30394	NC_014119	GTC	2	6	1251314	1251319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30395	NC_014119	GGA	2	6	1251360	1251365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30398	NC_014119	TCCG	2	8	1251406	1251413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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30400	NC_014119	CG	3	6	1251450	1251455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30401	NC_014119	ACG	2	6	1251465	1251470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681510
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30432	NC_014119	TCG	2	6	1252841	1252846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681510
30433	NC_014119	CG	3	6	1252891	1252896	0 %	0 %	50 %	50 %	295681510
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30452	NC_014119	CG	3	6	1253778	1253783	0 %	0 %	50 %	50 %	295681510
30453	NC_014119	GCCG	2	8	1253818	1253825	0 %	0 %	50 %	50 %	295681510
30454	NC_014119	GGC	2	6	1253838	1253843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681510
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30458	NC_014119	GC	3	6	1254233	1254238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30459	NC_014119	CGG	2	6	1254264	1254269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30460	NC_014119	GC	3	6	1254304	1254309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30461	NC_014119	GCA	2	6	1254346	1254351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30462	NC_014119	AGA	3	9	1254352	1254360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30463	NC_014119	AATC	2	8	1254368	1254375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30464	NC_014119	AGT	2	6	1254385	1254390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30465	NC_014119	CGAC	2	8	1254396	1254403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30466	NC_014119	CAA	2	6	1254422	1254427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30467	NC_014119	GC	4	8	1254495	1254502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30468	NC_014119	TCG	2	6	1254516	1254521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30469	NC_014119	TCC	2	6	1254587	1254592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295681511
30470	NC_014119	AGT	2	6	1254606	1254611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295681511
30471	NC_014119	CGG	2	6	1254639	1254644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681511
30472	NC_014119	AGC	2	6	1254650	1254655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681511
30473	NC_014119	GCG	2	6	1254667	1254672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681511
30474	NC_014119	CTG	2	6	1254739	1254744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295681511
30475	NC_014119	AC	3	6	1254770	1254775	50 %	0 %	0 %	50 %	295681511
30476	NC_014119	GCA	2	6	1254805	1254810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681511
30477	NC_014119	GGT	2	6	1254904	1254909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295681511
30478	NC_014119	TCA	2	6	1255032	1255037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295681511
30479	NC_014119	GAC	2	6	1255051	1255056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681511
30480	NC_014119	GACGG	2	10	1255089	1255098	20 %	0 %	60 %	20 %	295681511
30481	NC_014119	GCC	3	9	1255161	1255169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30482	NC_014119	CCG	2	6	1255177	1255182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30483	NC_014119	GGC	2	6	1255199	1255204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30484	NC_014119	TGT	2	6	1255231	1255236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30485	NC_014119	TCA	2	6	1255249	1255254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30486	NC_014119	GGCGA	2	10	1255328	1255337	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30487	NC_014119	CAA	2	6	1255412	1255417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30488	NC_014119	A	7	7	1255416	1255422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30489	NC_014119	GAT	2	6	1255447	1255452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30490	NC_014119	CG	4	8	1255506	1255513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30491	NC_014119	GC	3	6	1255616	1255621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30492	NC_014119	GC	3	6	1255652	1255657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30493	NC_014119	TTG	2	6	1255681	1255686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30494	NC_014119	TGA	2	6	1255762	1255767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295681512
30495	NC_014119	GCAG	2	8	1255787	1255794	25 %	0 %	50 %	25 %	295681512
30496	NC_014119	CCG	2	6	1255894	1255899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295681512
30497	NC_014119	CGA	2	6	1255920	1255925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681512
30498	NC_014119	AGC	2	6	1255960	1255965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295681512
30499	NC_014119	GCG	2	6	1256009	1256014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681512
30500	NC_014119	CGG	2	6	1256025	1256030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295681512

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