MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 3

Total Repeats: 31152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014119	AGTTTG	2	12	295014	295025	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	295680673
7003	NC_014119	CG	3	6	295086	295091	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7004	NC_014119	TCGCG	2	10	295115	295124	0 %	20 %	40 %	40 %	295680674
7005	NC_014119	TGC	2	6	295180	295185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680674
7006	NC_014119	GC	3	6	295195	295200	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7007	NC_014119	CGC	2	6	295326	295331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680674
7008	NC_014119	TGA	2	6	295370	295375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680674
7009	NC_014119	GCA	2	6	295409	295414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680674
7010	NC_014119	GCC	2	6	295419	295424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680674
7011	NC_014119	GTA	2	6	295443	295448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680674
7012	NC_014119	TCGA	2	8	295471	295478	25 %	25 %	25 %	25 %	295680674
7013	NC_014119	GGC	2	6	295491	295496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680674
7014	NC_014119	GC	3	6	295562	295567	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7015	NC_014119	TGC	2	6	295589	295594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680674
7016	NC_014119	CG	3	6	295595	295600	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7017	NC_014119	CGA	2	6	295602	295607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680674
7018	NC_014119	GC	3	6	295682	295687	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7019	NC_014119	ACG	2	6	295718	295723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680674
7020	NC_014119	CG	3	6	295785	295790	0 %	0 %	50 %	50 %	295680674
7021	NC_014119	GCG	2	6	295810	295815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680674
7022	NC_014119	CCG	2	6	295891	295896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680674
7023	NC_014119	TTGC	2	8	295927	295934	0 %	50 %	25 %	25 %	295680674
7024	NC_014119	CGG	2	6	295982	295987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680674
7025	NC_014119	GCG	2	6	296000	296005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680674
7026	NC_014119	CGC	2	6	296032	296037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680674
7027	NC_014119	AGGA	2	8	296105	296112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_014119	ATT	2	6	296124	296129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_014119	TATT	2	8	296147	296154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_014119	GC	3	6	296197	296202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_014119	CGC	2	6	296321	296326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7032	NC_014119	CGA	2	6	296345	296350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_014119	GATGC	2	10	296398	296407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7034	NC_014119	GCGA	2	8	296434	296441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_014119	GAC	2	6	296473	296478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_014119	CGT	2	6	296534	296539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_014119	CG	3	6	296543	296548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_014119	CG	3	6	296550	296555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_014119	CGA	2	6	296568	296573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_014119	GTC	2	6	296602	296607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_014119	CAG	2	6	296629	296634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_014119	CCG	2	6	296671	296676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_014119	CGCT	2	8	296748	296755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_014119	GAC	2	6	296809	296814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_014119	TTGG	2	8	296863	296870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_014119	CT	4	8	296931	296938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_014119	ACC	2	6	296958	296963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295680675
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7051	NC_014119	GCT	2	6	297059	297064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680675
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7054	NC_014119	GCC	2	6	297207	297212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680675
7055	NC_014119	TTCG	2	8	297287	297294	0 %	50 %	25 %	25 %	295680675
7056	NC_014119	TC	3	6	297335	297340	0 %	50 %	0 %	50 %	295680675
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7058	NC_014119	GGC	2	6	297425	297430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680675
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7061	NC_014119	GC	4	8	297594	297601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_014119	CGA	2	6	297604	297609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_014119	CGA	2	6	297621	297626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_014119	TCCG	2	8	297702	297709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_014119	CGA	2	6	297728	297733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7067	NC_014119	CTGG	2	8	297790	297797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7068	NC_014119	ACC	2	6	297807	297812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7069	NC_014119	GCTA	2	8	297835	297842	25 %	25 %	25 %	25 %	295680676
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7081	NC_014119	GATC	2	8	298383	298390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7084	NC_014119	TGCTT	2	10	298461	298470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7098	NC_014119	GC	3	6	299028	299033	0 %	0 %	50 %	50 %	295680678
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7102	NC_014119	CG	4	8	299225	299232	0 %	0 %	50 %	50 %	295680678
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7116	NC_014119	ACGCG	2	10	299792	299801	20 %	0 %	40 %	40 %	295680678
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7126	NC_014119	ATC	2	6	300293	300298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680679
7127	NC_014119	CG	3	6	300307	300312	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7128	NC_014119	AGC	2	6	300382	300387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7129	NC_014119	TGC	2	6	300391	300396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7130	NC_014119	CAGG	2	8	300417	300424	25 %	0 %	50 %	25 %	295680679
7131	NC_014119	CAC	2	6	300452	300457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295680679
7132	NC_014119	TGG	2	6	300560	300565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680679
7133	NC_014119	CG	3	6	300617	300622	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7134	NC_014119	CAT	2	6	300632	300637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680679
7135	NC_014119	TTG	2	6	300640	300645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295680679
7136	NC_014119	CG	3	6	300759	300764	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7137	NC_014119	CCG	2	6	300806	300811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680679
7138	NC_014119	GGCG	2	8	300821	300828	0 %	0 %	75 %	25 %	295680679
7139	NC_014119	GCT	2	6	300950	300955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7140	NC_014119	CGC	2	6	300992	300997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680679
7141	NC_014119	CGT	2	6	301010	301015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7142	NC_014119	TCA	2	6	301018	301023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680679
7143	NC_014119	CCAGC	2	10	301024	301033	20 %	0 %	20 %	60 %	295680679
7144	NC_014119	GCG	2	6	301050	301055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680679
7145	NC_014119	GGC	2	6	301058	301063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680679
7146	NC_014119	GC	3	6	301080	301085	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7147	NC_014119	CCG	2	6	301096	301101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680679
7148	NC_014119	CCGAAG	2	12	301159	301170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7149	NC_014119	CGCGA	2	10	301182	301191	20 %	0 %	40 %	40 %	295680679
7150	NC_014119	TCG	2	6	301192	301197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7151	NC_014119	CGA	2	6	301205	301210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7152	NC_014119	AGC	2	6	301264	301269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7153	NC_014119	GGC	2	6	301277	301282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680679
7154	NC_014119	CGG	2	6	301295	301300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680679
7155	NC_014119	GC	3	6	301318	301323	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7156	NC_014119	GCA	2	6	301325	301330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7157	NC_014119	CTT	2	6	301388	301393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295680679
7158	NC_014119	TTC	2	6	301416	301421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295680679
7159	NC_014119	GC	4	8	301423	301430	0 %	0 %	50 %	50 %	295680679
7160	NC_014119	TGC	2	6	301432	301437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680679
7161	NC_014119	CTA	2	6	301440	301445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680679
7162	NC_014119	CTGCC	2	10	301525	301534	0 %	20 %	20 %	60 %	295680680
7163	NC_014119	GGCT	2	8	301565	301572	0 %	25 %	50 %	25 %	295680680
7164	NC_014119	CGA	2	6	301624	301629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680680
7165	NC_014119	GCG	2	6	301639	301644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680680
7166	NC_014119	CACGCA	2	12	301654	301665	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	295680680
7167	NC_014119	GC	3	6	301911	301916	0 %	0 %	50 %	50 %	295680680
7168	NC_014119	CGC	2	6	301962	301967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680680
7169	NC_014119	CTG	2	6	301989	301994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680680
7170	NC_014119	CGCT	2	8	302004	302011	0 %	25 %	25 %	50 %	295680680
7171	NC_014119	CTGG	2	8	302014	302021	0 %	25 %	50 %	25 %	295680680
7172	NC_014119	CTG	2	6	302063	302068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680680
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7174	NC_014119	CTG	2	6	302126	302131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680680
7175	NC_014119	GCT	2	6	302173	302178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680680
7176	NC_014119	CGC	2	6	302196	302201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680680
7177	NC_014119	CTG	2	6	302225	302230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680680
7178	NC_014119	GC	3	6	302327	302332	0 %	0 %	50 %	50 %	295680680
7179	NC_014119	CGAG	2	8	302359	302366	25 %	0 %	50 %	25 %	295680680
7180	NC_014119	GGC	2	6	302422	302427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680680
7181	NC_014119	ATTC	2	8	302464	302471	25 %	50 %	0 %	25 %	295680680
7182	NC_014119	CGC	2	6	302508	302513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680680
7183	NC_014119	CG	3	6	302527	302532	0 %	0 %	50 %	50 %	295680680
7184	NC_014119	GC	3	6	302548	302553	0 %	0 %	50 %	50 %	295680680
7185	NC_014119	TTC	2	6	302577	302582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7186	NC_014119	TC	3	6	302586	302591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7187	NC_014119	GGC	2	6	302630	302635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680681
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7189	NC_014119	GC	3	6	302668	302673	0 %	0 %	50 %	50 %	295680681
7190	NC_014119	GCT	2	6	302690	302695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7191	NC_014119	CT	4	8	302701	302708	0 %	50 %	0 %	50 %	295680681
7192	NC_014119	TCACGC	2	12	302714	302725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295680681
7193	NC_014119	CGG	2	6	302735	302740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680681
7194	NC_014119	TCG	2	6	302752	302757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7195	NC_014119	TCG	2	6	302779	302784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7196	NC_014119	GTC	2	6	302829	302834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
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7199	NC_014119	ACG	2	6	302938	302943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7200	NC_014119	CCG	2	6	302974	302979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680681
7201	NC_014119	CG	3	6	303019	303024	0 %	0 %	50 %	50 %	295680681
7202	NC_014119	ACC	2	6	303030	303035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295680681
7203	NC_014119	GAC	2	6	303056	303061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7204	NC_014119	GTC	3	9	303078	303086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7205	NC_014119	TCG	3	9	303126	303134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7206	NC_014119	ACG	2	6	303271	303276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7207	NC_014119	ACT	2	6	303277	303282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680681
7208	NC_014119	TCG	2	6	303313	303318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
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7210	NC_014119	CG	3	6	303341	303346	0 %	0 %	50 %	50 %	295680681
7211	NC_014119	GCG	2	6	303382	303387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680681
7212	NC_014119	TCT	2	6	303580	303585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295680681
7213	NC_014119	CGC	2	6	303598	303603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680681
7214	NC_014119	CGA	2	6	303622	303627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7215	NC_014119	CTA	2	6	303632	303637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680681
7216	NC_014119	GC	3	6	303674	303679	0 %	0 %	50 %	50 %	295680681
7217	NC_014119	CGA	2	6	303692	303697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7218	NC_014119	CCG	2	6	303781	303786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680681
7219	NC_014119	ACCG	2	8	303873	303880	25 %	0 %	25 %	50 %	295680681
7220	NC_014119	CGACTT	2	12	303881	303892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295680681
7221	NC_014119	GGT	2	6	303926	303931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680681
7222	NC_014119	CAA	2	6	303956	303961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295680681
7223	NC_014119	CGGCG	2	10	303966	303975	0 %	0 %	60 %	40 %	295680681
7224	NC_014119	CTG	2	6	304020	304025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680681
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7226	NC_014119	TCT	2	6	304072	304077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295680681
7227	NC_014119	CGC	2	6	304129	304134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680681
7228	NC_014119	CG	4	8	304153	304160	0 %	0 %	50 %	50 %	295680681
7229	NC_014119	ACG	2	6	304173	304178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680681
7230	NC_014119	GAT	2	6	304327	304332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680682
7231	NC_014119	CGG	2	6	304336	304341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680682
7232	NC_014119	TCGA	2	8	304403	304410	25 %	25 %	25 %	25 %	295680682
7233	NC_014119	CCG	2	6	304413	304418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680682
7234	NC_014119	CG	3	6	304457	304462	0 %	0 %	50 %	50 %	295680682
7235	NC_014119	GC	3	6	304564	304569	0 %	0 %	50 %	50 %	295680682
7236	NC_014119	CTG	2	6	304613	304618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680682
7237	NC_014119	CATC	2	8	304621	304628	25 %	25 %	0 %	50 %	295680682
7238	NC_014119	ATC	2	6	304635	304640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680682
7239	NC_014119	GAA	2	6	304652	304657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295680682
7240	NC_014119	GC	4	8	304663	304670	0 %	0 %	50 %	50 %	295680682
7241	NC_014119	CTA	2	6	304702	304707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680682
7242	NC_014119	ATC	2	6	304719	304724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680682
7243	NC_014119	AGCC	2	8	304790	304797	25 %	0 %	25 %	50 %	295680682
7244	NC_014119	GCG	2	6	304844	304849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680682
7245	NC_014119	CG	4	8	304888	304895	0 %	0 %	50 %	50 %	295680682
7246	NC_014119	CG	3	6	304946	304951	0 %	0 %	50 %	50 %	295680682
7247	NC_014119	GCA	2	6	304972	304977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680682
7248	NC_014119	GGCGC	2	10	305008	305017	0 %	0 %	60 %	40 %	295680682
7249	NC_014119	TCG	2	6	305187	305192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680682
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7251	NC_014119	CGC	2	6	305298	305303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680682
7252	NC_014119	GC	3	6	305375	305380	0 %	0 %	50 %	50 %	295680683
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7323	NC_014119	GCT	2	6	307965	307970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7324	NC_014119	TCG	2	6	307975	307980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7369	NC_014119	CAG	2	6	309634	309639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680684
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7492	NC_014119	CTCGC	2	10	314893	314902	0 %	20 %	20 %	60 %	295680688
7493	NC_014119	GCG	2	6	314903	314908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680688
7494	NC_014119	ACGT	2	8	314935	314942	25 %	25 %	25 %	25 %	295680688
7495	NC_014119	CG	3	6	314952	314957	0 %	0 %	50 %	50 %	295680688
7496	NC_014119	CAT	2	6	314988	314993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680688
7497	NC_014119	CGAT	2	8	315024	315031	25 %	25 %	25 %	25 %	295680688
7498	NC_014119	CG	3	6	315037	315042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7499	NC_014119	GCGA	2	8	315043	315050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7500	NC_014119	ACG	2	6	315076	315081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680689

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