MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 67001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014118	ATC	2	6	1861037	1861042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48502	NC_014118	GAC	2	6	1861043	1861048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48503	NC_014118	ACC	2	6	1861078	1861083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48504	NC_014118	CGC	2	6	1861094	1861099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48505	NC_014118	TGCGC	2	10	1861132	1861141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48506	NC_014118	CAA	2	6	1861223	1861228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295700490
48507	NC_014118	GCGA	2	8	1861273	1861280	25 %	0 %	50 %	25 %	295700490
48508	NC_014118	CG	3	6	1861299	1861304	0 %	0 %	50 %	50 %	295700490
48509	NC_014118	CG	3	6	1861328	1861333	0 %	0 %	50 %	50 %	295700490
48510	NC_014118	GGGC	2	8	1861338	1861345	0 %	0 %	75 %	25 %	295700490
48511	NC_014118	TCGCG	2	10	1861371	1861380	0 %	20 %	40 %	40 %	295700490
48512	NC_014118	CTG	2	6	1861424	1861429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700490
48513	NC_014118	CCG	2	6	1861534	1861539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700490
48514	NC_014118	GCC	2	6	1861578	1861583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700490
48515	NC_014118	TGC	2	6	1861591	1861596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700490
48516	NC_014118	GCGA	2	8	1861672	1861679	25 %	0 %	50 %	25 %	295700490
48517	NC_014118	CGG	2	6	1861691	1861696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700490
48518	NC_014118	TCGA	2	8	1861736	1861743	25 %	25 %	25 %	25 %	295700490
48519	NC_014118	AAT	2	6	1861842	1861847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295700491
48520	NC_014118	CG	5	10	1861874	1861883	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48521	NC_014118	GGC	2	6	1861947	1861952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700491
48522	NC_014118	AGC	2	6	1862012	1862017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700491
48523	NC_014118	GCA	2	6	1862022	1862027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700491
48524	NC_014118	CTC	3	9	1862074	1862082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295700491
48525	NC_014118	CA	3	6	1862105	1862110	50 %	0 %	0 %	50 %	295700491
48526	NC_014118	GC	4	8	1862116	1862123	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48527	NC_014118	GCC	2	6	1862145	1862150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700491
48528	NC_014118	CCA	2	6	1862151	1862156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295700491
48529	NC_014118	CG	3	6	1862160	1862165	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48530	NC_014118	GCC	2	6	1862175	1862180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700491
48531	NC_014118	GCGAC	2	10	1862202	1862211	20 %	0 %	40 %	40 %	295700491
48532	NC_014118	TG	3	6	1862219	1862224	0 %	50 %	50 %	0 %	295700491
48533	NC_014118	CG	3	6	1862240	1862245	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48534	NC_014118	CGA	2	6	1862251	1862256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700491
48535	NC_014118	GCAGC	2	10	1862262	1862271	20 %	0 %	40 %	40 %	295700491
48536	NC_014118	GCG	2	6	1862282	1862287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700491
48537	NC_014118	CGAC	2	8	1862310	1862317	25 %	0 %	25 %	50 %	295700491
48538	NC_014118	TCGA	2	8	1862336	1862343	25 %	25 %	25 %	25 %	295700491
48539	NC_014118	CG	3	6	1862356	1862361	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48540	NC_014118	GCA	2	6	1862373	1862378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700491
48541	NC_014118	GCG	2	6	1862379	1862384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700491
48542	NC_014118	CG	3	6	1862433	1862438	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48543	NC_014118	CG	3	6	1862454	1862459	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48544	NC_014118	CTT	2	6	1862472	1862477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295700491
48545	NC_014118	CG	4	8	1862632	1862639	0 %	0 %	50 %	50 %	295700491
48546	NC_014118	GTC	2	6	1862779	1862784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48547	NC_014118	GCA	2	6	1862802	1862807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48548	NC_014118	ACA	2	6	1862875	1862880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295700492
48549	NC_014118	GC	3	6	1862950	1862955	0 %	0 %	50 %	50 %	295700492
48550	NC_014118	GCC	2	6	1862971	1862976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700492
48551	NC_014118	GCC	2	6	1862994	1862999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700492
48552	NC_014118	GCGG	2	8	1863018	1863025	0 %	0 %	75 %	25 %	295700492
48553	NC_014118	CCA	2	6	1863052	1863057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295700492
48554	NC_014118	GAA	2	6	1863096	1863101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295700492
48555	NC_014118	TGC	2	6	1863148	1863153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700492
48556	NC_014118	CGA	2	6	1863182	1863187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700492
48557	NC_014118	GCT	2	6	1863242	1863247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700492
48558	NC_014118	CGG	2	6	1863301	1863306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700492
48559	NC_014118	CGCA	2	8	1863350	1863357	25 %	0 %	25 %	50 %	295700492
48560	NC_014118	GCCTG	2	10	1863425	1863434	0 %	20 %	40 %	40 %	295700492
48561	NC_014118	GAC	2	6	1863450	1863455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700492
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48563	NC_014118	CCG	2	6	1863523	1863528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700492
48564	NC_014118	GCGCT	2	10	1863538	1863547	0 %	20 %	40 %	40 %	295700492
48565	NC_014118	GAT	2	6	1863561	1863566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700492
48566	NC_014118	GTT	2	6	1863590	1863595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295700492
48567	NC_014118	GGC	2	6	1863603	1863608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700492
48568	NC_014118	CAG	3	9	1863609	1863617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700492
48569	NC_014118	CGA	2	6	1863653	1863658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48570	NC_014118	CAT	2	6	1863700	1863705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295700493
48571	NC_014118	GC	3	6	1863816	1863821	0 %	0 %	50 %	50 %	295700493
48572	NC_014118	ACG	2	6	1863834	1863839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700493
48573	NC_014118	CGCGC	2	10	1863847	1863856	0 %	0 %	40 %	60 %	295700493
48574	NC_014118	GAC	2	6	1863932	1863937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700493
48575	NC_014118	CG	4	8	1863947	1863954	0 %	0 %	50 %	50 %	295700493
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48579	NC_014118	CG	3	6	1864107	1864112	0 %	0 %	50 %	50 %	295700493
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48583	NC_014118	GC	3	6	1864173	1864178	0 %	0 %	50 %	50 %	295700493
48584	NC_014118	CCAT	2	8	1864182	1864189	25 %	25 %	0 %	50 %	295700493
48585	NC_014118	CG	4	8	1864195	1864202	0 %	0 %	50 %	50 %	295700493
48586	NC_014118	ACG	2	6	1864229	1864234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700493
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48590	NC_014118	TGA	2	6	1864438	1864443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48591	NC_014118	GCGCC	2	10	1864540	1864549	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48592	NC_014118	GA	3	6	1864550	1864555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48593	NC_014118	GAC	2	6	1864565	1864570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700494
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48595	NC_014118	GA	3	6	1864752	1864757	50 %	0 %	50 %	0 %	295700494
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48598	NC_014118	GTGC	2	8	1864844	1864851	0 %	25 %	50 %	25 %	295700494
48599	NC_014118	ATG	2	6	1864971	1864976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700494
48600	NC_014118	CCT	2	6	1864978	1864983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48601	NC_014118	CG	3	6	1864998	1865003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48602	NC_014118	CCTG	2	8	1865055	1865062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48603	NC_014118	GCG	2	6	1865114	1865119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48604	NC_014118	ATCG	2	8	1865174	1865181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48605	NC_014118	GCG	2	6	1865218	1865223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48606	NC_014118	ACT	2	6	1865292	1865297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48607	NC_014118	GAA	2	6	1865305	1865310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48608	NC_014118	AGA	2	6	1865361	1865366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295700495
48609	NC_014118	GAA	2	6	1865441	1865446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295700495
48610	NC_014118	CAG	2	6	1865501	1865506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700495
48611	NC_014118	GGC	2	6	1865550	1865555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700495
48612	NC_014118	TGC	2	6	1865560	1865565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700495
48613	NC_014118	CGT	2	6	1865608	1865613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700495
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48616	NC_014118	TGG	2	6	1865812	1865817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295700495
48617	NC_014118	TGGC	2	8	1865826	1865833	0 %	25 %	50 %	25 %	295700495
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48737	NC_014118	GCC	2	6	1872049	1872054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700503
48738	NC_014118	CGGC	2	8	1872108	1872115	0 %	0 %	50 %	50 %	295700503
48739	NC_014118	CGT	3	9	1872153	1872161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700503
48740	NC_014118	TGC	2	6	1872269	1872274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700503
48741	NC_014118	GACC	2	8	1872315	1872322	25 %	0 %	25 %	50 %	295700503
48742	NC_014118	GCC	2	6	1872373	1872378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700503
48743	NC_014118	GAT	2	6	1872408	1872413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700503
48744	NC_014118	CGCTGC	2	12	1872423	1872434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295700503
48745	NC_014118	CGT	2	6	1872474	1872479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700503
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48747	NC_014118	GCC	2	6	1872628	1872633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700503
48748	NC_014118	CGA	2	6	1872645	1872650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700503
48749	NC_014118	TCCG	2	8	1872665	1872672	0 %	25 %	25 %	50 %	295700503
48750	NC_014118	CG	3	6	1872724	1872729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48751	NC_014118	ATGAA	2	10	1872795	1872804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48752	NC_014118	TCT	2	6	1872805	1872810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48753	NC_014118	TCA	2	6	1872811	1872816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48754	NC_014118	GAAT	2	8	1872820	1872827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48755	NC_014118	CTG	3	9	1872878	1872886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700504
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48762	NC_014118	CG	3	6	1873209	1873214	0 %	0 %	50 %	50 %	295700504
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48767	NC_014118	CGGC	2	8	1873452	1873459	0 %	0 %	50 %	50 %	295700504
48768	NC_014118	CGA	2	6	1873477	1873482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700504
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48771	NC_014118	GC	4	8	1873633	1873640	0 %	0 %	50 %	50 %	295700504
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48777	NC_014118	GTT	2	6	1873811	1873816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48779	NC_014118	GC	3	6	1873901	1873906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48780	NC_014118	CG	3	6	1873936	1873941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48781	NC_014118	CAC	2	6	1873997	1874002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48783	NC_014118	GACGC	2	10	1874146	1874155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48784	NC_014118	AAT	2	6	1874232	1874237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48786	NC_014118	ACA	2	6	1874289	1874294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48787	NC_014118	CG	3	6	1874334	1874339	0 %	0 %	50 %	50 %	295700505
48788	NC_014118	CG	3	6	1874344	1874349	0 %	0 %	50 %	50 %	295700505
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48801	NC_014118	GTCATG	2	12	1874921	1874932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295700505
48802	NC_014118	GGC	2	6	1874954	1874959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700505
48803	NC_014118	CGG	2	6	1874973	1874978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700505
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48806	NC_014118	TCT	2	6	1875079	1875084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295700505
48807	NC_014118	CAT	2	6	1875178	1875183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295700505
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48812	NC_014118	CTGG	2	8	1875229	1875236	0 %	25 %	50 %	25 %	295700505
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48814	NC_014118	GCA	2	6	1875386	1875391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48815	NC_014118	TTC	2	6	1875507	1875512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295700506
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48817	NC_014118	CGAT	2	8	1875571	1875578	25 %	25 %	25 %	25 %	295700506
48818	NC_014118	CGA	2	6	1875602	1875607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48819	NC_014118	AGC	2	6	1875631	1875636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
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48822	NC_014118	GTT	2	6	1875792	1875797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295700506
48823	NC_014118	CGACGT	2	12	1875818	1875829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48824	NC_014118	CGC	2	6	1875830	1875835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700506
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48829	NC_014118	CTG	2	6	1875978	1875983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700506
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48832	NC_014118	CG	3	6	1876089	1876094	0 %	0 %	50 %	50 %	295700506
48833	NC_014118	CGATC	2	10	1876121	1876130	20 %	20 %	20 %	40 %	295700506
48834	NC_014118	CGA	2	6	1876166	1876171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48835	NC_014118	CGCAA	2	10	1876196	1876205	40 %	0 %	20 %	40 %	295700506
48836	NC_014118	AGC	2	6	1876264	1876269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48837	NC_014118	GCA	2	6	1876286	1876291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48838	NC_014118	CG	3	6	1876301	1876306	0 %	0 %	50 %	50 %	295700506
48839	NC_014118	CGC	2	6	1876343	1876348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700506
48840	NC_014118	CGA	2	6	1876374	1876379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700506
48841	NC_014118	AAC	2	6	1876390	1876395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295700506
48842	NC_014118	ATC	2	6	1876405	1876410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295700506
48843	NC_014118	CGGCG	2	10	1876429	1876438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48844	NC_014118	GCC	2	6	1876449	1876454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48845	NC_014118	TGG	2	6	1876481	1876486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295700507
48846	NC_014118	GCT	2	6	1876526	1876531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700507
48847	NC_014118	TGA	2	6	1876559	1876564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700507
48848	NC_014118	ATCGA	2	10	1876627	1876636	40 %	20 %	20 %	20 %	295700507
48849	NC_014118	TCG	2	6	1876651	1876656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700507
48850	NC_014118	GTCAGC	2	12	1876684	1876695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295700507
48851	NC_014118	TCT	2	6	1876700	1876705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295700507
48852	NC_014118	GAT	2	6	1876716	1876721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700507
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48970	NC_014118	CGG	2	6	1881483	1881488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700510
48971	NC_014118	GTC	2	6	1881673	1881678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700511
48972	NC_014118	ACGCC	2	10	1881694	1881703	20 %	0 %	20 %	60 %	295700511
48973	NC_014118	GAT	2	6	1881714	1881719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295700511
48974	NC_014118	CG	3	6	1881740	1881745	0 %	0 %	50 %	50 %	295700511
48975	NC_014118	CG	3	6	1881765	1881770	0 %	0 %	50 %	50 %	295700511
48976	NC_014118	CGA	2	6	1881803	1881808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700511
48977	NC_014118	AC	3	6	1881816	1881821	50 %	0 %	0 %	50 %	295700511
48978	NC_014118	TG	3	6	1881876	1881881	0 %	50 %	50 %	0 %	295700511
48979	NC_014118	TAA	2	6	1881931	1881936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295700511
48980	NC_014118	CGC	2	6	1881951	1881956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700511
48981	NC_014118	CG	3	6	1881979	1881984	0 %	0 %	50 %	50 %	295700511
48982	NC_014118	CGC	2	6	1881999	1882004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700511
48983	NC_014118	GCC	2	6	1882065	1882070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700511
48984	NC_014118	CGG	2	6	1882072	1882077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700511
48985	NC_014118	AC	3	6	1882100	1882105	50 %	0 %	0 %	50 %	295700511
48986	NC_014118	CGGC	2	8	1882127	1882134	0 %	0 %	50 %	50 %	295700511
48987	NC_014118	GCG	2	6	1882159	1882164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700511
48988	NC_014118	CG	3	6	1882266	1882271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48989	NC_014118	AGC	2	6	1882291	1882296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48990	NC_014118	GC	3	6	1882306	1882311	0 %	0 %	50 %	50 %	295700512
48991	NC_014118	TGC	2	6	1882345	1882350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48992	NC_014118	CGC	2	6	1882381	1882386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295700512
48993	NC_014118	CGT	2	6	1882402	1882407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48994	NC_014118	ACG	2	6	1882437	1882442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48995	NC_014118	GC	3	6	1882451	1882456	0 %	0 %	50 %	50 %	295700512
48996	NC_014118	CGG	2	6	1882508	1882513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295700512
48997	NC_014118	ACG	2	6	1882545	1882550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48998	NC_014118	TCG	2	6	1882599	1882604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700512
48999	NC_014118	GAA	2	6	1882610	1882615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295700512
49000	NC_014118	GTC	2	6	1882616	1882621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295700512

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