MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 67001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014118	GAT	2	6	555353	555358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295699340
15002	NC_014118	GGT	2	6	555395	555400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295699340
15003	NC_014118	CGA	2	6	555415	555420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699340
15004	NC_014118	GAATG	2	10	555507	555516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_014118	TCGA	2	8	555561	555568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15006	NC_014118	GCA	2	6	555575	555580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_014118	GC	3	6	555596	555601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15008	NC_014118	CGC	2	6	555611	555616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_014118	CCG	2	6	555632	555637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_014118	GC	3	6	555639	555644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_014118	GAC	2	6	555663	555668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_014118	GCG	2	6	555671	555676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_014118	CGC	2	6	555677	555682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15014	NC_014118	CAG	2	6	555717	555722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_014118	CGA	2	6	555818	555823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_014118	CGGC	2	8	555836	555843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_014118	AGCGC	2	10	555890	555899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15018	NC_014118	TGC	2	6	555901	555906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_014118	GCA	2	6	555914	555919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_014118	CAT	2	6	555986	555991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_014118	GC	4	8	555992	555999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15022	NC_014118	GTC	2	6	556127	556132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_014118	CGA	2	6	556212	556217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_014118	TGC	2	6	556322	556327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_014118	TTGAA	2	10	556398	556407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_014118	GCCG	2	8	556443	556450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15027	NC_014118	TC	3	6	556494	556499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15028	NC_014118	GCT	2	6	556515	556520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699341
15029	NC_014118	CAA	2	6	556522	556527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295699341
15030	NC_014118	ATTGC	2	10	556665	556674	20 %	40 %	20 %	20 %	295699341
15031	NC_014118	GCT	2	6	556743	556748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699341
15032	NC_014118	CGG	2	6	556762	556767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699341
15033	NC_014118	TCG	2	6	556779	556784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699341
15034	NC_014118	CGG	2	6	556849	556854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699341
15035	NC_014118	ACG	2	6	556855	556860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699341
15036	NC_014118	CCCAG	2	10	556958	556967	20 %	0 %	20 %	60 %	295699341
15037	NC_014118	ATC	2	6	556987	556992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295699341
15038	NC_014118	TCAA	2	8	557123	557130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15039	NC_014118	TCA	2	6	557176	557181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295699342
15040	NC_014118	CGT	2	6	557214	557219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15041	NC_014118	TTC	2	6	557223	557228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295699342
15042	NC_014118	GGT	2	6	557265	557270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295699342
15043	NC_014118	TCG	2	6	557317	557322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15044	NC_014118	CAG	2	6	557409	557414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15045	NC_014118	TGG	2	6	557420	557425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295699342
15046	NC_014118	GGC	2	6	557442	557447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699342
15047	NC_014118	CCG	2	6	557450	557455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699342
15048	NC_014118	GTT	2	6	557521	557526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295699342
15049	NC_014118	GC	3	6	557570	557575	0 %	0 %	50 %	50 %	295699342
15050	NC_014118	ATG	2	6	557585	557590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295699342
15051	NC_014118	TGC	2	6	557622	557627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15052	NC_014118	ACG	2	6	557654	557659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15053	NC_014118	GCT	2	6	557715	557720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15054	NC_014118	GAC	2	6	557860	557865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699342
15055	NC_014118	CCA	2	6	557873	557878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295699342
15056	NC_014118	ACT	2	6	557929	557934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_014118	GGC	2	6	557951	557956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_014118	GCG	2	6	557970	557975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_014118	GTC	2	6	557979	557984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_014118	CTC	2	6	558068	558073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295699343
15061	NC_014118	CAG	2	6	558075	558080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699343
15062	NC_014118	CATC	2	8	558109	558116	25 %	25 %	0 %	50 %	295699343
15063	NC_014118	GTTCG	2	10	558134	558143	0 %	40 %	40 %	20 %	295699343
15064	NC_014118	CAG	2	6	558170	558175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699343
15065	NC_014118	CG	3	6	558248	558253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15066	NC_014118	GC	3	6	558316	558321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15067	NC_014118	TTAT	2	8	558330	558337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_014118	CGACA	2	10	558341	558350	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15069	NC_014118	CA	3	6	558352	558357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15070	NC_014118	CGT	2	6	558363	558368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_014118	CG	4	8	558369	558376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15072	NC_014118	CGA	2	6	558435	558440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_014118	GATC	2	8	558453	558460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15074	NC_014118	AGATC	2	10	558561	558570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15075	NC_014118	GCG	2	6	558587	558592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_014118	GCG	2	6	558602	558607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_014118	CGGAC	2	10	558646	558655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15078	NC_014118	CGGC	2	8	558665	558672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15079	NC_014118	AGTG	2	8	558714	558721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_014118	AAG	2	6	558764	558769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_014118	CG	3	6	558787	558792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15082	NC_014118	CG	3	6	558794	558799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15083	NC_014118	CCT	2	6	558855	558860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15084	NC_014118	GGC	2	6	558873	558878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699344
15085	NC_014118	CGC	2	6	558994	558999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699344
15086	NC_014118	AGCGCG	2	12	559016	559027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295699344
15087	NC_014118	GC	3	6	559032	559037	0 %	0 %	50 %	50 %	295699344
15088	NC_014118	TCGC	2	8	559073	559080	0 %	25 %	25 %	50 %	295699344
15089	NC_014118	GCC	2	6	559117	559122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699344
15090	NC_014118	GGC	3	9	559150	559158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699344
15091	NC_014118	AGC	2	6	559166	559171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15092	NC_014118	GC	3	6	559188	559193	0 %	0 %	50 %	50 %	295699344
15093	NC_014118	CTG	2	6	559278	559283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15094	NC_014118	CACG	2	8	559359	559366	25 %	0 %	25 %	50 %	295699344
15095	NC_014118	GCA	2	6	559389	559394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15096	NC_014118	CG	4	8	559435	559442	0 %	0 %	50 %	50 %	295699344
15097	NC_014118	GC	3	6	559482	559487	0 %	0 %	50 %	50 %	295699344
15098	NC_014118	CG	3	6	559507	559512	0 %	0 %	50 %	50 %	295699344
15099	NC_014118	GTCGGC	2	12	559516	559527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295699344
15100	NC_014118	AGC	2	6	559571	559576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15101	NC_014118	GCG	2	6	559577	559582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699344
15102	NC_014118	AGC	2	6	559604	559609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15103	NC_014118	GCA	2	6	559674	559679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699344
15104	NC_014118	GGT	2	6	559726	559731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295699344
15105	NC_014118	CGG	3	9	559738	559746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_014118	GCCG	2	8	559824	559831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15107	NC_014118	CG	4	8	559856	559863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15108	NC_014118	GC	3	6	559891	559896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15109	NC_014118	GAG	2	6	559914	559919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_014118	GC	3	6	559986	559991	0 %	0 %	50 %	50 %	295699345
15111	NC_014118	GAC	2	6	559992	559997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699345
15112	NC_014118	CGT	2	6	560015	560020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699345
15113	NC_014118	CG	3	6	560075	560080	0 %	0 %	50 %	50 %	295699345
15114	NC_014118	TCG	2	6	560110	560115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699345
15115	NC_014118	GCG	3	9	560116	560124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699345
15116	NC_014118	ATGGCG	2	12	560137	560148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	295699345
15117	NC_014118	ACG	2	6	560161	560166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699345
15118	NC_014118	CGC	2	6	560216	560221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699345
15119	NC_014118	CCG	2	6	560249	560254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699345
15120	NC_014118	CG	3	6	560326	560331	0 %	0 %	50 %	50 %	295699345
15121	NC_014118	CG	3	6	560456	560461	0 %	0 %	50 %	50 %	295699345
15122	NC_014118	CG	5	10	560467	560476	0 %	0 %	50 %	50 %	295699345
15123	NC_014118	GC	3	6	560519	560524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15124	NC_014118	CGTG	2	8	560533	560540	0 %	25 %	50 %	25 %	295699346
15125	NC_014118	CTG	2	6	560545	560550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699346
15126	NC_014118	CGT	2	6	560560	560565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699346
15127	NC_014118	GTGTC	2	10	560608	560617	0 %	40 %	40 %	20 %	295699346
15128	NC_014118	GCC	2	6	560699	560704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699346
15129	NC_014118	GCC	2	6	560708	560713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699346
15130	NC_014118	ATC	2	6	560730	560735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295699346
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15132	NC_014118	GCA	3	9	560776	560784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699346
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15157	NC_014118	CGG	2	6	561822	561827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699347
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15163	NC_014118	CGCGG	2	10	562101	562110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15164	NC_014118	ATG	2	6	562136	562141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_014118	A	7	7	562177	562183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15166	NC_014118	CGC	2	6	562224	562229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699348
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15234	NC_014118	GATC	2	8	564225	564232	25 %	25 %	25 %	25 %	295699349
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15238	NC_014118	CGATG	2	10	564345	564354	20 %	20 %	40 %	20 %	295699349
15239	NC_014118	GA	3	6	564356	564361	50 %	0 %	50 %	0 %	295699349
15240	NC_014118	GC	3	6	564430	564435	0 %	0 %	50 %	50 %	295699349
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15244	NC_014118	GATG	2	8	564603	564610	25 %	25 %	50 %	0 %	295699349
15245	NC_014118	GAATC	2	10	564660	564669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15246	NC_014118	CAG	2	6	564705	564710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699350
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15250	NC_014118	GACCG	2	10	564822	564831	20 %	0 %	40 %	40 %	295699350
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15303	NC_014118	CGAAC	2	10	567449	567458	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15304	NC_014118	GTAT	2	8	567459	567466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15355	NC_014118	CGGCTG	2	12	569092	569103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295699352
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15358	NC_014118	ATTA	2	8	569194	569201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_014118	GA	3	6	569205	569210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_014118	AT	3	6	569214	569219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15361	NC_014118	CAATG	2	10	569245	569254	40 %	20 %	20 %	20 %	295699353
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15364	NC_014118	CG	3	6	569314	569319	0 %	0 %	50 %	50 %	295699353
15365	NC_014118	GCGCG	2	10	569335	569344	0 %	0 %	60 %	40 %	295699353
15366	NC_014118	GGC	2	6	569362	569367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699353
15367	NC_014118	GGC	2	6	569399	569404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699353
15368	NC_014118	GC	3	6	569403	569408	0 %	0 %	50 %	50 %	295699353
15369	NC_014118	GCC	2	6	569420	569425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699353
15370	NC_014118	CGC	2	6	569426	569431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295699353
15371	NC_014118	CGGC	2	8	569434	569441	0 %	0 %	50 %	50 %	295699353
15372	NC_014118	CG	4	8	569452	569459	0 %	0 %	50 %	50 %	295699353
15373	NC_014118	AGC	2	6	569466	569471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699353
15374	NC_014118	GC	5	10	569470	569479	0 %	0 %	50 %	50 %	295699353
15375	NC_014118	GTT	2	6	569500	569505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295699353
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15380	NC_014118	CGA	2	6	569680	569685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699353
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15383	NC_014118	GCT	2	6	569845	569850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699353
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15386	NC_014118	GCT	2	6	569920	569925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699353
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15391	NC_014118	TTC	2	6	570129	570134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295699354
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15407	NC_014118	CG	3	6	570649	570654	0 %	0 %	50 %	50 %	295699354
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15411	NC_014118	GC	3	6	570926	570931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15412	NC_014118	ATA	2	6	570937	570942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15413	NC_014118	CG	3	6	571000	571005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15414	NC_014118	GCG	2	6	571080	571085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15415	NC_014118	ACGA	2	8	571090	571097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15416	NC_014118	CG	3	6	571109	571114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15417	NC_014118	AC	3	6	571230	571235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15418	NC_014118	AGC	2	6	571236	571241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15420	NC_014118	CGG	2	6	571422	571427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295699355
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15424	NC_014118	GAC	2	6	571543	571548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699355
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15435	NC_014118	GC	3	6	571953	571958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15475	NC_014118	GCG	2	6	573453	573458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15489	NC_014118	TCG	2	6	574036	574041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699358
15490	NC_014118	ACGCG	2	10	574042	574051	20 %	0 %	40 %	40 %	295699358
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15492	NC_014118	CGA	2	6	574142	574147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295699358
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15494	NC_014118	TCG	2	6	574177	574182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295699358
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