MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 55133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_013714	ATT	2	6	2310323	2310328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48502	NC_013714	TCA	2	6	2310331	2310336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48503	NC_013714	AAC	2	6	2310381	2310386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48504	NC_013714	ACAT	2	8	2310426	2310433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48505	NC_013714	AGC	2	6	2310446	2310451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48506	NC_013714	T	8	8	2310461	2310468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48507	NC_013714	TTA	2	6	2310564	2310569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48508	NC_013714	TA	3	6	2310616	2310621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48509	NC_013714	CAA	2	6	2310657	2310662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48510	NC_013714	CAG	2	6	2310671	2310676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48511	NC_013714	CCA	2	6	2310680	2310685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48512	NC_013714	ATT	2	6	2310762	2310767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48513	NC_013714	CTG	2	6	2310775	2310780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48514	NC_013714	A	6	6	2310843	2310848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48515	NC_013714	T	7	7	2310913	2310919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48516	NC_013714	T	6	6	2310926	2310931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48517	NC_013714	A	6	6	2311041	2311046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48518	NC_013714	CAT	2	6	2311150	2311155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48519	NC_013714	AT	3	6	2311249	2311254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48520	NC_013714	CCTTGG	2	12	2311418	2311429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48521	NC_013714	GGT	2	6	2311434	2311439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456867
48522	NC_013714	CTG	2	6	2311521	2311526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48523	NC_013714	CAG	2	6	2311580	2311585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48524	NC_013714	AGC	2	6	2311594	2311599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48525	NC_013714	CGA	2	6	2311607	2311612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48526	NC_013714	GTAG	2	8	2311644	2311651	25 %	25 %	50 %	0 %	283456867
48527	NC_013714	GGAA	2	8	2311833	2311840	50 %	0 %	50 %	0 %	283456867
48528	NC_013714	GGC	2	6	2311910	2311915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456867
48529	NC_013714	GA	3	6	2311928	2311933	50 %	0 %	50 %	0 %	283456867
48530	NC_013714	TTG	2	6	2311957	2311962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456867
48531	NC_013714	CATC	2	8	2311985	2311992	25 %	25 %	0 %	50 %	283456867
48532	NC_013714	CAG	2	6	2312091	2312096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48533	NC_013714	TGAA	2	8	2312143	2312150	50 %	25 %	25 %	0 %	283456867
48534	NC_013714	TGG	2	6	2312183	2312188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456867
48535	NC_013714	TGC	2	6	2312200	2312205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48536	NC_013714	TGG	2	6	2312210	2312215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456867
48537	NC_013714	TTC	2	6	2312221	2312226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456867
48538	NC_013714	TTG	2	6	2312233	2312238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456867
48539	NC_013714	CCT	2	6	2312252	2312257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456867
48540	NC_013714	GAAC	2	8	2312364	2312371	50 %	0 %	25 %	25 %	283456867
48541	NC_013714	TGC	2	6	2312387	2312392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48542	NC_013714	GCC	2	6	2312400	2312405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456867
48543	NC_013714	GTG	2	6	2312434	2312439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456867
48544	NC_013714	GCC	2	6	2312440	2312445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456867
48545	NC_013714	AG	3	6	2312496	2312501	50 %	0 %	50 %	0 %	283456867
48546	NC_013714	TTC	2	6	2312569	2312574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456867
48547	NC_013714	TTC	2	6	2312602	2312607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456867
48548	NC_013714	TCT	2	6	2312609	2312614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456867
48549	NC_013714	TG	3	6	2312632	2312637	0 %	50 %	50 %	0 %	283456867
48550	NC_013714	TCA	2	6	2312717	2312722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456867
48551	NC_013714	CCA	2	6	2312774	2312779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456867
48552	NC_013714	TCA	2	6	2312809	2312814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456867
48553	NC_013714	GCC	2	6	2312850	2312855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456867
48554	NC_013714	GCG	2	6	2312872	2312877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456867
48555	NC_013714	TGC	3	9	2312884	2312892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456867
48556	NC_013714	TGA	2	6	2312900	2312905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456867
48557	NC_013714	CGG	2	6	2312969	2312974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456867
48558	NC_013714	T	6	6	2313090	2313095	0 %	100 %	0 %	0 %	283456867
48559	NC_013714	GCCGT	2	10	2313107	2313116	0 %	20 %	40 %	40 %	283456867
48560	NC_013714	TTCG	2	8	2313156	2313163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48561	NC_013714	TCC	2	6	2313316	2313321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456868
48562	NC_013714	ATT	2	6	2313330	2313335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283456868
48563	NC_013714	CAG	2	6	2313378	2313383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456868
48564	NC_013714	CCA	2	6	2313443	2313448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456868
48565	NC_013714	TGA	2	6	2313473	2313478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456868
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48567	NC_013714	ACGCC	2	10	2313557	2313566	20 %	0 %	20 %	60 %	283456868
48568	NC_013714	CGG	2	6	2313578	2313583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456868
48569	NC_013714	CAT	2	6	2313599	2313604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456868
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48572	NC_013714	GC	3	6	2313787	2313792	0 %	0 %	50 %	50 %	283456868
48573	NC_013714	CAG	2	6	2313843	2313848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456868
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48585	NC_013714	CAC	2	6	2314524	2314529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456868
48586	NC_013714	CTG	2	6	2314560	2314565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456868
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48590	NC_013714	GTC	2	6	2314787	2314792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456868
48591	NC_013714	C	6	6	2314855	2314860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48592	NC_013714	AGA	2	6	2314880	2314885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48593	NC_013714	ATA	2	6	2314932	2314937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48594	NC_013714	TCA	2	6	2315002	2315007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456869
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48596	NC_013714	ATG	2	6	2315085	2315090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456869
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48599	NC_013714	CACC	2	8	2315268	2315275	25 %	0 %	0 %	75 %	283456869
48600	NC_013714	ACC	2	6	2315280	2315285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456869
48601	NC_013714	ACTGG	2	10	2315300	2315309	20 %	20 %	40 %	20 %	283456869
48602	NC_013714	TGCA	2	8	2315318	2315325	25 %	25 %	25 %	25 %	283456869
48603	NC_013714	GCG	2	6	2315337	2315342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456869
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48606	NC_013714	CAGG	2	8	2315564	2315571	25 %	0 %	50 %	25 %	283456869
48607	NC_013714	GCA	3	9	2315620	2315628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456869
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48612	NC_013714	ATC	2	6	2315886	2315891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456869
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48615	NC_013714	GCA	2	6	2316043	2316048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456869
48616	NC_013714	CTCGT	2	10	2316069	2316078	0 %	40 %	20 %	40 %	283456869
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48618	NC_013714	GAT	2	6	2316297	2316302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456870
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48720	NC_013714	CAT	2	6	2321148	2321153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456874
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48723	NC_013714	GAA	2	6	2321348	2321353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48724	NC_013714	A	6	6	2321365	2321370	100 %	0 %	0 %	0 %	283456875
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48733	NC_013714	CGATC	2	10	2321727	2321736	20 %	20 %	20 %	40 %	283456875
48734	NC_013714	CGG	2	6	2321778	2321783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456875
48735	NC_013714	TAC	2	6	2321794	2321799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456875
48736	NC_013714	CAT	2	6	2321814	2321819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456875
48737	NC_013714	ACG	2	6	2321846	2321851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456875
48738	NC_013714	CGG	2	6	2321928	2321933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456875
48739	NC_013714	TAC	3	9	2322001	2322009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456875
48740	NC_013714	GACCA	2	10	2322013	2322022	40 %	0 %	20 %	40 %	283456875
48741	NC_013714	ATTCG	2	10	2322078	2322087	20 %	40 %	20 %	20 %	283456875
48742	NC_013714	AAT	2	6	2322109	2322114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283456875
48743	NC_013714	CGG	2	6	2322132	2322137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456875
48744	NC_013714	CGG	2	6	2322144	2322149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456875
48745	NC_013714	GTG	2	6	2322174	2322179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456875
48746	NC_013714	AG	3	6	2322187	2322192	50 %	0 %	50 %	0 %	283456875
48747	NC_013714	AGACGG	2	12	2322210	2322221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283456875
48748	NC_013714	CAA	2	6	2322252	2322257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283456875
48749	NC_013714	CTG	2	6	2322295	2322300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48750	NC_013714	T	6	6	2322339	2322344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48751	NC_013714	CG	3	6	2322439	2322444	0 %	0 %	50 %	50 %	283456876
48752	NC_013714	CAG	2	6	2322465	2322470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456876
48753	NC_013714	CGC	2	6	2322570	2322575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456876
48754	NC_013714	CGA	2	6	2322647	2322652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456876
48755	NC_013714	GATGGC	2	12	2322660	2322671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283456876
48756	NC_013714	GAC	2	6	2322687	2322692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456876
48757	NC_013714	GAA	2	6	2322726	2322731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456876
48758	NC_013714	CGGC	2	8	2322742	2322749	0 %	0 %	50 %	50 %	283456876
48759	NC_013714	CGTC	2	8	2322760	2322767	0 %	25 %	25 %	50 %	283456876
48760	NC_013714	GAA	2	6	2322798	2322803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456876
48761	NC_013714	CAT	2	6	2322843	2322848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456876
48762	NC_013714	T	6	6	2322852	2322857	0 %	100 %	0 %	0 %	283456876
48763	NC_013714	GCTG	2	8	2322860	2322867	0 %	25 %	50 %	25 %	283456876
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48771	NC_013714	GTT	2	6	2323371	2323376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456876
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48776	NC_013714	CAGTA	2	10	2323558	2323567	40 %	20 %	20 %	20 %	283456876
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48780	NC_013714	TAC	2	6	2323667	2323672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48781	NC_013714	ATC	2	6	2323722	2323727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456877
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48788	NC_013714	CGTT	2	8	2324134	2324141	0 %	50 %	25 %	25 %	283456877
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48790	NC_013714	CTG	2	6	2324223	2324228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456877
48791	NC_013714	ATC	2	6	2324275	2324280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456877
48792	NC_013714	CTT	2	6	2324298	2324303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456877
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48794	NC_013714	GAA	2	6	2324367	2324372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456877
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48825	NC_013714	CAT	2	6	2325884	2325889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456879
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48832	NC_013714	GAT	2	6	2326225	2326230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456879
48833	NC_013714	GATG	2	8	2326251	2326258	25 %	25 %	50 %	0 %	283456879
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48841	NC_013714	CAG	2	6	2326555	2326560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456879
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48843	NC_013714	GAT	2	6	2326573	2326578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456879
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48965	NC_013714	GCTG	2	8	2332485	2332492	0 %	25 %	50 %	25 %	283456884
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48967	NC_013714	TCG	2	6	2332622	2332627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456884
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48971	NC_013714	CGC	2	6	2332930	2332935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456884
48972	NC_013714	TGGC	2	8	2332969	2332976	0 %	25 %	50 %	25 %	283456884
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48976	NC_013714	CCG	2	6	2333046	2333051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456884
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49000	NC_013714	CGCC	2	8	2334126	2334133	0 %	0 %	25 %	75 %	283456884

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