MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 55133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47003	NC_013714	CTT	2	6	2241976	2241981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456811
47004	NC_013714	AGG	2	6	2242014	2242019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456811
47005	NC_013714	CCG	2	6	2242026	2242031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456811
47006	NC_013714	CGAG	2	8	2242053	2242060	25 %	0 %	50 %	25 %	283456811
47007	NC_013714	CGAT	2	8	2242071	2242078	25 %	25 %	25 %	25 %	283456811
47008	NC_013714	CCGA	2	8	2242079	2242086	25 %	0 %	25 %	50 %	283456811
47009	NC_013714	GGC	2	6	2242130	2242135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456811
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47012	NC_013714	GAG	2	6	2242208	2242213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456811
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47015	NC_013714	TGCC	2	8	2242337	2242344	0 %	25 %	25 %	50 %	283456811
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47049	NC_013714	CGG	2	6	2243666	2243671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456813
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47093	NC_013714	TGAC	2	8	2245889	2245896	25 %	25 %	25 %	25 %	283456814
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47099	NC_013714	CGCA	2	8	2246142	2246149	25 %	0 %	25 %	50 %	283456815
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47102	NC_013714	TCA	2	6	2246296	2246301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456815
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47108	NC_013714	CG	3	6	2246482	2246487	0 %	0 %	50 %	50 %	283456815
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47112	NC_013714	CAC	2	6	2246623	2246628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47113	NC_013714	CAT	2	6	2246630	2246635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47114	NC_013714	ATT	2	6	2246684	2246689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47116	NC_013714	TA	3	6	2246706	2246711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47231	NC_013714	CGT	2	6	2251243	2251248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47232	NC_013714	CGA	2	6	2251311	2251316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47233	NC_013714	GCC	2	6	2251349	2251354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456818
47234	NC_013714	CGGAA	2	10	2251416	2251425	40 %	0 %	40 %	20 %	283456818
47235	NC_013714	TCTCGT	2	12	2251431	2251442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283456818
47236	NC_013714	CGCCA	2	10	2251551	2251560	20 %	0 %	20 %	60 %	283456818
47237	NC_013714	GTT	2	6	2251564	2251569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456818
47238	NC_013714	GGT	2	6	2251588	2251593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456818
47239	NC_013714	CTG	2	6	2251606	2251611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47240	NC_013714	GCG	2	6	2251637	2251642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47241	NC_013714	CAT	2	6	2251648	2251653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456818
47242	NC_013714	TCG	2	6	2251709	2251714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47243	NC_013714	GAA	2	6	2251723	2251728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456818
47244	NC_013714	ATC	2	6	2251729	2251734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456818
47245	NC_013714	CAG	2	6	2251735	2251740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47246	NC_013714	CGG	2	6	2251911	2251916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47247	NC_013714	GAT	2	6	2251918	2251923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456818
47248	NC_013714	GCG	2	6	2251946	2251951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47249	NC_013714	TCT	2	6	2251968	2251973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456818
47250	NC_013714	CGC	2	6	2251983	2251988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456818
47251	NC_013714	GC	3	6	2252022	2252027	0 %	0 %	50 %	50 %	283456818
47252	NC_013714	CTT	2	6	2252041	2252046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456818
47253	NC_013714	CGG	2	6	2252055	2252060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47254	NC_013714	TGT	2	6	2252061	2252066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456818
47255	NC_013714	TCG	2	6	2252105	2252110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47256	NC_013714	CAG	2	6	2252125	2252130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47257	NC_013714	GAT	2	6	2252188	2252193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456818
47258	NC_013714	TTC	2	6	2252309	2252314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456818
47259	NC_013714	CGG	2	6	2252340	2252345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47260	NC_013714	GAC	2	6	2252359	2252364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47261	NC_013714	GCC	2	6	2252380	2252385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456818
47262	NC_013714	GGA	2	6	2252446	2252451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456818
47263	NC_013714	CG	3	6	2252515	2252520	0 %	0 %	50 %	50 %	283456818
47264	NC_013714	CCA	2	6	2252648	2252653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456818
47265	NC_013714	TCA	2	6	2252679	2252684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456818
47266	NC_013714	CAT	2	6	2252691	2252696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456818
47267	NC_013714	GCG	2	6	2252795	2252800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47268	NC_013714	GCT	2	6	2252817	2252822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47269	NC_013714	TGC	2	6	2252823	2252828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47270	NC_013714	GTA	2	6	2252830	2252835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456818
47271	NC_013714	CCAGGG	2	12	2252850	2252861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283456818
47272	NC_013714	GGC	2	6	2252890	2252895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456818
47273	NC_013714	CGA	2	6	2252919	2252924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456818
47274	NC_013714	TCA	2	6	2252931	2252936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456818
47275	NC_013714	CTCAT	2	10	2252961	2252970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47276	NC_013714	GGGC	2	8	2252979	2252986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47277	NC_013714	TGT	2	6	2253010	2253015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47278	NC_013714	CGG	2	6	2253110	2253115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47279	NC_013714	GTC	2	6	2253126	2253131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456819
47280	NC_013714	GATGTC	2	12	2253135	2253146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283456819
47281	NC_013714	CGG	2	6	2253278	2253283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456819
47282	NC_013714	ACGT	2	8	2253285	2253292	25 %	25 %	25 %	25 %	283456819
47283	NC_013714	TTG	2	6	2253304	2253309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456819
47284	NC_013714	CCA	2	6	2253335	2253340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456819
47285	NC_013714	TGA	2	6	2253356	2253361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456819
47286	NC_013714	TCA	2	6	2253428	2253433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456819
47287	NC_013714	CCA	2	6	2253476	2253481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456820
47288	NC_013714	CCT	2	6	2253484	2253489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456820
47289	NC_013714	GAA	2	6	2253507	2253512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283456820
47290	NC_013714	GTT	2	6	2253524	2253529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456820
47291	NC_013714	TCGGCA	2	12	2253531	2253542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283456820
47292	NC_013714	ATC	2	6	2253566	2253571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456820
47293	NC_013714	GCTG	2	8	2253572	2253579	0 %	25 %	50 %	25 %	283456820
47294	NC_013714	TCG	2	6	2253585	2253590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456820
47295	NC_013714	CCT	2	6	2253646	2253651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456820
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47297	NC_013714	CTTC	2	8	2253697	2253704	0 %	50 %	0 %	50 %	283456820
47298	NC_013714	CATG	2	8	2253781	2253788	25 %	25 %	25 %	25 %	283456820
47299	NC_013714	CAAC	2	8	2253826	2253833	50 %	0 %	0 %	50 %	283456820
47300	NC_013714	TGTTC	2	10	2253946	2253955	0 %	60 %	20 %	20 %	283456820
47301	NC_013714	ATGC	2	8	2253977	2253984	25 %	25 %	25 %	25 %	283456820
47302	NC_013714	TCA	2	6	2254018	2254023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456820
47303	NC_013714	ATG	2	6	2254032	2254037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456820
47304	NC_013714	GGA	2	6	2254091	2254096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283456820
47305	NC_013714	GTCGAT	2	12	2254109	2254120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283456820
47306	NC_013714	GCC	2	6	2254152	2254157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456820
47307	NC_013714	TGA	2	6	2254195	2254200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456820
47308	NC_013714	TCGG	2	8	2254248	2254255	0 %	25 %	50 %	25 %	283456820
47309	NC_013714	ACG	2	6	2254283	2254288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456820
47310	NC_013714	CATG	2	8	2254293	2254300	25 %	25 %	25 %	25 %	283456820
47311	NC_013714	CGG	2	6	2254303	2254308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456820
47312	NC_013714	CAC	2	6	2254420	2254425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456820
47313	NC_013714	CGG	2	6	2254430	2254435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456820
47314	NC_013714	CGA	2	6	2254481	2254486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456820
47315	NC_013714	GGA	2	6	2254574	2254579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47316	NC_013714	GC	3	6	2254809	2254814	0 %	0 %	50 %	50 %	283456821
47317	NC_013714	GAT	2	6	2254826	2254831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456821
47318	NC_013714	GCC	2	6	2254853	2254858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456821
47319	NC_013714	CGA	2	6	2254870	2254875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47320	NC_013714	TCG	2	6	2254899	2254904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47321	NC_013714	GC	3	6	2254918	2254923	0 %	0 %	50 %	50 %	283456821
47322	NC_013714	CAT	2	6	2254924	2254929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456821
47323	NC_013714	GAC	2	6	2254934	2254939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47324	NC_013714	CTT	2	6	2254952	2254957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456821
47325	NC_013714	GAC	2	6	2254958	2254963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47326	NC_013714	CGGA	2	8	2255068	2255075	25 %	0 %	50 %	25 %	283456821
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47328	NC_013714	CCA	2	6	2255138	2255143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456821
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47330	NC_013714	GCG	2	6	2255157	2255162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456821
47331	NC_013714	GCG	2	6	2255267	2255272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456821
47332	NC_013714	CG	3	6	2255275	2255280	0 %	0 %	50 %	50 %	283456821
47333	NC_013714	GCA	2	6	2255332	2255337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47334	NC_013714	ATCCGG	2	12	2255345	2255356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47335	NC_013714	TCG	2	6	2255370	2255375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456821
47336	NC_013714	GCC	2	6	2255393	2255398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456821
47337	NC_013714	GGT	2	6	2255402	2255407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456821
47338	NC_013714	CGC	2	6	2255449	2255454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456821
47339	NC_013714	TCT	2	6	2255500	2255505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456821
47340	NC_013714	ACGC	2	8	2255638	2255645	25 %	0 %	25 %	50 %	283456821
47341	NC_013714	GCAC	2	8	2255661	2255668	25 %	0 %	25 %	50 %	283456821
47342	NC_013714	GC	3	6	2255691	2255696	0 %	0 %	50 %	50 %	283456821
47343	NC_013714	TCAA	2	8	2255730	2255737	50 %	25 %	0 %	25 %	283456821
47344	NC_013714	CCG	2	6	2255802	2255807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456821
47345	NC_013714	GC	3	6	2255842	2255847	0 %	0 %	50 %	50 %	283456821
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47347	NC_013714	CGG	2	6	2256043	2256048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456821
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47443	NC_013714	CGA	2	6	2260146	2260151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456825
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47445	NC_013714	CGA	2	6	2260233	2260238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456825
47446	NC_013714	TAGCGG	2	12	2260382	2260393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283456825
47447	NC_013714	CGA	2	6	2260406	2260411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456825
47448	NC_013714	CAAG	2	8	2260422	2260429	50 %	0 %	25 %	25 %	283456825
47449	NC_013714	GAATC	2	10	2260433	2260442	40 %	20 %	20 %	20 %	283456825
47450	NC_013714	CGC	2	6	2260552	2260557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456825
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47452	NC_013714	TTCC	2	8	2260587	2260594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47453	NC_013714	CAGG	2	8	2260621	2260628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47454	NC_013714	GAC	2	6	2260743	2260748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456826
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47461	NC_013714	GCG	2	6	2261050	2261055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456826
47462	NC_013714	CAT	2	6	2261078	2261083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456826
47463	NC_013714	TCC	2	6	2261101	2261106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283456826
47464	NC_013714	CAAG	2	8	2261114	2261121	50 %	0 %	25 %	25 %	283456826
47465	NC_013714	CGA	2	6	2261129	2261134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456826
47466	NC_013714	GAT	2	6	2261147	2261152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283456826
47467	NC_013714	GCA	2	6	2261204	2261209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456826
47468	NC_013714	CG	3	6	2261225	2261230	0 %	0 %	50 %	50 %	283456826
47469	NC_013714	GTGGCG	2	12	2261266	2261277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283456826
47470	NC_013714	GGC	2	6	2261295	2261300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456826
47471	NC_013714	TCT	2	6	2261321	2261326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456826
47472	NC_013714	GTCA	2	8	2261328	2261335	25 %	25 %	25 %	25 %	283456826
47473	NC_013714	CAT	2	6	2261373	2261378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283456827
47474	NC_013714	TGG	2	6	2261565	2261570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283456827
47475	NC_013714	CTG	2	6	2261650	2261655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47476	NC_013714	CGT	2	6	2261733	2261738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47477	NC_013714	GGC	2	6	2261764	2261769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456827
47478	NC_013714	GCA	2	6	2261772	2261777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47479	NC_013714	CAG	2	6	2261893	2261898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47480	NC_013714	ACC	2	6	2262001	2262006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283456827
47481	NC_013714	GAC	2	6	2262058	2262063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47482	NC_013714	CAG	2	6	2262091	2262096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47483	NC_013714	CCG	2	6	2262099	2262104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283456827
47484	NC_013714	CGA	2	6	2262108	2262113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47485	NC_013714	TGT	2	6	2262153	2262158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283456827
47486	NC_013714	CTG	2	6	2262205	2262210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47487	NC_013714	TTC	2	6	2262305	2262310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456827
47488	NC_013714	TGCTC	2	10	2262339	2262348	0 %	40 %	20 %	40 %	283456827
47489	NC_013714	CGCT	2	8	2262359	2262366	0 %	25 %	25 %	50 %	283456827
47490	NC_013714	CGG	2	6	2262393	2262398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456827
47491	NC_013714	TCACGC	2	12	2262404	2262415	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283456827
47492	NC_013714	TGCGCC	2	12	2262440	2262451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283456827
47493	NC_013714	GCT	2	6	2262474	2262479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456827
47494	NC_013714	TGCG	2	8	2262497	2262504	0 %	25 %	50 %	25 %	283456827
47495	NC_013714	CGG	2	6	2262582	2262587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283456827
47496	NC_013714	CGA	2	6	2262763	2262768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47497	NC_013714	ACGA	2	8	2262784	2262791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47498	NC_013714	TTC	2	6	2262935	2262940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283456828
47499	NC_013714	CCGA	2	8	2262953	2262960	25 %	0 %	25 %	50 %	283456828
47500	NC_013714	TCG	2	6	2262968	2262973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283456828

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