MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 1499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	TCT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013130	ATA	2	6	77	82	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013130	ATTTTT	2	12	85	96	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013130	TAAAAA	2	12	101	112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013130	TAC	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013130	T	8	8	133	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	A	6	6	141	146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013130	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013130	TA	3	6	181	186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013130	TAA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	AAG	2	6	269	274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	AAAT	2	8	308	315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	TAT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	AATT	2	8	408	415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	TCT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013130	TCT	2	6	491	496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013130	TAT	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013130	GCAA	2	8	530	537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013130	TTGC	2	8	560	567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013130	ATTAAT	2	12	573	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013130	TTA	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013130	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013130	A	7	7	649	655	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
26	NC_013130	ATTAAT	2	12	663	674	50 %	50 %	0 %	0 %	256055274
27	NC_013130	AC	3	6	710	715	50 %	0 %	0 %	50 %	256055274
28	NC_013130	A	8	8	766	773	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
29	NC_013130	ATTT	2	8	797	804	25 %	75 %	0 %	0 %	256055274
30	NC_013130	TGG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055274
31	NC_013130	ATTTA	2	10	867	876	40 %	60 %	0 %	0 %	256055274
32	NC_013130	ATT	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
33	NC_013130	AGCA	2	8	960	967	50 %	0 %	25 %	25 %	256055274
34	NC_013130	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
35	NC_013130	A	7	7	1039	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
36	NC_013130	A	7	7	1117	1123	100 %	0 %	0 %	0 %	256055274
37	NC_013130	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
38	NC_013130	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013130	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013130	AATTAA	2	12	1162	1173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013130	CCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013130	TAA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013130	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013130	TAA	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013130	TAA	3	9	1355	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013130	ATT	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013130	ATT	2	6	1393	1398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013130	TAAT	2	8	1415	1422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013130	AAT	3	9	1420	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013130	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	256055275
51	NC_013130	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
52	NC_013130	ATG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
53	NC_013130	AAC	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055275
54	NC_013130	TGA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
55	NC_013130	GAATT	2	10	1587	1596	40 %	40 %	20 %	0 %	256055275
56	NC_013130	AGCAA	2	10	1598	1607	60 %	0 %	20 %	20 %	256055275
57	NC_013130	TTAAAC	2	12	1634	1645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256055275
58	NC_013130	TTA	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
59	NC_013130	TAG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
60	NC_013130	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
61	NC_013130	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
62	NC_013130	A	6	6	1841	1846	100 %	0 %	0 %	0 %	256055275
63	NC_013130	AGA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
64	NC_013130	TAA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055275
65	NC_013130	TA	3	6	1957	1962	50 %	50 %	0 %	0 %	256055275
66	NC_013130	TAAT	2	8	1985	1992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013130	A	6	6	1995	2000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013130	T	7	7	2034	2040	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
69	NC_013130	TTAA	2	8	2043	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	256055276
70	NC_013130	TTTTA	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	256055276
71	NC_013130	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
72	NC_013130	T	7	7	2101	2107	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
73	NC_013130	T	6	6	2160	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
74	NC_013130	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
75	NC_013130	T	6	6	2252	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	256055276
76	NC_013130	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
77	NC_013130	CT	4	8	2418	2425	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
78	NC_013130	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055276
79	NC_013130	TAT	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
80	NC_013130	GGCAT	2	10	2448	2457	20 %	20 %	40 %	20 %	256055276
81	NC_013130	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
82	NC_013130	CAAA	2	8	2542	2549	75 %	0 %	0 %	25 %	256055276
83	NC_013130	ATTT	2	8	2650	2657	25 %	75 %	0 %	0 %	256055276
84	NC_013130	A	6	6	2722	2727	100 %	0 %	0 %	0 %	256055276
85	NC_013130	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
86	NC_013130	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
87	NC_013130	TC	3	6	2813	2818	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
88	NC_013130	ATC	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055276
89	NC_013130	TCTA	2	8	2916	2923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013130	ATT	2	6	2946	2951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013130	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013130	A	7	7	2976	2982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013130	TA	3	6	3042	3047	50 %	50 %	0 %	0 %	256055277
94	NC_013130	T	6	6	3057	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
95	NC_013130	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
96	NC_013130	TAA	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
97	NC_013130	ACT	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
98	NC_013130	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
99	NC_013130	CAA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
100	NC_013130	TCT	3	9	3355	3363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
101	NC_013130	GTA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055277
102	NC_013130	T	6	6	3430	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
103	NC_013130	AAG	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
104	NC_013130	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
105	NC_013130	T	6	6	3482	3487	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
106	NC_013130	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
107	NC_013130	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055277
108	NC_013130	TTG	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
109	NC_013130	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
110	NC_013130	TCT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
111	NC_013130	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
112	NC_013130	CAAT	2	8	3614	3621	50 %	25 %	0 %	25 %	256055277
113	NC_013130	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
114	NC_013130	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
115	NC_013130	CTGTAT	2	12	3706	3717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256055277
116	NC_013130	TCA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
117	NC_013130	CCAC	2	8	3747	3754	25 %	0 %	0 %	75 %	256055277
118	NC_013130	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
119	NC_013130	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
120	NC_013130	CTT	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
121	NC_013130	T	6	6	3988	3993	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
122	NC_013130	T	7	7	4035	4041	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
123	NC_013130	T	8	8	4054	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
124	NC_013130	T	7	7	4120	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	256055277
125	NC_013130	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055277
126	NC_013130	GTG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055277
127	NC_013130	TCT	3	9	4174	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
128	NC_013130	AACA	2	8	4203	4210	75 %	0 %	0 %	25 %	256055277
129	NC_013130	TAA	3	9	4220	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
130	NC_013130	TAAAT	2	10	4250	4259	60 %	40 %	0 %	0 %	256055277
131	NC_013130	ATT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013130	TAAA	2	8	4282	4289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013130	TACA	2	8	4304	4311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013130	ATGT	2	8	4316	4323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013130	TAA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013130	T	7	7	4380	4386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013130	A	7	7	4391	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013130	TAAA	2	8	4413	4420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013130	TAA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013130	A	6	6	4460	4465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013130	TAA	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013130	ATT	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013130	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013130	AAATTT	2	12	4544	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013130	A	7	7	4579	4585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_013130	TATAA	2	10	9397	9406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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