MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_012815	ACC	2	6	1920604	1920609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43002	NC_012815	AAT	2	6	1920640	1920645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241197025
43003	NC_012815	GAA	2	6	1920655	1920660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241197025
43004	NC_012815	TCG	2	6	1920739	1920744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197025
43005	NC_012815	CTGTTC	2	12	1920745	1920756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241197025
43006	NC_012815	GGT	2	6	1920763	1920768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197025
43007	NC_012815	GTG	2	6	1920811	1920816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197025
43008	NC_012815	GCA	2	6	1920845	1920850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197025
43009	NC_012815	CG	3	6	1920884	1920889	0 %	0 %	50 %	50 %	241197025
43010	NC_012815	GTG	2	6	1920958	1920963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197025
43011	NC_012815	CAC	2	6	1921002	1921007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197025
43012	NC_012815	GATG	2	8	1921080	1921087	25 %	25 %	50 %	0 %	241197025
43013	NC_012815	TGG	2	6	1921103	1921108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197025
43014	NC_012815	AC	3	6	1921239	1921244	50 %	0 %	0 %	50 %	241197025
43015	NC_012815	CGCT	2	8	1921309	1921316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43016	NC_012815	CGG	2	6	1921318	1921323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43017	NC_012815	CGA	2	6	1921327	1921332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43018	NC_012815	GC	3	6	1921382	1921387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43019	NC_012815	CCA	2	6	1921494	1921499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197026
43020	NC_012815	TCG	2	6	1921535	1921540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43021	NC_012815	TCC	2	6	1921571	1921576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197026
43022	NC_012815	TCC	2	6	1921601	1921606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197026
43023	NC_012815	CATC	2	8	1921611	1921618	25 %	25 %	0 %	50 %	241197026
43024	NC_012815	GTG	2	6	1921655	1921660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197026
43025	NC_012815	GCG	2	6	1921720	1921725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197026
43026	NC_012815	CGG	2	6	1921728	1921733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197026
43027	NC_012815	CCA	2	6	1921803	1921808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197026
43028	NC_012815	TGG	2	6	1921811	1921816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197026
43029	NC_012815	AGCGC	2	10	1921821	1921830	20 %	0 %	40 %	40 %	241197026
43030	NC_012815	CACC	2	8	1921857	1921864	25 %	0 %	0 %	75 %	241197026
43031	NC_012815	GTG	3	9	1921870	1921878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197026
43032	NC_012815	GCC	2	6	1921943	1921948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197026
43033	NC_012815	GCA	2	6	1921953	1921958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43034	NC_012815	GGGC	2	8	1921968	1921975	0 %	0 %	75 %	25 %	241197026
43035	NC_012815	CG	3	6	1922008	1922013	0 %	0 %	50 %	50 %	241197026
43036	NC_012815	ATC	2	6	1922024	1922029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197026
43037	NC_012815	CCA	2	6	1922124	1922129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197026
43038	NC_012815	AGC	3	9	1922162	1922170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43039	NC_012815	CGGT	2	8	1922216	1922223	0 %	25 %	50 %	25 %	241197026
43040	NC_012815	CGG	2	6	1922241	1922246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197026
43041	NC_012815	CAT	2	6	1922296	1922301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197026
43042	NC_012815	TCG	2	6	1922315	1922320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43043	NC_012815	GCA	2	6	1922349	1922354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43044	NC_012815	TTG	2	6	1922360	1922365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241197026
43045	NC_012815	CCG	2	6	1922378	1922383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197026
43046	NC_012815	CGG	2	6	1922444	1922449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197026
43047	NC_012815	GA	3	6	1922450	1922455	50 %	0 %	50 %	0 %	241197026
43048	NC_012815	GGT	2	6	1922527	1922532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197026
43049	NC_012815	GC	3	6	1922659	1922664	0 %	0 %	50 %	50 %	241197026
43050	NC_012815	GCA	3	9	1922700	1922708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197026
43051	NC_012815	GCC	2	6	1922722	1922727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197026
43052	NC_012815	CGC	2	6	1922805	1922810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197026
43053	NC_012815	GCCC	2	8	1922824	1922831	0 %	0 %	25 %	75 %	241197026
43054	NC_012815	GCG	2	6	1922880	1922885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197026
43055	NC_012815	GCA	2	6	1922921	1922926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43056	NC_012815	GCAT	2	8	1923016	1923023	25 %	25 %	25 %	25 %	241197027
43057	NC_012815	CGA	2	6	1923056	1923061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197027
43058	NC_012815	ACC	2	6	1923111	1923116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197027
43059	NC_012815	CA	3	6	1923197	1923202	50 %	0 %	0 %	50 %	241197027
43060	NC_012815	CGG	2	6	1923223	1923228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197027
43061	NC_012815	GC	3	6	1923306	1923311	0 %	0 %	50 %	50 %	241197027
43062	NC_012815	CGT	2	6	1923318	1923323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197027
43063	NC_012815	GCC	2	6	1923351	1923356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197027
43064	NC_012815	GCA	2	6	1923360	1923365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197027
43065	NC_012815	ATG	2	6	1923369	1923374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197027
43066	NC_012815	ATG	2	6	1923498	1923503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197027
43067	NC_012815	GCG	2	6	1923509	1923514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197027
43068	NC_012815	ACCG	2	8	1923519	1923526	25 %	0 %	25 %	50 %	241197027
43069	NC_012815	CTCG	2	8	1923542	1923549	0 %	25 %	25 %	50 %	241197027
43070	NC_012815	GGT	2	6	1923566	1923571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197027
43071	NC_012815	CCG	2	6	1923583	1923588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197027
43072	NC_012815	ATC	2	6	1923624	1923629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197027
43073	NC_012815	TGCC	2	8	1923663	1923670	0 %	25 %	25 %	50 %	241197027
43074	NC_012815	CAG	2	6	1923702	1923707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197027
43075	NC_012815	CCG	2	6	1923709	1923714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197027
43076	NC_012815	CAT	2	6	1923740	1923745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197027
43077	NC_012815	GGT	2	6	1923752	1923757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197027
43078	NC_012815	CAT	2	6	1923822	1923827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197027
43079	NC_012815	GCG	2	6	1923847	1923852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197027
43080	NC_012815	CGA	2	6	1923920	1923925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197027
43081	NC_012815	AGGC	2	8	1923984	1923991	25 %	0 %	50 %	25 %	241197027
43082	NC_012815	CACCG	2	10	1924007	1924016	20 %	0 %	20 %	60 %	241197028
43083	NC_012815	GCT	2	6	1924057	1924062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43084	NC_012815	GAG	2	6	1924127	1924132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241197028
43085	NC_012815	ACG	2	6	1924142	1924147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43086	NC_012815	GCC	2	6	1924160	1924165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43087	NC_012815	TCC	2	6	1924217	1924222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197028
43088	NC_012815	AAC	2	6	1924250	1924255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241197028
43089	NC_012815	CGC	2	6	1924405	1924410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43090	NC_012815	CTGC	2	8	1924439	1924446	0 %	25 %	25 %	50 %	241197028
43091	NC_012815	GAG	2	6	1924451	1924456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241197028
43092	NC_012815	GC	3	6	1924521	1924526	0 %	0 %	50 %	50 %	241197028
43093	NC_012815	CGA	2	6	1924642	1924647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43094	NC_012815	GCGG	2	8	1924666	1924673	0 %	0 %	75 %	25 %	241197028
43095	NC_012815	CCG	2	6	1924845	1924850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43096	NC_012815	GCC	2	6	1924928	1924933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43097	NC_012815	ACG	2	6	1924968	1924973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43098	NC_012815	GAT	2	6	1925087	1925092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197028
43099	NC_012815	CCG	2	6	1925103	1925108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43100	NC_012815	GGC	2	6	1925188	1925193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197028
43101	NC_012815	AGG	2	6	1925211	1925216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241197028
43102	NC_012815	CCG	2	6	1925235	1925240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43103	NC_012815	CTG	2	6	1925309	1925314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43104	NC_012815	CGC	2	6	1925350	1925355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197028
43105	NC_012815	AGG	2	6	1925373	1925378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241197028
43106	NC_012815	GCG	2	6	1925436	1925441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197028
43107	NC_012815	ATG	2	6	1925442	1925447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197028
43108	NC_012815	ACC	3	9	1925465	1925473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197028
43109	NC_012815	ACA	2	6	1925495	1925500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241197028
43110	NC_012815	CA	3	6	1925531	1925536	50 %	0 %	0 %	50 %	241197028
43111	NC_012815	TGC	2	6	1925568	1925573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43112	NC_012815	GCA	2	6	1925583	1925588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
43113	NC_012815	CGGG	2	8	1925592	1925599	0 %	0 %	75 %	25 %	241197028
43114	NC_012815	CAA	2	6	1925623	1925628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241197028
43115	NC_012815	CGA	2	6	1925662	1925667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
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43117	NC_012815	ACG	2	6	1925748	1925753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197028
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43232	NC_012815	CCG	2	6	1930326	1930331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43233	NC_012815	AAT	2	6	1930474	1930479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43234	NC_012815	ACAGC	2	10	1930511	1930520	40 %	0 %	20 %	40 %	241197030
43235	NC_012815	TCA	2	6	1930535	1930540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197030
43236	NC_012815	CCG	2	6	1930556	1930561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197030
43237	NC_012815	ATCT	2	8	1930576	1930583	25 %	50 %	0 %	25 %	241197030
43238	NC_012815	CGT	3	9	1930605	1930613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197030
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43241	NC_012815	CGA	2	6	1930758	1930763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197030
43242	NC_012815	CGG	2	6	1930772	1930777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197030
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43251	NC_012815	CGA	2	6	1931280	1931285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197030
43252	NC_012815	CGA	2	6	1931304	1931309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197030
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43255	NC_012815	GCCGC	2	10	1931414	1931423	0 %	0 %	40 %	60 %	241197030
43256	NC_012815	CCG	2	6	1931571	1931576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43257	NC_012815	GAT	2	6	1931594	1931599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197031
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43259	NC_012815	TGC	2	6	1931697	1931702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197031
43260	NC_012815	GTT	2	6	1931726	1931731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241197031
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43262	NC_012815	ATG	2	6	1931817	1931822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197031
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43264	NC_012815	GC	4	8	1931871	1931878	0 %	0 %	50 %	50 %	241197031
43265	NC_012815	CGC	2	6	1931900	1931905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197031
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43267	NC_012815	GT	3	6	1931947	1931952	0 %	50 %	50 %	0 %	241197031
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43302	NC_012815	AGC	2	6	1933241	1933246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197032
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43305	NC_012815	GC	3	6	1933389	1933394	0 %	0 %	50 %	50 %	241197032
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43323	NC_012815	TTC	2	6	1933975	1933980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43329	NC_012815	CCCAC	2	10	1934393	1934402	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43330	NC_012815	CTATAC	2	12	1934413	1934424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43331	NC_012815	GGC	2	6	1934486	1934491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43333	NC_012815	CGA	2	6	1934586	1934591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197033
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43335	NC_012815	GC	3	6	1934677	1934682	0 %	0 %	50 %	50 %	241197033
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43341	NC_012815	CA	3	6	1934962	1934967	50 %	0 %	0 %	50 %	241197033
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43348	NC_012815	TCG	2	6	1935296	1935301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197033
43349	NC_012815	TCA	2	6	1935303	1935308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197033
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43426	NC_012815	CGC	2	6	1938432	1938437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.