MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_012815	GCGCC	2	10	1878373	1878382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42003	NC_012815	ATC	2	6	1878515	1878520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196997
42004	NC_012815	GC	3	6	1878544	1878549	0 %	0 %	50 %	50 %	241196997
42005	NC_012815	TCA	2	6	1878590	1878595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196997
42006	NC_012815	ACC	2	6	1878740	1878745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196997
42007	NC_012815	CGT	2	6	1878774	1878779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196997
42008	NC_012815	CGCA	2	8	1878796	1878803	25 %	0 %	25 %	50 %	241196997
42009	NC_012815	CAC	2	6	1879003	1879008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196997
42010	NC_012815	CG	3	6	1879014	1879019	0 %	0 %	50 %	50 %	241196997
42011	NC_012815	CACG	2	8	1879041	1879048	25 %	0 %	25 %	50 %	241196997
42012	NC_012815	TCG	2	6	1879049	1879054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196997
42013	NC_012815	CGT	2	6	1879065	1879070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196997
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42015	NC_012815	GCA	2	6	1879168	1879173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196997
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42023	NC_012815	GCA	2	6	1879542	1879547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196997
42024	NC_012815	TCGT	2	8	1879556	1879563	0 %	50 %	25 %	25 %	241196997
42025	NC_012815	CGG	2	6	1879623	1879628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196997
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42044	NC_012815	TCGCCA	2	12	1880451	1880462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241196997
42045	NC_012815	GAG	2	6	1880473	1880478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42054	NC_012815	GC	3	6	1880863	1880868	0 %	0 %	50 %	50 %	241196998
42055	NC_012815	TGA	2	6	1880887	1880892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196998
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42062	NC_012815	GCG	2	6	1881228	1881233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196998
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42071	NC_012815	GC	3	6	1881651	1881656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42072	NC_012815	AC	4	8	1881680	1881687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42088	NC_012815	CAT	2	6	1882359	1882364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196999
42089	NC_012815	CA	3	6	1882377	1882382	50 %	0 %	0 %	50 %	241196999
42090	NC_012815	TCGC	2	8	1882390	1882397	0 %	25 %	25 %	50 %	241196999
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42102	NC_012815	GTC	2	6	1883114	1883119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197000
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42106	NC_012815	CGGC	2	8	1883200	1883207	0 %	0 %	50 %	50 %	241197000
42107	NC_012815	CCG	2	6	1883325	1883330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241197000
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42115	NC_012815	TCG	2	6	1883533	1883538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197000
42116	NC_012815	GCG	3	9	1883551	1883559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197000
42117	NC_012815	TCG	2	6	1883578	1883583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197000
42118	NC_012815	TGCC	2	8	1883632	1883639	0 %	25 %	25 %	50 %	241197000
42119	NC_012815	CTC	2	6	1883666	1883671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197000
42120	NC_012815	TTG	2	6	1883691	1883696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241197000
42121	NC_012815	TGAA	2	8	1883713	1883720	50 %	25 %	25 %	0 %	241197000
42122	NC_012815	GAT	2	6	1883792	1883797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197000
42123	NC_012815	CGG	2	6	1883830	1883835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197000
42124	NC_012815	TTGC	2	8	1883869	1883876	0 %	50 %	25 %	25 %	241197000
42125	NC_012815	A	6	6	1883913	1883918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42126	NC_012815	CG	3	6	1883920	1883925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42127	NC_012815	CTG	2	6	1883945	1883950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42128	NC_012815	CGTCAG	2	12	1884048	1884059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241197001
42129	NC_012815	CGA	3	9	1884064	1884072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197001
42130	NC_012815	GAT	2	6	1884143	1884148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197001
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42132	NC_012815	CCA	2	6	1884229	1884234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197001
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42135	NC_012815	CTT	2	6	1884365	1884370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241197001
42136	NC_012815	GTC	2	6	1884395	1884400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197001
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42139	NC_012815	GCGA	2	8	1884543	1884550	25 %	0 %	50 %	25 %	241197001
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42143	NC_012815	TCG	2	6	1884765	1884770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197001
42144	NC_012815	CG	3	6	1884787	1884792	0 %	0 %	50 %	50 %	241197001
42145	NC_012815	CCT	2	6	1884844	1884849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197001
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42150	NC_012815	ACC	2	6	1885197	1885202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197001
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42167	NC_012815	AAC	2	6	1885914	1885919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42168	NC_012815	TAG	2	6	1885945	1885950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42169	NC_012815	AATT	2	8	1885960	1885967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42170	NC_012815	GTA	2	6	1885975	1885980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197002
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42172	NC_012815	CGG	2	6	1886150	1886155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42173	NC_012815	ATG	2	6	1886165	1886170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42175	NC_012815	GCG	2	6	1886269	1886274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42176	NC_012815	AAAC	2	8	1886400	1886407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42177	NC_012815	ACC	2	6	1886417	1886422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42178	NC_012815	CGGT	2	8	1886426	1886433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42179	NC_012815	CGT	2	6	1886483	1886488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42181	NC_012815	AGG	2	6	1886514	1886519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42183	NC_012815	AGAT	2	8	1886696	1886703	50 %	25 %	25 %	0 %	241197003
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42205	NC_012815	CG	3	6	1887769	1887774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42206	NC_012815	GAC	2	6	1887994	1887999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42209	NC_012815	CGA	2	6	1888259	1888264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42210	NC_012815	CAG	2	6	1888266	1888271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42211	NC_012815	TCG	2	6	1888276	1888281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42212	NC_012815	ACGCCG	2	12	1888357	1888368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241197004
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42214	NC_012815	TGCG	2	8	1888486	1888493	0 %	25 %	50 %	25 %	241197004
42215	NC_012815	CG	3	6	1888492	1888497	0 %	0 %	50 %	50 %	241197004
42216	NC_012815	AGC	2	6	1888552	1888557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42217	NC_012815	GCGA	2	8	1888588	1888595	25 %	0 %	50 %	25 %	241197004
42218	NC_012815	GAA	2	6	1888611	1888616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241197004
42219	NC_012815	GTC	2	6	1888617	1888622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42220	NC_012815	TGG	2	6	1888748	1888753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197004
42221	NC_012815	CAT	2	6	1888766	1888771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197004
42222	NC_012815	CG	3	6	1888805	1888810	0 %	0 %	50 %	50 %	241197004
42223	NC_012815	CGG	2	6	1888859	1888864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197004
42224	NC_012815	TGCCA	2	10	1888929	1888938	20 %	20 %	20 %	40 %	241197004
42225	NC_012815	GAG	2	6	1888971	1888976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241197004
42226	NC_012815	CG	4	8	1888991	1888998	0 %	0 %	50 %	50 %	241197004
42227	NC_012815	GTA	2	6	1889022	1889027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241197004
42228	NC_012815	ATC	2	6	1889037	1889042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197004
42229	NC_012815	CCACG	2	10	1889078	1889087	20 %	0 %	20 %	60 %	241197004
42230	NC_012815	CGT	2	6	1889237	1889242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197004
42231	NC_012815	GGC	2	6	1889274	1889279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197004
42232	NC_012815	CTC	2	6	1889283	1889288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241197004
42233	NC_012815	GCTC	2	8	1889309	1889316	0 %	25 %	25 %	50 %	241197004
42234	NC_012815	CGAG	2	8	1889327	1889334	25 %	0 %	50 %	25 %	241197004
42235	NC_012815	AGC	2	6	1889539	1889544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197004
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42238	NC_012815	ATC	2	6	1889608	1889613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241197004
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42242	NC_012815	GGATT	2	10	1889815	1889824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42243	NC_012815	CCA	2	6	1889957	1889962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42244	NC_012815	CCT	2	6	1889991	1889996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42245	NC_012815	TTC	2	6	1890001	1890006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42247	NC_012815	TTGC	2	8	1890123	1890130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42248	NC_012815	CG	3	6	1890142	1890147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42249	NC_012815	GC	3	6	1890176	1890181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42250	NC_012815	TCA	2	6	1890304	1890309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42253	NC_012815	ACA	2	6	1890585	1890590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42257	NC_012815	GCC	2	6	1890841	1890846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42271	NC_012815	GGCC	2	8	1891341	1891348	0 %	0 %	50 %	50 %	241197005
42272	NC_012815	GCA	2	6	1891389	1891394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241197005
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42347	NC_012815	CAC	2	6	1894259	1894264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42348	NC_012815	GTAA	2	8	1894285	1894292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42349	NC_012815	TA	3	6	1894305	1894310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42450	NC_012815	TTCTCA	2	12	1898551	1898562	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241197011
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42454	NC_012815	GTT	2	6	1898717	1898722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241197011
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42459	NC_012815	TCG	2	6	1898836	1898841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
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42464	NC_012815	CTT	2	6	1899101	1899106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241197011
42465	NC_012815	CGG	2	6	1899107	1899112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241197011
42466	NC_012815	ACC	3	9	1899186	1899194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241197011
42467	NC_012815	CTG	2	6	1899228	1899233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
42468	NC_012815	TC	3	6	1899269	1899274	0 %	50 %	0 %	50 %	241197011
42469	NC_012815	GGT	2	6	1899275	1899280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241197011
42470	NC_012815	TCG	2	6	1899346	1899351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
42471	NC_012815	TGC	3	9	1899415	1899423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
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42473	NC_012815	GCT	2	6	1899473	1899478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
42474	NC_012815	TCG	2	6	1899508	1899513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241197011
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