MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_012815	CGCC	2	8	1853189	1853196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41502	NC_012815	CGG	2	6	1853269	1853274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41503	NC_012815	AGCGA	2	10	1853307	1853316	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41504	NC_012815	AGG	2	6	1853337	1853342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41505	NC_012815	CGG	2	6	1853437	1853442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196985
41506	NC_012815	GA	3	6	1853449	1853454	50 %	0 %	50 %	0 %	241196985
41507	NC_012815	TGC	2	6	1853458	1853463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41508	NC_012815	GAG	2	6	1853472	1853477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196985
41509	NC_012815	CGG	2	6	1853500	1853505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196985
41510	NC_012815	GCT	2	6	1853540	1853545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41511	NC_012815	TGC	2	6	1853605	1853610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41512	NC_012815	CGC	2	6	1853661	1853666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196985
41513	NC_012815	TTC	2	6	1853670	1853675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196985
41514	NC_012815	TGC	2	6	1853680	1853685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41515	NC_012815	ACG	2	6	1853690	1853695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41516	NC_012815	TCG	2	6	1853713	1853718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41517	NC_012815	CCT	2	6	1853719	1853724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196985
41518	NC_012815	CGA	2	6	1853732	1853737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41519	NC_012815	ATC	2	6	1853775	1853780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196985
41520	NC_012815	CG	3	6	1853800	1853805	0 %	0 %	50 %	50 %	241196985
41521	NC_012815	CGA	2	6	1853834	1853839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196985
41522	NC_012815	CA	3	6	1853840	1853845	50 %	0 %	0 %	50 %	241196985
41523	NC_012815	CGC	2	6	1853858	1853863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196985
41524	NC_012815	GC	3	6	1853862	1853867	0 %	0 %	50 %	50 %	241196985
41525	NC_012815	GCA	2	6	1853942	1853947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196985
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41527	NC_012815	CGC	2	6	1854033	1854038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196985
41528	NC_012815	TGCC	2	8	1854083	1854090	0 %	25 %	25 %	50 %	241196985
41529	NC_012815	AGG	2	6	1854091	1854096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196985
41530	NC_012815	ACA	2	6	1854178	1854183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196985
41531	NC_012815	CGG	2	6	1854313	1854318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196985
41532	NC_012815	ACG	2	6	1854413	1854418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41533	NC_012815	GGA	2	6	1854546	1854551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41534	NC_012815	T	6	6	1854555	1854560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41535	NC_012815	AGG	2	6	1854611	1854616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41536	NC_012815	CTC	2	6	1854637	1854642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41537	NC_012815	GAA	2	6	1854673	1854678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41538	NC_012815	CGA	2	6	1854755	1854760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41539	NC_012815	TGGCC	2	10	1854812	1854821	0 %	20 %	40 %	40 %	241196986
41540	NC_012815	CTC	2	6	1854837	1854842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196986
41541	NC_012815	CAT	2	6	1854849	1854854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196986
41542	NC_012815	CTG	2	6	1854873	1854878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41543	NC_012815	CCT	2	6	1854905	1854910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196986
41544	NC_012815	CGA	2	6	1854911	1854916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41545	NC_012815	GTG	2	6	1854958	1854963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196986
41546	NC_012815	GAC	2	6	1855008	1855013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41547	NC_012815	CGT	2	6	1855250	1855255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41548	NC_012815	GGT	2	6	1855287	1855292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196986
41549	NC_012815	AGGT	2	8	1855336	1855343	25 %	25 %	50 %	0 %	241196986
41550	NC_012815	TCC	2	6	1855378	1855383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196986
41551	NC_012815	CTT	2	6	1855491	1855496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196986
41552	NC_012815	GTC	2	6	1855506	1855511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41553	NC_012815	CTT	2	6	1855587	1855592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196986
41554	NC_012815	TTG	2	6	1855603	1855608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196986
41555	NC_012815	GAT	2	6	1855611	1855616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196986
41556	NC_012815	GTA	2	6	1855620	1855625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196986
41557	NC_012815	ACG	2	6	1855630	1855635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41558	NC_012815	GC	3	6	1855670	1855675	0 %	0 %	50 %	50 %	241196986
41559	NC_012815	TTG	3	9	1855681	1855689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196986
41560	NC_012815	CGG	2	6	1855721	1855726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196986
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41562	NC_012815	CTG	2	6	1855815	1855820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41563	NC_012815	GGC	2	6	1855833	1855838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196986
41564	NC_012815	CGG	2	6	1855904	1855909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196986
41565	NC_012815	CCTTGC	2	12	1855937	1855948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241196986
41566	NC_012815	CGT	2	6	1855949	1855954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41567	NC_012815	GCT	2	6	1855959	1855964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196986
41568	NC_012815	GCG	2	6	1855999	1856004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196986
41569	NC_012815	CAT	2	6	1856147	1856152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41570	NC_012815	GAC	2	6	1856325	1856330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41571	NC_012815	CGG	2	6	1856332	1856337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41572	NC_012815	AAC	2	6	1856413	1856418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196987
41573	NC_012815	ACG	2	6	1856423	1856428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41574	NC_012815	TGG	2	6	1856431	1856436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196987
41575	NC_012815	GGC	2	6	1856599	1856604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196987
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41577	NC_012815	CGA	2	6	1856661	1856666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41578	NC_012815	GCATG	2	10	1856688	1856697	20 %	20 %	40 %	20 %	241196987
41579	NC_012815	TCG	3	9	1856702	1856710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196987
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41582	NC_012815	G	6	6	1856863	1856868	0 %	0 %	100 %	0 %	241196987
41583	NC_012815	AGC	2	6	1856924	1856929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41584	NC_012815	GAA	2	6	1856943	1856948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196987
41585	NC_012815	AAG	2	6	1856971	1856976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196987
41586	NC_012815	GTGGA	2	10	1856999	1857008	20 %	20 %	60 %	0 %	241196987
41587	NC_012815	AAC	2	6	1857115	1857120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196987
41588	NC_012815	AGCACC	2	12	1857230	1857241	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241196987
41589	NC_012815	CG	4	8	1857246	1857253	0 %	0 %	50 %	50 %	241196987
41590	NC_012815	GCG	3	9	1857307	1857315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196987
41591	NC_012815	ACG	2	6	1857353	1857358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41592	NC_012815	ACC	3	9	1857367	1857375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196987
41593	NC_012815	TGA	2	6	1857380	1857385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196987
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41595	NC_012815	GCT	2	6	1857471	1857476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41596	NC_012815	CAC	2	6	1857486	1857491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196987
41597	NC_012815	GC	4	8	1857515	1857522	0 %	0 %	50 %	50 %	241196987
41598	NC_012815	GCG	2	6	1857532	1857537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196987
41599	NC_012815	GAG	2	6	1857586	1857591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196987
41600	NC_012815	ATC	2	6	1857626	1857631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196987
41601	NC_012815	CGA	3	9	1857717	1857725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41602	NC_012815	GCCG	2	8	1857807	1857814	0 %	0 %	50 %	50 %	241196987
41603	NC_012815	GCC	2	6	1857853	1857858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196987
41604	NC_012815	GAC	2	6	1857874	1857879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41605	NC_012815	CGA	2	6	1857942	1857947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41606	NC_012815	CGA	2	6	1857951	1857956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41607	NC_012815	CGATC	2	10	1858074	1858083	20 %	20 %	20 %	40 %	241196987
41608	NC_012815	GGT	2	6	1858101	1858106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196987
41609	NC_012815	CGA	2	6	1858125	1858130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41610	NC_012815	TGC	2	6	1858166	1858171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196987
41611	NC_012815	GGGC	2	8	1858223	1858230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41612	NC_012815	GCCC	2	8	1858288	1858295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41613	NC_012815	GGGCC	2	10	1858398	1858407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41614	NC_012815	GC	3	6	1858430	1858435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41615	NC_012815	CGGCC	2	10	1858459	1858468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41616	NC_012815	CCA	2	6	1858655	1858660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196988
41617	NC_012815	GCA	2	6	1858661	1858666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196988
41618	NC_012815	GCAGG	2	10	1858682	1858691	20 %	0 %	60 %	20 %	241196988
41619	NC_012815	GTGC	2	8	1858717	1858724	0 %	25 %	50 %	25 %	241196988
41620	NC_012815	GGC	2	6	1858725	1858730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196988
41621	NC_012815	TCC	2	6	1858732	1858737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196988
41622	NC_012815	CG	3	6	1858796	1858801	0 %	0 %	50 %	50 %	241196988
41623	NC_012815	TCA	2	6	1858816	1858821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196988
41624	NC_012815	AGTG	2	8	1858822	1858829	25 %	25 %	50 %	0 %	241196988
41625	NC_012815	GCCG	2	8	1858860	1858867	0 %	0 %	50 %	50 %	241196988
41626	NC_012815	GCT	2	6	1858877	1858882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196988
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41631	NC_012815	CG	4	8	1859265	1859272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41632	NC_012815	CG	3	6	1859280	1859285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41633	NC_012815	CA	3	6	1859370	1859375	50 %	0 %	0 %	50 %	241196989
41634	NC_012815	ACGA	2	8	1859382	1859389	50 %	0 %	25 %	25 %	241196989
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41636	NC_012815	AAC	2	6	1859448	1859453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196989
41637	NC_012815	AGC	2	6	1859473	1859478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196989
41638	NC_012815	TGG	2	6	1859545	1859550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196989
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41641	NC_012815	AGCGCA	2	12	1859740	1859751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196989
41642	NC_012815	GTT	2	6	1859816	1859821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41643	NC_012815	AAT	2	6	1859843	1859848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41644	NC_012815	ATT	2	6	1859865	1859870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196990
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41652	NC_012815	GCT	2	6	1860317	1860322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196990
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41654	NC_012815	CG	3	6	1860406	1860411	0 %	0 %	50 %	50 %	241196990
41655	NC_012815	TTC	2	6	1860420	1860425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196990
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41663	NC_012815	GCA	2	6	1860760	1860765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41665	NC_012815	CTG	2	6	1860949	1860954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41695	NC_012815	GGT	2	6	1862145	1862150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41696	NC_012815	GCG	2	6	1862180	1862185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41697	NC_012815	GCC	2	6	1862286	1862291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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41699	NC_012815	GCC	2	6	1862380	1862385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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41702	NC_012815	CA	3	6	1862505	1862510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41703	NC_012815	G	8	8	1862516	1862523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41704	NC_012815	TCCC	2	8	1862579	1862586	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41705	NC_012815	CCT	2	6	1862673	1862678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41708	NC_012815	CCA	2	6	1863161	1863166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41709	NC_012815	ACC	2	6	1863405	1863410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41710	NC_012815	CAC	2	6	1863433	1863438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41711	NC_012815	GCC	2	6	1863583	1863588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41712	NC_012815	ACC	2	6	1863704	1863709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41713	NC_012815	GGC	2	6	1863729	1863734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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41716	NC_012815	ACC	2	6	1863872	1863877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41717	NC_012815	CGGC	2	8	1863882	1863889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41718	NC_012815	AGG	2	6	1863955	1863960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41719	NC_012815	GGTC	2	8	1864011	1864018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41720	NC_012815	GAC	2	6	1864101	1864106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41721	NC_012815	CA	3	6	1864189	1864194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41722	NC_012815	CGC	2	6	1864214	1864219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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41724	NC_012815	CCT	2	6	1864374	1864379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41725	NC_012815	GAC	2	6	1864435	1864440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41726	NC_012815	CGA	2	6	1864461	1864466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41727	NC_012815	CCG	2	6	1864480	1864485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41728	NC_012815	C	6	6	1864573	1864578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41729	NC_012815	TCC	2	6	1864703	1864708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41730	NC_012815	ATC	2	6	1864747	1864752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41731	NC_012815	CTCCC	2	10	1864940	1864949	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41732	NC_012815	CCAT	2	8	1865077	1865084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41733	NC_012815	GCAT	2	8	1865153	1865160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41734	NC_012815	CAC	2	6	1865165	1865170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41735	NC_012815	GC	3	6	1865215	1865220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41736	NC_012815	CAT	2	6	1865256	1865261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41737	NC_012815	TCGC	2	8	1865268	1865275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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