MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_012815	CAT	2	6	1831454	1831459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196967
41002	NC_012815	GCC	2	6	1831547	1831552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41003	NC_012815	GC	3	6	1831605	1831610	0 %	0 %	50 %	50 %	241196968
41004	NC_012815	CCG	2	6	1831623	1831628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196968
41005	NC_012815	TGC	2	6	1831701	1831706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196968
41006	NC_012815	CGG	2	6	1831716	1831721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196968
41007	NC_012815	TCC	2	6	1831784	1831789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196968
41008	NC_012815	CTGA	2	8	1831837	1831844	25 %	25 %	25 %	25 %	241196968
41009	NC_012815	CAC	2	6	1831918	1831923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196968
41010	NC_012815	GACC	2	8	1831977	1831984	25 %	0 %	25 %	50 %	241196968
41011	NC_012815	CTC	2	6	1832154	1832159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196969
41012	NC_012815	CGC	2	6	1832168	1832173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41013	NC_012815	CGA	2	6	1832249	1832254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41014	NC_012815	GCCGGT	2	12	1832259	1832270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196969
41015	NC_012815	CGCGCA	2	12	1832291	1832302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241196969
41016	NC_012815	CGC	2	6	1832309	1832314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41017	NC_012815	GCC	2	6	1832496	1832501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41018	NC_012815	CTGGC	2	10	1832505	1832514	0 %	20 %	40 %	40 %	241196969
41019	NC_012815	GATCTT	2	12	1832529	1832540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241196969
41020	NC_012815	TTC	2	6	1832548	1832553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196969
41021	NC_012815	CGG	2	6	1832558	1832563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196969
41022	NC_012815	CTT	2	6	1832580	1832585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196969
41023	NC_012815	GTC	2	6	1832658	1832663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41024	NC_012815	GCGGG	2	10	1832678	1832687	0 %	0 %	80 %	20 %	241196969
41025	NC_012815	CCT	2	6	1832734	1832739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196969
41026	NC_012815	GCC	2	6	1832745	1832750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41027	NC_012815	GTC	2	6	1832784	1832789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41028	NC_012815	GCC	3	9	1832808	1832816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41029	NC_012815	CCG	2	6	1832842	1832847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41030	NC_012815	GCCACC	2	12	1832850	1832861	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241196969
41031	NC_012815	CCG	4	12	1832908	1832919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196969
41032	NC_012815	CGT	2	6	1832966	1832971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41033	NC_012815	CGT	2	6	1833002	1833007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41034	NC_012815	CCTT	2	8	1833040	1833047	0 %	50 %	0 %	50 %	241196969
41035	NC_012815	TTG	2	6	1833052	1833057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196969
41036	NC_012815	TCG	2	6	1833112	1833117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41037	NC_012815	TGC	2	6	1833179	1833184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196969
41038	NC_012815	CCT	2	6	1833189	1833194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41039	NC_012815	CATG	2	8	1833247	1833254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41040	NC_012815	ACC	2	6	1833329	1833334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196970
41041	NC_012815	CG	3	6	1833343	1833348	0 %	0 %	50 %	50 %	241196970
41042	NC_012815	TGG	2	6	1833447	1833452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196970
41043	NC_012815	GTC	2	6	1833577	1833582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196970
41044	NC_012815	GAT	2	6	1833613	1833618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196970
41045	NC_012815	CTG	2	6	1833622	1833627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196970
41046	NC_012815	CTT	2	6	1833646	1833651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196970
41047	NC_012815	TGCGGT	2	12	1833654	1833665	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241196970
41048	NC_012815	TGA	2	6	1833669	1833674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196970
41049	NC_012815	CG	3	6	1833679	1833684	0 %	0 %	50 %	50 %	241196970
41050	NC_012815	CGG	2	6	1833711	1833716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196970
41051	NC_012815	CTTC	2	8	1833717	1833724	0 %	50 %	0 %	50 %	241196970
41052	NC_012815	TGGCC	2	10	1833726	1833735	0 %	20 %	40 %	40 %	241196970
41053	NC_012815	GGC	2	6	1833775	1833780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196970
41054	NC_012815	CGG	2	6	1833849	1833854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196970
41055	NC_012815	GTC	2	6	1833868	1833873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196970
41056	NC_012815	GCT	2	6	1833879	1833884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196970
41057	NC_012815	TCG	2	6	1833947	1833952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196970
41058	NC_012815	TTG	2	6	1834003	1834008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196971
41059	NC_012815	GTC	3	9	1834014	1834022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41060	NC_012815	TCG	2	6	1834051	1834056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41061	NC_012815	GTT	2	6	1834062	1834067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196971
41062	NC_012815	CGG	2	6	1834082	1834087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196971
41063	NC_012815	CTG	2	6	1834110	1834115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
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41065	NC_012815	TCA	2	6	1834151	1834156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196971
41066	NC_012815	GGC	2	6	1834167	1834172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196971
41067	NC_012815	TCT	2	6	1834178	1834183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196971
41068	NC_012815	GTC	2	6	1834188	1834193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41069	NC_012815	TTG	2	6	1834267	1834272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196971
41070	NC_012815	GTT	2	6	1834314	1834319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196971
41071	NC_012815	CTT	2	6	1834344	1834349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196971
41072	NC_012815	GTC	2	6	1834350	1834355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41073	NC_012815	ATC	2	6	1834381	1834386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196971
41074	NC_012815	CTTC	2	8	1834397	1834404	0 %	50 %	0 %	50 %	241196971
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41077	NC_012815	ACGG	2	8	1834621	1834628	25 %	0 %	50 %	25 %	241196971
41078	NC_012815	CGG	2	6	1834640	1834645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196971
41079	NC_012815	ATG	2	6	1834705	1834710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196971
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41082	NC_012815	TGA	2	6	1834781	1834786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196971
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41084	NC_012815	GCC	2	6	1834854	1834859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196971
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41086	NC_012815	GCC	2	6	1834905	1834910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196971
41087	NC_012815	GTT	2	6	1834965	1834970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196971
41088	NC_012815	TCG	2	6	1835038	1835043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41089	NC_012815	GTG	2	6	1835095	1835100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196971
41090	NC_012815	GAG	2	6	1835107	1835112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196971
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41092	NC_012815	CTTC	2	8	1835141	1835148	0 %	50 %	0 %	50 %	241196971
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41099	NC_012815	CAG	2	6	1835322	1835327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41100	NC_012815	GCC	3	9	1835343	1835351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196971
41101	NC_012815	CGGT	2	8	1835417	1835424	0 %	25 %	50 %	25 %	241196971
41102	NC_012815	TGA	2	6	1835429	1835434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196971
41103	NC_012815	GCAGG	2	10	1835506	1835515	20 %	0 %	60 %	20 %	241196971
41104	NC_012815	GCTTCA	2	12	1835564	1835575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241196971
41105	NC_012815	CGA	2	6	1835714	1835719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196971
41106	NC_012815	CCA	2	6	1835744	1835749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196971
41107	NC_012815	GTG	2	6	1835758	1835763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196971
41108	NC_012815	CGGT	2	8	1835789	1835796	0 %	25 %	50 %	25 %	241196971
41109	NC_012815	TGG	2	6	1835828	1835833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196971
41110	NC_012815	GCCG	2	8	1835923	1835930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41111	NC_012815	CT	3	6	1835943	1835948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41112	NC_012815	A	7	7	1836019	1836025	100 %	0 %	0 %	0 %	241196972
41113	NC_012815	CAA	2	6	1836130	1836135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196972
41114	NC_012815	GCG	2	6	1836136	1836141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196972
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41116	NC_012815	CTTG	2	8	1836264	1836271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41117	NC_012815	CAATCT	2	12	1836272	1836283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41233	NC_012815	GAA	2	6	1841208	1841213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196976
41234	NC_012815	GTC	2	6	1841364	1841369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196977
41235	NC_012815	GTT	2	6	1841482	1841487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196977
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41237	NC_012815	ATC	2	6	1841618	1841623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196977
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41240	NC_012815	GGC	2	6	1841686	1841691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196977
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41244	NC_012815	TCG	2	6	1841787	1841792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196977
41245	NC_012815	GCT	2	6	1841797	1841802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196977
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41251	NC_012815	GAT	2	6	1841959	1841964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196977
41252	NC_012815	ATG	2	6	1841981	1841986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196977
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41254	NC_012815	GAA	2	6	1842073	1842078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196977
41255	NC_012815	TTG	2	6	1842104	1842109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196977
41256	NC_012815	ATG	2	6	1842149	1842154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196977
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41260	NC_012815	CTG	2	6	1842367	1842372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196978
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41262	NC_012815	ATG	2	6	1842415	1842420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196978
41263	NC_012815	GTT	2	6	1842447	1842452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196978
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41297	NC_012815	CT	3	6	1843756	1843761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41298	NC_012815	CGCCC	2	10	1843991	1844000	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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41325	NC_012815	TTCCT	2	10	1845293	1845302	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41326	NC_012815	TCG	2	6	1845380	1845385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41327	NC_012815	AGC	2	6	1845558	1845563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196980
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41331	NC_012815	CGC	2	6	1845824	1845829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196980
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41333	NC_012815	TGC	2	6	1845853	1845858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196980
41334	NC_012815	ACG	2	6	1845934	1845939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196980
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41336	NC_012815	CGG	2	6	1845995	1846000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196980
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41338	NC_012815	GC	3	6	1846008	1846013	0 %	0 %	50 %	50 %	241196980
41339	NC_012815	CTT	2	6	1846034	1846039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196980
41340	NC_012815	GGCA	2	8	1846090	1846097	25 %	0 %	50 %	25 %	241196980
41341	NC_012815	CGA	2	6	1846109	1846114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196980
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41343	NC_012815	CGA	2	6	1846322	1846327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196980
41344	NC_012815	TGC	3	9	1846402	1846410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196980
41345	NC_012815	CGACAC	2	12	1846412	1846423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241196980
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41347	NC_012815	TCA	2	6	1846549	1846554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196980
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41366	NC_012815	GCCG	2	8	1847384	1847391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41367	NC_012815	CGG	2	6	1847395	1847400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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41452	NC_012815	GA	4	8	1851034	1851041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41453	NC_012815	AGGA	2	8	1851044	1851051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41454	NC_012815	CAC	2	6	1851164	1851169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41460	NC_012815	GCA	2	6	1851393	1851398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196983
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41462	NC_012815	GAA	2	6	1851478	1851483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196983
41463	NC_012815	GAACAG	2	12	1851691	1851702	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241196983
41464	NC_012815	AGC	2	6	1851710	1851715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196983
41465	NC_012815	GGC	2	6	1851718	1851723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196983
41466	NC_012815	GTT	2	6	1851727	1851732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196983
41467	NC_012815	CCA	2	6	1851745	1851750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196983
41468	NC_012815	TGA	2	6	1851798	1851803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196983
41469	NC_012815	GAA	2	6	1851826	1851831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196983
41470	NC_012815	CGA	2	6	1851870	1851875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196983
41471	NC_012815	TGCCT	2	10	1851919	1851928	0 %	40 %	20 %	40 %	241196983
41472	NC_012815	AGC	2	6	1851941	1851946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196983
41473	NC_012815	ATC	2	6	1851980	1851985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196983
41474	NC_012815	GAA	2	6	1851988	1851993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196983
41475	NC_012815	CCT	2	6	1852043	1852048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196984
41476	NC_012815	GTG	2	6	1852054	1852059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196984
41477	NC_012815	CCA	2	6	1852088	1852093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196984
41478	NC_012815	GAA	2	6	1852098	1852103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196984
41479	NC_012815	CAT	2	6	1852284	1852289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196984
41480	NC_012815	GAT	3	9	1852296	1852304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196984
41481	NC_012815	GGC	2	6	1852319	1852324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196984
41482	NC_012815	GAT	2	6	1852392	1852397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196984
41483	NC_012815	CAT	2	6	1852398	1852403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196984
41484	NC_012815	CTG	2	6	1852413	1852418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196984
41485	NC_012815	GAGC	2	8	1852470	1852477	25 %	0 %	50 %	25 %	241196984
41486	NC_012815	AGC	3	9	1852504	1852512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196984
41487	NC_012815	ATG	2	6	1852531	1852536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196984
41488	NC_012815	CCG	2	6	1852537	1852542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196984
41489	NC_012815	GAA	2	6	1852557	1852562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196984
41490	NC_012815	CGA	2	6	1852625	1852630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196984
41491	NC_012815	TGG	2	6	1852643	1852648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196984
41492	NC_012815	GC	4	8	1852708	1852715	0 %	0 %	50 %	50 %	241196984
41493	NC_012815	GTG	2	6	1852753	1852758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196984
41494	NC_012815	CGA	2	6	1852820	1852825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196984
41495	NC_012815	GCA	2	6	1852832	1852837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196984
41496	NC_012815	CCA	2	6	1852848	1852853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196984
41497	NC_012815	CAC	2	6	1852922	1852927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41498	NC_012815	TCT	2	6	1853014	1853019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41499	NC_012815	TCGTG	2	10	1853035	1853044	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41500	NC_012815	CTT	2	6	1853057	1853062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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