MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_012815	CGAA	2	8	1744924	1744931	50 %	0 %	25 %	25 %	241196903
39003	NC_012815	GC	3	6	1744950	1744955	0 %	0 %	50 %	50 %	241196903
39004	NC_012815	GTT	2	6	1744993	1744998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196903
39005	NC_012815	CGC	2	6	1745009	1745014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196903
39006	NC_012815	GCA	2	6	1745134	1745139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196903
39007	NC_012815	CTC	2	6	1745156	1745161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196903
39008	NC_012815	GAT	2	6	1745168	1745173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196903
39009	NC_012815	CGC	2	6	1745242	1745247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196903
39010	NC_012815	CTG	2	6	1745289	1745294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39011	NC_012815	ACA	2	6	1745353	1745358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39012	NC_012815	CCT	2	6	1745399	1745404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39013	NC_012815	AGG	2	6	1745411	1745416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39014	NC_012815	TC	3	6	1745448	1745453	0 %	50 %	0 %	50 %	241196904
39015	NC_012815	GCT	3	9	1745463	1745471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39016	NC_012815	GCG	2	6	1745501	1745506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196904
39017	NC_012815	CAG	2	6	1745518	1745523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39018	NC_012815	CCA	2	6	1745526	1745531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196904
39019	NC_012815	CGC	2	6	1745551	1745556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196904
39020	NC_012815	TTC	2	6	1745591	1745596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196904
39021	NC_012815	CAG	2	6	1745638	1745643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39022	NC_012815	CAT	2	6	1745682	1745687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196904
39023	NC_012815	TGC	2	6	1745805	1745810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39024	NC_012815	TCC	2	6	1745813	1745818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196904
39025	NC_012815	CCA	2	6	1745849	1745854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196904
39026	NC_012815	TAGGTG	2	12	1745864	1745875	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241196904
39027	NC_012815	TGC	2	6	1745885	1745890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39028	NC_012815	CTT	2	6	1745977	1745982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196904
39029	NC_012815	GAGCTG	2	12	1745983	1745994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241196904
39030	NC_012815	CCG	2	6	1746047	1746052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196904
39031	NC_012815	GTCACC	2	12	1746110	1746121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241196904
39032	NC_012815	TGT	2	6	1746180	1746185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196904
39033	NC_012815	TCAG	2	8	1746284	1746291	25 %	25 %	25 %	25 %	241196904
39034	NC_012815	TTC	2	6	1746320	1746325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196904
39035	NC_012815	GAT	2	6	1746373	1746378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196904
39036	NC_012815	CAT	2	6	1746405	1746410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196904
39037	NC_012815	GCG	2	6	1746495	1746500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196904
39038	NC_012815	ATG	2	6	1746593	1746598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196904
39039	NC_012815	GCT	2	6	1746738	1746743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39040	NC_012815	TTG	2	6	1746797	1746802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196904
39041	NC_012815	CGT	2	6	1746835	1746840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196904
39042	NC_012815	CTT	2	6	1746880	1746885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196904
39043	NC_012815	CGG	2	6	1747098	1747103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196904
39044	NC_012815	TGT	2	6	1747149	1747154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39045	NC_012815	ACGC	2	8	1747177	1747184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39046	NC_012815	AC	3	6	1747233	1747238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39047	NC_012815	GTT	2	6	1747257	1747262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39048	NC_012815	AGG	2	6	1747281	1747286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39049	NC_012815	TTG	2	6	1747498	1747503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196905
39050	NC_012815	GTC	2	6	1747512	1747517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196905
39051	NC_012815	GCGTC	2	10	1747772	1747781	0 %	20 %	40 %	40 %	241196905
39052	NC_012815	AACGTG	2	12	1747834	1747845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196905
39053	NC_012815	GTCC	2	8	1747860	1747867	0 %	25 %	25 %	50 %	241196905
39054	NC_012815	CAG	2	6	1748039	1748044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196905
39055	NC_012815	CACGT	2	10	1748137	1748146	20 %	20 %	20 %	40 %	241196905
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39058	NC_012815	CGA	2	6	1748346	1748351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196905
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39060	NC_012815	T	6	6	1748392	1748397	0 %	100 %	0 %	0 %	241196905
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39065	NC_012815	TAG	3	9	1748761	1748769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196905
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39072	NC_012815	CGG	2	6	1749110	1749115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196905
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39077	NC_012815	ATCTTG	2	12	1749453	1749464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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39083	NC_012815	TCG	2	6	1749670	1749675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39084	NC_012815	CCG	2	6	1749791	1749796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39085	NC_012815	CGGC	2	8	1749800	1749807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39086	NC_012815	TCG	2	6	1749814	1749819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39087	NC_012815	GGC	2	6	1749825	1749830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39088	NC_012815	CA	3	6	1749869	1749874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39089	NC_012815	CTTC	2	8	1749909	1749916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39090	NC_012815	AATC	2	8	1750001	1750008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39091	NC_012815	T	6	6	1750029	1750034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39092	NC_012815	AC	3	6	1750043	1750048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39093	NC_012815	CAA	2	6	1750134	1750139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39094	NC_012815	CGC	2	6	1750154	1750159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39095	NC_012815	AT	3	6	1750160	1750165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39096	NC_012815	ACC	2	6	1750218	1750223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39097	NC_012815	ATT	2	6	1750245	1750250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196906
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39099	NC_012815	GC	3	6	1750304	1750309	0 %	0 %	50 %	50 %	241196906
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39106	NC_012815	GTC	2	6	1750528	1750533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196906
39107	NC_012815	AGT	2	6	1750599	1750604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196906
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39110	NC_012815	GCAG	2	8	1750697	1750704	25 %	0 %	50 %	25 %	241196906
39111	NC_012815	GCCCC	2	10	1750722	1750731	0 %	0 %	20 %	80 %	241196906
39112	NC_012815	CCT	2	6	1750743	1750748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196906
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39118	NC_012815	GCT	2	6	1751055	1751060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196906
39119	NC_012815	CGA	2	6	1751062	1751067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196906
39120	NC_012815	CAC	3	9	1751098	1751106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196906
39121	NC_012815	CGA	2	6	1751109	1751114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196906
39122	NC_012815	CAC	2	6	1751179	1751184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196906
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39125	NC_012815	GCA	2	6	1751297	1751302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39126	NC_012815	TCG	2	6	1751364	1751369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196907
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39129	NC_012815	CG	3	6	1751429	1751434	0 %	0 %	50 %	50 %	241196907
39130	NC_012815	TCG	2	6	1751510	1751515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196907
39131	NC_012815	GC	3	6	1751523	1751528	0 %	0 %	50 %	50 %	241196907
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39134	NC_012815	GGC	2	6	1751566	1751571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196907
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39153	NC_012815	CTC	2	6	1752058	1752063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196907
39154	NC_012815	CTG	2	6	1752109	1752114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196907
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39156	NC_012815	CG	3	6	1752249	1752254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39157	NC_012815	GC	4	8	1752282	1752289	0 %	0 %	50 %	50 %	241196908
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39204	NC_012815	GC	3	6	1754271	1754276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39205	NC_012815	CG	3	6	1754281	1754286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39206	NC_012815	A	6	6	1754301	1754306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39207	NC_012815	TGCA	2	8	1754327	1754334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39208	NC_012815	CAG	2	6	1754388	1754393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196910
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39220	NC_012815	GCA	2	6	1754627	1754632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196910
39221	NC_012815	GC	3	6	1754635	1754640	0 %	0 %	50 %	50 %	241196910
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39224	NC_012815	TGA	2	6	1754674	1754679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196910
39225	NC_012815	AGT	2	6	1754680	1754685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196910
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39227	NC_012815	GTCG	2	8	1754705	1754712	0 %	25 %	50 %	25 %	241196910
39228	NC_012815	GTA	2	6	1754765	1754770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196910
39229	NC_012815	GAT	2	6	1754819	1754824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196910
39230	NC_012815	GCA	2	6	1754830	1754835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196910
39231	NC_012815	GC	3	6	1754896	1754901	0 %	0 %	50 %	50 %	241196910
39232	NC_012815	CAGC	2	8	1754966	1754973	25 %	0 %	25 %	50 %	241196910
39233	NC_012815	CGG	2	6	1755061	1755066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196910
39234	NC_012815	TCT	3	9	1755108	1755116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39235	NC_012815	A	6	6	1755196	1755201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39354	NC_012815	ACG	2	6	1759956	1759961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196919
39355	NC_012815	CGG	2	6	1760018	1760023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196919
39356	NC_012815	TTCA	2	8	1760037	1760044	25 %	50 %	0 %	25 %	241196919
39357	NC_012815	CAT	2	6	1760090	1760095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196919
39358	NC_012815	GGTGA	2	10	1760097	1760106	20 %	20 %	60 %	0 %	241196919
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39360	NC_012815	CGA	2	6	1760129	1760134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196919
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39362	NC_012815	TCG	2	6	1760209	1760214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196919
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39368	NC_012815	C	7	7	1760596	1760602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39369	NC_012815	GGA	2	6	1760630	1760635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39370	NC_012815	GAG	2	6	1760641	1760646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39371	NC_012815	TGG	2	6	1760653	1760658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39372	NC_012815	AGCCG	2	10	1760669	1760678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39373	NC_012815	ATGAG	2	10	1760679	1760688	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39374	NC_012815	TCGGC	2	10	1760726	1760735	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39375	NC_012815	CCA	2	6	1760747	1760752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39376	NC_012815	GCG	2	6	1760799	1760804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196920
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39385	NC_012815	GCA	2	6	1761133	1761138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196920
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39390	NC_012815	CGA	2	6	1761314	1761319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196920
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39401	NC_012815	TAC	2	6	1761803	1761808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39402	NC_012815	GC	3	6	1761827	1761832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39403	NC_012815	TCC	2	6	1761876	1761881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196921
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39406	NC_012815	CAC	3	9	1761965	1761973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196921
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39408	NC_012815	GAT	2	6	1761983	1761988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196921
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39453	NC_012815	TGCA	2	8	1763368	1763375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39454	NC_012815	TCT	2	6	1763392	1763397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39463	NC_012815	GC	3	6	1763891	1763896	0 %	0 %	50 %	50 %	241196922
39464	NC_012815	GCT	2	6	1763921	1763926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196922
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