MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_012815	GAAC	2	8	1653699	1653706	50 %	0 %	25 %	25 %	241196832
37003	NC_012815	AGC	2	6	1653787	1653792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196832
37004	NC_012815	CCG	2	6	1653813	1653818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196832
37005	NC_012815	AAT	2	6	1653909	1653914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196832
37006	NC_012815	ACC	2	6	1653988	1653993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196832
37007	NC_012815	CGAA	2	8	1654147	1654154	50 %	0 %	25 %	25 %	241196832
37008	NC_012815	GAT	2	6	1654246	1654251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196832
37009	NC_012815	GAG	2	6	1654280	1654285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196832
37010	NC_012815	TGC	2	6	1654295	1654300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196832
37011	NC_012815	ATC	2	6	1654348	1654353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196832
37012	NC_012815	TAC	2	6	1654389	1654394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196832
37013	NC_012815	CCA	2	6	1654423	1654428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196832
37014	NC_012815	CCT	2	6	1654572	1654577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196832
37015	NC_012815	TA	3	6	1654587	1654592	50 %	50 %	0 %	0 %	241196832
37016	NC_012815	GAT	2	6	1654671	1654676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37017	NC_012815	CGATG	2	10	1654703	1654712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37018	NC_012815	ATT	2	6	1654776	1654781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37019	NC_012815	T	6	6	1654795	1654800	0 %	100 %	0 %	0 %	241196833
37020	NC_012815	T	7	7	1654804	1654810	0 %	100 %	0 %	0 %	241196833
37021	NC_012815	CAG	2	6	1654811	1654816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196833
37022	NC_012815	ACT	2	6	1654818	1654823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196833
37023	NC_012815	AAT	2	6	1654829	1654834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196833
37024	NC_012815	CTT	2	6	1654860	1654865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196833
37025	NC_012815	CGG	2	6	1654966	1654971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196833
37026	NC_012815	GAT	3	9	1655046	1655054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196833
37027	NC_012815	CTG	2	6	1655064	1655069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196833
37028	NC_012815	CCA	2	6	1655081	1655086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196833
37029	NC_012815	AGT	2	6	1655088	1655093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196833
37030	NC_012815	ATG	2	6	1655149	1655154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196833
37031	NC_012815	CAG	2	6	1655228	1655233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196833
37032	NC_012815	ATCGAT	2	12	1655238	1655249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241196833
37033	NC_012815	GCG	3	9	1655320	1655328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196833
37034	NC_012815	TGG	2	6	1655342	1655347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196833
37035	NC_012815	AAC	2	6	1655376	1655381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196833
37036	NC_012815	CGG	2	6	1655440	1655445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196833
37037	NC_012815	ATC	2	6	1655508	1655513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196833
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37039	NC_012815	GCC	2	6	1655605	1655610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196833
37040	NC_012815	AAT	2	6	1655619	1655624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196833
37041	NC_012815	ACC	2	6	1655628	1655633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196833
37042	NC_012815	ACA	2	6	1655758	1655763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196833
37043	NC_012815	GCGG	2	8	1655796	1655803	0 %	0 %	75 %	25 %	241196833
37044	NC_012815	AT	3	6	1655983	1655988	50 %	50 %	0 %	0 %	241196833
37045	NC_012815	GTG	2	6	1656058	1656063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196833
37046	NC_012815	CAC	2	6	1656117	1656122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196833
37047	NC_012815	AGA	2	6	1656439	1656444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37048	NC_012815	CT	3	6	1656448	1656453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37049	NC_012815	GAG	2	6	1656456	1656461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37050	NC_012815	AGAGAA	2	12	1656539	1656550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37051	NC_012815	ATC	2	6	1656782	1656787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37052	NC_012815	GCC	2	6	1656845	1656850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37053	NC_012815	GGTC	2	8	1656856	1656863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37054	NC_012815	AGG	2	6	1656881	1656886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37055	NC_012815	GC	3	6	1656947	1656952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37056	NC_012815	CAG	2	6	1657082	1657087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37057	NC_012815	CGA	3	9	1657101	1657109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37058	NC_012815	AAG	2	6	1657155	1657160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196834
37059	NC_012815	CGAGAG	2	12	1657226	1657237	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241196834
37060	NC_012815	GAC	2	6	1657241	1657246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37061	NC_012815	CGC	2	6	1657349	1657354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196834
37062	NC_012815	CGG	2	6	1657468	1657473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196834
37063	NC_012815	CTG	2	6	1657486	1657491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37064	NC_012815	ACG	2	6	1657528	1657533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37065	NC_012815	GAG	2	6	1657551	1657556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196834
37066	NC_012815	CAAG	2	8	1657565	1657572	50 %	0 %	25 %	25 %	241196834
37067	NC_012815	CGA	2	6	1657604	1657609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37068	NC_012815	GCA	2	6	1657610	1657615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37069	NC_012815	AGCG	2	8	1657626	1657633	25 %	0 %	50 %	25 %	241196834
37070	NC_012815	CGA	2	6	1657646	1657651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196834
37071	NC_012815	GA	3	6	1657654	1657659	50 %	0 %	50 %	0 %	241196834
37072	NC_012815	AGG	3	9	1657675	1657683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196834
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37076	NC_012815	GC	4	8	1657758	1657765	0 %	0 %	50 %	50 %	241196834
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37082	NC_012815	GGC	2	6	1657987	1657992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196834
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37085	NC_012815	TCG	2	6	1658027	1658032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37088	NC_012815	CA	3	6	1658170	1658175	50 %	0 %	0 %	50 %	241196835
37089	NC_012815	TA	3	6	1658188	1658193	50 %	50 %	0 %	0 %	241196835
37090	NC_012815	AGC	2	6	1658204	1658209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196835
37091	NC_012815	ATG	2	6	1658219	1658224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196835
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37097	NC_012815	GC	3	6	1658552	1658557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37098	NC_012815	GGAG	2	8	1658597	1658604	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37099	NC_012815	GTG	2	6	1658618	1658623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37100	NC_012815	CTG	2	6	1658659	1658664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37101	NC_012815	GCC	2	6	1658731	1658736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37102	NC_012815	C	6	6	1658735	1658740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37103	NC_012815	TCG	2	6	1658789	1658794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37104	NC_012815	GT	3	6	1658821	1658826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37105	NC_012815	TCA	2	6	1658839	1658844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37107	NC_012815	GGC	2	6	1658959	1658964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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37110	NC_012815	GCG	2	6	1659046	1659051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37111	NC_012815	TCG	2	6	1659069	1659074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196836
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37118	NC_012815	GCG	2	6	1659242	1659247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196836
37119	NC_012815	GCT	2	6	1659287	1659292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196836
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37122	NC_012815	TCG	2	6	1659445	1659450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196836
37123	NC_012815	CTG	2	6	1659486	1659491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196836
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37125	NC_012815	GGC	2	6	1659546	1659551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196836
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37132	NC_012815	CTG	2	6	1659771	1659776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196836
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37146	NC_012815	AAC	3	9	1660542	1660550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37147	NC_012815	ACAT	2	8	1660612	1660619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37148	NC_012815	A	6	6	1660633	1660638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37183	NC_012815	CGA	2	6	1662176	1662181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196838
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37210	NC_012815	CTGT	2	8	1663205	1663212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37211	NC_012815	CCG	2	6	1663224	1663229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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37341	NC_012815	CCG	2	6	1667764	1667769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196841
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37347	NC_012815	CG	3	6	1667957	1667962	0 %	0 %	50 %	50 %	241196841
37348	NC_012815	GTTC	2	8	1668005	1668012	0 %	50 %	25 %	25 %	241196841
37349	NC_012815	GC	3	6	1668078	1668083	0 %	0 %	50 %	50 %	241196841
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37460	NC_012815	TCT	2	6	1673052	1673057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196846
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37467	NC_012815	TTC	2	6	1673388	1673393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196847
37468	NC_012815	CTCG	2	8	1673412	1673419	0 %	25 %	25 %	50 %	241196847
37469	NC_012815	GGA	2	6	1673487	1673492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196847
37470	NC_012815	AGT	2	6	1673591	1673596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196847
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37472	NC_012815	TCGC	2	8	1673680	1673687	0 %	25 %	25 %	50 %	241196847
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37477	NC_012815	TCC	2	6	1673809	1673814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196847
37478	NC_012815	TGCC	2	8	1673827	1673834	0 %	25 %	25 %	50 %	241196847
37479	NC_012815	ACC	2	6	1673844	1673849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196847
37480	NC_012815	GCG	2	6	1673988	1673993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196847
37481	NC_012815	CG	3	6	1673992	1673997	0 %	0 %	50 %	50 %	241196847
37482	NC_012815	CA	3	6	1674044	1674049	50 %	0 %	0 %	50 %	241196847
37483	NC_012815	CCGC	2	8	1674052	1674059	0 %	0 %	25 %	75 %	241196847
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37486	NC_012815	TCGCC	2	10	1674266	1674275	0 %	20 %	20 %	60 %	241196847
37487	NC_012815	GCCA	3	12	1674349	1674360	25 %	0 %	25 %	50 %	241196847
37488	NC_012815	CGT	2	6	1674398	1674403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196847
37489	NC_012815	CGA	2	6	1674473	1674478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196847
37490	NC_012815	AGG	2	6	1674580	1674585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196847
37491	NC_012815	CAC	2	6	1674600	1674605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196847
37492	NC_012815	TGTC	2	8	1674674	1674681	0 %	50 %	25 %	25 %	241196847
37493	NC_012815	TCT	2	6	1674687	1674692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37494	NC_012815	CTT	2	6	1674718	1674723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37495	NC_012815	GC	3	6	1674756	1674761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37496	NC_012815	CAG	2	6	1674795	1674800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37497	NC_012815	CGC	2	6	1674865	1674870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196848
37498	NC_012815	TCC	2	6	1674920	1674925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196848
37499	NC_012815	AAG	2	6	1675001	1675006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196848
37500	NC_012815	AGGA	2	8	1675044	1675051	50 %	0 %	50 %	0 %	241196848

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