MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_012815	GAAG	2	8	1607023	1607030	50 %	0 %	50 %	0 %	241196794
36003	NC_012815	AAG	2	6	1607075	1607080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196794
36004	NC_012815	GCA	2	6	1607104	1607109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196794
36005	NC_012815	TGG	2	6	1607137	1607142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196794
36006	NC_012815	ATG	2	6	1607190	1607195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196794
36007	NC_012815	GTAC	2	8	1607204	1607211	25 %	25 %	25 %	25 %	241196794
36008	NC_012815	CA	3	6	1607235	1607240	50 %	0 %	0 %	50 %	241196794
36009	NC_012815	GTG	2	6	1607289	1607294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196794
36010	NC_012815	CAC	2	6	1607324	1607329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196794
36011	NC_012815	ACC	2	6	1607355	1607360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196794
36012	NC_012815	CTG	2	6	1607477	1607482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196794
36013	NC_012815	GAG	2	6	1607559	1607564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36014	NC_012815	CTC	2	6	1607608	1607613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36015	NC_012815	GAA	2	6	1607678	1607683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36016	NC_012815	AT	3	6	1607717	1607722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36017	NC_012815	CAAA	2	8	1607762	1607769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36018	NC_012815	ATAG	2	8	1607799	1607806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36019	NC_012815	ACCTTC	2	12	1607833	1607844	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241196795
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36021	NC_012815	CGC	2	6	1607892	1607897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196795
36022	NC_012815	CAG	2	6	1607925	1607930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196795
36023	NC_012815	CCT	2	6	1607954	1607959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196795
36024	NC_012815	CTG	2	6	1608015	1608020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196795
36025	NC_012815	GGT	2	6	1608039	1608044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196795
36026	NC_012815	GAA	2	6	1608057	1608062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196795
36027	NC_012815	TGG	2	6	1608113	1608118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196795
36028	NC_012815	TGA	2	6	1608125	1608130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196795
36029	NC_012815	TTC	2	6	1608193	1608198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196795
36030	NC_012815	ACT	2	6	1608241	1608246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196795
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36032	NC_012815	ATT	2	6	1608298	1608303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36033	NC_012815	ATT	2	6	1608366	1608371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36034	NC_012815	TGC	2	6	1608480	1608485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36035	NC_012815	AGG	2	6	1608496	1608501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36036	NC_012815	GCT	2	6	1608648	1608653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36037	NC_012815	GAA	2	6	1608664	1608669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36038	NC_012815	CAAC	2	8	1608688	1608695	50 %	0 %	0 %	50 %	241196796
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36043	NC_012815	CAG	2	6	1608995	1609000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196796
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36053	NC_012815	TGC	2	6	1609384	1609389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196796
36054	NC_012815	TGTTC	2	10	1609399	1609408	0 %	60 %	20 %	20 %	241196796
36055	NC_012815	TGA	2	6	1609417	1609422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196796
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36085	NC_012815	GTC	2	6	1611092	1611097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36087	NC_012815	GTA	2	6	1611162	1611167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36102	NC_012815	CAC	3	9	1611990	1611998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196798
36103	NC_012815	ATG	2	6	1612012	1612017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196798
36104	NC_012815	TCT	2	6	1612031	1612036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196798
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36106	NC_012815	ACGT	2	8	1612113	1612120	25 %	25 %	25 %	25 %	241196798
36107	NC_012815	TCAT	2	8	1612144	1612151	25 %	50 %	0 %	25 %	241196798
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36110	NC_012815	CAATCT	2	12	1612226	1612237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196798
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36116	NC_012815	TCA	2	6	1612493	1612498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196798
36117	NC_012815	CGA	2	6	1612514	1612519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196798
36118	NC_012815	TGACC	2	10	1612553	1612562	20 %	20 %	20 %	40 %	241196798
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36121	NC_012815	TGC	2	6	1612676	1612681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196798
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36124	NC_012815	A	6	6	1612878	1612883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36125	NC_012815	CCA	2	6	1612923	1612928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36131	NC_012815	TCG	2	6	1613226	1613231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196799
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36216	NC_012815	TA	3	6	1617613	1617618	50 %	50 %	0 %	0 %	241196802
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36223	NC_012815	AAT	2	6	1617976	1617981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196803
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36228	NC_012815	GCA	2	6	1618245	1618250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36229	NC_012815	GAAATT	2	12	1618346	1618357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	241196803
36230	NC_012815	GTC	2	6	1618374	1618379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36231	NC_012815	CCT	2	6	1618390	1618395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196803
36232	NC_012815	GTA	2	6	1618403	1618408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196803
36233	NC_012815	GCA	2	6	1618420	1618425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36234	NC_012815	TCC	2	6	1618442	1618447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196803
36235	NC_012815	A	6	6	1618515	1618520	100 %	0 %	0 %	0 %	241196803
36236	NC_012815	CAA	2	6	1618526	1618531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196803
36237	NC_012815	GAA	2	6	1618654	1618659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196803
36238	NC_012815	GCA	2	6	1618701	1618706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36239	NC_012815	CAG	2	6	1618745	1618750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36240	NC_012815	CGC	2	6	1618831	1618836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196803
36241	NC_012815	GCA	2	6	1618900	1618905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36242	NC_012815	ACA	2	6	1618935	1618940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196803
36243	NC_012815	AGC	2	6	1618965	1618970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196803
36244	NC_012815	ACC	2	6	1618977	1618982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196803
36245	NC_012815	CATA	2	8	1619032	1619039	50 %	25 %	0 %	25 %	241196803
36246	NC_012815	AG	3	6	1619061	1619066	50 %	0 %	50 %	0 %	241196803
36247	NC_012815	GTT	2	6	1619105	1619110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196803
36248	NC_012815	ATAC	2	8	1619131	1619138	50 %	25 %	0 %	25 %	241196803
36249	NC_012815	CTGC	2	8	1619234	1619241	0 %	25 %	25 %	50 %	241196803
36250	NC_012815	ATT	2	6	1619270	1619275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196804
36251	NC_012815	ATC	2	6	1619335	1619340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196804
36252	NC_012815	TCA	2	6	1619360	1619365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196804
36253	NC_012815	TCC	2	6	1619383	1619388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196804
36254	NC_012815	GCATC	2	10	1619442	1619451	20 %	20 %	20 %	40 %	241196804
36255	NC_012815	GCAC	2	8	1619538	1619545	25 %	0 %	25 %	50 %	241196804
36256	NC_012815	GCA	2	6	1619672	1619677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196804
36257	NC_012815	CG	3	6	1619721	1619726	0 %	0 %	50 %	50 %	241196804
36258	NC_012815	GAT	2	6	1619733	1619738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196804
36259	NC_012815	TCC	2	6	1619824	1619829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196804
36260	NC_012815	ATC	2	6	1619847	1619852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196804
36261	NC_012815	TGG	2	6	1619861	1619866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196804
36262	NC_012815	GTT	2	6	1619871	1619876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196804
36263	NC_012815	TAT	2	6	1619930	1619935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196804
36264	NC_012815	TTCA	2	8	1619952	1619959	25 %	50 %	0 %	25 %	241196804
36265	NC_012815	GCA	2	6	1619969	1619974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196804
36266	NC_012815	CTC	2	6	1620012	1620017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196804
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36268	NC_012815	GCA	2	6	1620125	1620130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196804
36269	NC_012815	GCA	2	6	1620148	1620153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196804
36270	NC_012815	CAT	2	6	1620231	1620236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196805
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36272	NC_012815	ATG	2	6	1620355	1620360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196805
36273	NC_012815	CTC	2	6	1620396	1620401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196805
36274	NC_012815	GC	4	8	1620513	1620520	0 %	0 %	50 %	50 %	241196805
36275	NC_012815	GTA	2	6	1620537	1620542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196805
36276	NC_012815	TGC	2	6	1620627	1620632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196805
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36282	NC_012815	ATC	2	6	1620915	1620920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196805
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36284	NC_012815	GAG	2	6	1621116	1621121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196805
36285	NC_012815	CATG	2	8	1621128	1621135	25 %	25 %	25 %	25 %	241196805
36286	NC_012815	TTC	2	6	1621146	1621151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196805
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36294	NC_012815	GAATC	2	10	1621529	1621538	40 %	20 %	20 %	20 %	241196806
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36296	NC_012815	CAAG	2	8	1621590	1621597	50 %	0 %	25 %	25 %	241196806
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36300	NC_012815	GTA	2	6	1621966	1621971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196806
36301	NC_012815	GGT	2	6	1621994	1621999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196806
36302	NC_012815	G	6	6	1622035	1622040	0 %	0 %	100 %	0 %	241196806
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36316	NC_012815	ATCTTC	2	12	1622545	1622556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241196807
36317	NC_012815	GC	3	6	1622584	1622589	0 %	0 %	50 %	50 %	241196807
36318	NC_012815	TTC	2	6	1622683	1622688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196807
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36327	NC_012815	TCG	2	6	1623121	1623126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196807
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36330	NC_012815	CAA	2	6	1623201	1623206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196807
36331	NC_012815	AGCG	2	8	1623283	1623290	25 %	0 %	50 %	25 %	241196807
36332	NC_012815	TGGC	2	8	1623343	1623350	0 %	25 %	50 %	25 %	241196807
36333	NC_012815	CG	3	6	1623366	1623371	0 %	0 %	50 %	50 %	241196807
36334	NC_012815	CT	3	6	1623428	1623433	0 %	50 %	0 %	50 %	241196808
36335	NC_012815	CAG	2	6	1623450	1623455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196808
36336	NC_012815	GC	3	6	1623537	1623542	0 %	0 %	50 %	50 %	241196808
36337	NC_012815	GCG	2	6	1623624	1623629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196808
36338	NC_012815	TCG	2	6	1623637	1623642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196808
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36341	NC_012815	CAG	2	6	1623729	1623734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196808
36342	NC_012815	ATC	2	6	1623798	1623803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196808
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36344	NC_012815	CG	3	6	1623890	1623895	0 %	0 %	50 %	50 %	241196808
36345	NC_012815	CGG	2	6	1623949	1623954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196808
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36470	NC_012815	TCA	2	6	1629274	1629279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196813
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36497	NC_012815	TTA	2	6	1630151	1630156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196814
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