MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_012815	CGTG	2	8	1540819	1540826	0 %	25 %	50 %	25 %	241196751
34503	NC_012815	GCT	2	6	1540900	1540905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196751
34504	NC_012815	CCG	2	6	1540995	1541000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196751
34505	NC_012815	CGG	2	6	1541036	1541041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196751
34506	NC_012815	TGCGCG	2	12	1541137	1541148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196751
34507	NC_012815	CTGG	2	8	1541159	1541166	0 %	25 %	50 %	25 %	241196751
34508	NC_012815	CCG	2	6	1541167	1541172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196751
34509	NC_012815	TGC	2	6	1541179	1541184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196751
34510	NC_012815	CTT	2	6	1541239	1541244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196751
34511	NC_012815	ATT	2	6	1541280	1541285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34512	NC_012815	TG	3	6	1541345	1541350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34513	NC_012815	TCG	2	6	1541410	1541415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34514	NC_012815	TTG	2	6	1541441	1541446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196752
34515	NC_012815	ATG	2	6	1541455	1541460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196752
34516	NC_012815	GCC	2	6	1541476	1541481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196752
34517	NC_012815	CGC	2	6	1541570	1541575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196752
34518	NC_012815	CCA	2	6	1541624	1541629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196752
34519	NC_012815	GAT	2	6	1541634	1541639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196752
34520	NC_012815	CACCG	2	10	1541643	1541652	20 %	0 %	20 %	60 %	241196752
34521	NC_012815	CGT	2	6	1541678	1541683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34522	NC_012815	CGT	2	6	1541834	1541839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34523	NC_012815	GAT	2	6	1541844	1541849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196752
34524	NC_012815	AGA	2	6	1541888	1541893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196752
34525	NC_012815	CTG	2	6	1541898	1541903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34526	NC_012815	GAC	2	6	1541928	1541933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34527	NC_012815	CGCC	2	8	1541948	1541955	0 %	0 %	25 %	75 %	241196752
34528	NC_012815	CGA	2	6	1542029	1542034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196752
34529	NC_012815	CGT	2	6	1542078	1542083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196752
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34532	NC_012815	ATC	2	6	1542202	1542207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196752
34533	NC_012815	ATA	2	6	1542250	1542255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196752
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34538	NC_012815	CGT	2	6	1542542	1542547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196753
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34542	NC_012815	TGCG	2	8	1542704	1542711	0 %	25 %	50 %	25 %	241196753
34543	NC_012815	CGG	2	6	1542728	1542733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196753
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34548	NC_012815	CGA	2	6	1542920	1542925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196753
34549	NC_012815	GCG	2	6	1542941	1542946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196753
34550	NC_012815	ATC	2	6	1542960	1542965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196753
34551	NC_012815	GTC	2	6	1542996	1543001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196753
34552	NC_012815	GGC	2	6	1543002	1543007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196753
34553	NC_012815	TCC	2	6	1543077	1543082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34554	NC_012815	TG	3	6	1543091	1543096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34555	NC_012815	CGT	2	6	1543219	1543224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196754
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34560	NC_012815	CGA	2	6	1543416	1543421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196754
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34586	NC_012815	CG	3	6	1544724	1544729	0 %	0 %	50 %	50 %	241196755
34587	NC_012815	GCA	2	6	1544738	1544743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196755
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34598	NC_012815	AGTC	2	8	1545271	1545278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34599	NC_012815	GCCC	2	8	1545285	1545292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34600	NC_012815	ACG	2	6	1545312	1545317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34601	NC_012815	GCC	2	6	1545356	1545361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34602	NC_012815	CACG	2	8	1545366	1545373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34603	NC_012815	ACTA	2	8	1545440	1545447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34604	NC_012815	TCG	2	6	1545487	1545492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196756
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34606	NC_012815	GTA	2	6	1545588	1545593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196756
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34609	NC_012815	GAT	2	6	1545723	1545728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196756
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34614	NC_012815	GCCT	2	8	1546149	1546156	0 %	25 %	25 %	50 %	241196756
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34743	NC_012815	CAG	2	6	1551948	1551953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196757
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34832	NC_012815	ATC	2	6	1556338	1556343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196759
34833	NC_012815	TGGG	2	8	1556365	1556372	0 %	25 %	75 %	0 %	241196759
34834	NC_012815	CAC	2	6	1556403	1556408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196759
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34840	NC_012815	CGA	2	6	1556700	1556705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196759
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34842	NC_012815	CACCG	2	10	1556791	1556800	20 %	0 %	20 %	60 %	241196759
34843	NC_012815	CG	3	6	1556868	1556873	0 %	0 %	50 %	50 %	241196759
34844	NC_012815	TCG	2	6	1556975	1556980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196759
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34846	NC_012815	CAC	3	9	1557087	1557095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196759
34847	NC_012815	GAC	2	6	1557166	1557171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196759
34848	NC_012815	ACG	2	6	1557221	1557226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196759
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34851	NC_012815	CG	3	6	1557346	1557351	0 %	0 %	50 %	50 %	241196759
34852	NC_012815	AGC	2	6	1557452	1557457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196759
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34943	NC_012815	CAC	2	6	1562596	1562601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196760
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34947	NC_012815	TCG	2	6	1562799	1562804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196760
34948	NC_012815	TGCGCT	2	12	1562827	1562838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196760
34949	NC_012815	GT	3	6	1562853	1562858	0 %	50 %	50 %	0 %	241196760
34950	NC_012815	GCG	2	6	1562861	1562866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196760
34951	NC_012815	ATC	2	6	1562996	1563001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196760
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34953	NC_012815	GTGCCG	2	12	1563008	1563019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196760
34954	NC_012815	TGGGC	2	10	1563097	1563106	0 %	20 %	60 %	20 %	241196761
34955	NC_012815	GTT	2	6	1563137	1563142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196761
34956	NC_012815	TGGGT	2	10	1563151	1563160	0 %	40 %	60 %	0 %	241196761
34957	NC_012815	CGCGAG	2	12	1563332	1563343	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241196761
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34959	NC_012815	CG	3	6	1563468	1563473	0 %	0 %	50 %	50 %	241196761
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34961	NC_012815	CA	3	6	1563591	1563596	50 %	0 %	0 %	50 %	241196761
34962	NC_012815	CGA	2	6	1563638	1563643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196761
34963	NC_012815	GAC	2	6	1563654	1563659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196761
34964	NC_012815	TTC	2	6	1563666	1563671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196761
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34966	NC_012815	GAC	2	6	1563696	1563701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196761
34967	NC_012815	TCG	2	6	1563783	1563788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196761
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34973	NC_012815	GTC	2	6	1564143	1564148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196761
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34982	NC_012815	GC	4	8	1564499	1564506	0 %	0 %	50 %	50 %	241196762
34983	NC_012815	TGG	2	6	1564574	1564579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196762
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34985	NC_012815	TGC	2	6	1564656	1564661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196762
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34988	NC_012815	CTGC	2	8	1564780	1564787	0 %	25 %	25 %	50 %	241196762
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34991	NC_012815	GCG	2	6	1564923	1564928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196762
34992	NC_012815	GC	3	6	1564935	1564940	0 %	0 %	50 %	50 %	241196762
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34994	NC_012815	TGC	2	6	1565016	1565021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196762
34995	NC_012815	GGCG	2	8	1565023	1565030	0 %	0 %	75 %	25 %	241196762
34996	NC_012815	TGCC	2	8	1565048	1565055	0 %	25 %	25 %	50 %	241196762
34997	NC_012815	CCACG	2	10	1565059	1565068	20 %	0 %	20 %	60 %	241196762
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