MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_012815	GC	3	6	1497078	1497083	0 %	0 %	50 %	50 %	241196721
33503	NC_012815	GGA	2	6	1497085	1497090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196721
33504	NC_012815	GCC	2	6	1497145	1497150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196721
33505	NC_012815	TCGA	2	8	1497251	1497258	25 %	25 %	25 %	25 %	241196721
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33507	NC_012815	GC	3	6	1497344	1497349	0 %	0 %	50 %	50 %	241196721
33508	NC_012815	GAT	2	6	1497352	1497357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196721
33509	NC_012815	ATC	2	6	1497371	1497376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196721
33510	NC_012815	CAT	3	9	1497382	1497390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196721
33511	NC_012815	CAT	2	6	1497394	1497399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196721
33512	NC_012815	CGT	2	6	1497439	1497444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196721
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33515	NC_012815	CGA	2	6	1497474	1497479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196721
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33553	NC_012815	ACA	2	6	1498953	1498958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33554	NC_012815	CAA	2	6	1498999	1499004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33555	NC_012815	CG	3	6	1499006	1499011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33556	NC_012815	ATG	2	6	1499074	1499079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33590	NC_012815	TGC	2	6	1500360	1500365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33591	NC_012815	ATGT	2	8	1500400	1500407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33592	NC_012815	CT	3	6	1500425	1500430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33593	NC_012815	GTCA	2	8	1500543	1500550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33594	NC_012815	AAT	2	6	1500560	1500565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33601	NC_012815	GAAG	2	8	1500924	1500931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33602	NC_012815	GGA	2	6	1500959	1500964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33603	NC_012815	TCAA	2	8	1500987	1500994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33604	NC_012815	ATC	2	6	1501045	1501050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33605	NC_012815	GCAG	2	8	1501056	1501063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33606	NC_012815	CA	3	6	1501149	1501154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33607	NC_012815	GCG	2	6	1501196	1501201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33608	NC_012815	ATG	2	6	1501246	1501251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33612	NC_012815	CTTGCC	2	12	1501379	1501390	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241196725
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33617	NC_012815	TCCA	2	8	1501714	1501721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33618	NC_012815	GATCA	2	10	1501760	1501769	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33619	NC_012815	ATG	2	6	1501817	1501822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33620	NC_012815	TCCA	2	8	1501830	1501837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33621	NC_012815	GCA	2	6	1501843	1501848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33622	NC_012815	ATGC	2	8	1501887	1501894	25 %	25 %	25 %	25 %	241196726
33623	NC_012815	AC	3	6	1501917	1501922	50 %	0 %	0 %	50 %	241196726
33624	NC_012815	GCT	2	6	1502004	1502009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196726
33625	NC_012815	CAC	2	6	1502089	1502094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196726
33626	NC_012815	CAT	2	6	1502127	1502132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196726
33627	NC_012815	CGT	2	6	1502152	1502157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33628	NC_012815	TCC	2	6	1502173	1502178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33629	NC_012815	TG	3	6	1502274	1502279	0 %	50 %	50 %	0 %	241196727
33630	NC_012815	AAC	2	6	1502292	1502297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196727
33631	NC_012815	GAC	2	6	1502480	1502485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196727
33632	NC_012815	GGCT	2	8	1502806	1502813	0 %	25 %	50 %	25 %	241196727
33633	NC_012815	CTG	2	6	1502822	1502827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196727
33634	NC_012815	ATG	2	6	1502866	1502871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196727
33635	NC_012815	GTC	2	6	1502907	1502912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196727
33636	NC_012815	TACCG	2	10	1502975	1502984	20 %	20 %	20 %	40 %	241196727
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33638	NC_012815	CCA	2	6	1503127	1503132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196727
33639	NC_012815	CCA	2	6	1503152	1503157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196727
33640	NC_012815	TG	3	6	1503220	1503225	0 %	50 %	50 %	0 %	241196727
33641	NC_012815	CAT	2	6	1503232	1503237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196727
33642	NC_012815	ATC	2	6	1503271	1503276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196728
33643	NC_012815	TTCG	2	8	1503357	1503364	0 %	50 %	25 %	25 %	241196728
33644	NC_012815	ATG	2	6	1503369	1503374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196728
33645	NC_012815	CTG	2	6	1503406	1503411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196728
33646	NC_012815	GAT	2	6	1503470	1503475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196728
33647	NC_012815	CCATGA	2	12	1503522	1503533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241196728
33648	NC_012815	GTT	2	6	1503619	1503624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196728
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33650	NC_012815	ATAC	2	8	1503686	1503693	50 %	25 %	0 %	25 %	241196728
33651	NC_012815	TCTT	2	8	1503759	1503766	0 %	75 %	0 %	25 %	241196728
33652	NC_012815	TCA	2	6	1503771	1503776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196728
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33656	NC_012815	CTG	2	6	1503946	1503951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196728
33657	NC_012815	GCA	2	6	1503964	1503969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196728
33658	NC_012815	GAA	2	6	1503981	1503986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196728
33659	NC_012815	ATT	2	6	1504040	1504045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196728
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33683	NC_012815	TGCAA	2	10	1505286	1505295	40 %	20 %	20 %	20 %	241196728
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33719	NC_012815	AC	3	6	1507262	1507267	50 %	0 %	0 %	50 %	241196729
33720	NC_012815	T	7	7	1507300	1507306	0 %	100 %	0 %	0 %	241196729
33721	NC_012815	TGA	2	6	1507376	1507381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196729
33722	NC_012815	CG	3	6	1507407	1507412	0 %	0 %	50 %	50 %	241196729
33723	NC_012815	GCA	2	6	1507449	1507454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196729
33724	NC_012815	AAATC	2	10	1507475	1507484	60 %	20 %	0 %	20 %	241196729
33725	NC_012815	CCT	2	6	1507485	1507490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196729
33726	NC_012815	TCG	2	6	1507571	1507576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196729
33727	NC_012815	TCA	2	6	1507616	1507621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196729
33728	NC_012815	CCGCT	2	10	1507648	1507657	0 %	20 %	20 %	60 %	241196729
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33730	NC_012815	TGC	2	6	1507774	1507779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196729
33731	NC_012815	A	6	6	1507821	1507826	100 %	0 %	0 %	0 %	241196729
33732	NC_012815	AAG	2	6	1507921	1507926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196729
33733	NC_012815	ATC	2	6	1507971	1507976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33734	NC_012815	ATC	2	6	1507978	1507983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33735	NC_012815	GTC	2	6	1507984	1507989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196730
33736	NC_012815	AGC	2	6	1507990	1507995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196730
33737	NC_012815	CAAT	2	8	1508051	1508058	50 %	25 %	0 %	25 %	241196730
33738	NC_012815	GCCT	2	8	1508059	1508066	0 %	25 %	25 %	50 %	241196730
33739	NC_012815	ATC	2	6	1508134	1508139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33740	NC_012815	ACG	2	6	1508152	1508157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196730
33741	NC_012815	TCA	2	6	1508177	1508182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33742	NC_012815	CAGC	2	8	1508256	1508263	25 %	0 %	25 %	50 %	241196730
33743	NC_012815	TCA	2	6	1508279	1508284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33744	NC_012815	TG	3	6	1508339	1508344	0 %	50 %	50 %	0 %	241196730
33745	NC_012815	TAC	2	6	1508352	1508357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33746	NC_012815	CTT	2	6	1508455	1508460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196730
33747	NC_012815	TCAT	2	8	1508462	1508469	25 %	50 %	0 %	25 %	241196730
33748	NC_012815	CG	3	6	1508546	1508551	0 %	0 %	50 %	50 %	241196730
33749	NC_012815	AGCA	2	8	1508587	1508594	50 %	0 %	25 %	25 %	241196730
33750	NC_012815	TCACTG	2	12	1508673	1508684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241196730
33751	NC_012815	TCC	2	6	1508711	1508716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196730
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33754	NC_012815	CAT	2	6	1508814	1508819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
33755	NC_012815	GCT	2	6	1508833	1508838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196730
33756	NC_012815	ATC	2	6	1508852	1508857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
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33761	NC_012815	CTG	2	6	1509072	1509077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196730
33762	NC_012815	GCGA	2	8	1509083	1509090	25 %	0 %	50 %	25 %	241196730
33763	NC_012815	TTCA	2	8	1509133	1509140	25 %	50 %	0 %	25 %	241196730
33764	NC_012815	CAT	2	6	1509163	1509168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196730
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33766	NC_012815	CA	3	6	1509211	1509216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33767	NC_012815	CAT	2	6	1509223	1509228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33768	NC_012815	AGC	2	6	1509234	1509239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33770	NC_012815	AAG	2	6	1509260	1509265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33771	NC_012815	AGAT	2	8	1509289	1509296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33772	NC_012815	ACA	2	6	1509322	1509327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33773	NC_012815	CAG	2	6	1509364	1509369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33775	NC_012815	AC	3	6	1509445	1509450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33776	NC_012815	TACA	2	8	1509502	1509509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33777	NC_012815	CAT	2	6	1509656	1509661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196731
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33818	NC_012815	TTCG	2	8	1511877	1511884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33822	NC_012815	GTT	2	6	1512187	1512192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33823	NC_012815	TCC	2	6	1512240	1512245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33824	NC_012815	GGC	2	6	1512311	1512316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33825	NC_012815	GTG	2	6	1512379	1512384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33830	NC_012815	GCCGTT	2	12	1512751	1512762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33832	NC_012815	TAG	2	6	1512951	1512956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33838	NC_012815	AGT	2	6	1513211	1513216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196733
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33840	NC_012815	GCA	2	6	1513259	1513264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196733
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33842	NC_012815	CG	3	6	1513377	1513382	0 %	0 %	50 %	50 %	241196733
33843	NC_012815	TTC	2	6	1513423	1513428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196733
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33846	NC_012815	CTTCCG	2	12	1513556	1513567	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241196733
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33851	NC_012815	CGCT	2	8	1513816	1513823	0 %	25 %	25 %	50 %	241196733
33852	NC_012815	GC	3	6	1513858	1513863	0 %	0 %	50 %	50 %	241196733
33853	NC_012815	TCG	2	6	1513999	1514004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196733
33854	NC_012815	GCCC	2	8	1514093	1514100	0 %	0 %	25 %	75 %	241196733
33855	NC_012815	CGAG	2	8	1514105	1514112	25 %	0 %	50 %	25 %	241196733
33856	NC_012815	CG	3	6	1514128	1514133	0 %	0 %	50 %	50 %	241196733
33857	NC_012815	CGA	2	6	1514138	1514143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196733
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33870	NC_012815	GC	3	6	1514438	1514443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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33971	NC_012815	TTC	2	6	1518221	1518226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196734
33972	NC_012815	TCC	2	6	1518230	1518235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196734
33973	NC_012815	GTC	2	6	1518250	1518255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33974	NC_012815	TCG	2	6	1518275	1518280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33975	NC_012815	GTCG	2	8	1518346	1518353	0 %	25 %	50 %	25 %	241196734
33976	NC_012815	TGA	2	6	1518357	1518362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196734
33977	NC_012815	CGG	2	6	1518389	1518394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196734
33978	NC_012815	GCTC	2	8	1518408	1518415	0 %	25 %	25 %	50 %	241196734
33979	NC_012815	GAA	2	6	1518418	1518423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196734
33980	NC_012815	CGG	2	6	1518501	1518506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196734
33981	NC_012815	GCA	2	6	1518536	1518541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33982	NC_012815	CGT	2	6	1518543	1518548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33983	NC_012815	TGA	2	6	1518549	1518554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196734
33984	NC_012815	AC	3	6	1518579	1518584	50 %	0 %	0 %	50 %	241196734
33985	NC_012815	GCGAT	2	10	1518591	1518600	20 %	20 %	40 %	20 %	241196734
33986	NC_012815	CGG	2	6	1518642	1518647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196734
33987	NC_012815	AGC	2	6	1518659	1518664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33988	NC_012815	GAT	2	6	1518775	1518780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196734
33989	NC_012815	TCG	2	6	1518803	1518808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33990	NC_012815	GC	3	6	1518812	1518817	0 %	0 %	50 %	50 %	241196734
33991	NC_012815	CCT	2	6	1518831	1518836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196734
33992	NC_012815	CAA	2	6	1518952	1518957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196734
33993	NC_012815	TCG	2	6	1518966	1518971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33994	NC_012815	CG	3	6	1518970	1518975	0 %	0 %	50 %	50 %	241196734
33995	NC_012815	ATG	2	6	1518985	1518990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196734
33996	NC_012815	ACG	2	6	1518991	1518996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33997	NC_012815	GA	3	6	1519116	1519121	50 %	0 %	50 %	0 %	241196734
33998	NC_012815	CGA	2	6	1519123	1519128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196734
33999	NC_012815	CAT	2	6	1519150	1519155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196734
34000	NC_012815	TTGG	2	8	1519184	1519191	0 %	50 %	50 %	0 %	241196734

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