MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_012815	GC	3	6	1452861	1452866	0 %	0 %	50 %	50 %	241196687
32502	NC_012815	AGG	2	6	1452947	1452952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196687
32503	NC_012815	GGA	2	6	1452957	1452962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196687
32504	NC_012815	TCA	2	6	1452974	1452979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196687
32505	NC_012815	CG	3	6	1452999	1453004	0 %	0 %	50 %	50 %	241196687
32506	NC_012815	GAC	2	6	1453027	1453032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32507	NC_012815	TCA	2	6	1453085	1453090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196687
32508	NC_012815	CAC	2	6	1453113	1453118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196687
32509	NC_012815	CAGG	2	8	1453165	1453172	25 %	0 %	50 %	25 %	241196687
32510	NC_012815	CAT	2	6	1453209	1453214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196687
32511	NC_012815	CGG	2	6	1453257	1453262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196687
32512	NC_012815	GATCT	2	10	1453276	1453285	20 %	40 %	20 %	20 %	241196687
32513	NC_012815	CTC	2	6	1453293	1453298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196687
32514	NC_012815	CGA	2	6	1453377	1453382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32515	NC_012815	TCGAC	2	10	1453431	1453440	20 %	20 %	20 %	40 %	241196687
32516	NC_012815	TGC	2	6	1453451	1453456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32517	NC_012815	TCA	2	6	1453496	1453501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196687
32518	NC_012815	CAT	2	6	1453530	1453535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196687
32519	NC_012815	CCGC	2	8	1453583	1453590	0 %	0 %	25 %	75 %	241196687
32520	NC_012815	CCGC	2	8	1453601	1453608	0 %	0 %	25 %	75 %	241196687
32521	NC_012815	GCC	2	6	1453621	1453626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196687
32522	NC_012815	CACCGT	2	12	1453650	1453661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241196687
32523	NC_012815	ACGA	2	8	1453732	1453739	50 %	0 %	25 %	25 %	241196687
32524	NC_012815	CGA	2	6	1453823	1453828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32525	NC_012815	CTC	2	6	1453881	1453886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196687
32526	NC_012815	CCG	2	6	1453970	1453975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196687
32527	NC_012815	GAC	2	6	1454001	1454006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32528	NC_012815	CG	3	6	1454035	1454040	0 %	0 %	50 %	50 %	241196687
32529	NC_012815	ACGC	2	8	1454048	1454055	25 %	0 %	25 %	50 %	241196687
32530	NC_012815	CGAC	2	8	1454111	1454118	25 %	0 %	25 %	50 %	241196687
32531	NC_012815	GTC	2	6	1454121	1454126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32532	NC_012815	CGA	2	6	1454127	1454132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196687
32533	NC_012815	TA	3	6	1454215	1454220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32534	NC_012815	GCA	2	6	1454249	1454254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32535	NC_012815	CAC	2	6	1454319	1454324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196688
32536	NC_012815	CGA	2	6	1454325	1454330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196688
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32538	NC_012815	GGA	2	6	1454370	1454375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196688
32539	NC_012815	ACA	2	6	1454399	1454404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196688
32540	NC_012815	CGC	2	6	1454410	1454415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196688
32541	NC_012815	ATC	2	6	1454416	1454421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196688
32542	NC_012815	CGG	2	6	1454426	1454431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196688
32543	NC_012815	ACTC	2	8	1454432	1454439	25 %	25 %	0 %	50 %	241196688
32544	NC_012815	TCG	2	6	1454450	1454455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196688
32545	NC_012815	TG	3	6	1454523	1454528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32546	NC_012815	TCC	2	6	1454540	1454545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32547	NC_012815	CA	3	6	1454560	1454565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32548	NC_012815	AGG	2	6	1454578	1454583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32549	NC_012815	GCCC	2	8	1454677	1454684	0 %	0 %	25 %	75 %	241196689
32550	NC_012815	GC	3	6	1454743	1454748	0 %	0 %	50 %	50 %	241196689
32551	NC_012815	GC	3	6	1454812	1454817	0 %	0 %	50 %	50 %	241196689
32552	NC_012815	AGC	2	6	1454834	1454839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196689
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32554	NC_012815	CGCA	2	8	1454902	1454909	25 %	0 %	25 %	50 %	241196689
32555	NC_012815	GTA	2	6	1454944	1454949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196689
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32560	NC_012815	AT	3	6	1455177	1455182	50 %	50 %	0 %	0 %	241196689
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32567	NC_012815	CGG	2	6	1455610	1455615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32568	NC_012815	GAAC	2	8	1455619	1455626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32569	NC_012815	GGA	2	6	1455640	1455645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32571	NC_012815	CGA	2	6	1455690	1455695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196690
32572	NC_012815	TGC	2	6	1455756	1455761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196690
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32574	NC_012815	GAGCT	2	10	1455920	1455929	20 %	20 %	40 %	20 %	241196690
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32577	NC_012815	GGCTC	2	10	1456035	1456044	0 %	20 %	40 %	40 %	241196690
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32584	NC_012815	TGG	2	6	1456321	1456326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32585	NC_012815	CGG	2	6	1456362	1456367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196691
32586	NC_012815	GCG	3	9	1456373	1456381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196691
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32588	NC_012815	GAATGC	2	12	1456434	1456445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196691
32589	NC_012815	CGCA	2	8	1456468	1456475	25 %	0 %	25 %	50 %	241196691
32590	NC_012815	CA	3	6	1456491	1456496	50 %	0 %	0 %	50 %	241196691
32591	NC_012815	CGC	2	6	1456521	1456526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196691
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32593	NC_012815	G	6	6	1456638	1456643	0 %	0 %	100 %	0 %	241196691
32594	NC_012815	TCC	2	6	1456691	1456696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196691
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32598	NC_012815	GCC	2	6	1456830	1456835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196691
32599	NC_012815	GC	3	6	1456880	1456885	0 %	0 %	50 %	50 %	241196691
32600	NC_012815	CTC	2	6	1456909	1456914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196691
32601	NC_012815	CTG	2	6	1456930	1456935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196691
32602	NC_012815	CCT	2	6	1457028	1457033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196691
32603	NC_012815	TCT	2	6	1457040	1457045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196691
32604	NC_012815	CGT	2	6	1457049	1457054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196691
32605	NC_012815	GTCC	2	8	1457055	1457062	0 %	25 %	25 %	50 %	241196691
32606	NC_012815	CGGG	2	8	1457080	1457087	0 %	0 %	75 %	25 %	241196691
32607	NC_012815	GAT	2	6	1457140	1457145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196691
32608	NC_012815	CGG	2	6	1457407	1457412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196692
32609	NC_012815	TCG	2	6	1457550	1457555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
32610	NC_012815	GTC	2	6	1457573	1457578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
32611	NC_012815	ATC	2	6	1457642	1457647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196692
32612	NC_012815	TCG	2	6	1457709	1457714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
32613	NC_012815	CA	3	6	1457778	1457783	50 %	0 %	0 %	50 %	241196692
32614	NC_012815	AGC	2	6	1457793	1457798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196692
32615	NC_012815	TCG	2	6	1457811	1457816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
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32617	NC_012815	GGT	2	6	1457911	1457916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196692
32618	NC_012815	TGC	2	6	1457964	1457969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
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32622	NC_012815	GCA	2	6	1458121	1458126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196692
32623	NC_012815	CTG	2	6	1458128	1458133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196692
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32725	NC_012815	TGCC	2	8	1462381	1462388	0 %	25 %	25 %	50 %	241196697
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32727	NC_012815	CACGAA	2	12	1462489	1462500	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241196697
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32729	NC_012815	ATG	2	6	1462586	1462591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196697
32730	NC_012815	AC	3	6	1462608	1462613	50 %	0 %	0 %	50 %	241196697
32731	NC_012815	TCA	2	6	1462647	1462652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196697
32732	NC_012815	CAA	2	6	1462663	1462668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196697
32733	NC_012815	GCA	2	6	1462731	1462736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196697
32734	NC_012815	CCT	2	6	1462790	1462795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196698
32735	NC_012815	GCA	2	6	1462825	1462830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196698
32736	NC_012815	ACC	2	6	1462941	1462946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196698
32737	NC_012815	TGA	2	6	1462957	1462962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196698
32738	NC_012815	GC	3	6	1463103	1463108	0 %	0 %	50 %	50 %	241196698
32739	NC_012815	GGT	2	6	1463261	1463266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196698
32740	NC_012815	CG	3	6	1463289	1463294	0 %	0 %	50 %	50 %	241196698
32741	NC_012815	GAT	2	6	1463312	1463317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196698
32742	NC_012815	GAA	2	6	1463384	1463389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196698
32743	NC_012815	TGC	2	6	1463441	1463446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32744	NC_012815	TGGCTG	2	12	1463465	1463476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32745	NC_012815	GCCAC	2	10	1463521	1463530	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32746	NC_012815	ATG	2	6	1463548	1463553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32747	NC_012815	CAA	3	9	1463598	1463606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196699
32748	NC_012815	GCA	2	6	1463653	1463658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196699
32749	NC_012815	CGCC	2	8	1463719	1463726	0 %	0 %	25 %	75 %	241196699
32750	NC_012815	GTC	2	6	1463738	1463743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196699
32751	NC_012815	CCT	2	6	1463749	1463754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196699
32752	NC_012815	CGC	2	6	1463755	1463760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196699
32753	NC_012815	GCAT	2	8	1463775	1463782	25 %	25 %	25 %	25 %	241196699
32754	NC_012815	CA	3	6	1463784	1463789	50 %	0 %	0 %	50 %	241196699
32755	NC_012815	GCG	2	6	1463855	1463860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196699
32756	NC_012815	GCCT	2	8	1463877	1463884	0 %	25 %	25 %	50 %	241196699
32757	NC_012815	ACGA	2	8	1463934	1463941	50 %	0 %	25 %	25 %	241196699
32758	NC_012815	TTC	2	6	1463973	1463978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196699
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32760	NC_012815	CGGC	2	8	1464091	1464098	0 %	0 %	50 %	50 %	241196699
32761	NC_012815	TGC	3	9	1464126	1464134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196699
32762	NC_012815	TCC	2	6	1464135	1464140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196699
32763	NC_012815	GAA	2	6	1464215	1464220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196699
32764	NC_012815	GC	3	6	1464235	1464240	0 %	0 %	50 %	50 %	241196699
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32768	NC_012815	GC	3	6	1464361	1464366	0 %	0 %	50 %	50 %	241196699
32769	NC_012815	AGG	2	6	1464391	1464396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196699
32770	NC_012815	GTA	2	6	1464398	1464403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196699
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32772	NC_012815	GGCCA	2	10	1464458	1464467	20 %	0 %	40 %	40 %	241196699
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32780	NC_012815	TC	3	6	1464786	1464791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32781	NC_012815	CTCGTT	2	12	1464792	1464803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32782	NC_012815	CG	3	6	1464812	1464817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32783	NC_012815	GCATG	2	10	1464863	1464872	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32784	NC_012815	CAG	2	6	1464905	1464910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32785	NC_012815	TGCG	2	8	1464914	1464921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32786	NC_012815	GC	3	6	1464970	1464975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32787	NC_012815	GC	3	6	1464993	1464998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32788	NC_012815	CCCA	2	8	1465045	1465052	25 %	0 %	0 %	75 %	241196700
32789	NC_012815	AGC	3	9	1465078	1465086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196700
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32793	NC_012815	AGC	2	6	1465192	1465197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196700
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32795	NC_012815	GAT	2	6	1465263	1465268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196700
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32802	NC_012815	CAC	2	6	1465578	1465583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196700
32803	NC_012815	CACC	2	8	1465601	1465608	25 %	0 %	0 %	75 %	241196700
32804	NC_012815	GAA	2	6	1465611	1465616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196700
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32810	NC_012815	TCG	2	6	1465839	1465844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196701
32811	NC_012815	CTG	2	6	1465871	1465876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196701
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32814	NC_012815	CGT	2	6	1465969	1465974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196701
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32822	NC_012815	TGA	2	6	1466233	1466238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196701
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32831	NC_012815	TCT	2	6	1466575	1466580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196701
32832	NC_012815	CATG	2	8	1466743	1466750	25 %	25 %	25 %	25 %	241196701
32833	NC_012815	GCC	2	6	1466780	1466785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196701
32834	NC_012815	GAT	2	6	1466819	1466824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196701
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32836	NC_012815	GCCT	2	8	1466961	1466968	0 %	25 %	25 %	50 %	241196702
32837	NC_012815	CGT	2	6	1467058	1467063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196702
32838	NC_012815	CTG	2	6	1467065	1467070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196702
32839	NC_012815	TTC	2	6	1467087	1467092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196702
32840	NC_012815	CGG	2	6	1467103	1467108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196702
32841	NC_012815	AGT	2	6	1467115	1467120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196702
32842	NC_012815	CGAG	2	8	1467130	1467137	25 %	0 %	50 %	25 %	241196702
32843	NC_012815	CTG	2	6	1467275	1467280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196702
32844	NC_012815	CGT	2	6	1467313	1467318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196702
32845	NC_012815	ATCG	2	8	1467353	1467360	25 %	25 %	25 %	25 %	241196702
32846	NC_012815	CTT	2	6	1467446	1467451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196702
32847	NC_012815	TGC	2	6	1467465	1467470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196702
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32956	NC_012815	CCAT	2	8	1473967	1473974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32957	NC_012815	GCAT	2	8	1474043	1474050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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32968	NC_012815	CAC	2	6	1474456	1474461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32971	NC_012815	A	6	6	1474500	1474505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32972	NC_012815	ACCCC	2	10	1474541	1474550	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32973	NC_012815	CGGG	2	8	1474553	1474560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32974	NC_012815	ACC	3	9	1474592	1474600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32975	NC_012815	CCA	2	6	1474601	1474606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32976	NC_012815	ACCC	2	8	1474611	1474618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32977	NC_012815	AC	3	6	1474653	1474658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32978	NC_012815	GGC	2	6	1474689	1474694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32979	NC_012815	GCAC	2	8	1474709	1474716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32980	NC_012815	CACAC	2	10	1474717	1474726	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32981	NC_012815	GCG	2	6	1474762	1474767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32983	NC_012815	C	6	6	1474927	1474932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32984	NC_012815	GT	3	6	1474988	1474993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32985	NC_012815	ATG	2	6	1475183	1475188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32986	NC_012815	TCC	2	6	1475209	1475214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32987	NC_012815	CGG	2	6	1475225	1475230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32988	NC_012815	GCG	2	6	1475268	1475273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32990	NC_012815	GAC	3	9	1475323	1475331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32991	NC_012815	CAC	2	6	1475336	1475341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32996	NC_012815	GCCC	2	8	1475739	1475746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32997	NC_012815	CGA	2	6	1475795	1475800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32999	NC_012815	CTG	2	6	1476025	1476030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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