MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_012815	CGG	2	6	1272940	1272945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196533
28503	NC_012815	TCG	2	6	1272948	1272953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196533
28504	NC_012815	CTT	3	9	1272971	1272979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196533
28505	NC_012815	TCG	2	6	1272997	1273002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196533
28506	NC_012815	CGT	2	6	1273055	1273060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28507	NC_012815	TGCT	2	8	1273062	1273069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28508	NC_012815	ATT	2	6	1273133	1273138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28509	NC_012815	TCC	2	6	1273172	1273177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196534
28510	NC_012815	CGA	2	6	1273230	1273235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196534
28511	NC_012815	GCC	2	6	1273238	1273243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196534
28512	NC_012815	TCC	2	6	1273259	1273264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196534
28513	NC_012815	TCG	2	6	1273298	1273303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196534
28514	NC_012815	CCA	2	6	1273309	1273314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196534
28515	NC_012815	CCGC	2	8	1273332	1273339	0 %	0 %	25 %	75 %	241196534
28516	NC_012815	CGG	2	6	1273356	1273361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196534
28517	NC_012815	CGA	2	6	1273392	1273397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196534
28518	NC_012815	CGCA	2	8	1273400	1273407	25 %	0 %	25 %	50 %	241196534
28519	NC_012815	CCG	2	6	1273408	1273413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196534
28520	NC_012815	GCG	2	6	1273493	1273498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196534
28521	NC_012815	CCA	2	6	1273539	1273544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196534
28522	NC_012815	ATG	2	6	1273550	1273555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196534
28523	NC_012815	ATCGC	2	10	1273556	1273565	20 %	20 %	20 %	40 %	241196534
28524	NC_012815	TCA	2	6	1273613	1273618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196534
28525	NC_012815	GCA	2	6	1273671	1273676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196534
28526	NC_012815	GCC	3	9	1273694	1273702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196534
28527	NC_012815	CCG	2	6	1273799	1273804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196534
28528	NC_012815	GGC	2	6	1273909	1273914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28529	NC_012815	CAG	2	6	1274046	1274051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28530	NC_012815	GTG	2	6	1274158	1274163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196535
28531	NC_012815	GC	4	8	1274202	1274209	0 %	0 %	50 %	50 %	241196535
28532	NC_012815	CA	3	6	1274256	1274261	50 %	0 %	0 %	50 %	241196535
28533	NC_012815	CCG	2	6	1274321	1274326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196535
28534	NC_012815	ACG	2	6	1274336	1274341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28535	NC_012815	GAC	2	6	1274350	1274355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28536	NC_012815	CGC	2	6	1274365	1274370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196535
28537	NC_012815	GC	3	6	1274390	1274395	0 %	0 %	50 %	50 %	241196535
28538	NC_012815	GCA	2	6	1274417	1274422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28539	NC_012815	TCA	2	6	1274477	1274482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196535
28540	NC_012815	GGA	2	6	1274484	1274489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196535
28541	NC_012815	TGG	2	6	1274522	1274527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196535
28542	NC_012815	CTTT	2	8	1274532	1274539	0 %	75 %	0 %	25 %	241196535
28543	NC_012815	CGA	2	6	1274601	1274606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28544	NC_012815	ACC	2	6	1274665	1274670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196535
28545	NC_012815	TGCCA	2	10	1274734	1274743	20 %	20 %	20 %	40 %	241196535
28546	NC_012815	GGCA	2	8	1274759	1274766	25 %	0 %	50 %	25 %	241196535
28547	NC_012815	GAT	2	6	1274779	1274784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196535
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28549	NC_012815	GCA	2	6	1274810	1274815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28550	NC_012815	ATG	2	6	1274878	1274883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196535
28551	NC_012815	CCG	2	6	1274891	1274896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196535
28552	NC_012815	GCA	2	6	1274913	1274918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28553	NC_012815	AGC	2	6	1274927	1274932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196535
28554	NC_012815	CCG	2	6	1275065	1275070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196535
28555	NC_012815	TCC	2	6	1275140	1275145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28556	NC_012815	CAG	2	6	1275173	1275178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28557	NC_012815	TGG	2	6	1275196	1275201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196536
28558	NC_012815	CACGG	2	10	1275213	1275222	20 %	0 %	40 %	40 %	241196536
28559	NC_012815	GGC	2	6	1275276	1275281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196536
28560	NC_012815	CGA	2	6	1275305	1275310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28561	NC_012815	CATGCA	2	12	1275341	1275352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241196536
28562	NC_012815	GCA	2	6	1275417	1275422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
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28564	NC_012815	TCG	2	6	1275568	1275573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28565	NC_012815	GCC	3	9	1275594	1275602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196536
28566	NC_012815	CGT	2	6	1275614	1275619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196536
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28569	NC_012815	TGC	2	6	1275733	1275738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28570	NC_012815	GAT	2	6	1275767	1275772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196536
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28572	NC_012815	CTC	2	6	1275790	1275795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196536
28573	NC_012815	CAT	2	6	1275818	1275823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196536
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28579	NC_012815	ACCT	2	8	1276196	1276203	25 %	25 %	0 %	50 %	241196536
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28583	NC_012815	GAC	2	6	1276296	1276301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
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28587	NC_012815	GAT	2	6	1276472	1276477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196536
28588	NC_012815	ATC	2	6	1276485	1276490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196536
28589	NC_012815	GCC	2	6	1276491	1276496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196536
28590	NC_012815	CA	3	6	1276679	1276684	50 %	0 %	0 %	50 %	241196536
28591	NC_012815	TGCC	2	8	1276702	1276709	0 %	25 %	25 %	50 %	241196536
28592	NC_012815	ATC	2	6	1276716	1276721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196536
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28595	NC_012815	CAT	2	6	1276826	1276831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196536
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28597	NC_012815	GAC	2	6	1276851	1276856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28598	NC_012815	ACG	2	6	1276900	1276905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28599	NC_012815	CAC	2	6	1276961	1276966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196536
28600	NC_012815	ACG	3	9	1276978	1276986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28601	NC_012815	GTG	2	6	1276989	1276994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196536
28602	NC_012815	TGG	2	6	1277035	1277040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196536
28603	NC_012815	CG	3	6	1277047	1277052	0 %	0 %	50 %	50 %	241196536
28604	NC_012815	TGA	2	6	1277072	1277077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196536
28605	NC_012815	AAG	2	6	1277244	1277249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196536
28606	NC_012815	GGA	2	6	1277252	1277257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196536
28607	NC_012815	TCA	2	6	1277301	1277306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196536
28608	NC_012815	CCT	2	6	1277318	1277323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196536
28609	NC_012815	GGC	2	6	1277352	1277357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196536
28610	NC_012815	CAG	2	6	1277358	1277363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196536
28611	NC_012815	GCG	2	6	1277421	1277426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28612	NC_012815	GCT	2	6	1277495	1277500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196537
28613	NC_012815	CTC	2	6	1277533	1277538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196537
28614	NC_012815	CTG	2	6	1277545	1277550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196537
28615	NC_012815	ACC	2	6	1277555	1277560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196537
28616	NC_012815	TCG	2	6	1277618	1277623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196537
28617	NC_012815	TCT	2	6	1277667	1277672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196537
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28627	NC_012815	GAT	2	6	1278090	1278095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196537
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28633	NC_012815	CTC	2	6	1278216	1278221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28634	NC_012815	TGAC	2	8	1278261	1278268	25 %	25 %	25 %	25 %	241196538
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28722	NC_012815	CTT	2	6	1281787	1281792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196540
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28727	NC_012815	AGT	2	6	1281942	1281947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196540
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28729	NC_012815	TCG	2	6	1282070	1282075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196540
28730	NC_012815	CGC	2	6	1282089	1282094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196540
28731	NC_012815	GTCGCG	2	12	1282108	1282119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196540
28732	NC_012815	TTG	2	6	1282148	1282153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196540
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28752	NC_012815	CA	3	6	1283149	1283154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28753	NC_012815	TG	3	6	1283157	1283162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28754	NC_012815	GCC	2	6	1283166	1283171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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28833	NC_012815	GCA	2	6	1286612	1286617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28844	NC_012815	CCA	2	6	1287091	1287096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28848	NC_012815	CCT	2	6	1287235	1287240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28849	NC_012815	CGCC	2	8	1287280	1287287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28850	NC_012815	CTCAC	2	10	1287294	1287303	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28851	NC_012815	CTTC	2	8	1287370	1287377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28852	NC_012815	ACG	2	6	1287395	1287400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28854	NC_012815	CG	3	6	1287420	1287425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28855	NC_012815	TCC	2	6	1287438	1287443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28858	NC_012815	CTT	2	6	1287485	1287490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28861	NC_012815	ACG	2	6	1287536	1287541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28862	NC_012815	GAGT	2	8	1287550	1287557	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28863	NC_012815	CCTTT	2	10	1287656	1287665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28864	NC_012815	CTA	2	6	1287667	1287672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196547
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28872	NC_012815	TCG	2	6	1288223	1288228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196547
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28965	NC_012815	TCG	2	6	1292956	1292961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196550
28966	NC_012815	CAC	2	6	1293035	1293040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196550
28967	NC_012815	CGA	2	6	1293101	1293106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196550
28968	NC_012815	CG	3	6	1293118	1293123	0 %	0 %	50 %	50 %	241196550
28969	NC_012815	CAT	2	6	1293249	1293254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196551
28970	NC_012815	CTT	2	6	1293328	1293333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196551
28971	NC_012815	ATC	2	6	1293350	1293355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196551
28972	NC_012815	CGA	2	6	1293517	1293522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28973	NC_012815	CTG	2	6	1293553	1293558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28974	NC_012815	TCC	3	9	1293563	1293571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196551
28975	NC_012815	CGA	2	6	1293588	1293593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28976	NC_012815	GCG	2	6	1293676	1293681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196551
28977	NC_012815	GC	3	6	1293686	1293691	0 %	0 %	50 %	50 %	241196551
28978	NC_012815	CGT	2	6	1293771	1293776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28979	NC_012815	GCC	2	6	1293785	1293790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196551
28980	NC_012815	GC	3	6	1293842	1293847	0 %	0 %	50 %	50 %	241196551
28981	NC_012815	AGC	2	6	1293848	1293853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28982	NC_012815	GCCATA	2	12	1293880	1293891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241196551
28983	NC_012815	CAG	2	6	1293910	1293915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28984	NC_012815	GTG	2	6	1294001	1294006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196551
28985	NC_012815	GTT	2	6	1294030	1294035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196551
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28987	NC_012815	TG	4	8	1294133	1294140	0 %	50 %	50 %	0 %	241196551
28988	NC_012815	TTC	2	6	1294187	1294192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196551
28989	NC_012815	GCC	2	6	1294261	1294266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196551
28990	NC_012815	TC	3	6	1294347	1294352	0 %	50 %	0 %	50 %	241196551
28991	NC_012815	ACG	2	6	1294376	1294381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28992	NC_012815	CTC	2	6	1294405	1294410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196551
28993	NC_012815	TCC	2	6	1294433	1294438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196551
28994	NC_012815	ATA	2	6	1294498	1294503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196551
28995	NC_012815	CGT	2	6	1294561	1294566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196551
28996	NC_012815	GCG	2	6	1294591	1294596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196551
28997	NC_012815	TCA	2	6	1294608	1294613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196551
28998	NC_012815	GTT	2	6	1294686	1294691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196552
28999	NC_012815	GACA	2	8	1294726	1294733	50 %	0 %	25 %	25 %	241196552
29000	NC_012815	CGCC	2	8	1294761	1294768	0 %	0 %	25 %	75 %	241196552

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