MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_012815	GCA	2	6	1250956	1250961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28002	NC_012815	CCT	2	6	1251072	1251077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196521
28003	NC_012815	TTCG	2	8	1251085	1251092	0 %	50 %	25 %	25 %	241196521
28004	NC_012815	CGC	2	6	1251154	1251159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196521
28005	NC_012815	CAG	2	6	1251178	1251183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28006	NC_012815	TCG	2	6	1251191	1251196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28007	NC_012815	TTGCGC	2	12	1251245	1251256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28008	NC_012815	TCG	2	6	1251272	1251277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28009	NC_012815	CTC	2	6	1251283	1251288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196521
28010	NC_012815	TTG	2	6	1251332	1251337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196521
28011	NC_012815	CGG	2	6	1251384	1251389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196521
28012	NC_012815	CG	3	6	1251470	1251475	0 %	0 %	50 %	50 %	241196521
28013	NC_012815	GACC	2	8	1251489	1251496	25 %	0 %	25 %	50 %	241196521
28014	NC_012815	GGCA	2	8	1251538	1251545	25 %	0 %	50 %	25 %	241196521
28015	NC_012815	CGG	2	6	1251585	1251590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196521
28016	NC_012815	GTC	2	6	1251598	1251603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28017	NC_012815	GCT	2	6	1251660	1251665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28018	NC_012815	GCG	2	6	1251782	1251787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196521
28019	NC_012815	GC	3	6	1251800	1251805	0 %	0 %	50 %	50 %	241196521
28020	NC_012815	GAATCT	2	12	1251825	1251836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241196521
28021	NC_012815	GCC	2	6	1251847	1251852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196521
28022	NC_012815	CGT	2	6	1251865	1251870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28023	NC_012815	CCGG	2	8	1251922	1251929	0 %	0 %	50 %	50 %	241196521
28024	NC_012815	TGCA	2	8	1251946	1251953	25 %	25 %	25 %	25 %	241196521
28025	NC_012815	CGAAT	2	10	1251980	1251989	40 %	20 %	20 %	20 %	241196521
28026	NC_012815	CGA	2	6	1251990	1251995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28027	NC_012815	CCA	2	6	1252008	1252013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196521
28028	NC_012815	ATC	2	6	1252049	1252054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196521
28029	NC_012815	AGT	2	6	1252071	1252076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196521
28030	NC_012815	GGC	2	6	1252083	1252088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196521
28031	NC_012815	CGT	2	6	1252113	1252118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28032	NC_012815	GAT	2	6	1252141	1252146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196521
28033	NC_012815	CGA	2	6	1252185	1252190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28034	NC_012815	ACG	2	6	1252193	1252198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28035	NC_012815	CTT	2	6	1252318	1252323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196521
28036	NC_012815	GC	3	6	1252326	1252331	0 %	0 %	50 %	50 %	241196521
28037	NC_012815	GAC	2	6	1252387	1252392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28038	NC_012815	CGA	2	6	1252419	1252424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28039	NC_012815	CGA	2	6	1252587	1252592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28040	NC_012815	ATG	2	6	1252646	1252651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196521
28041	NC_012815	ACG	2	6	1252666	1252671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196521
28042	NC_012815	CG	3	6	1252696	1252701	0 %	0 %	50 %	50 %	241196521
28043	NC_012815	GCTC	2	8	1252842	1252849	0 %	25 %	25 %	50 %	241196521
28044	NC_012815	CCT	2	6	1252862	1252867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28045	NC_012815	CTC	2	6	1252872	1252877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28046	NC_012815	GC	3	6	1252951	1252956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28047	NC_012815	CGCTC	2	10	1252983	1252992	0 %	20 %	20 %	60 %	241196522
28048	NC_012815	GT	3	6	1253091	1253096	0 %	50 %	50 %	0 %	241196522
28049	NC_012815	CGG	2	6	1253230	1253235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196522
28050	NC_012815	GTC	2	6	1253301	1253306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196522
28051	NC_012815	GCAT	2	8	1253331	1253338	25 %	25 %	25 %	25 %	241196522
28052	NC_012815	TCG	2	6	1253415	1253420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196522
28053	NC_012815	GGC	2	6	1253428	1253433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196523
28054	NC_012815	GTG	2	6	1253465	1253470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196523
28055	NC_012815	TCA	2	6	1253522	1253527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196523
28056	NC_012815	TCG	2	6	1253612	1253617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196523
28057	NC_012815	CTC	2	6	1253671	1253676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196523
28058	NC_012815	TAC	2	6	1253769	1253774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28059	NC_012815	GAC	2	6	1253863	1253868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28060	NC_012815	GCA	2	6	1253902	1253907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28061	NC_012815	CGA	2	6	1253979	1253984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28062	NC_012815	CAC	2	6	1254039	1254044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196524
28063	NC_012815	CAG	2	6	1254055	1254060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28064	NC_012815	TGAGC	2	10	1254135	1254144	20 %	20 %	40 %	20 %	241196524
28065	NC_012815	TCGA	2	8	1254172	1254179	25 %	25 %	25 %	25 %	241196524
28066	NC_012815	GAA	2	6	1254186	1254191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196524
28067	NC_012815	GC	3	6	1254219	1254224	0 %	0 %	50 %	50 %	241196524
28068	NC_012815	GGC	2	6	1254276	1254281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196524
28069	NC_012815	CGG	2	6	1254322	1254327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196524
28070	NC_012815	CGG	2	6	1254365	1254370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196524
28071	NC_012815	ACA	2	6	1254410	1254415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196524
28072	NC_012815	GTG	2	6	1254418	1254423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196524
28073	NC_012815	CAA	2	6	1254429	1254434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196524
28074	NC_012815	CGC	2	6	1254435	1254440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196524
28075	NC_012815	CGA	2	6	1254486	1254491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28076	NC_012815	CGA	2	6	1254513	1254518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28077	NC_012815	CCCTC	2	10	1254521	1254530	0 %	20 %	0 %	80 %	241196524
28078	NC_012815	GC	3	6	1254565	1254570	0 %	0 %	50 %	50 %	241196524
28079	NC_012815	GAC	2	6	1254639	1254644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28080	NC_012815	CCGCA	2	10	1254660	1254669	20 %	0 %	20 %	60 %	241196524
28081	NC_012815	CCA	2	6	1254707	1254712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196524
28082	NC_012815	CCAG	2	8	1254821	1254828	25 %	0 %	25 %	50 %	241196524
28083	NC_012815	CGA	2	6	1254846	1254851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28084	NC_012815	CGA	2	6	1254888	1254893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28085	NC_012815	GAA	2	6	1254969	1254974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196524
28086	NC_012815	AGCC	2	8	1255018	1255025	25 %	0 %	25 %	50 %	241196524
28087	NC_012815	AGC	2	6	1255028	1255033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28088	NC_012815	CGA	3	9	1255038	1255046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28089	NC_012815	CCCA	2	8	1255051	1255058	25 %	0 %	0 %	75 %	241196524
28090	NC_012815	AGC	2	6	1255091	1255096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196524
28091	NC_012815	CGC	2	6	1255100	1255105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196524
28092	NC_012815	CGA	2	6	1255196	1255201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28093	NC_012815	CATC	2	8	1255220	1255227	25 %	25 %	0 %	50 %	241196525
28094	NC_012815	CAT	2	6	1255230	1255235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196525
28095	NC_012815	TC	3	6	1255307	1255312	0 %	50 %	0 %	50 %	241196525
28096	NC_012815	GGC	2	6	1255314	1255319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196525
28097	NC_012815	CAAT	2	8	1255381	1255388	50 %	25 %	0 %	25 %	241196525
28098	NC_012815	CTG	2	6	1255392	1255397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28099	NC_012815	CACG	2	8	1255411	1255418	25 %	0 %	25 %	50 %	241196525
28100	NC_012815	CCA	2	6	1255508	1255513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196525
28101	NC_012815	CTG	2	6	1255524	1255529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28102	NC_012815	TCG	2	6	1255564	1255569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28103	NC_012815	GCCAT	2	10	1255585	1255594	20 %	20 %	20 %	40 %	241196525
28104	NC_012815	TCG	2	6	1255687	1255692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28105	NC_012815	AGGT	2	8	1255741	1255748	25 %	25 %	50 %	0 %	241196525
28106	NC_012815	CGG	2	6	1255772	1255777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196525
28107	NC_012815	CGC	2	6	1255833	1255838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196525
28108	NC_012815	TGG	2	6	1255880	1255885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196525
28109	NC_012815	TGA	2	6	1255904	1255909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196525
28110	NC_012815	TTC	2	6	1255938	1255943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196525
28111	NC_012815	CAC	2	6	1255955	1255960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196525
28112	NC_012815	GGTGCC	2	12	1256040	1256051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196525
28113	NC_012815	GCC	2	6	1256065	1256070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196525
28114	NC_012815	GTG	3	9	1256071	1256079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196525
28115	NC_012815	GTTG	2	8	1256105	1256112	0 %	50 %	50 %	0 %	241196525
28116	NC_012815	GTTC	2	8	1256117	1256124	0 %	50 %	25 %	25 %	241196525
28117	NC_012815	TGAG	2	8	1256126	1256133	25 %	25 %	50 %	0 %	241196525
28118	NC_012815	TCCA	2	8	1256184	1256191	25 %	25 %	0 %	50 %	241196525
28119	NC_012815	CAC	2	6	1256196	1256201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196525
28120	NC_012815	GC	3	6	1256215	1256220	0 %	0 %	50 %	50 %	241196525
28121	NC_012815	GCA	2	6	1256306	1256311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196525
28122	NC_012815	GC	3	6	1256327	1256332	0 %	0 %	50 %	50 %	241196525
28123	NC_012815	CTG	2	6	1256346	1256351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196525
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28127	NC_012815	GCAG	3	12	1256601	1256612	25 %	0 %	50 %	25 %	241196526
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28130	NC_012815	CG	5	10	1256716	1256725	0 %	0 %	50 %	50 %	241196526
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28218	NC_012815	GAG	2	6	1260415	1260420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28219	NC_012815	GCG	2	6	1260463	1260468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196528
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28223	NC_012815	CG	3	6	1260671	1260676	0 %	0 %	50 %	50 %	241196528
28224	NC_012815	GCA	2	6	1260685	1260690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196528
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28226	NC_012815	CGT	2	6	1260708	1260713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28227	NC_012815	GC	3	6	1260729	1260734	0 %	0 %	50 %	50 %	241196528
28228	NC_012815	GCCGGC	2	12	1260771	1260782	0 %	0 %	50 %	50 %	241196528
28229	NC_012815	GCA	2	6	1260868	1260873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28230	NC_012815	TCC	2	6	1260951	1260956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196528
28231	NC_012815	CCG	2	6	1260990	1260995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28232	NC_012815	ATG	2	6	1261029	1261034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196528
28233	NC_012815	ATC	2	6	1261068	1261073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196528
28234	NC_012815	CCT	2	6	1261075	1261080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196528
28235	NC_012815	CCG	3	9	1261122	1261130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28236	NC_012815	ACCG	2	8	1261215	1261222	25 %	0 %	25 %	50 %	241196528
28237	NC_012815	ATG	2	6	1261303	1261308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196528
28238	NC_012815	GTC	2	6	1261326	1261331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28239	NC_012815	CTCCGG	2	12	1261340	1261351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241196528
28240	NC_012815	CTC	2	6	1261379	1261384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196528
28241	NC_012815	CGT	2	6	1261411	1261416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28242	NC_012815	ATCGC	2	10	1261431	1261440	20 %	20 %	20 %	40 %	241196528
28243	NC_012815	GGA	2	6	1261487	1261492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196528
28244	NC_012815	CCG	2	6	1261531	1261536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28245	NC_012815	GAA	2	6	1261538	1261543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196528
28246	NC_012815	CGC	2	6	1261573	1261578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28247	NC_012815	CACC	2	8	1261591	1261598	25 %	0 %	0 %	75 %	241196528
28248	NC_012815	TCG	2	6	1261626	1261631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28249	NC_012815	TCCA	2	8	1261736	1261743	25 %	25 %	0 %	50 %	241196528
28250	NC_012815	CGC	2	6	1261759	1261764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28251	NC_012815	GCC	2	6	1261833	1261838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196528
28252	NC_012815	GCGA	2	8	1261858	1261865	25 %	0 %	50 %	25 %	241196528
28253	NC_012815	TCGT	2	8	1261916	1261923	0 %	50 %	25 %	25 %	241196528
28254	NC_012815	TGA	2	6	1261936	1261941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196528
28255	NC_012815	GTTC	2	8	1262086	1262093	0 %	50 %	25 %	25 %	241196528
28256	NC_012815	GGCC	2	8	1262116	1262123	0 %	0 %	50 %	50 %	241196528
28257	NC_012815	GTCC	2	8	1262165	1262172	0 %	25 %	25 %	50 %	241196528
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28261	NC_012815	CGT	2	6	1262377	1262382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
28262	NC_012815	AGC	3	9	1262415	1262423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196528
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28264	NC_012815	GC	3	6	1262441	1262446	0 %	0 %	50 %	50 %	241196528
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28270	NC_012815	CCT	2	6	1262646	1262651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196528
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28283	NC_012815	CACC	2	8	1263184	1263191	25 %	0 %	0 %	75 %	241196528
28284	NC_012815	TCG	2	6	1263213	1263218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196528
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28342	NC_012815	GC	3	6	1265779	1265784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28343	NC_012815	TCG	2	6	1265800	1265805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28344	NC_012815	CGT	2	6	1265946	1265951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28345	NC_012815	ATA	2	6	1265965	1265970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28346	NC_012815	TATG	2	8	1265994	1266001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28347	NC_012815	GAGCGC	2	12	1266006	1266017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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28349	NC_012815	CAG	3	9	1266057	1266065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28351	NC_012815	GCG	2	6	1266196	1266201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28354	NC_012815	CCA	2	6	1266326	1266331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28461	NC_012815	CTC	2	6	1271422	1271427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28462	NC_012815	AG	3	6	1271450	1271455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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28464	NC_012815	GCAC	2	8	1271508	1271515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28465	NC_012815	GTC	2	6	1271669	1271674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196533
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