MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26503	NC_012815	CGC	2	6	1183399	1183404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196468
26504	NC_012815	ACG	2	6	1183422	1183427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196468
26505	NC_012815	GCC	2	6	1183437	1183442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196468
26506	NC_012815	TGC	2	6	1183454	1183459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196468
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26509	NC_012815	TGC	2	6	1183602	1183607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196468
26510	NC_012815	ATG	2	6	1183629	1183634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196468
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26616	NC_012815	C	6	6	1188530	1188535	0 %	0 %	0 %	100 %	241196472
26617	NC_012815	GGC	2	6	1188555	1188560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196472
26618	NC_012815	TGC	2	6	1188569	1188574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196472
26619	NC_012815	TCC	2	6	1188653	1188658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196472
26620	NC_012815	GCAG	2	8	1188667	1188674	25 %	0 %	50 %	25 %	241196472
26621	NC_012815	GCT	2	6	1188678	1188683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196472
26622	NC_012815	TGG	2	6	1188715	1188720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196472
26623	NC_012815	G	6	6	1188719	1188724	0 %	0 %	100 %	0 %	241196472
26624	NC_012815	GCT	2	6	1188783	1188788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196472
26625	NC_012815	GAAAC	2	10	1188802	1188811	60 %	0 %	20 %	20 %	241196472
26626	NC_012815	CCG	2	6	1188849	1188854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196472
26627	NC_012815	AGG	2	6	1188860	1188865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196472
26628	NC_012815	GCC	2	6	1188874	1188879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196472
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26631	NC_012815	GAT	2	6	1189122	1189127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196472
26632	NC_012815	CCT	2	6	1189226	1189231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196472
26633	NC_012815	GCA	2	6	1189245	1189250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196472
26634	NC_012815	GGC	2	6	1189272	1189277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196472
26635	NC_012815	CTG	2	6	1189287	1189292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196472
26636	NC_012815	GT	3	6	1189454	1189459	0 %	50 %	50 %	0 %	241196473
26637	NC_012815	AAC	2	6	1189643	1189648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196473
26638	NC_012815	AAT	2	6	1189711	1189716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196473
26639	NC_012815	GC	3	6	1189724	1189729	0 %	0 %	50 %	50 %	241196473
26640	NC_012815	TCCA	2	8	1189761	1189768	25 %	25 %	0 %	50 %	241196473
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26642	NC_012815	CTG	2	6	1189918	1189923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196473
26643	NC_012815	CGA	2	6	1190058	1190063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196473
26644	NC_012815	CTT	2	6	1190098	1190103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196473
26645	NC_012815	GCA	2	6	1190106	1190111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196473
26646	NC_012815	CGG	2	6	1190115	1190120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196473
26647	NC_012815	GGTC	2	8	1190145	1190152	0 %	25 %	50 %	25 %	241196473
26648	NC_012815	CGC	2	6	1190172	1190177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196473
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26650	NC_012815	GGCC	2	8	1190286	1190293	0 %	0 %	50 %	50 %	241196473
26651	NC_012815	CATG	2	8	1190307	1190314	25 %	25 %	25 %	25 %	241196473
26652	NC_012815	AC	3	6	1190315	1190320	50 %	0 %	0 %	50 %	241196473
26653	NC_012815	CAT	2	6	1190401	1190406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196473
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26655	NC_012815	GC	3	6	1190474	1190479	0 %	0 %	50 %	50 %	241196473
26656	NC_012815	CGA	2	6	1190529	1190534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196473
26657	NC_012815	AT	3	6	1190552	1190557	50 %	50 %	0 %	0 %	241196473
26658	NC_012815	ATG	3	9	1190606	1190614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196473
26659	NC_012815	CGA	2	6	1190640	1190645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196473
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26661	NC_012815	CTC	2	6	1190692	1190697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196473
26662	NC_012815	AAT	2	6	1190718	1190723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196473
26663	NC_012815	GCA	2	6	1190789	1190794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196473
26664	NC_012815	CCT	2	6	1190839	1190844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26665	NC_012815	TGCA	2	8	1190916	1190923	25 %	25 %	25 %	25 %	241196474
26666	NC_012815	GCAT	2	8	1190930	1190937	25 %	25 %	25 %	25 %	241196474
26667	NC_012815	CTG	2	6	1191038	1191043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196474
26668	NC_012815	GCAT	2	8	1191048	1191055	25 %	25 %	25 %	25 %	241196474
26669	NC_012815	CGA	2	6	1191058	1191063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196474
26670	NC_012815	CATC	2	8	1191163	1191170	25 %	25 %	0 %	50 %	241196474
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26680	NC_012815	AGGC	2	8	1191691	1191698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26681	NC_012815	AC	4	8	1191712	1191719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26682	NC_012815	CA	3	6	1191722	1191727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26683	NC_012815	CA	3	6	1191731	1191736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26684	NC_012815	AC	3	6	1191783	1191788	50 %	0 %	0 %	50 %	241196475
26685	NC_012815	CAT	2	6	1191796	1191801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196475
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26687	NC_012815	TTC	2	6	1191827	1191832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196475
26688	NC_012815	C	6	6	1191854	1191859	0 %	0 %	0 %	100 %	241196475
26689	NC_012815	TCG	2	6	1191909	1191914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
26690	NC_012815	TCG	2	6	1191948	1191953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
26691	NC_012815	GGCG	2	8	1191961	1191968	0 %	0 %	75 %	25 %	241196475
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26694	NC_012815	TTC	2	6	1192154	1192159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196475
26695	NC_012815	CTG	2	6	1192229	1192234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
26696	NC_012815	TCG	2	6	1192245	1192250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
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26699	NC_012815	CAT	2	6	1192477	1192482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196475
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26702	NC_012815	TG	3	6	1192657	1192662	0 %	50 %	50 %	0 %	241196475
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26704	NC_012815	CAT	2	6	1192789	1192794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196475
26705	NC_012815	CTG	2	6	1192890	1192895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
26706	NC_012815	TCG	2	6	1192956	1192961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196475
26707	NC_012815	CGG	2	6	1192969	1192974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196475
26708	NC_012815	TTGG	2	8	1193031	1193038	0 %	50 %	50 %	0 %	241196475
26709	NC_012815	CG	3	6	1193152	1193157	0 %	0 %	50 %	50 %	241196476
26710	NC_012815	GCC	2	6	1193250	1193255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196476
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26713	NC_012815	GCCA	2	8	1193399	1193406	25 %	0 %	25 %	50 %	241196476
26714	NC_012815	GTCG	2	8	1193424	1193431	0 %	25 %	50 %	25 %	241196476
26715	NC_012815	AGA	2	6	1193432	1193437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196476
26716	NC_012815	CGC	2	6	1193447	1193452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196476
26717	NC_012815	CGG	2	6	1193508	1193513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196476
26718	NC_012815	CTG	2	6	1193526	1193531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196476
26719	NC_012815	CG	3	6	1193763	1193768	0 %	0 %	50 %	50 %	241196476
26720	NC_012815	CGG	2	6	1193774	1193779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196476
26721	NC_012815	CCGG	2	8	1193788	1193795	0 %	0 %	50 %	50 %	241196476
26722	NC_012815	CGT	2	6	1193825	1193830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196476
26723	NC_012815	GAT	2	6	1193859	1193864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196476
26724	NC_012815	AC	3	6	1193955	1193960	50 %	0 %	0 %	50 %	241196476
26725	NC_012815	GTG	2	6	1194007	1194012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196476
26726	NC_012815	CCG	2	6	1194064	1194069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196476
26727	NC_012815	GCC	2	6	1194100	1194105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196476
26728	NC_012815	TCCG	2	8	1194106	1194113	0 %	25 %	25 %	50 %	241196476
26729	NC_012815	TCG	2	6	1194158	1194163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196477
26730	NC_012815	TGCT	2	8	1194179	1194186	0 %	50 %	25 %	25 %	241196477
26731	NC_012815	CGG	2	6	1194225	1194230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196477
26732	NC_012815	CGA	2	6	1194243	1194248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196477
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26734	NC_012815	GTGC	2	8	1194340	1194347	0 %	25 %	50 %	25 %	241196477
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26850	NC_012815	TGC	2	6	1199478	1199483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26851	NC_012815	CGG	2	6	1199519	1199524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196479
26852	NC_012815	TCG	2	6	1199556	1199561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26853	NC_012815	CAC	2	6	1199564	1199569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196479
26854	NC_012815	CTG	2	6	1199597	1199602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26855	NC_012815	TCC	2	6	1199613	1199618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196479
26856	NC_012815	ACG	2	6	1199637	1199642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26857	NC_012815	GCCAT	2	10	1199712	1199721	20 %	20 %	20 %	40 %	241196479
26858	NC_012815	GAG	2	6	1199734	1199739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196479
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26860	NC_012815	TCG	2	6	1199886	1199891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26861	NC_012815	CTG	2	6	1200011	1200016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196479
26862	NC_012815	CGG	2	6	1200043	1200048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196479
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26866	NC_012815	AAAT	2	8	1200315	1200322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26867	NC_012815	CATG	2	8	1200336	1200343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26868	NC_012815	TAT	2	6	1200353	1200358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196480
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26871	NC_012815	GC	3	6	1200496	1200501	0 %	0 %	50 %	50 %	241196480
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26897	NC_012815	CTG	2	6	1201559	1201564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26899	NC_012815	CA	3	6	1201577	1201582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26900	NC_012815	AG	3	6	1201664	1201669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26919	NC_012815	TCGTGC	2	12	1202416	1202427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196481
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26937	NC_012815	CATC	2	8	1203106	1203113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26938	NC_012815	AGACA	2	10	1203128	1203137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26939	NC_012815	TGT	2	6	1203147	1203152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26951	NC_012815	ACA	2	6	1203742	1203747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196482
26952	NC_012815	TCA	2	6	1203751	1203756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196482
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26955	NC_012815	GC	4	8	1203917	1203924	0 %	0 %	50 %	50 %	241196482
26956	NC_012815	TTC	2	6	1203951	1203956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196482
26957	NC_012815	CA	3	6	1204004	1204009	50 %	0 %	0 %	50 %	241196482
26958	NC_012815	GGCATC	2	12	1204011	1204022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196482
26959	NC_012815	AGC	2	6	1204044	1204049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196482
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26961	NC_012815	T	8	8	1204282	1204289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26962	NC_012815	GCA	2	6	1204341	1204346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196483
26963	NC_012815	TGCA	2	8	1204347	1204354	25 %	25 %	25 %	25 %	241196483
26964	NC_012815	ATG	2	6	1204378	1204383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196483
26965	NC_012815	AAAG	2	8	1204396	1204403	75 %	0 %	25 %	0 %	241196483
26966	NC_012815	AAC	2	6	1204443	1204448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196483
26967	NC_012815	AAC	2	6	1204452	1204457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196483
26968	NC_012815	CGG	3	9	1204691	1204699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196483
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26970	NC_012815	T	6	6	1204782	1204787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26973	NC_012815	GGCTA	2	10	1204828	1204837	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26974	NC_012815	AGG	2	6	1204862	1204867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26991	NC_012815	GC	3	6	1205543	1205548	0 %	0 %	50 %	50 %	241196485
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