MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_012815	CGC	2	6	846076	846081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196163
19502	NC_012815	GGA	2	6	846120	846125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196163
19503	NC_012815	CTT	2	6	846135	846140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196163
19504	NC_012815	GC	3	6	846232	846237	0 %	0 %	50 %	50 %	241196163
19505	NC_012815	GCC	2	6	846283	846288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196163
19506	NC_012815	TGC	2	6	846311	846316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196163
19507	NC_012815	CGT	2	6	846326	846331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196163
19508	NC_012815	GCC	2	6	846542	846547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196163
19509	NC_012815	CCGAG	2	10	846572	846581	20 %	0 %	40 %	40 %	241196163
19510	NC_012815	AAG	2	6	846610	846615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196163
19511	NC_012815	GGC	2	6	846616	846621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196163
19512	NC_012815	GGC	2	6	846640	846645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196163
19513	NC_012815	TGC	2	6	846668	846673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196163
19514	NC_012815	AT	3	6	846697	846702	50 %	50 %	0 %	0 %	241196163
19515	NC_012815	TGC	3	9	846740	846748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196163
19516	NC_012815	TCG	2	6	846776	846781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196163
19517	NC_012815	GCTG	2	8	846849	846856	0 %	25 %	50 %	25 %	241196164
19518	NC_012815	GAG	4	12	846929	846940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196164
19519	NC_012815	TCG	3	9	846969	846977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19520	NC_012815	TGG	2	6	846984	846989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196164
19521	NC_012815	AGA	2	6	847008	847013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196164
19522	NC_012815	TCA	2	6	847023	847028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196164
19523	NC_012815	GGA	2	6	847051	847056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196164
19524	NC_012815	ACG	2	6	847062	847067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19525	NC_012815	CGA	2	6	847069	847074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19526	NC_012815	CAT	2	6	847099	847104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196164
19527	NC_012815	GCG	2	6	847107	847112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196164
19528	NC_012815	GTC	3	9	847139	847147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19529	NC_012815	TGC	2	6	847164	847169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19530	NC_012815	CAT	2	6	847270	847275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196164
19531	NC_012815	CTG	2	6	847277	847282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19532	NC_012815	CGA	2	6	847330	847335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19533	NC_012815	CTG	2	6	847346	847351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19534	NC_012815	CGA	2	6	847357	847362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19535	NC_012815	GCC	2	6	847472	847477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196164
19536	NC_012815	ATC	2	6	847538	847543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196164
19537	NC_012815	GAC	2	6	847547	847552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19538	NC_012815	CGTT	2	8	847670	847677	0 %	50 %	25 %	25 %	241196164
19539	NC_012815	CATG	2	8	847729	847736	25 %	25 %	25 %	25 %	241196164
19540	NC_012815	TCG	2	6	847767	847772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19541	NC_012815	AAG	2	6	847817	847822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196164
19542	NC_012815	TCA	2	6	847848	847853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196164
19543	NC_012815	GACG	2	8	847930	847937	25 %	0 %	50 %	25 %	241196164
19544	NC_012815	CGC	2	6	848000	848005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196164
19545	NC_012815	CGC	2	6	848030	848035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196164
19546	NC_012815	AAC	2	6	848144	848149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196164
19547	NC_012815	CTCG	2	8	848203	848210	0 %	25 %	25 %	50 %	241196164
19548	NC_012815	CAA	2	6	848221	848226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196164
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19550	NC_012815	CGA	2	6	848425	848430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19551	NC_012815	CGA	2	6	848455	848460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19552	NC_012815	TGG	2	6	848478	848483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196164
19553	NC_012815	CGA	2	6	848758	848763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19554	NC_012815	AGC	2	6	848796	848801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196164
19555	NC_012815	GATG	2	8	848843	848850	25 %	25 %	50 %	0 %	241196164
19556	NC_012815	GCATC	2	10	848899	848908	20 %	20 %	20 %	40 %	241196164
19557	NC_012815	GTCGC	2	10	848982	848991	0 %	20 %	40 %	40 %	241196164
19558	NC_012815	GC	3	6	848990	848995	0 %	0 %	50 %	50 %	241196164
19559	NC_012815	CGGT	2	8	849015	849022	0 %	25 %	50 %	25 %	241196164
19560	NC_012815	CAA	2	6	849124	849129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196164
19561	NC_012815	CCG	2	6	849161	849166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196164
19562	NC_012815	GGC	2	6	849238	849243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196164
19563	NC_012815	AAG	2	6	849308	849313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196164
19564	NC_012815	TTG	2	6	849393	849398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196164
19565	NC_012815	AGA	2	6	849399	849404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196164
19566	NC_012815	GGCA	2	8	849441	849448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19567	NC_012815	AGC	2	6	849489	849494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196165
19568	NC_012815	CAT	2	6	849536	849541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196165
19569	NC_012815	GCT	2	6	849542	849547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196165
19570	NC_012815	CAAT	2	8	849573	849580	50 %	25 %	0 %	25 %	241196165
19571	NC_012815	CGA	3	9	849631	849639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196165
19572	NC_012815	CCG	2	6	849641	849646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196165
19573	NC_012815	TCC	2	6	849656	849661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196165
19574	NC_012815	GCCCAG	2	12	849770	849781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241196165
19575	NC_012815	CAG	2	6	849827	849832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196165
19576	NC_012815	GGA	2	6	849887	849892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196165
19577	NC_012815	GCC	2	6	849901	849906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196165
19578	NC_012815	TCA	2	6	849930	849935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196165
19579	NC_012815	GAC	2	6	849959	849964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196165
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19581	NC_012815	TGC	2	6	850047	850052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196165
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19583	NC_012815	AAT	2	6	850226	850231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196165
19584	NC_012815	TTCA	2	8	850303	850310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19585	NC_012815	CATG	2	8	850313	850320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19586	NC_012815	GGAGG	2	10	850438	850447	20 %	0 %	80 %	0 %	241196166
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19589	NC_012815	TGGC	2	8	850493	850500	0 %	25 %	50 %	25 %	241196166
19590	NC_012815	GGA	2	6	850569	850574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196166
19591	NC_012815	GGC	2	6	850647	850652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196166
19592	NC_012815	GGT	3	9	850671	850679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196166
19593	NC_012815	GCA	2	6	850710	850715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196166
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19595	NC_012815	TAT	2	6	850729	850734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196166
19596	NC_012815	CGA	2	6	850821	850826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196166
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19598	NC_012815	AC	3	6	851041	851046	50 %	0 %	0 %	50 %	241196166
19599	NC_012815	TCGA	2	8	851342	851349	25 %	25 %	25 %	25 %	241196166
19600	NC_012815	CGG	2	6	851402	851407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196166
19601	NC_012815	ATG	2	6	851447	851452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196166
19602	NC_012815	GGC	2	6	851513	851518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196167
19603	NC_012815	TGG	2	6	851569	851574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196167
19604	NC_012815	CAA	2	6	851576	851581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196167
19605	NC_012815	CAG	2	6	851736	851741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196167
19606	NC_012815	TGA	2	6	851770	851775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196167
19607	NC_012815	GT	3	6	851802	851807	0 %	50 %	50 %	0 %	241196167
19608	NC_012815	CTG	2	6	851829	851834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196167
19609	NC_012815	GC	3	6	851857	851862	0 %	0 %	50 %	50 %	241196167
19610	NC_012815	CAGG	2	8	851895	851902	25 %	0 %	50 %	25 %	241196167
19611	NC_012815	ACC	2	6	851928	851933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196167
19612	NC_012815	GAAT	2	8	851969	851976	50 %	25 %	25 %	0 %	241196167
19613	NC_012815	CGG	2	6	851984	851989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196167
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19615	NC_012815	CGT	2	6	852059	852064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196167
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19618	NC_012815	TGC	3	9	852160	852168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196167
19619	NC_012815	CGA	2	6	852203	852208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196167
19620	NC_012815	TGG	2	6	852220	852225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196167
19621	NC_012815	TTG	2	6	852230	852235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196167
19622	NC_012815	ATC	2	6	852255	852260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196167
19623	NC_012815	GCCA	2	8	852276	852283	25 %	0 %	25 %	50 %	241196167
19624	NC_012815	CCG	2	6	852433	852438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196167
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19627	NC_012815	ATC	2	6	852694	852699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196168
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19631	NC_012815	CATT	2	8	852941	852948	25 %	50 %	0 %	25 %	241196168
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19654	NC_012815	CGATG	2	10	854163	854172	20 %	20 %	40 %	20 %	241196169
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19702	NC_012815	ATCTC	2	10	856459	856468	20 %	40 %	0 %	40 %	241196171
19703	NC_012815	AATA	2	8	856495	856502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19729	NC_012815	AGT	2	6	857790	857795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196172
19730	NC_012815	CTT	2	6	857851	857856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19731	NC_012815	ACGG	2	8	857874	857881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19732	NC_012815	GA	3	6	857902	857907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19733	NC_012815	CGA	2	6	857914	857919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19734	NC_012815	GAC	3	9	858176	858184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19735	NC_012815	CTG	2	6	858215	858220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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19737	NC_012815	TCGC	2	8	858262	858269	0 %	25 %	25 %	50 %	241196173
19738	NC_012815	GCT	2	6	858337	858342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19739	NC_012815	GCA	2	6	858415	858420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19740	NC_012815	TGC	2	6	858432	858437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19741	NC_012815	TGC	2	6	858471	858476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
19742	NC_012815	CGTGGC	2	12	858571	858582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241196173
19743	NC_012815	TCGA	2	8	858617	858624	25 %	25 %	25 %	25 %	241196173
19744	NC_012815	CATGGC	2	12	858667	858678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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19749	NC_012815	CG	3	6	858897	858902	0 %	0 %	50 %	50 %	241196173
19750	NC_012815	TGC	3	9	858954	858962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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19754	NC_012815	GAA	2	6	859069	859074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196173
19755	NC_012815	GTGC	2	8	859110	859117	0 %	25 %	50 %	25 %	241196173
19756	NC_012815	G	6	6	859137	859142	0 %	0 %	100 %	0 %	241196173
19757	NC_012815	TCG	2	6	859194	859199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196173
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19766	NC_012815	TGT	2	6	859737	859742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196174
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19780	NC_012815	CGAA	2	8	860318	860325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19854	NC_012815	CGA	2	6	864068	864073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196177
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19976	NC_012815	GATT	2	8	869678	869685	25 %	50 %	25 %	0 %	241196183
19977	NC_012815	GA	3	6	869728	869733	50 %	0 %	50 %	0 %	241196183
19978	NC_012815	GCGTTC	2	12	869948	869959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196183
19979	NC_012815	GT	3	6	870148	870153	0 %	50 %	50 %	0 %	241196183
19980	NC_012815	GTC	2	6	870185	870190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196183
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19984	NC_012815	CG	3	6	870639	870644	0 %	0 %	50 %	50 %	241196183
19985	NC_012815	CGGG	2	8	870737	870744	0 %	0 %	75 %	25 %	241196183
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19989	NC_012815	GGC	2	6	871097	871102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196183
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19992	NC_012815	AC	4	8	871233	871240	50 %	0 %	0 %	50 %	241196183
19993	NC_012815	CGTG	2	8	871244	871251	0 %	25 %	50 %	25 %	241196183
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19996	NC_012815	GC	3	6	871329	871334	0 %	0 %	50 %	50 %	241196183
19997	NC_012815	G	9	9	871364	871372	0 %	0 %	100 %	0 %	241196183
19998	NC_012815	GCG	2	6	871418	871423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196184
19999	NC_012815	GCT	2	6	871444	871449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196184
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