MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_012815	TCA	2	6	797446	797451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196122
18502	NC_012815	CCGT	2	8	797455	797462	0 %	25 %	25 %	50 %	241196122
18503	NC_012815	TCTGCC	2	12	797469	797480	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241196122
18504	NC_012815	GTTC	2	8	797483	797490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18505	NC_012815	ATG	2	6	797537	797542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_012815	AC	3	6	797544	797549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18507	NC_012815	TGG	2	6	797581	797586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_012815	TGT	2	6	797593	797598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_012815	ATGAC	2	10	797608	797617	40 %	20 %	20 %	20 %	241196123
18510	NC_012815	GCGA	2	8	797634	797641	25 %	0 %	50 %	25 %	241196123
18511	NC_012815	AGA	2	6	797648	797653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196123
18512	NC_012815	GGT	2	6	797654	797659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196123
18513	NC_012815	ACC	2	6	797688	797693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196123
18514	NC_012815	GTG	2	6	797703	797708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196123
18515	NC_012815	CCGG	2	8	797860	797867	0 %	0 %	50 %	50 %	241196123
18516	NC_012815	GAG	2	6	797874	797879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196123
18517	NC_012815	CCG	2	6	797884	797889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196123
18518	NC_012815	CGA	2	6	797978	797983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18519	NC_012815	GCA	2	6	798005	798010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18520	NC_012815	TTG	2	6	798018	798023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196123
18521	NC_012815	CGTGA	2	10	798039	798048	20 %	20 %	40 %	20 %	241196123
18522	NC_012815	CGT	2	6	798113	798118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18523	NC_012815	GGC	2	6	798195	798200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196123
18524	NC_012815	GGCG	2	8	798245	798252	0 %	0 %	75 %	25 %	241196123
18525	NC_012815	GCA	2	6	798288	798293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18526	NC_012815	CAC	2	6	798335	798340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196123
18527	NC_012815	GGC	2	6	798368	798373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196123
18528	NC_012815	TCA	2	6	798424	798429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196123
18529	NC_012815	CCGGG	2	10	798485	798494	0 %	0 %	60 %	40 %	241196123
18530	NC_012815	CG	3	6	798512	798517	0 %	0 %	50 %	50 %	241196123
18531	NC_012815	CAT	2	6	798521	798526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196123
18532	NC_012815	CGC	2	6	798530	798535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196123
18533	NC_012815	GAG	2	6	798540	798545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196123
18534	NC_012815	GGC	2	6	798554	798559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196123
18535	NC_012815	GAT	2	6	798605	798610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196123
18536	NC_012815	ATCA	2	8	798696	798703	50 %	25 %	0 %	25 %	241196123
18537	NC_012815	TGA	2	6	798775	798780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196123
18538	NC_012815	GGT	2	6	798833	798838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196123
18539	NC_012815	CAG	2	6	798843	798848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18540	NC_012815	TCG	2	6	798865	798870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18541	NC_012815	ATC	2	6	798883	798888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196123
18542	NC_012815	GA	3	6	798910	798915	50 %	0 %	50 %	0 %	241196123
18543	NC_012815	CAT	2	6	798944	798949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196123
18544	NC_012815	CAGA	2	8	798981	798988	50 %	0 %	25 %	25 %	241196123
18545	NC_012815	GAC	2	6	799071	799076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196123
18546	NC_012815	CGAC	2	8	799078	799085	25 %	0 %	25 %	50 %	241196123
18547	NC_012815	AGA	2	6	799097	799102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196123
18548	NC_012815	CGG	2	6	799115	799120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196123
18549	NC_012815	TGA	2	6	799208	799213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196124
18550	NC_012815	TGG	2	6	799235	799240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196124
18551	NC_012815	CAC	2	6	799275	799280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196124
18552	NC_012815	ATCT	2	8	799282	799289	25 %	50 %	0 %	25 %	241196124
18553	NC_012815	GGTG	2	8	799296	799303	0 %	25 %	75 %	0 %	241196124
18554	NC_012815	CGT	2	6	799333	799338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18555	NC_012815	GGC	2	6	799362	799367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196124
18556	NC_012815	TGT	2	6	799380	799385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196124
18557	NC_012815	GTTC	2	8	799388	799395	0 %	50 %	25 %	25 %	241196124
18558	NC_012815	TCA	2	6	799424	799429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196124
18559	NC_012815	CGC	2	6	799472	799477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196124
18560	NC_012815	TGA	2	6	799478	799483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196124
18561	NC_012815	CAT	2	6	799488	799493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196124
18562	NC_012815	TCA	2	6	799550	799555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196124
18563	NC_012815	TGG	2	6	799584	799589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196124
18564	NC_012815	TCGTCA	2	12	799625	799636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241196124
18565	NC_012815	CAT	2	6	799737	799742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196124
18566	NC_012815	TC	3	6	799764	799769	0 %	50 %	0 %	50 %	241196124
18567	NC_012815	GTGGC	2	10	799781	799790	0 %	20 %	60 %	20 %	241196124
18568	NC_012815	GCC	2	6	799831	799836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196124
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18570	NC_012815	GTC	2	6	799890	799895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18571	NC_012815	CGC	2	6	799897	799902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196124
18572	NC_012815	CGC	2	6	799910	799915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196124
18573	NC_012815	GGT	2	6	799944	799949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196124
18574	NC_012815	GCT	2	6	799974	799979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18575	NC_012815	TGG	2	6	799985	799990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196124
18576	NC_012815	TCGGCT	2	12	799994	800005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18577	NC_012815	TCA	2	6	800009	800014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196124
18578	NC_012815	TGC	2	6	800069	800074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18579	NC_012815	GGC	2	6	800110	800115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196124
18580	NC_012815	TGT	2	6	800117	800122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196124
18581	NC_012815	CCA	2	6	800138	800143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196124
18582	NC_012815	CTG	2	6	800166	800171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18583	NC_012815	CGT	2	6	800231	800236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196124
18584	NC_012815	GACG	2	8	800286	800293	25 %	0 %	50 %	25 %	241196124
18585	NC_012815	CCA	2	6	800307	800312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196124
18586	NC_012815	CGGC	2	8	800369	800376	0 %	0 %	50 %	50 %	241196124
18587	NC_012815	GGC	2	6	800464	800469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196124
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18589	NC_012815	AGG	2	6	800588	800593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_012815	CCT	2	6	800622	800627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18591	NC_012815	T	6	6	800658	800663	0 %	100 %	0 %	0 %	241196125
18592	NC_012815	GAT	2	6	800709	800714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196125
18593	NC_012815	TCG	2	6	800770	800775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196125
18594	NC_012815	TTCG	2	8	800820	800827	0 %	50 %	25 %	25 %	241196125
18595	NC_012815	TCGAGG	2	12	800938	800949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241196125
18596	NC_012815	GCC	2	6	800959	800964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196125
18597	NC_012815	TCA	2	6	801017	801022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196125
18598	NC_012815	GCC	2	6	801057	801062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196125
18599	NC_012815	TGA	3	9	801068	801076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196125
18600	NC_012815	TCTT	2	8	801079	801086	0 %	75 %	0 %	25 %	241196125
18601	NC_012815	TCG	2	6	801115	801120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196125
18602	NC_012815	CAGC	2	8	801144	801151	25 %	0 %	25 %	50 %	241196125
18603	NC_012815	CTG	2	6	801162	801167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196125
18604	NC_012815	GTT	2	6	801291	801296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196125
18605	NC_012815	AGC	2	6	801352	801357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196125
18606	NC_012815	GC	3	6	801404	801409	0 %	0 %	50 %	50 %	241196125
18607	NC_012815	TCT	2	6	801455	801460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196125
18608	NC_012815	CGC	2	6	801560	801565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196125
18609	NC_012815	CGGC	2	8	801577	801584	0 %	0 %	50 %	50 %	241196125
18610	NC_012815	GGC	2	6	801609	801614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196125
18611	NC_012815	CG	3	6	801635	801640	0 %	0 %	50 %	50 %	241196125
18612	NC_012815	AGC	2	6	801649	801654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196125
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18614	NC_012815	GAGT	2	8	801716	801723	25 %	25 %	50 %	0 %	241196125
18615	NC_012815	CAG	2	6	801783	801788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196125
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18617	NC_012815	CGG	2	6	801848	801853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196125
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18619	NC_012815	CGG	2	6	801941	801946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196125
18620	NC_012815	CTC	2	6	801966	801971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196125
18621	NC_012815	GAT	2	6	801993	801998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196125
18622	NC_012815	GGC	2	6	802008	802013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196125
18623	NC_012815	CGT	2	6	802085	802090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196125
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18638	NC_012815	GAG	2	6	802750	802755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18730	NC_012815	CA	3	6	807372	807377	50 %	0 %	0 %	50 %	241196131
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18733	NC_012815	GGCC	2	8	807474	807481	0 %	0 %	50 %	50 %	241196131
18734	NC_012815	GAC	2	6	807540	807545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18735	NC_012815	G	6	6	807587	807592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18736	NC_012815	CAT	2	6	807661	807666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18737	NC_012815	ACC	2	6	807685	807690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196132
18738	NC_012815	TCGCG	2	10	807716	807725	0 %	20 %	40 %	40 %	241196132
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18979	NC_012815	ACG	2	6	820732	820737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18980	NC_012815	CGT	2	6	820744	820749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18981	NC_012815	GAT	2	6	820752	820757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196141
18982	NC_012815	ACG	3	9	820758	820766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18983	NC_012815	CAT	2	6	820767	820772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196141
18984	NC_012815	GGA	2	6	820781	820786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196141
18985	NC_012815	ATCC	2	8	820799	820806	25 %	25 %	0 %	50 %	241196141
18986	NC_012815	TGA	2	6	820886	820891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196141
18987	NC_012815	ACG	2	6	820942	820947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18988	NC_012815	GC	3	6	820954	820959	0 %	0 %	50 %	50 %	241196141
18989	NC_012815	TACGAT	2	12	820962	820973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241196141
18990	NC_012815	GAC	2	6	821016	821021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18991	NC_012815	AC	3	6	821020	821025	50 %	0 %	0 %	50 %	241196141
18992	NC_012815	ACG	2	6	821060	821065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141
18993	NC_012815	CA	3	6	821107	821112	50 %	0 %	0 %	50 %	241196141
18994	NC_012815	GAA	2	6	821183	821188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196141
18995	NC_012815	CAC	2	6	821282	821287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196141
18996	NC_012815	ATC	2	6	821292	821297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196141
18997	NC_012815	GA	3	6	821334	821339	50 %	0 %	50 %	0 %	241196141
18998	NC_012815	ACGC	2	8	821350	821357	25 %	0 %	25 %	50 %	241196141
18999	NC_012815	TGA	2	6	821387	821392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196141
19000	NC_012815	CGA	2	6	821435	821440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196141

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