MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_012815	A	6	6	676763	676768	100 %	0 %	0 %	0 %	241196023
16003	NC_012815	ATC	2	6	676777	676782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
16004	NC_012815	CCA	2	6	676787	676792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196023
16005	NC_012815	AAC	2	6	676874	676879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196023
16006	NC_012815	ACG	2	6	676938	676943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
16007	NC_012815	GGA	2	6	676947	676952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196023
16008	NC_012815	CTA	2	6	676965	676970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
16009	NC_012815	TCG	2	6	677044	677049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
16010	NC_012815	GAG	2	6	677083	677088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196023
16011	NC_012815	GTCA	2	8	677101	677108	25 %	25 %	25 %	25 %	241196023
16012	NC_012815	GAG	2	6	677146	677151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196023
16013	NC_012815	CACG	2	8	677174	677181	25 %	0 %	25 %	50 %	241196023
16014	NC_012815	GAG	2	6	677266	677271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196023
16015	NC_012815	GTC	2	6	677287	677292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
16016	NC_012815	ACCT	2	8	677317	677324	25 %	25 %	0 %	50 %	241196023
16017	NC_012815	CGA	2	6	677433	677438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
16018	NC_012815	AGC	2	6	677471	677476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
16019	NC_012815	ATG	2	6	677524	677529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196023
16020	NC_012815	GAT	2	6	677545	677550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196023
16021	NC_012815	TCA	2	6	677577	677582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
16022	NC_012815	AAC	2	6	677593	677598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196023
16023	NC_012815	ACT	2	6	677615	677620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
16024	NC_012815	GAAC	2	8	677662	677669	50 %	0 %	25 %	25 %	241196023
16025	NC_012815	ATT	2	6	677765	677770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241196023
16026	NC_012815	A	6	6	677833	677838	100 %	0 %	0 %	0 %	241196023
16027	NC_012815	AGC	2	6	677843	677848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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16029	NC_012815	CAT	2	6	677898	677903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
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16033	NC_012815	GA	3	6	678069	678074	50 %	0 %	50 %	0 %	241196023
16034	NC_012815	ATCA	2	8	678166	678173	50 %	25 %	0 %	25 %	241196023
16035	NC_012815	GCA	2	6	678216	678221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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16037	NC_012815	GCGATA	2	12	678335	678346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241196023
16038	NC_012815	GC	4	8	678347	678354	0 %	0 %	50 %	50 %	241196023
16039	NC_012815	ATCG	2	8	678372	678379	25 %	25 %	25 %	25 %	241196023
16040	NC_012815	GTC	2	6	678384	678389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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16045	NC_012815	ATG	2	6	678629	678634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196023
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16047	NC_012815	GTTG	2	8	678708	678715	0 %	50 %	50 %	0 %	241196023
16048	NC_012815	TCCG	2	8	678719	678726	0 %	25 %	25 %	50 %	241196023
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16052	NC_012815	TTC	2	6	678889	678894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196023
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16054	NC_012815	CG	3	6	678925	678930	0 %	0 %	50 %	50 %	241196023
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16056	NC_012815	CTT	2	6	679011	679016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196023
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16060	NC_012815	GCA	2	6	679178	679183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
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16062	NC_012815	TCA	2	6	679232	679237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196023
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16064	NC_012815	AAG	2	6	679343	679348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196023
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16067	NC_012815	TG	3	6	679756	679761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_012815	TGA	2	6	679806	679811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_012815	GCG	2	6	679863	679868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_012815	CGA	2	6	679885	679890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_012815	TC	3	6	679922	679927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_012815	CAT	2	6	680007	680012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16074	NC_012815	ATTGG	2	10	680106	680115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_012815	TTCG	2	8	680119	680126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16086	NC_012815	CCT	2	6	680618	680623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16087	NC_012815	GCGA	2	8	680742	680749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16088	NC_012815	ATG	2	6	680809	680814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_012815	TGGCA	2	10	680835	680844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16090	NC_012815	ATTT	2	8	680914	680921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_012815	GAA	2	6	681046	681051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196025
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16094	NC_012815	G	6	6	681113	681118	0 %	0 %	100 %	0 %	241196025
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16104	NC_012815	GCT	2	6	681387	681392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196025
16105	NC_012815	TTG	2	6	681427	681432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196025
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16107	NC_012815	AT	3	6	681528	681533	50 %	50 %	0 %	0 %	241196025
16108	NC_012815	TGA	2	6	681552	681557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196025
16109	NC_012815	GAA	2	6	681571	681576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196025
16110	NC_012815	TCAAT	2	10	681599	681608	40 %	40 %	0 %	20 %	241196025
16111	NC_012815	CACT	2	8	681647	681654	25 %	25 %	0 %	50 %	241196025
16112	NC_012815	TCG	2	6	681661	681666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196025
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16115	NC_012815	CGA	2	6	681756	681761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196025
16116	NC_012815	TGAG	2	8	681788	681795	25 %	25 %	50 %	0 %	241196025
16117	NC_012815	TGC	2	6	681825	681830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196025
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16121	NC_012815	GGA	2	6	681951	681956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196025
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16123	NC_012815	GA	3	6	682012	682017	50 %	0 %	50 %	0 %	241196025
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16126	NC_012815	TTG	2	6	682156	682161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196025
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16228	NC_012815	GT	3	6	686900	686905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16229	NC_012815	TAG	2	6	686915	686920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16230	NC_012815	AAT	2	6	686951	686956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16231	NC_012815	A	7	7	686966	686972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16232	NC_012815	CGG	2	6	687013	687018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16233	NC_012815	GGT	2	6	687102	687107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196031
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16235	NC_012815	G	6	6	687359	687364	0 %	0 %	100 %	0 %	241196031
16236	NC_012815	CGAA	2	8	687419	687426	50 %	0 %	25 %	25 %	241196031
16237	NC_012815	GAC	2	6	687436	687441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196031
16238	NC_012815	GGT	2	6	687561	687566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196031
16239	NC_012815	GGC	2	6	687609	687614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16241	NC_012815	TG	3	6	687623	687628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16242	NC_012815	GAG	2	6	687670	687675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16243	NC_012815	GC	3	6	687776	687781	0 %	0 %	50 %	50 %	241196032
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16362	NC_012815	CCAA	2	8	693158	693165	50 %	0 %	0 %	50 %	241196035
16363	NC_012815	TGG	2	6	693258	693263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16364	NC_012815	TGA	2	6	693266	693271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16366	NC_012815	CGC	2	6	693347	693352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16367	NC_012815	CGC	2	6	693363	693368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16368	NC_012815	GTAT	2	8	693537	693544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16369	NC_012815	TCGAC	2	10	693583	693592	20 %	20 %	20 %	40 %	241196036
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16450	NC_012815	CGAG	2	8	697611	697618	25 %	0 %	50 %	25 %	241196039
16451	NC_012815	TGCCG	2	10	697700	697709	0 %	20 %	40 %	40 %	241196039
16452	NC_012815	CATG	2	8	697792	697799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16453	NC_012815	GTC	2	6	697854	697859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196040
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16469	NC_012815	CG	3	6	698498	698503	0 %	0 %	50 %	50 %	241196040
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16474	NC_012815	CTCAT	2	10	698629	698638	20 %	40 %	0 %	40 %	241196040
16475	NC_012815	CGCTT	2	10	698653	698662	0 %	40 %	20 %	40 %	241196040
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