MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012815	A	6	6	654364	654369	100 %	0 %	0 %	0 %	241196001
15502	NC_012815	AAT	2	6	654405	654410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241196001
15503	NC_012815	CGC	3	9	654431	654439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196001
15504	NC_012815	GTG	2	6	654535	654540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196001
15505	NC_012815	TTC	2	6	654567	654572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196001
15506	NC_012815	GCA	2	6	654578	654583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196001
15507	NC_012815	TG	4	8	654603	654610	0 %	50 %	50 %	0 %	241196001
15508	NC_012815	TCG	2	6	654696	654701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
15509	NC_012815	CGT	2	6	654722	654727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196001
15510	NC_012815	GGC	2	6	654762	654767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196001
15511	NC_012815	CTCG	2	8	654932	654939	0 %	25 %	25 %	50 %	241196001
15512	NC_012815	TGCA	2	8	654947	654954	25 %	25 %	25 %	25 %	241196001
15513	NC_012815	CCT	2	6	655024	655029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15514	NC_012815	AGC	2	6	655053	655058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_012815	GGT	2	6	655066	655071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_012815	GGA	2	6	655098	655103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_012815	ATT	2	6	655107	655112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_012815	CGG	2	6	655118	655123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_012815	TCG	2	6	655124	655129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_012815	AAG	2	6	655172	655177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_012815	TGA	2	6	655186	655191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_012815	GT	3	6	655316	655321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_012815	GTA	2	6	655323	655328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_012815	GTT	2	6	655360	655365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_012815	AAATG	2	10	655383	655392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_012815	CTG	2	6	655464	655469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_012815	TTG	2	6	655516	655521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_012815	TGC	2	6	655569	655574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_012815	GGAGT	2	10	655588	655597	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_012815	TGT	2	6	655673	655678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_012815	AG	3	6	655720	655725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_012815	GATTGC	2	12	655744	655755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15533	NC_012815	AAG	2	6	655758	655763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_012815	TGA	2	6	655769	655774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_012815	TCGCTC	2	12	655801	655812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15536	NC_012815	TGG	2	6	655833	655838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_012815	TTCT	2	8	655983	655990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15538	NC_012815	TCC	2	6	656026	656031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_012815	AG	4	8	656227	656234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_012815	CCT	2	6	656295	656300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15541	NC_012815	TTG	2	6	656307	656312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_012815	TCA	2	6	656334	656339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_012815	TC	4	8	656422	656429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15544	NC_012815	ATTG	2	8	656468	656475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_012815	CG	3	6	656567	656572	0 %	0 %	50 %	50 %	241196002
15546	NC_012815	CTG	2	6	656747	656752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196002
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15555	NC_012815	TCG	2	6	657252	657257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_012815	AGC	2	6	657296	657301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_012815	GCCAT	2	10	657333	657342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15558	NC_012815	GCA	2	6	657445	657450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_012815	TCT	2	6	657451	657456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_012815	TG	3	6	657473	657478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_012815	GT	3	6	657532	657537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_012815	CGG	2	6	657578	657583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196003
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15603	NC_012815	GAG	2	6	659137	659142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196003
15604	NC_012815	GC	3	6	659149	659154	0 %	0 %	50 %	50 %	241196003
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15612	NC_012815	ATC	2	6	659544	659549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196004
15613	NC_012815	CA	3	6	659554	659559	50 %	0 %	0 %	50 %	241196004
15614	NC_012815	CCG	2	6	659575	659580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196004
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15617	NC_012815	CTT	2	6	659895	659900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196004
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15622	NC_012815	CGTT	2	8	660036	660043	0 %	50 %	25 %	25 %	241196004
15623	NC_012815	TGT	2	6	660120	660125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_012815	CGC	2	6	660195	660200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196005
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15742	NC_012815	GAG	2	6	665099	665104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196009
15743	NC_012815	GCAG	2	8	665151	665158	25 %	0 %	50 %	25 %	241196010
15744	NC_012815	CTGC	2	8	665173	665180	0 %	25 %	25 %	50 %	241196010
15745	NC_012815	CTC	2	6	665215	665220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196010
15746	NC_012815	GAT	2	6	665236	665241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196010
15747	NC_012815	CTG	2	6	665261	665266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196010
15748	NC_012815	ACG	2	6	665328	665333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196010
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15752	NC_012815	CTGC	2	8	665456	665463	0 %	25 %	25 %	50 %	241196010
15753	NC_012815	GCCG	2	8	665512	665519	0 %	0 %	50 %	50 %	241196010
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15765	NC_012815	CGA	2	6	665824	665829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196010
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15848	NC_012815	CGT	2	6	669124	669129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15849	NC_012815	ACTG	2	8	669131	669138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15850	NC_012815	TG	3	6	669230	669235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15851	NC_012815	CG	3	6	669282	669287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15852	NC_012815	CGACAA	2	12	669306	669317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15853	NC_012815	CAT	2	6	669413	669418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15858	NC_012815	CGG	2	6	669807	669812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196014
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15980	NC_012815	TCG	2	6	675534	675539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196021
15981	NC_012815	TCC	2	6	675654	675659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196021
15982	NC_012815	TCG	2	6	675684	675689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196021
15983	NC_012815	GATC	2	8	675754	675761	25 %	25 %	25 %	25 %	241196021
15984	NC_012815	CGGT	2	8	675762	675769	0 %	25 %	50 %	25 %	241196021
15985	NC_012815	TTTCG	2	10	675850	675859	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15986	NC_012815	GTC	2	6	675915	675920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15987	NC_012815	GCC	2	6	676038	676043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196022
15988	NC_012815	ATC	2	6	676044	676049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196022
15989	NC_012815	GC	3	6	676069	676074	0 %	0 %	50 %	50 %	241196022
15990	NC_012815	TC	3	6	676092	676097	0 %	50 %	0 %	50 %	241196022
15991	NC_012815	CAG	2	6	676149	676154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196022
15992	NC_012815	GAG	3	9	676173	676181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196022
15993	NC_012815	AAG	2	6	676206	676211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196022
15994	NC_012815	CAC	2	6	676256	676261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196022
15995	NC_012815	ATG	2	6	676369	676374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196022
15996	NC_012815	GGCAT	2	10	676392	676401	20 %	20 %	40 %	20 %	241196022
15997	NC_012815	AGC	2	6	676462	676467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196023
15998	NC_012815	ACA	2	6	676481	676486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196023
15999	NC_012815	AACCG	2	10	676512	676521	40 %	0 %	20 %	40 %	241196023
16000	NC_012815	TCG	2	6	676544	676549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196023

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