MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012815	TCGA	2	8	565462	565469	25 %	25 %	25 %	25 %	241195928
13502	NC_012815	GCAG	2	8	565510	565517	25 %	0 %	50 %	25 %	241195928
13503	NC_012815	CGA	2	6	565535	565540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13504	NC_012815	AAC	2	6	565615	565620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195928
13505	NC_012815	GCG	2	6	565658	565663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195928
13506	NC_012815	GGT	2	6	565758	565763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195928
13507	NC_012815	CAG	2	6	565785	565790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13508	NC_012815	CAG	2	6	565809	565814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13509	NC_012815	GCTC	2	8	565880	565887	0 %	25 %	25 %	50 %	241195928
13510	NC_012815	TGA	2	6	565925	565930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195928
13511	NC_012815	CAG	2	6	565935	565940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13512	NC_012815	CGA	2	6	565943	565948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13513	NC_012815	GAC	3	9	566031	566039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13514	NC_012815	CG	3	6	566150	566155	0 %	0 %	50 %	50 %	241195928
13515	NC_012815	TGA	2	6	566201	566206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195928
13516	NC_012815	GGT	2	6	566211	566216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195928
13517	NC_012815	ACC	2	6	566251	566256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195928
13518	NC_012815	AGC	2	6	566260	566265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13519	NC_012815	CGA	2	6	566333	566338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13520	NC_012815	GC	3	6	566415	566420	0 %	0 %	50 %	50 %	241195928
13521	NC_012815	GC	3	6	566439	566444	0 %	0 %	50 %	50 %	241195928
13522	NC_012815	AAC	2	6	566446	566451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195928
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13525	NC_012815	CGAAGG	2	12	566519	566530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241195928
13526	NC_012815	CG	3	6	566532	566537	0 %	0 %	50 %	50 %	241195928
13527	NC_012815	GGT	2	6	566571	566576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195928
13528	NC_012815	GGA	2	6	566592	566597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195928
13529	NC_012815	GAC	2	6	566605	566610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195928
13530	NC_012815	TGG	2	6	566642	566647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195928
13531	NC_012815	CCT	2	6	566661	566666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_012815	GT	3	6	566720	566725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_012815	TGC	2	6	566752	566757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_012815	AT	3	6	566780	566785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_012815	AT	3	6	566795	566800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_012815	TG	3	6	566809	566814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_012815	TGTC	2	8	566817	566824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_012815	TTG	2	6	566855	566860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_012815	GTA	2	6	566890	566895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_012815	GAG	2	6	566967	566972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195929
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13542	NC_012815	CGG	2	6	567064	567069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195929
13543	NC_012815	GT	3	6	567088	567093	0 %	50 %	50 %	0 %	241195929
13544	NC_012815	CGA	2	6	567137	567142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195929
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13550	NC_012815	GAT	2	6	567459	567464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195929
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13552	NC_012815	GTG	2	6	567830	567835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195929
13553	NC_012815	CTG	2	6	567894	567899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195929
13554	NC_012815	TGC	2	6	567958	567963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195929
13555	NC_012815	AGC	2	6	567976	567981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195929
13556	NC_012815	CG	3	6	568040	568045	0 %	0 %	50 %	50 %	241195929
13557	NC_012815	CG	3	6	568145	568150	0 %	0 %	50 %	50 %	241195929
13558	NC_012815	GAG	2	6	568170	568175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195929
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13564	NC_012815	CG	3	6	568494	568499	0 %	0 %	50 %	50 %	241195929
13565	NC_012815	CCGG	2	8	568532	568539	0 %	0 %	50 %	50 %	241195929
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13574	NC_012815	GACCG	2	10	568887	568896	20 %	0 %	40 %	40 %	241195929
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13592	NC_012815	TATCG	2	10	569637	569646	20 %	40 %	20 %	20 %	241195929
13593	NC_012815	GCAT	2	8	569659	569666	25 %	25 %	25 %	25 %	241195929
13594	NC_012815	TGC	2	6	569731	569736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195929
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13599	NC_012815	CTG	2	6	569964	569969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195929
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13601	NC_012815	TGGGCG	2	12	570061	570072	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241195929
13602	NC_012815	CGA	2	6	570074	570079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195929
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13604	NC_012815	TG	3	6	570197	570202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_012815	GGA	2	6	570219	570224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_012815	ACCA	2	8	570238	570245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_012815	GCGCAC	2	12	570248	570259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_012815	CAG	2	6	570312	570317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195930
13609	NC_012815	CG	4	8	570341	570348	0 %	0 %	50 %	50 %	241195930
13610	NC_012815	GTG	2	6	570364	570369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195930
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13614	NC_012815	GCA	2	6	570509	570514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195930
13615	NC_012815	TCG	2	6	570562	570567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195930
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13618	NC_012815	GCG	2	6	570589	570594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195930
13619	NC_012815	GCGA	3	12	570685	570696	25 %	0 %	50 %	25 %	241195930
13620	NC_012815	CGA	2	6	570770	570775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195930
13621	NC_012815	CGA	2	6	570932	570937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195930
13622	NC_012815	CGT	2	6	570941	570946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195930
13623	NC_012815	GTC	2	6	570948	570953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195930
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13626	NC_012815	TCG	2	6	571066	571071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195930
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13630	NC_012815	CCG	2	6	571373	571378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13633	NC_012815	CGTG	2	8	571516	571523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13634	NC_012815	GA	3	6	571563	571568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13635	NC_012815	CGA	2	6	571603	571608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13637	NC_012815	CGGC	2	8	571632	571639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13638	NC_012815	GGA	2	6	571648	571653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13729	NC_012815	CG	3	6	575706	575711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13730	NC_012815	TGCA	2	8	575721	575728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13731	NC_012815	TGA	2	6	575819	575824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13734	NC_012815	CAT	2	6	575871	575876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13735	NC_012815	CAG	2	6	576016	576021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195937
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13737	NC_012815	CGC	2	6	576217	576222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195937
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13739	NC_012815	GGT	2	6	576302	576307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195937
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13862	NC_012815	GATGTC	2	12	582399	582410	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241195941
13863	NC_012815	ATGA	2	8	582450	582457	50 %	25 %	25 %	0 %	241195941
13864	NC_012815	CAG	2	6	582498	582503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195941
13865	NC_012815	CCG	2	6	582511	582516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195941
13866	NC_012815	CG	3	6	582519	582524	0 %	0 %	50 %	50 %	241195941
13867	NC_012815	GGC	2	6	582533	582538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195941
13868	NC_012815	GTC	2	6	582546	582551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195941
13869	NC_012815	GGGC	2	8	582572	582579	0 %	0 %	75 %	25 %	241195941
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13874	NC_012815	CGA	2	6	582905	582910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195941
13875	NC_012815	GAT	3	9	582936	582944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195941
13876	NC_012815	CA	3	6	582995	583000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13877	NC_012815	GAT	2	6	583004	583009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13878	NC_012815	AAGC	2	8	583101	583108	50 %	0 %	25 %	25 %	241195942
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13881	NC_012815	CG	3	6	583177	583182	0 %	0 %	50 %	50 %	241195942
13882	NC_012815	GGTT	2	8	583213	583220	0 %	50 %	50 %	0 %	241195942
13883	NC_012815	CGT	2	6	583229	583234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195942
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13885	NC_012815	CCTG	2	8	583355	583362	0 %	25 %	25 %	50 %	241195942
13886	NC_012815	ATCGTG	2	12	583378	583389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241195942
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13900	NC_012815	TCA	2	6	583982	583987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195942
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13968	NC_012815	GCGA	2	8	587121	587128	25 %	0 %	50 %	25 %	241195945
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13973	NC_012815	TGGAA	2	10	587292	587301	40 %	20 %	40 %	0 %	241195945
13974	NC_012815	GGC	2	6	587305	587310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195945
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13980	NC_012815	CCA	2	6	587403	587408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195945
13981	NC_012815	GC	3	6	587412	587417	0 %	0 %	50 %	50 %	241195945
13982	NC_012815	GTT	2	6	587428	587433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195945
13983	NC_012815	CCG	2	6	587457	587462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195945
13984	NC_012815	GCT	2	6	587515	587520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195945
13985	NC_012815	TGG	2	6	587598	587603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195945
13986	NC_012815	GGC	2	6	587620	587625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195945
13987	NC_012815	GCT	2	6	587692	587697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195945
13988	NC_012815	CGT	2	6	587698	587703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195945
13989	NC_012815	GCTG	2	8	587805	587812	0 %	25 %	50 %	25 %	241195945
13990	NC_012815	CGC	2	6	587845	587850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195945
13991	NC_012815	GCC	2	6	587861	587866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195945
13992	NC_012815	CGC	2	6	587917	587922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195945
13993	NC_012815	GTG	2	6	587929	587934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195945
13994	NC_012815	TCG	2	6	587938	587943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195945
13995	NC_012815	CG	3	6	588040	588045	0 %	0 %	50 %	50 %	241195945
13996	NC_012815	TGC	2	6	588093	588098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195945
13997	NC_012815	GTT	2	6	588103	588108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195945
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13999	NC_012815	ATG	2	6	588182	588187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195945
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