MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012815	CGT	2	6	543245	543250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13002	NC_012815	TCG	2	6	543257	543262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13003	NC_012815	GGA	2	6	543310	543315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195909
13004	NC_012815	ACG	2	6	543337	543342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13005	NC_012815	GCATAC	2	12	543358	543369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241195909
13006	NC_012815	TCG	3	9	543377	543385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13007	NC_012815	CGA	2	6	543396	543401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13008	NC_012815	CTG	2	6	543412	543417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13009	NC_012815	CAA	2	6	543423	543428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195909
13010	NC_012815	GC	3	6	543477	543482	0 %	0 %	50 %	50 %	241195909
13011	NC_012815	CGC	2	6	543492	543497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195909
13012	NC_012815	CGC	2	6	543504	543509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195909
13013	NC_012815	GTG	2	6	543541	543546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195909
13014	NC_012815	CGA	2	6	543564	543569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13015	NC_012815	CAGAAG	2	12	543577	543588	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241195909
13016	NC_012815	CG	3	6	543606	543611	0 %	0 %	50 %	50 %	241195909
13017	NC_012815	AC	3	6	543631	543636	50 %	0 %	0 %	50 %	241195909
13018	NC_012815	GGCC	2	8	543666	543673	0 %	0 %	50 %	50 %	241195909
13019	NC_012815	GTG	2	6	543718	543723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195909
13020	NC_012815	GGC	2	6	543742	543747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195909
13021	NC_012815	CTG	2	6	543757	543762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195909
13022	NC_012815	CCA	2	6	543770	543775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195909
13023	NC_012815	GTG	2	6	543814	543819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195909
13024	NC_012815	CCG	2	6	543884	543889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195909
13025	NC_012815	GC	3	6	543933	543938	0 %	0 %	50 %	50 %	241195909
13026	NC_012815	AGATCG	2	12	543959	543970	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241195909
13027	NC_012815	AGT	2	6	544016	544021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195909
13028	NC_012815	GGT	2	6	544024	544029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_012815	GCC	2	6	544046	544051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_012815	GCAAT	2	10	544056	544065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13031	NC_012815	AT	3	6	544068	544073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_012815	CGG	2	6	544080	544085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_012815	GC	3	6	544191	544196	0 %	0 %	50 %	50 %	241195910
13034	NC_012815	CTT	2	6	544202	544207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195910
13035	NC_012815	TCC	2	6	544221	544226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195910
13036	NC_012815	CGA	3	9	544312	544320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195910
13037	NC_012815	TTG	2	6	544491	544496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195910
13038	NC_012815	CTT	2	6	544529	544534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_012815	GTC	2	6	544548	544553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_012815	CCG	2	6	544589	544594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_012815	TCGTC	2	10	544620	544629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13042	NC_012815	CATGC	2	10	544650	544659	20 %	20 %	20 %	40 %	241195911
13043	NC_012815	CCG	2	6	544701	544706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195911
13044	NC_012815	CCGACA	2	12	544711	544722	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241195911
13045	NC_012815	CTG	2	6	544743	544748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13046	NC_012815	CAG	2	6	544818	544823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13047	NC_012815	GCT	2	6	544853	544858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13048	NC_012815	CAC	2	6	544859	544864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195911
13049	NC_012815	TTC	2	6	544875	544880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195911
13050	NC_012815	CTG	2	6	544899	544904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13051	NC_012815	CGA	2	6	544976	544981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13052	NC_012815	TCA	2	6	545089	545094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195911
13053	NC_012815	TGG	2	6	545119	545124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195911
13054	NC_012815	GCC	2	6	545165	545170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195911
13055	NC_012815	GCT	2	6	545282	545287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13056	NC_012815	GAT	3	9	545291	545299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195911
13057	NC_012815	CAG	2	6	545304	545309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13058	NC_012815	CGG	2	6	545342	545347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195911
13059	NC_012815	AGC	2	6	545389	545394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195911
13060	NC_012815	CG	3	6	545398	545403	0 %	0 %	50 %	50 %	241195911
13061	NC_012815	ACC	2	6	545494	545499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195911
13062	NC_012815	CCA	2	6	545500	545505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195911
13063	NC_012815	TCGAT	2	10	545538	545547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13064	NC_012815	CCG	2	6	545703	545708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195912
13065	NC_012815	GAT	2	6	545738	545743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195912
13066	NC_012815	AAGG	2	8	545792	545799	50 %	0 %	50 %	0 %	241195912
13067	NC_012815	ACA	2	6	545955	545960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195912
13068	NC_012815	GTG	2	6	546005	546010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195912
13069	NC_012815	GGA	2	6	546019	546024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195912
13070	NC_012815	AGG	2	6	546045	546050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195912
13071	NC_012815	CGA	2	6	546058	546063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195912
13072	NC_012815	CGG	2	6	546094	546099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195912
13073	NC_012815	CAA	2	6	546208	546213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195912
13074	NC_012815	GAA	2	6	546256	546261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195912
13075	NC_012815	ATCG	2	8	546272	546279	25 %	25 %	25 %	25 %	241195912
13076	NC_012815	CGA	2	6	546313	546318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195912
13077	NC_012815	ACC	2	6	546339	546344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13078	NC_012815	GAGAG	2	10	546356	546365	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_012815	TGA	2	6	546400	546405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195913
13080	NC_012815	ATT	2	6	546447	546452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195913
13081	NC_012815	GAG	2	6	546468	546473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195913
13082	NC_012815	GC	3	6	546492	546497	0 %	0 %	50 %	50 %	241195913
13083	NC_012815	AGC	2	6	546516	546521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13084	NC_012815	GAG	2	6	546522	546527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195913
13085	NC_012815	GCCGT	2	10	546547	546556	0 %	20 %	40 %	40 %	241195913
13086	NC_012815	TGC	2	6	546562	546567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13087	NC_012815	CCG	2	6	546588	546593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195913
13088	NC_012815	CGCAT	2	10	546604	546613	20 %	20 %	20 %	40 %	241195913
13089	NC_012815	GC	3	6	546673	546678	0 %	0 %	50 %	50 %	241195913
13090	NC_012815	TGC	2	6	546688	546693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13091	NC_012815	TCG	2	6	546784	546789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13092	NC_012815	CATA	2	8	546853	546860	50 %	25 %	0 %	25 %	241195913
13093	NC_012815	AGC	2	6	546877	546882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13094	NC_012815	CGA	2	6	546898	546903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195913
13095	NC_012815	GCA	2	6	546928	546933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_012815	CGA	2	6	547081	547086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13097	NC_012815	CGT	2	6	547096	547101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13098	NC_012815	GCG	2	6	547156	547161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195914
13099	NC_012815	ACG	2	6	547172	547177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13100	NC_012815	CTT	2	6	547214	547219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195914
13101	NC_012815	GCG	2	6	547314	547319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195914
13102	NC_012815	CGCA	2	8	547359	547366	25 %	0 %	25 %	50 %	241195914
13103	NC_012815	GTC	2	6	547388	547393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13104	NC_012815	GCT	2	6	547537	547542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13105	NC_012815	CCAT	2	8	547555	547562	25 %	25 %	0 %	50 %	241195914
13106	NC_012815	CAC	2	6	547625	547630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195914
13107	NC_012815	CGG	2	6	547637	547642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195914
13108	NC_012815	GCG	2	6	547656	547661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195914
13109	NC_012815	GAG	2	6	547665	547670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195914
13110	NC_012815	CTT	2	6	547679	547684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195914
13111	NC_012815	CCT	2	6	547693	547698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195914
13112	NC_012815	CTG	2	6	547736	547741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13113	NC_012815	GTA	2	6	547742	547747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195914
13114	NC_012815	GCGT	2	8	547883	547890	0 %	25 %	50 %	25 %	241195914
13115	NC_012815	GTC	2	6	547922	547927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13116	NC_012815	ACG	3	9	547932	547940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13117	NC_012815	GTGCA	2	10	547955	547964	20 %	20 %	40 %	20 %	241195914
13118	NC_012815	GAC	2	6	547967	547972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195914
13119	NC_012815	GC	3	6	547975	547980	0 %	0 %	50 %	50 %	241195914
13120	NC_012815	AGCCGC	2	12	547987	547998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241195914
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13122	NC_012815	CGT	2	6	548129	548134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_012815	GT	3	6	548137	548142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_012815	CGC	2	6	548194	548199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_012815	CCT	2	6	548216	548221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13126	NC_012815	CG	4	8	548260	548267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_012815	GGA	2	6	548377	548382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195915
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13133	NC_012815	TGG	2	6	548646	548651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195915
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13135	NC_012815	TGC	2	6	548724	548729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195915
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13144	NC_012815	CCG	2	6	549222	549227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13151	NC_012815	ATT	2	6	549673	549678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_012815	ATT	2	6	549734	549739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_012815	AGT	2	6	549791	549796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13174	NC_012815	CGG	2	6	550979	550984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13240	NC_012815	TCG	2	6	553765	553770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
13241	NC_012815	CGT	2	6	553814	553819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
13242	NC_012815	GCT	2	6	553820	553825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
13243	NC_012815	GT	3	6	553864	553869	0 %	50 %	50 %	0 %	241195919
13244	NC_012815	CGG	2	6	554077	554082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195919
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13248	NC_012815	CGTGC	2	10	554172	554181	0 %	20 %	40 %	40 %	241195919
13249	NC_012815	TGC	2	6	554188	554193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195919
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13251	NC_012815	GAT	2	6	554282	554287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13254	NC_012815	ACGC	2	8	554571	554578	25 %	0 %	25 %	50 %	241195920
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13257	NC_012815	ACGA	2	8	554781	554788	50 %	0 %	25 %	25 %	241195921
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13264	NC_012815	CGAA	2	8	555040	555047	50 %	0 %	25 %	25 %	241195921
13265	NC_012815	ACG	2	6	555241	555246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195921
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13268	NC_012815	TCG	2	6	555344	555349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195921
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13271	NC_012815	GGCG	2	8	555376	555383	0 %	0 %	75 %	25 %	241195921
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13300	NC_012815	AAG	2	6	556760	556765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195922
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13302	NC_012815	CGA	2	6	556806	556811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195922
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13305	NC_012815	GCG	2	6	557027	557032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13306	NC_012815	GAGC	2	8	557049	557056	25 %	0 %	50 %	25 %	241195923
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13311	NC_012815	CTG	2	6	557185	557190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195923
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13347	NC_012815	CGA	2	6	558585	558590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195923
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13349	NC_012815	GAC	2	6	558620	558625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195924
13350	NC_012815	CGA	2	6	558709	558714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195924
13351	NC_012815	GCAC	2	8	558742	558749	25 %	0 %	25 %	50 %	241195924
13352	NC_012815	CCCG	2	8	558782	558789	0 %	0 %	25 %	75 %	241195924
13353	NC_012815	GCG	2	6	558828	558833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195924
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13355	NC_012815	GCG	2	6	558871	558876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195924
13356	NC_012815	CAA	2	6	558883	558888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195924
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13359	NC_012815	GCG	2	6	559027	559032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195924
13360	NC_012815	GCC	2	6	559067	559072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195924
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13363	NC_012815	GGA	2	6	559147	559152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195924
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13425	NC_012815	CGA	2	6	562112	562117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195925
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13469	NC_012815	GCG	2	6	564203	564208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13470	NC_012815	TGA	2	6	564303	564308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13476	NC_012815	GCGG	2	8	564490	564497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13477	NC_012815	CTC	2	6	564517	564522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195927
13478	NC_012815	CG	3	6	564566	564571	0 %	0 %	50 %	50 %	241195927
13479	NC_012815	ACC	2	6	564587	564592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195927
13480	NC_012815	GCT	2	6	564618	564623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195927
13481	NC_012815	CCTTCG	2	12	564756	564767	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241195927
13482	NC_012815	CGA	2	6	564792	564797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195927
13483	NC_012815	AC	3	6	564863	564868	50 %	0 %	0 %	50 %	241195927
13484	NC_012815	ACG	2	6	564905	564910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13485	NC_012815	GT	3	6	564921	564926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_012815	CAG	2	6	564970	564975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_012815	TG	3	6	564994	564999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13488	NC_012815	GTT	2	6	565029	565034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_012815	G	6	6	565050	565055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_012815	GAA	2	6	565072	565077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_012815	GC	3	6	565082	565087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13492	NC_012815	CGT	2	6	565100	565105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_012815	TCG	2	6	565204	565209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195928
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