MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012815	AAG	2	6	416397	416402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195796
10002	NC_012815	CGCCT	2	10	416403	416412	0 %	20 %	20 %	60 %	241195796
10003	NC_012815	CAG	2	6	416424	416429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10004	NC_012815	AGC	2	6	416479	416484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10005	NC_012815	GAG	2	6	416499	416504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195796
10006	NC_012815	ACGA	2	8	416526	416533	50 %	0 %	25 %	25 %	241195796
10007	NC_012815	CAA	2	6	416561	416566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195796
10008	NC_012815	GCGCA	2	10	416613	416622	20 %	0 %	40 %	40 %	241195796
10009	NC_012815	GCC	2	6	416643	416648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195796
10010	NC_012815	GCC	2	6	416676	416681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195796
10011	NC_012815	CGCA	2	8	416691	416698	25 %	0 %	25 %	50 %	241195796
10012	NC_012815	CGC	2	6	416747	416752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195796
10013	NC_012815	CAG	2	6	416754	416759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10014	NC_012815	AAG	2	6	416772	416777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195796
10015	NC_012815	CTG	2	6	416787	416792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10016	NC_012815	AGG	3	9	416824	416832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195796
10017	NC_012815	GAG	2	6	416868	416873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195796
10018	NC_012815	CGC	2	6	416885	416890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195796
10019	NC_012815	GAG	2	6	416946	416951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195796
10020	NC_012815	GGC	2	6	416981	416986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195796
10021	NC_012815	GGCTTC	2	12	417099	417110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10022	NC_012815	CGAC	2	8	417127	417134	25 %	0 %	25 %	50 %	241195796
10023	NC_012815	GGT	2	6	417143	417148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195796
10024	NC_012815	TCA	2	6	417241	417246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195796
10025	NC_012815	GCA	2	6	417330	417335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10026	NC_012815	CGG	2	6	417346	417351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195796
10027	NC_012815	ACG	2	6	417352	417357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10028	NC_012815	ACGA	2	8	417369	417376	50 %	0 %	25 %	25 %	241195796
10029	NC_012815	CGG	2	6	417391	417396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195796
10030	NC_012815	CGA	2	6	417488	417493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10031	NC_012815	GAC	2	6	417504	417509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195796
10032	NC_012815	TTCGA	2	10	417540	417549	20 %	40 %	20 %	20 %	241195796
10033	NC_012815	ACA	2	6	417553	417558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195796
10034	NC_012815	AAC	2	6	417573	417578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195796
10035	NC_012815	CAT	3	9	417609	417617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_012815	AAG	2	6	417717	417722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012815	AGC	2	6	417792	417797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195797
10038	NC_012815	GAT	2	6	417807	417812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195797
10039	NC_012815	GCA	2	6	417832	417837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195797
10040	NC_012815	CAA	2	6	417881	417886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195797
10041	NC_012815	GC	3	6	417891	417896	0 %	0 %	50 %	50 %	241195797
10042	NC_012815	CTG	2	6	417915	417920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195797
10043	NC_012815	CGT	2	6	417924	417929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195797
10044	NC_012815	GCT	2	6	417982	417987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195797
10045	NC_012815	GCTC	2	8	417997	418004	0 %	25 %	25 %	50 %	241195797
10046	NC_012815	GC	3	6	418011	418016	0 %	0 %	50 %	50 %	241195797
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10052	NC_012815	AAG	2	6	418230	418235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195797
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10054	NC_012815	TGC	2	6	418318	418323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195797
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10064	NC_012815	GC	4	8	418678	418685	0 %	0 %	50 %	50 %	241195797
10065	NC_012815	TGG	2	6	418693	418698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195797
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10077	NC_012815	CG	3	6	419172	419177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_012815	TCG	2	6	419192	419197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_012815	GC	3	6	419240	419245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10084	NC_012815	CCCGC	2	10	419420	419429	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10085	NC_012815	CTT	2	6	419467	419472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_012815	C	6	6	419474	419479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10087	NC_012815	GGAA	2	8	419556	419563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012815	TGCGA	2	10	419585	419594	20 %	20 %	40 %	20 %	241195798
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10093	NC_012815	GAC	2	6	419787	419792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195798
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10104	NC_012815	AGCA	2	8	420423	420430	50 %	0 %	25 %	25 %	241195798
10105	NC_012815	TCA	2	6	420436	420441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195798
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10108	NC_012815	GGC	2	6	420485	420490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195798
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10111	NC_012815	TCCT	2	8	420558	420565	0 %	50 %	0 %	50 %	241195798
10112	NC_012815	TCA	2	6	420575	420580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195798
10113	NC_012815	GGCGCC	2	12	420581	420592	0 %	0 %	50 %	50 %	241195798
10114	NC_012815	TG	3	6	420633	420638	0 %	50 %	50 %	0 %	241195798
10115	NC_012815	CGT	2	6	420693	420698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195798
10116	NC_012815	GTA	2	6	420707	420712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195798
10117	NC_012815	CG	3	6	420736	420741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_012815	CG	3	6	420753	420758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_012815	TGGGG	2	10	420759	420768	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_012815	GCCG	2	8	420828	420835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_012815	GGC	2	6	420849	420854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_012815	GCC	2	6	420928	420933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195799
10123	NC_012815	GC	3	6	420976	420981	0 %	0 %	50 %	50 %	241195799
10124	NC_012815	ATC	2	6	421027	421032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195799
10125	NC_012815	TGC	2	6	421052	421057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195799
10126	NC_012815	GTC	2	6	421093	421098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195799
10127	NC_012815	CTT	2	6	421104	421109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195799
10128	NC_012815	CTG	2	6	421153	421158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195799
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10132	NC_012815	GC	3	6	421244	421249	0 %	0 %	50 %	50 %	241195799
10133	NC_012815	CGC	3	9	421247	421255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195799
10134	NC_012815	GCG	2	6	421271	421276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195799
10135	NC_012815	TGCCG	2	10	421278	421287	0 %	20 %	40 %	40 %	241195799
10136	NC_012815	CGGC	2	8	421346	421353	0 %	0 %	50 %	50 %	241195799
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10140	NC_012815	GC	3	6	421481	421486	0 %	0 %	50 %	50 %	241195799
10141	NC_012815	CGC	2	6	421491	421496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195799
10142	NC_012815	GAT	3	9	421509	421517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195799
10143	NC_012815	GCC	2	6	421573	421578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195799
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10152	NC_012815	CGTT	2	8	421918	421925	0 %	50 %	25 %	25 %	241195799
10153	NC_012815	GCT	2	6	421950	421955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195799
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10175	NC_012815	GC	4	8	422929	422936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10176	NC_012815	GAG	2	6	422991	422996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10177	NC_012815	GCA	2	6	423099	423104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195800
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10208	NC_012815	CAT	2	6	424341	424346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195801
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10212	NC_012815	GAC	2	6	424443	424448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195801
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10227	NC_012815	ATGCCG	3	18	425187	425204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195802
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10239	NC_012815	ACG	2	6	425720	425725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195802
10240	NC_012815	ATC	2	6	425765	425770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195802
10241	NC_012815	ATC	2	6	425835	425840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195802
10242	NC_012815	GCG	3	9	425861	425869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195802
10243	NC_012815	ACT	2	6	425910	425915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195802
10244	NC_012815	CGT	2	6	425977	425982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195802
10245	NC_012815	CGGCAT	2	12	425989	426000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195802
10246	NC_012815	GC	3	6	426053	426058	0 %	0 %	50 %	50 %	241195802
10247	NC_012815	GGC	2	6	426071	426076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195802
10248	NC_012815	AGCC	2	8	426097	426104	25 %	0 %	25 %	50 %	241195802
10249	NC_012815	AGGGG	2	10	426151	426160	20 %	0 %	80 %	0 %	241195802
10250	NC_012815	GGATGC	2	12	426220	426231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241195802
10251	NC_012815	CGGA	2	8	426243	426250	25 %	0 %	50 %	25 %	241195802
10252	NC_012815	AGG	2	6	426258	426263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195802
10253	NC_012815	GTG	2	6	426286	426291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195803
10254	NC_012815	GCC	2	6	426361	426366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195803
10255	NC_012815	GAG	2	6	426373	426378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195803
10256	NC_012815	GAG	2	6	426394	426399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195803
10257	NC_012815	TGC	2	6	426431	426436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195803
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10259	NC_012815	ATC	2	6	426493	426498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195803
10260	NC_012815	ATG	2	6	426524	426529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195803
10261	NC_012815	CGA	2	6	426555	426560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195803
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10263	NC_012815	CTG	2	6	426922	426927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195803
10264	NC_012815	ACG	2	6	426928	426933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195803
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10266	NC_012815	CTC	2	6	427011	427016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10267	NC_012815	TTGG	2	8	427026	427033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10268	NC_012815	ACA	2	6	427144	427149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195804
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10270	NC_012815	CCT	2	6	427216	427221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195804
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10287	NC_012815	GAAGT	2	10	428169	428178	40 %	20 %	40 %	0 %	241195804
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10303	NC_012815	GCG	2	6	428587	428592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195805
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10311	NC_012815	GCT	2	6	428814	428819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195805
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10341	NC_012815	TCG	2	6	429649	429654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195806
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10350	NC_012815	GCGT	2	8	430055	430062	0 %	25 %	50 %	25 %	241195806
10351	NC_012815	TCATCG	2	12	430081	430092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241195806
10352	NC_012815	CGGA	2	8	430112	430119	25 %	0 %	50 %	25 %	241195806
10353	NC_012815	TCG	2	6	430120	430125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195806
10354	NC_012815	GAA	3	9	430142	430150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195806
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10356	NC_012815	CGC	2	6	430271	430276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195807
10357	NC_012815	TGC	2	6	430327	430332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195807
10358	NC_012815	TGC	2	6	430387	430392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195807
10359	NC_012815	GCG	2	6	430439	430444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195807
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10361	NC_012815	CAA	2	6	430526	430531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195807
10362	NC_012815	GCGCG	2	10	430580	430589	0 %	0 %	60 %	40 %	241195807
10363	NC_012815	CAG	3	9	430650	430658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195807
10364	NC_012815	TCGC	2	8	430669	430676	0 %	25 %	25 %	50 %	241195807
10365	NC_012815	GCCGTG	2	12	430677	430688	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241195807
10366	NC_012815	CGCT	2	8	430744	430751	0 %	25 %	25 %	50 %	241195807
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10369	NC_012815	GCA	2	6	430814	430819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195807
10370	NC_012815	GCC	2	6	430821	430826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195807
10371	NC_012815	TTC	2	6	430848	430853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195807
10372	NC_012815	CGA	2	6	430906	430911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195807
10373	NC_012815	CAA	2	6	430916	430921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195807
10374	NC_012815	GAG	2	6	430932	430937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195807
10375	NC_012815	GA	4	8	430969	430976	50 %	0 %	50 %	0 %	241195807
10376	NC_012815	CGA	2	6	431050	431055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10377	NC_012815	AC	3	6	431124	431129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10378	NC_012815	CTGTC	2	10	431146	431155	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10379	NC_012815	GCG	2	6	431160	431165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10380	NC_012815	GGC	2	6	431167	431172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10381	NC_012815	GAA	2	6	431189	431194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10382	NC_012815	ACG	2	6	431274	431279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195808
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10384	NC_012815	CAT	2	6	431297	431302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195808
10385	NC_012815	CGT	2	6	431303	431308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195808
10386	NC_012815	GCG	2	6	431347	431352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195808
10387	NC_012815	ATC	2	6	431367	431372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195808
10388	NC_012815	CAT	2	6	431378	431383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195808
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10393	NC_012815	TCG	2	6	431629	431634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195808
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10452	NC_012815	GAT	2	6	434132	434137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10454	NC_012815	T	7	7	434160	434166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10455	NC_012815	AGGA	2	8	434200	434207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10463	NC_012815	AGC	2	6	434574	434579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195810
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10472	NC_012815	CGT	2	6	435027	435032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195811
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10475	NC_012815	TCA	2	6	435065	435070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195811
10476	NC_012815	TCG	2	6	435119	435124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195811
10477	NC_012815	AAG	2	6	435157	435162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195811
10478	NC_012815	GCTC	2	8	435328	435335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10479	NC_012815	ACG	2	6	435419	435424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10480	NC_012815	AGC	2	6	435454	435459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10481	NC_012815	GGTG	2	8	435479	435486	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10482	NC_012815	CA	3	6	435501	435506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10483	NC_012815	GAC	2	6	435571	435576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10484	NC_012815	CGA	2	6	435600	435605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10485	NC_012815	TGG	2	6	435641	435646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195812
10486	NC_012815	GTG	2	6	435700	435705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195812
10487	NC_012815	CGA	2	6	435714	435719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10488	NC_012815	GAC	2	6	435820	435825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10489	NC_012815	GAC	2	6	435838	435843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10490	NC_012815	GGT	2	6	435849	435854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195812
10491	NC_012815	TCG	2	6	435883	435888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195812
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10494	NC_012815	GC	4	8	435978	435985	0 %	0 %	50 %	50 %	241195812
10495	NC_012815	GCAT	2	8	435995	436002	25 %	25 %	25 %	25 %	241195812
10496	NC_012815	CAG	2	6	436012	436017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10497	NC_012815	TCGT	2	8	436018	436025	0 %	50 %	25 %	25 %	241195812
10498	NC_012815	CGA	2	6	436068	436073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195812
10499	NC_012815	GCCGC	2	10	436090	436099	0 %	0 %	40 %	60 %	241195812
10500	NC_012815	CGG	3	9	436151	436159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195812

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