MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012815	ATG	2	6	193276	193281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195636
4502	NC_012815	CGT	2	6	193285	193290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195636
4503	NC_012815	ACG	2	6	193294	193299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195636
4504	NC_012815	CAT	2	6	193355	193360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012815	A	6	6	193370	193375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_012815	TC	3	6	193417	193422	0 %	50 %	0 %	50 %	241195637
4507	NC_012815	CGG	2	6	193567	193572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195637
4508	NC_012815	TGC	2	6	193578	193583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4509	NC_012815	GCTCG	2	10	193591	193600	0 %	20 %	40 %	40 %	241195637
4510	NC_012815	CGC	2	6	193630	193635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195637
4511	NC_012815	GC	3	6	193634	193639	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4512	NC_012815	GGC	2	6	193642	193647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195637
4513	NC_012815	GCTC	2	8	193668	193675	0 %	25 %	25 %	50 %	241195637
4514	NC_012815	CGA	2	6	193749	193754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4515	NC_012815	TCA	2	6	193779	193784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4516	NC_012815	TCA	2	6	193803	193808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4517	NC_012815	TCA	2	6	193899	193904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4518	NC_012815	GCA	2	6	193954	193959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4519	NC_012815	CGA	2	6	193966	193971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4520	NC_012815	CG	3	6	193986	193991	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4521	NC_012815	CGT	2	6	194011	194016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4522	NC_012815	GC	3	6	194017	194022	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4523	NC_012815	AC	3	6	194082	194087	50 %	0 %	0 %	50 %	241195637
4524	NC_012815	CG	3	6	194102	194107	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4525	NC_012815	TGA	2	6	194115	194120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195637
4526	NC_012815	TCGC	2	8	194153	194160	0 %	25 %	25 %	50 %	241195637
4527	NC_012815	GTT	2	6	194218	194223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195637
4528	NC_012815	GGT	2	6	194260	194265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195637
4529	NC_012815	CG	3	6	194307	194312	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4530	NC_012815	AGG	2	6	194400	194405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195637
4531	NC_012815	AGC	2	6	194409	194414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4532	NC_012815	ATC	2	6	194420	194425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4533	NC_012815	CGA	2	6	194452	194457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4534	NC_012815	CG	3	6	194514	194519	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4535	NC_012815	ATC	2	6	194573	194578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4536	NC_012815	GTC	2	6	194599	194604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4537	NC_012815	TCA	2	6	194607	194612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195637
4538	NC_012815	GACG	2	8	194638	194645	25 %	0 %	50 %	25 %	241195637
4539	NC_012815	TCCT	2	8	194729	194736	0 %	50 %	0 %	50 %	241195637
4540	NC_012815	TCGAA	2	10	194751	194760	40 %	20 %	20 %	20 %	241195637
4541	NC_012815	CGA	2	6	194782	194787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4542	NC_012815	GC	3	6	194867	194872	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4543	NC_012815	AGG	2	6	194886	194891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195637
4544	NC_012815	GCGAG	2	10	194904	194913	20 %	0 %	60 %	20 %	241195637
4545	NC_012815	GGC	2	6	194999	195004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195637
4546	NC_012815	GC	4	8	195026	195033	0 %	0 %	50 %	50 %	241195637
4547	NC_012815	CGA	2	6	195064	195069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4548	NC_012815	ACCG	2	8	195095	195102	25 %	0 %	25 %	50 %	241195637
4549	NC_012815	CGA	2	6	195141	195146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195637
4550	NC_012815	GGT	2	6	195217	195222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195637
4551	NC_012815	GCAC	2	8	195231	195238	25 %	0 %	25 %	50 %	241195637
4552	NC_012815	GAG	3	9	195296	195304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195637
4553	NC_012815	GCG	2	6	195322	195327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012815	GATA	2	8	195356	195363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012815	GC	3	6	195407	195412	0 %	0 %	50 %	50 %	241195638
4556	NC_012815	GAT	2	6	195427	195432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
4557	NC_012815	CGG	2	6	195435	195440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195638
4558	NC_012815	TCGGCG	2	12	195506	195517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241195638
4559	NC_012815	CGA	2	6	195564	195569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4560	NC_012815	CTGC	2	8	195583	195590	0 %	25 %	25 %	50 %	241195638
4561	NC_012815	TGC	2	6	195611	195616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4562	NC_012815	TCGA	2	8	195619	195626	25 %	25 %	25 %	25 %	241195638
4563	NC_012815	GAT	2	6	195708	195713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
4564	NC_012815	GC	3	6	195747	195752	0 %	0 %	50 %	50 %	241195638
4565	NC_012815	CGA	2	6	195795	195800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4566	NC_012815	TGA	2	6	195818	195823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
4567	NC_012815	ACGA	2	8	195832	195839	50 %	0 %	25 %	25 %	241195638
4568	NC_012815	TCG	2	6	195889	195894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4569	NC_012815	GCTC	2	8	195911	195918	0 %	25 %	25 %	50 %	241195638
4570	NC_012815	ATG	2	6	195922	195927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
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4572	NC_012815	TCG	2	6	195995	196000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4573	NC_012815	TGA	2	6	196001	196006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
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4578	NC_012815	ATG	2	6	196198	196203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
4579	NC_012815	ATG	2	6	196207	196212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195638
4580	NC_012815	CGT	3	9	196236	196244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4581	NC_012815	CGGCG	2	10	196254	196263	0 %	0 %	60 %	40 %	241195638
4582	NC_012815	TCGA	2	8	196279	196286	25 %	25 %	25 %	25 %	241195638
4583	NC_012815	CGA	2	6	196413	196418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
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4585	NC_012815	AGC	2	6	196445	196450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
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4587	NC_012815	CGG	2	6	196562	196567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195638
4588	NC_012815	GAC	2	6	196620	196625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4589	NC_012815	CGG	2	6	196662	196667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195638
4590	NC_012815	TCGA	2	8	196675	196682	25 %	25 %	25 %	25 %	241195638
4591	NC_012815	TGC	2	6	196739	196744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4592	NC_012815	GAAG	2	8	196794	196801	50 %	0 %	50 %	0 %	241195638
4593	NC_012815	CGA	2	6	196809	196814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4594	NC_012815	GGT	2	6	196818	196823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195638
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4596	NC_012815	TGCCG	2	10	196831	196840	0 %	20 %	40 %	40 %	241195638
4597	NC_012815	CGCT	2	8	196861	196868	0 %	25 %	25 %	50 %	241195638
4598	NC_012815	CGA	2	6	196893	196898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
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4601	NC_012815	CGA	2	6	196980	196985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195638
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4603	NC_012815	GAG	2	6	197014	197019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195638
4604	NC_012815	CGT	2	6	197060	197065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4605	NC_012815	TCG	2	6	197135	197140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195638
4606	NC_012815	CA	3	6	197148	197153	50 %	0 %	0 %	50 %	241195638
4607	NC_012815	AGC	2	6	197331	197336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195639
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4615	NC_012815	TG	3	6	197754	197759	0 %	50 %	50 %	0 %	241195639
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4620	NC_012815	CGT	2	6	197860	197865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4621	NC_012815	GGC	2	6	197885	197890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195639
4622	NC_012815	GTGA	2	8	197940	197947	25 %	25 %	50 %	0 %	241195639
4623	NC_012815	GCG	2	6	198033	198038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195639
4624	NC_012815	GCC	2	6	198051	198056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195639
4625	NC_012815	GCT	2	6	198097	198102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4626	NC_012815	CGC	2	6	198112	198117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195639
4627	NC_012815	GC	4	8	198131	198138	0 %	0 %	50 %	50 %	241195639
4628	NC_012815	TGCTCG	2	12	198199	198210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4629	NC_012815	GTC	2	6	198242	198247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4630	NC_012815	CGAG	2	8	198280	198287	25 %	0 %	50 %	25 %	241195639
4631	NC_012815	GTC	2	6	198302	198307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4632	NC_012815	TTGC	2	8	198321	198328	0 %	50 %	25 %	25 %	241195639
4633	NC_012815	GTG	2	6	198411	198416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195639
4634	NC_012815	GCG	2	6	198462	198467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195639
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4638	NC_012815	ATG	2	6	198540	198545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195639
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4640	NC_012815	GGTT	2	8	198596	198603	0 %	50 %	50 %	0 %	241195639
4641	NC_012815	CGG	2	6	198622	198627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195639
4642	NC_012815	TCG	2	6	198672	198677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195639
4643	NC_012815	TGTGT	2	10	198691	198700	0 %	60 %	40 %	0 %	241195639
4644	NC_012815	GT	3	6	198727	198732	0 %	50 %	50 %	0 %	241195639
4645	NC_012815	TGCCC	2	10	198736	198745	0 %	20 %	20 %	60 %	241195639
4646	NC_012815	GCC	2	6	198755	198760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195639
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4648	NC_012815	TCA	2	6	198918	198923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4649	NC_012815	TTG	2	6	198985	198990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_012815	CG	3	6	198997	199002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4651	NC_012815	GC	3	6	199054	199059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4652	NC_012815	AGCCG	2	10	199086	199095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4653	NC_012815	CGG	2	6	199096	199101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4654	NC_012815	CG	3	6	199168	199173	0 %	0 %	50 %	50 %	241195640
4655	NC_012815	AGC	2	6	199178	199183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195640
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4663	NC_012815	CAG	2	6	199384	199389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195640
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4671	NC_012815	GC	3	6	199779	199784	0 %	0 %	50 %	50 %	241195640
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4674	NC_012815	CG	3	6	199968	199973	0 %	0 %	50 %	50 %	241195641
4675	NC_012815	CCG	2	6	200034	200039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195641
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4682	NC_012815	CTG	2	6	200313	200318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195641
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4686	NC_012815	CG	3	6	200396	200401	0 %	0 %	50 %	50 %	241195641
4687	NC_012815	CGT	2	6	200415	200420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195641
4688	NC_012815	TGC	2	6	200444	200449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195641
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4690	NC_012815	CGA	2	6	200520	200525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195641
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4693	NC_012815	GAAGT	2	10	200608	200617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4694	NC_012815	GC	4	8	200631	200638	0 %	0 %	50 %	50 %	241195642
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4699	NC_012815	GCG	2	6	200798	200803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195642
4700	NC_012815	GCT	2	6	200805	200810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195642
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4703	NC_012815	TGC	2	6	200858	200863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195642
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4713	NC_012815	GGC	2	6	201338	201343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4721	NC_012815	CGG	2	6	201571	201576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4724	NC_012815	AGA	3	9	201607	201615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4725	NC_012815	AAG	2	6	201616	201621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4727	NC_012815	AAAC	2	8	201978	201985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4728	NC_012815	CCT	2	6	202059	202064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195643
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4735	NC_012815	GCCGC	2	10	202292	202301	0 %	0 %	40 %	60 %	241195643
4736	NC_012815	CGT	2	6	202335	202340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195643
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4741	NC_012815	TCG	2	6	202596	202601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195643
4742	NC_012815	GATG	2	8	202618	202625	25 %	25 %	50 %	0 %	241195643
4743	NC_012815	GTT	2	6	202630	202635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195643
4744	NC_012815	ACG	2	6	202670	202675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195643
4745	NC_012815	CTT	2	6	202686	202691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195643
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4747	NC_012815	TCG	2	6	202733	202738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195643
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4765	NC_012815	GTG	2	6	203359	203364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4772	NC_012815	CGGT	2	8	203845	203852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4773	NC_012815	AGCG	2	8	203898	203905	25 %	0 %	50 %	25 %	241195644
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4864	NC_012815	CGA	2	6	207346	207351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195646
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4866	NC_012815	CAC	2	6	207413	207418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195646
4867	NC_012815	GAA	2	6	207428	207433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195646
4868	NC_012815	GAGCAT	2	12	207455	207466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241195646
4869	NC_012815	CGT	2	6	207484	207489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4870	NC_012815	GAA	2	6	207539	207544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195646
4871	NC_012815	GC	3	6	207553	207558	0 %	0 %	50 %	50 %	241195646
4872	NC_012815	CAT	2	6	207572	207577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195646
4873	NC_012815	GCA	2	6	207613	207618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4874	NC_012815	CATG	2	8	207649	207656	25 %	25 %	25 %	25 %	241195646
4875	NC_012815	AGCG	2	8	207692	207699	25 %	0 %	50 %	25 %	241195646
4876	NC_012815	ATG	2	6	207753	207758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195646
4877	NC_012815	CGA	2	6	207796	207801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4878	NC_012815	CAG	2	6	207806	207811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4879	NC_012815	TCG	2	6	207838	207843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4880	NC_012815	CCCA	2	8	207912	207919	25 %	0 %	0 %	75 %	241195646
4881	NC_012815	GCG	2	6	207940	207945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195646
4882	NC_012815	GGTG	2	8	207998	208005	0 %	25 %	75 %	0 %	241195646
4883	NC_012815	TGC	2	6	208051	208056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195646
4884	NC_012815	GGT	2	6	208103	208108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195646
4885	NC_012815	TGA	2	6	208126	208131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195646
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4888	NC_012815	TG	3	6	208233	208238	0 %	50 %	50 %	0 %	241195646
4889	NC_012815	TGCG	2	8	208330	208337	0 %	25 %	50 %	25 %	241195646
4890	NC_012815	GGT	2	6	208415	208420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195646
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4899	NC_012815	GTA	2	6	209105	209110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195646
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4912	NC_012815	CCT	2	6	209529	209534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4913	NC_012815	TAG	2	6	209590	209595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4914	NC_012815	CTC	2	6	209625	209630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4915	NC_012815	GC	3	6	209692	209697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4916	NC_012815	ACGAG	2	10	209788	209797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4985	NC_012815	TCG	2	6	212666	212671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195649
4986	NC_012815	ACG	3	9	212678	212686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195649
4987	NC_012815	GCC	2	6	212692	212697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195649
4988	NC_012815	TCG	3	9	212805	212813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4989	NC_012815	GTA	2	6	212828	212833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195650
4990	NC_012815	TCG	2	6	212865	212870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4991	NC_012815	GC	3	6	212950	212955	0 %	0 %	50 %	50 %	241195650
4992	NC_012815	CGT	2	6	213034	213039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4993	NC_012815	CGT	2	6	213133	213138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4994	NC_012815	CACGC	2	10	213194	213203	20 %	0 %	20 %	60 %	241195650
4995	NC_012815	AGC	2	6	213219	213224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4996	NC_012815	CTG	2	6	213278	213283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4997	NC_012815	TG	3	6	213282	213287	0 %	50 %	50 %	0 %	241195650
4998	NC_012815	TCG	2	6	213309	213314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650
4999	NC_012815	TTGG	2	8	213323	213330	0 %	50 %	50 %	0 %	241195650
5000	NC_012815	TCG	2	6	213334	213339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195650

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