MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia glumae BGR1 chromosome 1

Total Repeats: 117473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012724	GA	3	6	272811	272816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012724	CAAG	2	8	272845	272852	50 %	0 %	25 %	25 %	238025925
8003	NC_012724	GAA	2	6	272861	272866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025925
8004	NC_012724	AAG	2	6	272936	272941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025925
8005	NC_012724	GCG	2	6	273084	273089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025925
8006	NC_012724	CGC	2	6	273276	273281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025925
8007	NC_012724	GAG	2	6	273305	273310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025925
8008	NC_012724	ACT	2	6	273312	273317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025925
8009	NC_012724	ACA	2	6	273318	273323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025925
8010	NC_012724	GCT	2	6	273382	273387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
8011	NC_012724	GC	3	6	273388	273393	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8012	NC_012724	CGA	2	6	273403	273408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025925
8013	NC_012724	AAG	2	6	273464	273469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025925
8014	NC_012724	GAT	2	6	273529	273534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025925
8015	NC_012724	TGC	2	6	273543	273548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
8016	NC_012724	TGC	2	6	273552	273557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
8017	NC_012724	CGG	2	6	273589	273594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025925
8018	NC_012724	CGC	2	6	273629	273634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025925
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8023	NC_012724	GTC	2	6	273750	273755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
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8026	NC_012724	CAAGGG	2	12	273814	273825	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238025925
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8032	NC_012724	AAGGC	2	10	274149	274158	40 %	0 %	40 %	20 %	238025925
8033	NC_012724	GCG	2	6	274184	274189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025925
8034	NC_012724	GC	3	6	274259	274264	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8035	NC_012724	AAC	2	6	274283	274288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025925
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8040	NC_012724	CG	3	6	274458	274463	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8041	NC_012724	GC	3	6	274512	274517	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8042	NC_012724	ACC	2	6	274550	274555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025925
8043	NC_012724	CG	3	6	274562	274567	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8044	NC_012724	GCCG	2	8	274585	274592	0 %	0 %	50 %	50 %	238025925
8045	NC_012724	GAA	3	9	274624	274632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025925
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8047	NC_012724	CGT	2	6	274687	274692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
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8049	NC_012724	CGA	2	6	274759	274764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025925
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8052	NC_012724	TCG	2	6	274794	274799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025925
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8107	NC_012724	GCA	3	9	277063	277071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025925
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8110	NC_012724	T	9	9	277153	277161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012724	CGTC	2	8	277162	277169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_012724	GCGG	2	8	277170	277177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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8117	NC_012724	CTGA	2	8	277340	277347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_012724	GGC	2	6	277363	277368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_012724	CCG	2	6	277386	277391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_012724	CGGGC	2	10	277419	277428	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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8122	NC_012724	CGTGGT	2	12	277459	277470	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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8246	NC_012724	GGTG	2	8	281684	281691	0 %	25 %	75 %	0 %	238025929
8247	NC_012724	CAA	2	6	281762	281767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025929
8248	NC_012724	CTT	2	6	281789	281794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025929
8249	NC_012724	CTGCGC	2	12	281811	281822	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238025929
8250	NC_012724	GTG	3	9	281844	281852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025929
8251	NC_012724	GAA	2	6	281865	281870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025929
8252	NC_012724	CTG	2	6	281892	281897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8253	NC_012724	CGG	2	6	282016	282021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025929
8254	NC_012724	TGA	2	6	282037	282042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025929
8255	NC_012724	GAA	2	6	282054	282059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025929
8256	NC_012724	TCG	2	6	282285	282290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8257	NC_012724	GACC	2	8	282308	282315	25 %	0 %	25 %	50 %	238025929
8258	NC_012724	TCG	2	6	282319	282324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8259	NC_012724	TCT	2	6	282334	282339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025929
8260	NC_012724	CGT	2	6	282356	282361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8261	NC_012724	GCT	2	6	282377	282382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8262	NC_012724	AAG	2	6	282399	282404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025929
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8264	NC_012724	GC	3	6	282464	282469	0 %	0 %	50 %	50 %	238025929
8265	NC_012724	CGC	3	9	282479	282487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025929
8266	NC_012724	AGG	2	6	282499	282504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025929
8267	NC_012724	CGT	2	6	282661	282666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8268	NC_012724	CGA	2	6	282680	282685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8269	NC_012724	CAT	2	6	282701	282706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025929
8270	NC_012724	GCGGCC	2	12	282862	282873	0 %	0 %	50 %	50 %	238025929
8271	NC_012724	CCA	2	6	282886	282891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025929
8272	NC_012724	TTC	2	6	282930	282935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025929
8273	NC_012724	CG	3	6	282961	282966	0 %	0 %	50 %	50 %	238025929
8274	NC_012724	GCG	2	6	283012	283017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025929
8275	NC_012724	GTC	2	6	283035	283040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8276	NC_012724	GTTCG	2	10	283061	283070	0 %	40 %	40 %	20 %	238025929
8277	NC_012724	ACG	2	6	283075	283080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025929
8278	NC_012724	CGAA	2	8	283087	283094	50 %	0 %	25 %	25 %	238025929
8279	NC_012724	CG	3	6	283143	283148	0 %	0 %	50 %	50 %	238025929
8280	NC_012724	GAT	2	6	283169	283174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025929
8281	NC_012724	ATC	2	6	283419	283424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025929
8282	NC_012724	CGAAGT	2	12	283429	283440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238025929
8283	NC_012724	GTC	2	6	283443	283448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8284	NC_012724	TCA	2	6	283461	283466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8285	NC_012724	AGA	2	6	283475	283480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8286	NC_012724	GAC	2	6	283560	283565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025930
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8288	NC_012724	GTC	2	6	283593	283598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025930
8289	NC_012724	CGG	2	6	283605	283610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025930
8290	NC_012724	CGAAG	2	10	283611	283620	40 %	0 %	40 %	20 %	238025930
8291	NC_012724	ACG	2	6	283625	283630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025930
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8293	NC_012724	CA	3	6	283682	283687	50 %	0 %	0 %	50 %	238025930
8294	NC_012724	GAA	2	6	283752	283757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025930
8295	NC_012724	CTG	2	6	283846	283851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025930
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8303	NC_012724	GAAATC	2	12	284215	284226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238025930
8304	NC_012724	GAC	2	6	284250	284255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025930
8305	NC_012724	GCT	2	6	284283	284288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025930
8306	NC_012724	CTG	2	6	284323	284328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025930
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8309	NC_012724	TTC	2	6	284458	284463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025930
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8311	NC_012724	ACG	2	6	284494	284499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025930
8312	NC_012724	TCGA	2	8	284512	284519	25 %	25 %	25 %	25 %	238025930
8313	NC_012724	GAA	2	6	284599	284604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025930
8314	NC_012724	GGC	2	6	284629	284634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025930
8315	NC_012724	CGT	2	6	284652	284657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025930
8316	NC_012724	ATC	2	6	284707	284712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8317	NC_012724	GCAAAA	2	12	284824	284835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238025931
8318	NC_012724	A	6	6	284832	284837	100 %	0 %	0 %	0 %	238025931
8319	NC_012724	GATC	2	8	284872	284879	25 %	25 %	25 %	25 %	238025931
8320	NC_012724	GCC	2	6	284885	284890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025931
8321	NC_012724	TCG	2	6	284895	284900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025931
8322	NC_012724	TCC	2	6	284973	284978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238025931
8323	NC_012724	CGC	2	6	284982	284987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025931
8324	NC_012724	CAA	2	6	284992	284997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025931
8325	NC_012724	CG	3	6	285003	285008	0 %	0 %	50 %	50 %	238025931
8326	NC_012724	CGCA	2	8	285023	285030	25 %	0 %	25 %	50 %	238025931
8327	NC_012724	TCG	2	6	285048	285053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025931
8328	NC_012724	CCGA	2	8	285056	285063	25 %	0 %	25 %	50 %	238025931
8329	NC_012724	TGA	2	6	285081	285086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025931
8330	NC_012724	GCCG	2	8	285097	285104	0 %	0 %	50 %	50 %	238025931
8331	NC_012724	CGTCGA	2	12	285106	285117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238025931
8332	NC_012724	GTCG	2	8	285147	285154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8333	NC_012724	ATTG	2	8	285174	285181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8334	NC_012724	GCCC	2	8	285248	285255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8335	NC_012724	TGG	2	6	285259	285264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8336	NC_012724	CGG	2	6	285369	285374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025932
8337	NC_012724	CGCGC	2	10	285483	285492	0 %	0 %	40 %	60 %	238025932
8338	NC_012724	CG	3	6	285495	285500	0 %	0 %	50 %	50 %	238025932
8339	NC_012724	TCG	2	6	285612	285617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025932
8340	NC_012724	CACG	2	8	285724	285731	25 %	0 %	25 %	50 %	238025932
8341	NC_012724	GT	3	6	285789	285794	0 %	50 %	50 %	0 %	238025932
8342	NC_012724	CG	3	6	285859	285864	0 %	0 %	50 %	50 %	238025932
8343	NC_012724	GCT	3	9	285883	285891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025932
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8346	NC_012724	AAT	2	6	285966	285971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238025932
8347	NC_012724	GTC	2	6	286012	286017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025933
8348	NC_012724	CGT	2	6	286029	286034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025933
8349	NC_012724	CCA	2	6	286065	286070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025933
8350	NC_012724	TCG	2	6	286073	286078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025933
8351	NC_012724	AAG	2	6	286150	286155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025933
8352	NC_012724	CCGTGC	2	12	286179	286190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238025933
8353	NC_012724	GTC	2	6	286197	286202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025933
8354	NC_012724	GGT	2	6	286219	286224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025933
8355	NC_012724	GAA	2	6	286249	286254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025933
8356	NC_012724	CAA	2	6	286272	286277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025933
8357	NC_012724	TCT	2	6	286307	286312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238025933
8358	NC_012724	GCC	2	6	286331	286336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025933
8359	NC_012724	GGT	2	6	286341	286346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025933
8360	NC_012724	TCA	2	6	286427	286432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025933
8361	NC_012724	TCGCG	2	10	286460	286469	0 %	20 %	40 %	40 %	238025933
8362	NC_012724	AAG	2	6	286534	286539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025933
8363	NC_012724	GAG	2	6	286573	286578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238025933
8364	NC_012724	ATC	2	6	286609	286614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025934
8365	NC_012724	GGT	2	6	286640	286645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025934
8366	NC_012724	GGC	2	6	286730	286735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025934
8367	NC_012724	GCT	2	6	286742	286747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025934
8368	NC_012724	GCAA	2	8	286792	286799	50 %	0 %	25 %	25 %	238025934
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8390	NC_012724	TCCG	2	8	287550	287557	0 %	25 %	25 %	50 %	238025935
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8424	NC_012724	GC	3	6	288775	288780	0 %	0 %	50 %	50 %	238025938
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8430	NC_012724	TCG	2	6	289069	289074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025938
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8434	NC_012724	TGC	2	6	289175	289180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025939
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8442	NC_012724	GAA	2	6	289504	289509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025939
8443	NC_012724	TCGT	2	8	289568	289575	0 %	50 %	25 %	25 %	238025939
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8445	NC_012724	CTG	2	6	289660	289665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025940
8446	NC_012724	CAG	2	6	289702	289707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025940
8447	NC_012724	GAA	2	6	289728	289733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025940
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8449	NC_012724	GTC	2	6	289839	289844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025941
8450	NC_012724	CAA	2	6	289847	289852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025941
8451	NC_012724	GTG	2	6	289917	289922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025941
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8456	NC_012724	GCAG	2	8	290082	290089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8457	NC_012724	TTGC	2	8	290116	290123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8458	NC_012724	GAT	2	6	290226	290231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8462	NC_012724	ACA	2	6	290399	290404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025942
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8469	NC_012724	CGT	2	6	290572	290577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025942
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8472	NC_012724	ATC	2	6	290770	290775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025943
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8475	NC_012724	ACG	2	6	290896	290901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025943
8476	NC_012724	AAG	2	6	291004	291009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025943
8477	NC_012724	GAC	2	6	291024	291029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025943
8478	NC_012724	GTT	2	6	291096	291101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238025944
8479	NC_012724	AAG	2	6	291201	291206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025944
8480	NC_012724	ATC	2	6	291207	291212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238025944
8481	NC_012724	CG	3	6	291342	291347	0 %	0 %	50 %	50 %	238025944
8482	NC_012724	CGTG	2	8	291392	291399	0 %	25 %	50 %	25 %	238025944
8483	NC_012724	CG	3	6	291420	291425	0 %	0 %	50 %	50 %	238025944
8484	NC_012724	ACA	2	6	291445	291450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025944
8485	NC_012724	ACC	2	6	291534	291539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238025944
8486	NC_012724	CGA	3	9	291548	291556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025944
8487	NC_012724	AAG	2	6	291640	291645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238025945
8488	NC_012724	TGA	2	6	291702	291707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025945
8489	NC_012724	CAA	2	6	291754	291759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238025945
8490	NC_012724	CG	3	6	291846	291851	0 %	0 %	50 %	50 %	238025945
8491	NC_012724	TCG	2	6	292014	292019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025946
8492	NC_012724	CGA	2	6	292067	292072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025946
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8495	NC_012724	TGA	2	6	292261	292266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025946
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8497	NC_012724	CGG	2	6	292295	292300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025946
8498	NC_012724	GAAA	2	8	292335	292342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8499	NC_012724	GTG	2	6	292446	292451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238025947
8500	NC_012724	CGA	2	6	292505	292510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025947

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