MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012226	AT	3	6	76	81	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012226	TAAA	2	8	97	104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012226	T	6	6	130	135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012226	TCT	2	6	165	170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012226	AGC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012226	ATTA	2	8	215	222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012226	T	7	7	253	259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012226	T	6	6	261	266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012226	TTC	2	6	302	307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012226	AT	3	6	359	364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012226	T	6	6	364	369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012226	ATTT	2	8	371	378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012226	T	7	7	421	427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012226	ATCA	2	8	434	441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012226	T	7	7	461	467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012226	AATT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012226	ATA	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012226	T	6	6	538	543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012226	TAA	2	6	562	567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012226	TA	3	6	610	615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012226	AT	4	8	695	702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012226	AAT	3	9	703	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012226	ATTT	2	8	742	749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012226	TCT	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012226	ATTG	2	8	829	836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012226	TCT	2	6	858	863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012226	TTC	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012226	AT	3	6	921	926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012226	ATA	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012226	AT	3	6	1057	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012226	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012226	TTAT	2	8	1117	1124	25 %	75 %	0 %	0 %	225350701
33	NC_012226	T	6	6	1124	1129	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
34	NC_012226	T	7	7	1148	1154	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
35	NC_012226	TAA	2	6	1261	1266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
36	NC_012226	T	7	7	1271	1277	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
37	NC_012226	TTCT	2	8	1306	1313	0 %	75 %	0 %	25 %	225350701
38	NC_012226	CTC	2	6	1327	1332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225350701
39	NC_012226	ATTA	2	8	1340	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	225350701
40	NC_012226	TAT	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
41	NC_012226	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
42	NC_012226	AT	3	6	1407	1412	50 %	50 %	0 %	0 %	225350701
43	NC_012226	ATT	2	6	1457	1462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
44	NC_012226	GTCTCT	2	12	1504	1515	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225350701
45	NC_012226	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	225350701
46	NC_012226	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
47	NC_012226	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
48	NC_012226	TTC	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350701
49	NC_012226	T	7	7	1598	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
50	NC_012226	TGA	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350701
51	NC_012226	AT	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	225350701
52	NC_012226	CTA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350701
53	NC_012226	TAT	3	9	1759	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
54	NC_012226	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	225350701
55	NC_012226	CTC	2	6	1804	1809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225350701
56	NC_012226	TAT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
57	NC_012226	T	8	8	1858	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
58	NC_012226	TAA	2	6	1880	1885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
59	NC_012226	AGA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350701
60	NC_012226	TAT	2	6	1912	1917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
61	NC_012226	ATT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
62	NC_012226	T	6	6	1926	1931	0 %	100 %	0 %	0 %	225350701
63	NC_012226	ATT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
64	NC_012226	TTA	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350701
65	NC_012226	TAA	2	6	2009	2014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
66	NC_012226	TAA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
67	NC_012226	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350701
68	NC_012226	CTA	2	6	2076	2081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350702
69	NC_012226	T	7	7	2082	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
70	NC_012226	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
71	NC_012226	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	225350702
72	NC_012226	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
73	NC_012226	TAT	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
74	NC_012226	ATA	2	6	2202	2207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350702
75	NC_012226	T	6	6	2243	2248	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
76	NC_012226	ACC	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225350702
77	NC_012226	TTA	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
78	NC_012226	TA	4	8	2304	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	225350702
79	NC_012226	TCT	2	6	2351	2356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
80	NC_012226	TAT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
81	NC_012226	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
82	NC_012226	AT	3	6	2466	2471	50 %	50 %	0 %	0 %	225350702
83	NC_012226	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	225350702
84	NC_012226	TA	3	6	2536	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	225350702
85	NC_012226	ATT	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
86	NC_012226	TAT	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
87	NC_012226	TTC	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
88	NC_012226	TAT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
89	NC_012226	T	9	9	2658	2666	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
90	NC_012226	TCA	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350702
91	NC_012226	ATT	2	6	2710	2715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
92	NC_012226	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	225350702
93	NC_012226	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350702
94	NC_012226	T	6	6	2773	2778	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
95	NC_012226	ATTT	2	8	2787	2794	25 %	75 %	0 %	0 %	225350702
96	NC_012226	ATT	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350702
97	NC_012226	T	7	7	2815	2821	0 %	100 %	0 %	0 %	225350702
98	NC_012226	TA	3	6	2842	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	225350702
99	NC_012226	TTC	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
100	NC_012226	TGT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225350702
101	NC_012226	TTC	2	6	2884	2889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
102	NC_012226	A	6	6	2903	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	225350702
103	NC_012226	TCT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350702
104	NC_012226	ATTT	2	8	2955	2962	25 %	75 %	0 %	0 %	225350702
105	NC_012226	TAT	3	9	2991	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012226	AT	3	6	2998	3003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012226	ATA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012226	TA	3	6	3022	3027	50 %	50 %	0 %	0 %	225350703
109	NC_012226	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
110	NC_012226	AAAATT	2	12	3037	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
111	NC_012226	ATG	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350703
112	NC_012226	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
113	NC_012226	A	6	6	3106	3111	100 %	0 %	0 %	0 %	225350703
114	NC_012226	AGA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350703
115	NC_012226	T	6	6	3169	3174	0 %	100 %	0 %	0 %	225350703
116	NC_012226	AAT	2	6	3178	3183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
117	NC_012226	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
118	NC_012226	TAA	2	6	3255	3260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
119	NC_012226	TTA	2	6	3303	3308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
120	NC_012226	AT	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	225350703
121	NC_012226	AAAG	2	8	3346	3353	75 %	0 %	25 %	0 %	225350703
122	NC_012226	A	6	6	3362	3367	100 %	0 %	0 %	0 %	225350703
123	NC_012226	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
124	NC_012226	ACT	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350703
125	NC_012226	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
126	NC_012226	ATC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350703
127	NC_012226	AGA	2	6	3442	3447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350703
128	NC_012226	A	6	6	3452	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	225350703
129	NC_012226	AATTA	2	10	3466	3475	60 %	40 %	0 %	0 %	225350703
130	NC_012226	TAG	2	6	3484	3489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350703
131	NC_012226	TAA	3	9	3516	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
132	NC_012226	T	7	7	3541	3547	0 %	100 %	0 %	0 %	225350703
133	NC_012226	AAT	2	6	3570	3575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
134	NC_012226	AATA	2	8	3580	3587	75 %	25 %	0 %	0 %	225350703
135	NC_012226	CTT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350703
136	NC_012226	T	7	7	3592	3598	0 %	100 %	0 %	0 %	225350703
137	NC_012226	GAAAT	2	10	3602	3611	60 %	20 %	20 %	0 %	225350703
138	NC_012226	TCT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350703
139	NC_012226	AT	3	6	3666	3671	50 %	50 %	0 %	0 %	225350703
140	NC_012226	TTA	2	6	3692	3697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350703
141	NC_012226	ATTAT	2	10	3698	3707	40 %	60 %	0 %	0 %	225350703
142	NC_012226	TAAA	2	8	3714	3721	75 %	25 %	0 %	0 %	225350703
143	NC_012226	AAT	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350703
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