MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012225	GCA	3	9	132234	132242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619068
4002	NC_012225	ATA	2	6	132243	132248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619068
4003	NC_012225	TTAG	2	8	132267	132274	25 %	50 %	25 %	0 %	225619068
4004	NC_012225	AT	3	6	132299	132304	50 %	50 %	0 %	0 %	225619068
4005	NC_012225	ATA	2	6	132309	132314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619068
4006	NC_012225	TCT	2	6	132345	132350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619068
4007	NC_012225	TA	3	6	132382	132387	50 %	50 %	0 %	0 %	225619068
4008	NC_012225	AGG	2	6	132461	132466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619068
4009	NC_012225	AT	3	6	132494	132499	50 %	50 %	0 %	0 %	225619068
4010	NC_012225	TA	3	6	132554	132559	50 %	50 %	0 %	0 %	225619068
4011	NC_012225	AAT	2	6	132588	132593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619068
4012	NC_012225	GAT	2	6	132607	132612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012225	A	6	6	132616	132621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012225	TGT	2	6	132622	132627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012225	T	6	6	132627	132632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012225	AT	3	6	132643	132648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012225	TTAG	2	8	132668	132675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012225	ATTTT	2	10	132683	132692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012225	TAA	2	6	132729	132734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012225	ATTT	2	8	132764	132771	25 %	75 %	0 %	0 %	225619069
4021	NC_012225	AAG	2	6	132791	132796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619069
4022	NC_012225	AT	3	6	132806	132811	50 %	50 %	0 %	0 %	225619069
4023	NC_012225	ATG	2	6	132839	132844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619069
4024	NC_012225	GTAA	2	8	132859	132866	50 %	25 %	25 %	0 %	225619069
4025	NC_012225	TGAAAA	2	12	132897	132908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225619069
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4027	NC_012225	TAC	2	6	133015	133020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619069
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4029	NC_012225	TA	3	6	133061	133066	50 %	50 %	0 %	0 %	225619069
4030	NC_012225	ATTAGT	2	12	133084	133095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225619069
4031	NC_012225	AAGAA	2	10	133137	133146	80 %	0 %	20 %	0 %	225619069
4032	NC_012225	A	6	6	133245	133250	100 %	0 %	0 %	0 %	225619069
4033	NC_012225	TAA	2	6	133269	133274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619069
4034	NC_012225	GATT	2	8	133293	133300	25 %	50 %	25 %	0 %	225619069
4035	NC_012225	T	7	7	133299	133305	0 %	100 %	0 %	0 %	225619069
4036	NC_012225	AGG	2	6	133344	133349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619069
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4038	NC_012225	A	7	7	133485	133491	100 %	0 %	0 %	0 %	225619069
4039	NC_012225	ATATGA	2	12	133586	133597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225619069
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4041	NC_012225	AATA	2	8	133641	133648	75 %	25 %	0 %	0 %	225619069
4042	NC_012225	TAA	2	6	133654	133659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619069
4043	NC_012225	A	6	6	133658	133663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012225	TA	3	6	133667	133672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012225	GT	3	6	133684	133689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012225	AT	3	6	133690	133695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012225	TATAA	2	10	133702	133711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012225	ATT	2	6	133728	133733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012225	ATA	2	6	133740	133745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012225	TA	3	6	133768	133773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012225	ATG	2	6	133807	133812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619070
4052	NC_012225	TTATA	2	10	133817	133826	40 %	60 %	0 %	0 %	225619070
4053	NC_012225	TA	3	6	133833	133838	50 %	50 %	0 %	0 %	225619070
4054	NC_012225	ATA	3	9	133855	133863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619070
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4056	NC_012225	TAAT	2	8	133900	133907	50 %	50 %	0 %	0 %	225619070
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4060	NC_012225	ATT	2	6	134029	134034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619070
4061	NC_012225	TGA	2	6	134045	134050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619070
4062	NC_012225	AAAG	2	8	134061	134068	75 %	0 %	25 %	0 %	225619070
4063	NC_012225	TAC	2	6	134162	134167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619070
4064	NC_012225	T	6	6	134171	134176	0 %	100 %	0 %	0 %	225619070
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4068	NC_012225	ATA	2	6	134280	134285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619070
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4071	NC_012225	TAT	2	6	134398	134403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619070
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4073	NC_012225	A	6	6	134522	134527	100 %	0 %	0 %	0 %	225619070
4074	NC_012225	A	6	6	134596	134601	100 %	0 %	0 %	0 %	225619070
4075	NC_012225	ATT	3	9	134610	134618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012225	AT	3	6	134633	134638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012225	T	8	8	134645	134652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012225	ATA	2	6	134678	134683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012225	A	6	6	134754	134759	100 %	0 %	0 %	0 %	225619071
4080	NC_012225	TCAG	2	8	134781	134788	25 %	25 %	25 %	25 %	225619071
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4087	NC_012225	A	8	8	134895	134902	100 %	0 %	0 %	0 %	225619071
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4094	NC_012225	AGA	2	6	135123	135128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619071
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4097	NC_012225	ACAT	2	8	135228	135235	50 %	25 %	0 %	25 %	225619071
4098	NC_012225	CTC	2	6	135266	135271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619071
4099	NC_012225	TGT	2	6	135282	135287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619071
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4101	NC_012225	ATT	2	6	135411	135416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619071
4102	NC_012225	T	6	6	135465	135470	0 %	100 %	0 %	0 %	225619071
4103	NC_012225	GCG	2	6	135518	135523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225619071
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4105	NC_012225	GATAT	2	10	135611	135620	40 %	40 %	20 %	0 %	225619071
4106	NC_012225	TAA	2	6	135751	135756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012225	AT	3	6	135767	135772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_012225	ATA	2	6	135777	135782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_012225	A	7	7	135782	135788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012225	ATTT	2	8	135811	135818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012225	TTA	2	6	135821	135826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012225	ATA	2	6	135870	135875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012225	AATTA	2	10	135893	135902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012225	ATA	2	6	135908	135913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012225	TCA	2	6	136013	136018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619072
4116	NC_012225	GGA	2	6	136031	136036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619072
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4118	NC_012225	ATA	2	6	136064	136069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619072
4119	NC_012225	GCG	2	6	136152	136157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225619072
4120	NC_012225	AT	3	6	136178	136183	50 %	50 %	0 %	0 %	225619072
4121	NC_012225	A	7	7	136231	136237	100 %	0 %	0 %	0 %	225619072
4122	NC_012225	GAA	2	6	136298	136303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619072
4123	NC_012225	TAG	2	6	136398	136403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619072
4124	NC_012225	AGTA	2	8	136456	136463	50 %	25 %	25 %	0 %	225619072
4125	NC_012225	AGAA	2	8	136498	136505	75 %	0 %	25 %	0 %	225619072
4126	NC_012225	ATG	2	6	136533	136538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619072
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4128	NC_012225	GCT	2	6	136581	136586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619072
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4135	NC_012225	TTACT	2	10	136806	136815	20 %	60 %	0 %	20 %	225619072
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4159	NC_012225	CTG	2	6	138063	138068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619072
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4233	NC_012225	TTAT	2	8	140766	140773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_012225	A	6	6	140777	140782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_012225	TA	3	6	140873	140878	50 %	50 %	0 %	0 %	225619075
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4239	NC_012225	ATC	2	6	141056	141061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
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4265	NC_012225	TA	3	6	141958	141963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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