MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_012225	ATG	2	6	48123	48128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619000
1503	NC_012225	ATT	2	6	48190	48195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1504	NC_012225	TAT	2	6	48201	48206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1505	NC_012225	ATT	2	6	48256	48261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1506	NC_012225	TAT	2	6	48279	48284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1507	NC_012225	AT	4	8	48289	48296	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1508	NC_012225	CAT	2	6	48402	48407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619000
1509	NC_012225	TA	4	8	48418	48425	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1510	NC_012225	TTC	2	6	48442	48447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619000
1511	NC_012225	CTC	2	6	48501	48506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619000
1512	NC_012225	TAT	2	6	48541	48546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1513	NC_012225	TTTC	2	8	48570	48577	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
1514	NC_012225	TTTA	2	8	48583	48590	25 %	75 %	0 %	0 %	225619000
1515	NC_012225	TAAA	2	8	48597	48604	75 %	25 %	0 %	0 %	225619000
1516	NC_012225	TCC	2	6	48631	48636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619000
1517	NC_012225	ATC	2	6	48647	48652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619000
1518	NC_012225	TA	3	6	48688	48693	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1519	NC_012225	ATA	2	6	48822	48827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619000
1520	NC_012225	TTA	2	6	48834	48839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1521	NC_012225	TTC	2	6	48850	48855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619000
1522	NC_012225	T	7	7	48876	48882	0 %	100 %	0 %	0 %	225619000
1523	NC_012225	T	7	7	48910	48916	0 %	100 %	0 %	0 %	225619000
1524	NC_012225	AAT	2	6	48930	48935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619000
1525	NC_012225	ATA	2	6	49030	49035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619000
1526	NC_012225	CAG	2	6	49122	49127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619000
1527	NC_012225	TA	3	6	49201	49206	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1528	NC_012225	AAAT	2	8	49276	49283	75 %	25 %	0 %	0 %	225619000
1529	NC_012225	CATA	2	8	49287	49294	50 %	25 %	0 %	25 %	225619000
1530	NC_012225	AT	3	6	49431	49436	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1531	NC_012225	GACT	2	8	49460	49467	25 %	25 %	25 %	25 %	225619000
1532	NC_012225	TGT	2	6	49516	49521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619000
1533	NC_012225	ATC	2	6	49615	49620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619000
1534	NC_012225	T	6	6	49632	49637	0 %	100 %	0 %	0 %	225619000
1535	NC_012225	TATT	2	8	49646	49653	25 %	75 %	0 %	0 %	225619000
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1537	NC_012225	TTA	2	6	49676	49681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1538	NC_012225	AT	3	6	49702	49707	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1539	NC_012225	TCT	2	6	49708	49713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619000
1540	NC_012225	TCTT	2	8	49723	49730	0 %	75 %	0 %	25 %	225619000
1541	NC_012225	TAT	2	6	49765	49770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1542	NC_012225	AAGC	2	8	49773	49780	50 %	0 %	25 %	25 %	225619000
1543	NC_012225	ATT	3	9	49792	49800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1544	NC_012225	T	6	6	49813	49818	0 %	100 %	0 %	0 %	225619000
1545	NC_012225	TGC	2	6	49837	49842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619000
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1549	NC_012225	ATTT	2	8	49953	49960	25 %	75 %	0 %	0 %	225619000
1550	NC_012225	AT	3	6	49961	49966	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1551	NC_012225	AAT	2	6	49981	49986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619000
1552	NC_012225	GCT	2	6	49998	50003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619000
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1554	NC_012225	TAC	2	6	50026	50031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619000
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1556	NC_012225	ACA	2	6	50123	50128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619000
1557	NC_012225	TTA	2	6	50133	50138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619000
1558	NC_012225	A	7	7	50173	50179	100 %	0 %	0 %	0 %	225619000
1559	NC_012225	TTG	2	6	50199	50204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619000
1560	NC_012225	TTC	2	6	50245	50250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619000
1561	NC_012225	AGA	2	6	50356	50361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619000
1562	NC_012225	TAA	2	6	50362	50367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619000
1563	NC_012225	TA	4	8	50368	50375	50 %	50 %	0 %	0 %	225619000
1564	NC_012225	TTC	2	6	50391	50396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619000
1565	NC_012225	T	6	6	50403	50408	0 %	100 %	0 %	0 %	225619000
1566	NC_012225	TA	3	6	50459	50464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012225	TA	4	8	50476	50483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012225	TTG	2	6	50491	50496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012225	TAA	2	6	50531	50536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012225	TAT	2	6	50546	50551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012225	AT	3	6	50555	50560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012225	A	6	6	50566	50571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012225	ATT	2	6	50583	50588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012225	TAT	2	6	50600	50605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619001
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1577	NC_012225	ATT	2	6	50693	50698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619001
1578	NC_012225	T	7	7	50697	50703	0 %	100 %	0 %	0 %	225619001
1579	NC_012225	TTAT	2	8	50765	50772	25 %	75 %	0 %	0 %	225619001
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1583	NC_012225	TATT	2	8	50927	50934	25 %	75 %	0 %	0 %	225619001
1584	NC_012225	ACTA	2	8	50960	50967	50 %	25 %	0 %	25 %	225619001
1585	NC_012225	A	6	6	50981	50986	100 %	0 %	0 %	0 %	225619001
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1589	NC_012225	TAA	2	6	51275	51280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619001
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1592	NC_012225	TAA	2	6	51311	51316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619001
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1595	NC_012225	ATGA	2	8	51417	51424	50 %	25 %	25 %	0 %	225619001
1596	NC_012225	ATT	2	6	51492	51497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619001
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1601	NC_012225	GAA	2	6	51601	51606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619001
1602	NC_012225	ATG	2	6	51619	51624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619001
1603	NC_012225	ATA	2	6	51652	51657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619001
1604	NC_012225	ATA	2	6	51678	51683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619001
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1612	NC_012225	ATGA	2	8	51870	51877	50 %	25 %	25 %	0 %	225619001
1613	NC_012225	AGT	2	6	51908	51913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619001
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1616	NC_012225	A	6	6	51965	51970	100 %	0 %	0 %	0 %	225619001
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1621	NC_012225	A	6	6	52159	52164	100 %	0 %	0 %	0 %	225619001
1622	NC_012225	TAG	2	6	52183	52188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619001
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1624	NC_012225	AGA	2	6	52229	52234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619001
1625	NC_012225	GCA	2	6	52266	52271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619001
1626	NC_012225	AAG	2	6	52282	52287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619001
1627	NC_012225	GAA	2	6	52314	52319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619001
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