MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10503	NC_012225	CAT	2	6	340273	340278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619252
10504	NC_012225	ATG	2	6	340342	340347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619252
10505	NC_012225	A	7	7	340376	340382	100 %	0 %	0 %	0 %	225619252
10506	NC_012225	AGTT	2	8	340387	340394	25 %	50 %	25 %	0 %	225619252
10507	NC_012225	TAG	2	6	340408	340413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619252
10508	NC_012225	A	7	7	340493	340499	100 %	0 %	0 %	0 %	225619252
10509	NC_012225	AGA	2	6	340511	340516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619252
10510	NC_012225	AT	3	6	340517	340522	50 %	50 %	0 %	0 %	225619252
10511	NC_012225	AGAAA	2	10	340544	340553	80 %	0 %	20 %	0 %	225619252
10512	NC_012225	TA	3	6	340598	340603	50 %	50 %	0 %	0 %	225619252
10513	NC_012225	ATG	2	6	340630	340635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619252
10514	NC_012225	GCT	2	6	340686	340691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619252
10515	NC_012225	ATC	2	6	340730	340735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619252
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10517	NC_012225	TTTA	2	8	340766	340773	25 %	75 %	0 %	0 %	225619252
10518	NC_012225	CTA	2	6	340915	340920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619252
10519	NC_012225	CTG	2	6	340927	340932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619252
10520	NC_012225	GA	3	6	340947	340952	50 %	0 %	50 %	0 %	225619252
10521	NC_012225	AAG	2	6	340984	340989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619252
10522	NC_012225	TGC	2	6	341045	341050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619252
10523	NC_012225	AG	3	6	341143	341148	50 %	0 %	50 %	0 %	225619252
10524	NC_012225	CTT	2	6	341257	341262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619252
10525	NC_012225	TAAA	2	8	341280	341287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_012225	TTTA	2	8	341290	341297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_012225	AAT	3	9	341298	341306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_012225	ATT	2	6	341307	341312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_012225	ATT	2	6	341324	341329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_012225	T	7	7	341363	341369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_012225	ATG	2	6	341378	341383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_012225	A	6	6	341394	341399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_012225	TTC	2	6	341424	341429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619253
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10536	NC_012225	TAG	2	6	341544	341549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619253
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10539	NC_012225	TA	3	6	341602	341607	50 %	50 %	0 %	0 %	225619253
10540	NC_012225	T	6	6	341617	341622	0 %	100 %	0 %	0 %	225619253
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10550	NC_012225	T	7	7	341947	341953	0 %	100 %	0 %	0 %	225619253
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10555	NC_012225	AT	4	8	342052	342059	50 %	50 %	0 %	0 %	225619253
10556	NC_012225	TAA	2	6	342060	342065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619253
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10563	NC_012225	T	6	6	342239	342244	0 %	100 %	0 %	0 %	225619253
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10583	NC_012225	A	7	7	342611	342617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_012225	TA	3	6	342643	342648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_012225	AT	4	8	342693	342700	50 %	50 %	0 %	0 %	225619254
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10601	NC_012225	CTTA	2	8	343301	343308	25 %	50 %	0 %	25 %	225619254
10602	NC_012225	TAAT	2	8	343311	343318	50 %	50 %	0 %	0 %	225619254
10603	NC_012225	TAT	2	6	343354	343359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619254
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10605	NC_012225	GAAA	2	8	343375	343382	75 %	0 %	25 %	0 %	225619254
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10609	NC_012225	TA	4	8	343550	343557	50 %	50 %	0 %	0 %	225619255
10610	NC_012225	TA	3	6	343584	343589	50 %	50 %	0 %	0 %	225619255
10611	NC_012225	ATT	2	6	343644	343649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619255
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10619	NC_012225	GA	3	6	343901	343906	50 %	0 %	50 %	0 %	225619255
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10999	NC_012225	TAA	2	6	356460	356465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619267
11000	NC_012225	GGA	2	6	356669	356674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619267

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