MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_012225	TAA	2	6	325200	325205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619237
10003	NC_012225	TAATA	2	10	325227	325236	60 %	40 %	0 %	0 %	225619237
10004	NC_012225	GAT	2	6	325255	325260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619237
10005	NC_012225	TCAA	2	8	325280	325287	50 %	25 %	0 %	25 %	225619237
10006	NC_012225	A	7	7	325336	325342	100 %	0 %	0 %	0 %	225619237
10007	NC_012225	AGA	2	6	325349	325354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619237
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10009	NC_012225	AT	3	6	325380	325385	50 %	50 %	0 %	0 %	225619237
10010	NC_012225	A	6	6	325388	325393	100 %	0 %	0 %	0 %	225619237
10011	NC_012225	ACT	2	6	325420	325425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619237
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10013	NC_012225	ATCTAA	2	12	325446	325457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225619237
10014	NC_012225	GAG	2	6	325471	325476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619237
10015	NC_012225	ATA	2	6	325506	325511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619238
10016	NC_012225	GAA	2	6	325512	325517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619238
10017	NC_012225	TA	4	8	325525	325532	50 %	50 %	0 %	0 %	225619238
10018	NC_012225	ATTT	2	8	325548	325555	25 %	75 %	0 %	0 %	225619238
10019	NC_012225	TAT	2	6	325563	325568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619238
10020	NC_012225	T	6	6	325609	325614	0 %	100 %	0 %	0 %	225619238
10021	NC_012225	AGA	2	6	325663	325668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619238
10022	NC_012225	T	6	6	325673	325678	0 %	100 %	0 %	0 %	225619238
10023	NC_012225	AGC	2	6	325688	325693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619238
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10032	NC_012225	AAAT	2	8	325998	326005	75 %	25 %	0 %	0 %	225619238
10033	NC_012225	AAT	2	6	326024	326029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619238
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10038	NC_012225	ATAC	2	8	326204	326211	50 %	25 %	0 %	25 %	225619238
10039	NC_012225	TTA	2	6	326212	326217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619238
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10042	NC_012225	TAT	2	6	326320	326325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619238
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10094	NC_012225	ATC	2	6	327727	327732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619238
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10106	NC_012225	A	7	7	327964	327970	100 %	0 %	0 %	0 %	225619239
10107	NC_012225	T	7	7	327997	328003	0 %	100 %	0 %	0 %	225619239
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10110	NC_012225	A	6	6	328108	328113	100 %	0 %	0 %	0 %	225619239
10111	NC_012225	TA	3	6	328169	328174	50 %	50 %	0 %	0 %	225619239
10112	NC_012225	A	7	7	328199	328205	100 %	0 %	0 %	0 %	225619239
10113	NC_012225	AT	3	6	328227	328232	50 %	50 %	0 %	0 %	225619239
10114	NC_012225	T	6	6	328240	328245	0 %	100 %	0 %	0 %	225619239
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10121	NC_012225	GTT	2	6	328424	328429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619239
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10123	NC_012225	A	6	6	328456	328461	100 %	0 %	0 %	0 %	225619239
10124	NC_012225	TGC	2	6	328489	328494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619239
10125	NC_012225	TAATT	2	10	328516	328525	40 %	60 %	0 %	0 %	225619239
10126	NC_012225	A	6	6	328531	328536	100 %	0 %	0 %	0 %	225619239
10127	NC_012225	ATA	2	6	328557	328562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619239
10128	NC_012225	TCA	2	6	328576	328581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619239
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10159	NC_012225	A	7	7	329375	329381	100 %	0 %	0 %	0 %	225619240
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10163	NC_012225	ATG	2	6	329457	329462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619240
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10230	NC_012225	GTA	2	6	331779	331784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10233	NC_012225	AGTA	2	8	331817	331824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_012225	T	7	7	331962	331968	0 %	100 %	0 %	0 %	225619244
10239	NC_012225	ATA	2	6	331990	331995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619244
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10244	NC_012225	AT	3	6	332204	332209	50 %	50 %	0 %	0 %	225619244
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10246	NC_012225	AATT	2	8	332262	332269	50 %	50 %	0 %	0 %	225619244
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10254	NC_012225	TATTG	2	10	332539	332548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10272	NC_012225	TA	3	6	332910	332915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10273	NC_012225	TAT	2	6	332920	332925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10497	NC_012225	ATTA	2	8	340149	340156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_012225	ATTA	2	8	340159	340166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_012225	AT	3	6	340230	340235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_012225	ATTT	2	8	340244	340251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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