MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012225	AGCA	2	8	261055	261062	50 %	0 %	25 %	25 %	225619179
8002	NC_012225	A	6	6	261098	261103	100 %	0 %	0 %	0 %	225619179
8003	NC_012225	AG	3	6	261124	261129	50 %	0 %	50 %	0 %	225619179
8004	NC_012225	CTT	2	6	261171	261176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619179
8005	NC_012225	ATG	2	6	261192	261197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619179
8006	NC_012225	TGC	2	6	261292	261297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619179
8007	NC_012225	TTG	2	6	261315	261320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619179
8008	NC_012225	GAA	2	6	261392	261397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619179
8009	NC_012225	ATTC	2	8	261460	261467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_012225	TTTTA	2	10	261477	261486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012225	TAG	2	6	261499	261504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_012225	TTTA	2	8	261511	261518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_012225	AATT	2	8	261520	261527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012225	TTTTA	2	10	261587	261596	20 %	80 %	0 %	0 %	225619180
8015	NC_012225	AGA	2	6	261607	261612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619180
8016	NC_012225	AGA	2	6	261643	261648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619180
8017	NC_012225	TAAATT	2	12	261658	261669	50 %	50 %	0 %	0 %	225619180
8018	NC_012225	TCAG	2	8	261720	261727	25 %	25 %	25 %	25 %	225619180
8019	NC_012225	TCA	2	6	261796	261801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619180
8020	NC_012225	ACA	2	6	261845	261850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619180
8021	NC_012225	AAT	2	6	261854	261859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619180
8022	NC_012225	TGT	2	6	261871	261876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619180
8023	NC_012225	TAC	2	6	261898	261903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619180
8024	NC_012225	CAGA	2	8	261906	261913	50 %	0 %	25 %	25 %	225619180
8025	NC_012225	AAG	2	6	261969	261974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619180
8026	NC_012225	T	7	7	261994	262000	0 %	100 %	0 %	0 %	225619180
8027	NC_012225	AAGA	2	8	262037	262044	75 %	0 %	25 %	0 %	225619180
8028	NC_012225	ATA	2	6	262147	262152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619180
8029	NC_012225	ATA	2	6	262162	262167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_012225	ATA	2	6	262205	262210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8031	NC_012225	AAG	2	6	262233	262238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619181
8032	NC_012225	GATG	2	8	262249	262256	25 %	25 %	50 %	0 %	225619181
8033	NC_012225	TGT	2	6	262281	262286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619181
8034	NC_012225	AAT	2	6	262300	262305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8035	NC_012225	TAA	2	6	262314	262319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8036	NC_012225	GTT	2	6	262330	262335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619181
8037	NC_012225	TAGAAG	2	12	262337	262348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225619181
8038	NC_012225	T	6	6	262369	262374	0 %	100 %	0 %	0 %	225619181
8039	NC_012225	TA	3	6	262426	262431	50 %	50 %	0 %	0 %	225619181
8040	NC_012225	T	6	6	262486	262491	0 %	100 %	0 %	0 %	225619181
8041	NC_012225	A	6	6	262521	262526	100 %	0 %	0 %	0 %	225619181
8042	NC_012225	ATA	2	6	262529	262534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8043	NC_012225	ATA	2	6	262537	262542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8044	NC_012225	AAT	2	6	262586	262591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619181
8045	NC_012225	A	7	7	262605	262611	100 %	0 %	0 %	0 %	225619182
8046	NC_012225	AAT	2	6	262631	262636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619182
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8051	NC_012225	ATG	2	6	262708	262713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619182
8052	NC_012225	TAA	2	6	262727	262732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619182
8053	NC_012225	AGAT	2	8	262759	262766	50 %	25 %	25 %	0 %	225619182
8054	NC_012225	AGA	2	6	262772	262777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619182
8055	NC_012225	ATG	2	6	262804	262809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619182
8056	NC_012225	TGA	2	6	262811	262816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619182
8057	NC_012225	ATT	2	6	262846	262851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619182
8058	NC_012225	CAA	2	6	262879	262884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619182
8059	NC_012225	ATT	3	9	262885	262893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619182
8060	NC_012225	TAA	2	6	262982	262987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619182
8061	NC_012225	TAA	2	6	263026	263031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619182
8062	NC_012225	AATGA	2	10	263043	263052	60 %	20 %	20 %	0 %	225619182
8063	NC_012225	TAA	2	6	263057	263062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619182
8064	NC_012225	TAC	2	6	263063	263068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619182
8065	NC_012225	A	7	7	263101	263107	100 %	0 %	0 %	0 %	225619182
8066	NC_012225	TA	3	6	263113	263118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_012225	A	6	6	263120	263125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_012225	TTAA	2	8	263135	263142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_012225	TAAT	2	8	263165	263172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_012225	ATT	3	9	263173	263181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619183
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8072	NC_012225	ATG	2	6	263227	263232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619183
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8076	NC_012225	TCTA	2	8	263312	263319	25 %	50 %	0 %	25 %	225619183
8077	NC_012225	ATT	2	6	263330	263335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619183
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8093	NC_012225	TAAT	2	8	263976	263983	50 %	50 %	0 %	0 %	225619183
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8110	NC_012225	TTCT	2	8	264763	264770	0 %	75 %	0 %	25 %	225619183
8111	NC_012225	AAGT	2	8	264787	264794	50 %	25 %	25 %	0 %	225619183
8112	NC_012225	AT	4	8	264820	264827	50 %	50 %	0 %	0 %	225619183
8113	NC_012225	A	7	7	264835	264841	100 %	0 %	0 %	0 %	225619183
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