MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83002	NC_012225	TATTC	2	10	2608269	2608278	20 %	60 %	0 %	20 %	225621204
83003	NC_012225	TAA	2	6	2608346	2608351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83004	NC_012225	TTA	2	6	2608386	2608391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621204
83005	NC_012225	TTC	3	9	2608420	2608428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621204
83006	NC_012225	ATA	2	6	2608468	2608473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83007	NC_012225	ATAGA	2	10	2608495	2608504	60 %	20 %	20 %	0 %	225621204
83008	NC_012225	TAT	2	6	2608513	2608518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621204
83009	NC_012225	ATA	2	6	2608525	2608530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83010	NC_012225	A	7	7	2608598	2608604	100 %	0 %	0 %	0 %	225621204
83011	NC_012225	CTT	2	6	2608659	2608664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621204
83012	NC_012225	TA	3	6	2608674	2608679	50 %	50 %	0 %	0 %	225621204
83013	NC_012225	TGA	2	6	2608703	2608708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621204
83014	NC_012225	A	6	6	2608715	2608720	100 %	0 %	0 %	0 %	225621204
83015	NC_012225	AATT	2	8	2608733	2608740	50 %	50 %	0 %	0 %	225621204
83016	NC_012225	ATC	2	6	2608742	2608747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621204
83017	NC_012225	ATGA	2	8	2608839	2608846	50 %	25 %	25 %	0 %	225621204
83018	NC_012225	A	7	7	2608863	2608869	100 %	0 %	0 %	0 %	225621204
83019	NC_012225	AT	3	6	2608915	2608920	50 %	50 %	0 %	0 %	225621204
83020	NC_012225	AGC	2	6	2608943	2608948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225621204
83021	NC_012225	TGT	2	6	2608979	2608984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621204
83022	NC_012225	CTT	2	6	2609143	2609148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621204
83023	NC_012225	AT	3	6	2609161	2609166	50 %	50 %	0 %	0 %	225621204
83024	NC_012225	CTT	2	6	2609170	2609175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621204
83025	NC_012225	ATA	2	6	2609200	2609205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83026	NC_012225	TAA	2	6	2609207	2609212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83027	NC_012225	TTA	2	6	2609224	2609229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621204
83028	NC_012225	AAT	2	6	2609234	2609239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621204
83029	NC_012225	TAAA	2	8	2609348	2609355	75 %	25 %	0 %	0 %	225621204
83030	NC_012225	A	7	7	2609375	2609381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83031	NC_012225	TA	3	6	2609396	2609401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83032	NC_012225	T	6	6	2609413	2609418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83033	NC_012225	AT	4	8	2609431	2609438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83034	NC_012225	T	6	6	2609441	2609446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83038	NC_012225	TA	3	6	2609571	2609576	50 %	50 %	0 %	0 %	225621205
83039	NC_012225	CTTT	2	8	2609582	2609589	0 %	75 %	0 %	25 %	225621205
83040	NC_012225	AAG	2	6	2609633	2609638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621205
83041	NC_012225	TAT	2	6	2609639	2609644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621205
83042	NC_012225	TAT	2	6	2609664	2609669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621205
83043	NC_012225	TAT	2	6	2609690	2609695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621205
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83052	NC_012225	T	7	7	2610053	2610059	0 %	100 %	0 %	0 %	225621205
83053	NC_012225	AT	3	6	2610100	2610105	50 %	50 %	0 %	0 %	225621205
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83055	NC_012225	CTA	2	6	2610137	2610142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225621205
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83090	NC_012225	T	6	6	2611192	2611197	0 %	100 %	0 %	0 %	225621205
83091	NC_012225	TA	3	6	2611209	2611214	50 %	50 %	0 %	0 %	225621205
83092	NC_012225	ATT	3	9	2611285	2611293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83101	NC_012225	AT	3	6	2611609	2611614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83102	NC_012225	TA	3	6	2611653	2611658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83103	NC_012225	A	6	6	2611703	2611708	100 %	0 %	0 %	0 %	225621207
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83106	NC_012225	AAAT	2	8	2611789	2611796	75 %	25 %	0 %	0 %	225621207
83107	NC_012225	AAAAT	2	10	2611807	2611816	80 %	20 %	0 %	0 %	225621207
83108	NC_012225	GTT	2	6	2611842	2611847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225621207
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83114	NC_012225	TCT	2	6	2612151	2612156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225621207
83115	NC_012225	GGA	2	6	2612163	2612168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225621207
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83117	NC_012225	TAT	2	6	2612193	2612198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225621207
83118	NC_012225	AAATA	2	10	2612234	2612243	80 %	20 %	0 %	0 %	225621207
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83243	NC_012225	AGA	2	6	2615555	2615560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225621211
83244	NC_012225	AG	3	6	2615565	2615570	50 %	0 %	50 %	0 %	225621211
83245	NC_012225	ACTT	2	8	2615590	2615597	25 %	50 %	0 %	25 %	225621211
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83247	NC_012225	TGA	2	6	2615639	2615644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621211
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83255	NC_012225	TGA	2	6	2615948	2615953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225621211
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83257	NC_012225	A	7	7	2615978	2615984	100 %	0 %	0 %	0 %	225621211
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83356	NC_012225	TAAA	2	8	2619302	2619309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83357	NC_012225	TTTA	2	8	2619311	2619318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83358	NC_012225	T	7	7	2619348	2619354	0 %	100 %	0 %	0 %	225621213
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83483	NC_012225	AAT	3	9	2623407	2623415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225621221
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83486	NC_012225	ATA	2	6	2623441	2623446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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