MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	ACTAT	2	10	38	47	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012180	TTTC	2	8	63	70	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012180	TAT	3	9	92	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012180	GTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	T	6	6	253	258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012180	TTC	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012180	T	8	8	282	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012180	GATT	2	8	290	297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	AATT	2	8	360	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012180	TAA	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	TTA	2	6	395	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012180	TAT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	AT	3	6	459	464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012180	GAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	AATA	2	8	505	512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	TATT	2	8	513	520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	TAGA	2	8	668	675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
21	NC_012180	TA	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	224796763
22	NC_012180	AAT	2	6	793	798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
23	NC_012180	AAT	3	9	811	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
24	NC_012180	CTA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796763
25	NC_012180	ATA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
26	NC_012180	AGA	2	6	870	875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
27	NC_012180	CAA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
28	NC_012180	TAG	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
29	NC_012180	ATA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
30	NC_012180	GAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
31	NC_012180	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
32	NC_012180	AAAT	2	8	1013	1020	75 %	25 %	0 %	0 %	224796763
33	NC_012180	AAT	3	9	1018	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
34	NC_012180	AGA	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
35	NC_012180	CAA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
36	NC_012180	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
37	NC_012180	T	6	6	1158	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	224796763
38	NC_012180	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
39	NC_012180	ACA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
40	NC_012180	GATAA	2	10	1216	1225	60 %	20 %	20 %	0 %	224796763
41	NC_012180	GAG	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796763
42	NC_012180	ATA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
43	NC_012180	AAC	2	6	1288	1293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796763
44	NC_012180	TAA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796763
45	NC_012180	AGC	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796763
46	NC_012180	ATG	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796763
47	NC_012180	AAAAG	2	10	1423	1432	80 %	0 %	20 %	0 %	224796763
48	NC_012180	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
49	NC_012180	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796763
50	NC_012180	AAG	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796763
51	NC_012180	TTA	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796763
52	NC_012180	AGCA	2	8	1622	1629	50 %	0 %	25 %	25 %	224796763
53	NC_012180	A	6	6	1648	1653	100 %	0 %	0 %	0 %	224796763
54	NC_012180	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012180	TAA	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012180	AAAT	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012180	AATTT	2	10	1937	1946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012180	A	7	7	1986	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012180	GAA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012180	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012180	T	8	8	2039	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012180	TAG	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
63	NC_012180	TCA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
64	NC_012180	GTTTT	2	10	2192	2201	0 %	80 %	20 %	0 %	224796760
65	NC_012180	ATC	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
66	NC_012180	TAA	2	6	2228	2233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
67	NC_012180	CTT	2	6	2242	2247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
68	NC_012180	T	6	6	2246	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
69	NC_012180	TAA	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
70	NC_012180	T	8	8	2281	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
71	NC_012180	TCT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
72	NC_012180	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
73	NC_012180	T	8	8	2404	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
74	NC_012180	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
75	NC_012180	ATC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796760
76	NC_012180	AGC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796760
77	NC_012180	T	7	7	2568	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
78	NC_012180	TCT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796760
79	NC_012180	TTTGA	2	10	2635	2644	20 %	60 %	20 %	0 %	224796760
80	NC_012180	TGA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
81	NC_012180	T	6	6	2724	2729	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
82	NC_012180	ATT	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796760
83	NC_012180	T	7	7	2759	2765	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
84	NC_012180	AGT	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796760
85	NC_012180	T	6	6	2787	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	224796760
86	NC_012180	GTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	224796760
87	NC_012180	TAA	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
88	NC_012180	TAA	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796760
89	NC_012180	ATTTA	2	10	2879	2888	40 %	60 %	0 %	0 %	224796760
90	NC_012180	TAT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012180	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012180	ATA	3	9	2944	2952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012180	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012180	ATT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012180	AATTT	2	10	3003	3012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012180	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012180	TAA	2	6	3081	3086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012180	CAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012180	T	6	6	3175	3180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012180	A	6	6	3199	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012180	GTTTT	2	10	3249	3258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012180	TAA	2	6	3285	3290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012180	TCT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012180	T	7	7	3335	3341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012180	TGA	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012180	T	6	6	3407	3412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012180	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012180	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012180	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012180	T	7	7	3512	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012180	ACT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012180	AAC	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012180	ATT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012180	TCT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012180	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012180	TTTGA	2	10	3685	3694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012180	TGTT	2	8	3777	3784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012180	TA	4	8	3808	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012180	T	8	8	3844	3851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012180	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012180	A	7	7	3909	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
122	NC_012180	A	6	6	3921	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
123	NC_012180	AAGA	2	8	3947	3954	75 %	0 %	25 %	0 %	224796749
124	NC_012180	A	7	7	3954	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	224796749
125	NC_012180	TTA	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796749
126	NC_012180	TAA	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012180	ATG	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012180	A	7	7	4101	4107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012180	CAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796744
130	NC_012180	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
131	NC_012180	CA	3	6	4142	4147	50 %	0 %	0 %	50 %	224796744
132	NC_012180	AAT	2	6	4169	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796744
133	NC_012180	TGA	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796744
134	NC_012180	CAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	0 %	20 %	224796744
135	NC_012180	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796744
136	NC_012180	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012180	TAAA	2	8	4349	4356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012180	GAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012180	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	224796757
140	NC_012180	TAAG	2	8	4462	4469	50 %	25 %	25 %	0 %	224796757
141	NC_012180	AT	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	224796757
142	NC_012180	CTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796757
143	NC_012180	AGA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796757
144	NC_012180	CT	3	6	4537	4542	0 %	50 %	0 %	50 %	224796757
145	NC_012180	TAA	3	9	4545	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796757
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