MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	AGCCG	2	10	5	14	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012169	T	7	7	58	64	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	AAG	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012169	TAAA	2	8	98	105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012169	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012169	ATTC	2	8	115	122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012169	ATT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012169	ACT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012169	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012169	A	6	6	215	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012169	ATG	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012169	TAT	2	6	256	261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012169	AACA	2	8	269	276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012169	TA	4	8	284	291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012169	AT	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012169	CTAT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012169	A	8	8	355	362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012169	TAAA	3	12	369	380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012169	T	6	6	441	446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012169	CTT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012169	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012169	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012169	AATC	2	8	527	534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012169	AATT	2	8	580	587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012169	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012169	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012169	CATA	2	8	677	684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012169	TCTATT	2	12	714	725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012169	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012169	ATTTA	2	10	802	811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012169	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012169	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012169	AATT	2	8	852	859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012169	AAAT	2	8	901	908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012169	GAT	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012169	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012169	A	6	6	944	949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012169	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
39	NC_012169	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
40	NC_012169	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
41	NC_012169	CAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796535
42	NC_012169	ATATAA	2	12	1002	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
43	NC_012169	TTA	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
44	NC_012169	AT	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
45	NC_012169	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
46	NC_012169	A	7	7	1068	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
47	NC_012169	AT	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
48	NC_012169	TAAAA	2	10	1099	1108	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
49	NC_012169	TAAAA	2	10	1126	1135	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
50	NC_012169	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
51	NC_012169	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
52	NC_012169	TA	3	6	1189	1194	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
53	NC_012169	A	7	7	1226	1232	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
54	NC_012169	CAAA	2	8	1254	1261	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
55	NC_012169	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
56	NC_012169	ATT	2	6	1297	1302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
57	NC_012169	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
58	NC_012169	A	9	9	1385	1393	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
59	NC_012169	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
60	NC_012169	TCA	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
61	NC_012169	TAA	3	9	1455	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
62	NC_012169	AT	3	6	1474	1479	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
63	NC_012169	TATT	2	8	1485	1492	25 %	75 %	0 %	0 %	224796535
64	NC_012169	AATA	2	8	1502	1509	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
65	NC_012169	T	8	8	1530	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
66	NC_012169	AAAT	2	8	1561	1568	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
67	NC_012169	CTAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	224796535
68	NC_012169	AAAC	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
69	NC_012169	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
70	NC_012169	AAATTA	2	12	1617	1628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
71	NC_012169	A	6	6	1654	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
72	NC_012169	ACA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
73	NC_012169	TAAAAA	2	12	1721	1732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224796533
74	NC_012169	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
75	NC_012169	TAA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
76	NC_012169	AAC	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
77	NC_012169	A	9	9	1864	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
78	NC_012169	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796533
79	NC_012169	AAATA	2	10	1928	1937	80 %	20 %	0 %	0 %	224796533
80	NC_012169	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
81	NC_012169	T	6	6	1980	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	224796533
82	NC_012169	A	6	6	1990	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
83	NC_012169	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
84	NC_012169	ATT	2	6	2041	2046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796533
85	NC_012169	AGG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796533
86	NC_012169	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
87	NC_012169	ATAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	224796533
88	NC_012169	A	7	7	2170	2176	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
89	NC_012169	A	6	6	2215	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
90	NC_012169	CTTT	2	8	2262	2269	0 %	75 %	0 %	25 %	224796545
91	NC_012169	TCA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
92	NC_012169	AGG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796545
93	NC_012169	TTAC	2	8	2402	2409	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
94	NC_012169	ATTCA	2	10	2434	2443	40 %	40 %	0 %	20 %	224796545
95	NC_012169	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
96	NC_012169	ATA	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
97	NC_012169	CAA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796545
98	NC_012169	TTCA	2	8	2530	2537	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
99	NC_012169	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
100	NC_012169	A	6	6	2552	2557	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
101	NC_012169	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
102	NC_012169	TC	3	6	2610	2615	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
103	NC_012169	A	7	7	2623	2629	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
104	NC_012169	CAG	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796545
105	NC_012169	CTT	2	6	2664	2669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
106	NC_012169	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
107	NC_012169	CCT	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
108	NC_012169	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
109	NC_012169	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
110	NC_012169	AAT	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
111	NC_012169	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
112	NC_012169	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
113	NC_012169	CTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
114	NC_012169	T	6	6	3063	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
115	NC_012169	GAAT	2	8	3074	3081	50 %	25 %	25 %	0 %	224796545
116	NC_012169	TCA	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
117	NC_012169	AAGG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	224796545
118	NC_012169	A	6	6	3165	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
119	NC_012169	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
120	NC_012169	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
121	NC_012169	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
122	NC_012169	TC	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
123	NC_012169	CCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
124	NC_012169	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
125	NC_012169	ATA	2	6	3420	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
126	NC_012169	ATA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
127	NC_012169	AATTAG	2	12	3560	3571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224796543
128	NC_012169	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
129	NC_012169	A	7	7	3690	3696	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
130	NC_012169	A	6	6	3747	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
131	NC_012169	ATA	2	6	3789	3794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
132	NC_012169	A	6	6	3805	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
133	NC_012169	GAA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796543
134	NC_012169	TTA	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
135	NC_012169	A	8	8	3987	3994	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
136	NC_012169	TTA	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
137	NC_012169	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
138	NC_012169	ATA	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
139	NC_012169	ATTT	2	8	4139	4146	25 %	75 %	0 %	0 %	224796543
140	NC_012169	A	7	7	4147	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
141	NC_012169	AGT	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
142	NC_012169	ACT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
143	NC_012169	ATC	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
144	NC_012169	AAC	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
145	NC_012169	ATAA	2	8	4313	4320	75 %	25 %	0 %	0 %	224796543
146	NC_012169	TAT	2	6	4331	4336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
147	NC_012169	AATT	3	12	4370	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
148	NC_012169	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	224796543
149	NC_012169	TCA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
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151	NC_012169	ATT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
152	NC_012169	ATTA	2	8	4603	4610	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
153	NC_012169	AGC	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
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156	NC_012169	A	6	6	4842	4847	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
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158	NC_012169	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
159	NC_012169	AGTA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	25 %	0 %	224796542
160	NC_012169	ATT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
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162	NC_012169	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
163	NC_012169	AAAT	2	8	5002	5009	75 %	25 %	0 %	0 %	224796542
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167	NC_012169	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
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176	NC_012169	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
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179	NC_012169	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
180	NC_012169	T	6	6	5533	5538	0 %	100 %	0 %	0 %	224796542
181	NC_012169	ATT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012169	T	6	6	5570	5575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012169	TTTA	2	8	5579	5586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012169	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012169	AAG	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012169	ATAG	2	8	5723	5730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012169	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012169	CCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_012169	ACA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_012169	ACC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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195	NC_012169	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012169	AATT	2	8	5952	5959	50 %	50 %	0 %	0 %	224796538
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227	NC_012169	AT	3	6	7187	7192	50 %	50 %	0 %	0 %	224796537
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262	NC_012169	ATTT	2	8	8241	8248	25 %	75 %	0 %	0 %	224796544
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264	NC_012169	T	7	7	8290	8296	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
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271	NC_012169	T	6	6	8559	8564	0 %	100 %	0 %	0 %	224796544
272	NC_012169	TCCA	2	8	8575	8582	25 %	25 %	0 %	50 %	224796544
273	NC_012169	AAC	2	6	8605	8610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
274	NC_012169	AGCC	2	8	8638	8645	25 %	0 %	25 %	50 %	224796544
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277	NC_012169	ATT	2	6	8735	8740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
278	NC_012169	TAA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
279	NC_012169	GAA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796530
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281	NC_012169	A	7	7	8816	8822	100 %	0 %	0 %	0 %	224796530
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