MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 598

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012169	CTT	2	6	15729	15734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796546
502	NC_012169	TCT	2	6	15755	15760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796546
503	NC_012169	AAT	2	6	15761	15766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
504	NC_012169	T	6	6	15778	15783	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
505	NC_012169	T	8	8	15803	15810	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
506	NC_012169	T	8	8	15827	15834	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
507	NC_012169	A	7	7	15835	15841	100 %	0 %	0 %	0 %	224796546
508	NC_012169	T	7	7	15849	15855	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
509	NC_012169	T	9	9	15884	15892	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
510	NC_012169	T	6	6	15953	15958	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
511	NC_012169	T	7	7	15975	15981	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
512	NC_012169	TTTC	2	8	15987	15994	0 %	75 %	0 %	25 %	224796546
513	NC_012169	TCT	3	9	15995	16003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796546
514	NC_012169	TTA	6	18	16004	16021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796546
515	NC_012169	T	6	6	16049	16054	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
516	NC_012169	A	6	6	16069	16074	100 %	0 %	0 %	0 %	224796546
517	NC_012169	TACT	2	8	16077	16084	25 %	50 %	0 %	25 %	224796546
518	NC_012169	T	6	6	16105	16110	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
519	NC_012169	TTTAT	2	10	16127	16136	20 %	80 %	0 %	0 %	224796546
520	NC_012169	TTTTTG	2	12	16144	16155	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224796546
521	NC_012169	TAA	2	6	16169	16174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
522	NC_012169	TAA	2	6	16208	16213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
523	NC_012169	GTT	2	6	16217	16222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796546
524	NC_012169	TTTTA	2	10	16267	16276	20 %	80 %	0 %	0 %	224796546
525	NC_012169	ATA	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
526	NC_012169	T	6	6	16342	16347	0 %	100 %	0 %	0 %	224796546
527	NC_012169	ATACTA	2	12	16377	16388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224796546
528	NC_012169	TA	4	8	16465	16472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012169	AATT	2	8	16482	16489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012169	TGAA	2	8	16502	16509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012169	ATA	2	6	16522	16527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012169	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012169	TTAAG	2	10	16560	16569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012169	GCA	2	6	16622	16627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796540
535	NC_012169	AGC	2	6	16639	16644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796540
536	NC_012169	CTG	2	6	16684	16689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796540
537	NC_012169	CAG	2	6	16698	16703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796540
538	NC_012169	CAA	2	6	16707	16712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796540
539	NC_012169	TAT	2	6	16720	16725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796540
540	NC_012169	CAG	3	9	16750	16758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
541	NC_012169	CAG	2	6	16777	16782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
542	NC_012169	ACC	3	9	16787	16795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
543	NC_012169	AAC	2	6	16809	16814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
544	NC_012169	CAT	2	6	16840	16845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796532
545	NC_012169	ACC	2	6	16883	16888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
546	NC_012169	CAG	2	6	16897	16902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
547	NC_012169	CAA	2	6	16906	16911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
548	NC_012169	CTC	2	6	16946	16951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796532
549	NC_012169	AGC	2	6	16976	16981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
550	NC_012169	CAG	3	9	16996	17004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
551	NC_012169	CAG	2	6	17023	17028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
552	NC_012169	TCC	2	6	17040	17045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796532
553	NC_012169	ACCA	2	8	17063	17070	50 %	0 %	0 %	50 %	224796532
554	NC_012169	ATT	4	12	17099	17110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
555	NC_012169	AGC	2	6	17111	17116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
556	NC_012169	AGC	2	6	17153	17158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
557	NC_012169	ATT	2	6	17171	17176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
558	NC_012169	CAG	3	9	17194	17202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
559	NC_012169	AGC	2	6	17225	17230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
560	NC_012169	AGC	2	6	17252	17257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
561	NC_012169	CTG	2	6	17267	17272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796532
562	NC_012169	CCGCAC	2	12	17275	17286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224796532
563	NC_012169	CAG	2	6	17287	17292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
564	NC_012169	CAA	2	6	17296	17301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
565	NC_012169	TAT	2	6	17309	17314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
566	NC_012169	CAG	3	9	17338	17346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
567	NC_012169	CAT	2	6	17368	17373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796532
568	NC_012169	AGC	2	6	17378	17383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
569	NC_012169	AAC	2	6	17394	17399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
570	NC_012169	CAT	2	6	17419	17424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796532
571	NC_012169	CAG	2	6	17431	17436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
572	NC_012169	ACA	2	6	17439	17444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
573	NC_012169	ACC	2	6	17459	17464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
574	NC_012169	CAG	2	6	17473	17478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
575	NC_012169	CAA	2	6	17482	17487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
576	NC_012169	TTA	2	6	17526	17531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
577	NC_012169	GCA	2	6	17544	17549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
578	NC_012169	AGC	2	6	17555	17560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
579	NC_012169	CAG	3	9	17566	17574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
580	NC_012169	CTT	2	6	17645	17650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796532
581	NC_012169	AGC	2	6	17669	17674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
582	NC_012169	AGC	2	6	17711	17716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
583	NC_012169	ATT	2	6	17729	17734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
584	NC_012169	ATT	2	6	17747	17752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
585	NC_012169	CCAGCA	2	12	17757	17768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	224796532
586	NC_012169	AGC	2	6	17786	17791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
587	NC_012169	CAG	2	6	17812	17817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
588	NC_012169	GCCT	2	8	17825	17832	0 %	25 %	25 %	50 %	224796532
589	NC_012169	CAG	2	6	17845	17850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
590	NC_012169	CAA	2	6	17854	17859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
591	NC_012169	TAT	2	6	17867	17872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796532
592	NC_012169	CAG	3	9	17896	17904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
593	NC_012169	GCA	2	6	17922	17927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
594	NC_012169	ACC	4	12	17936	17947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
595	NC_012169	AGT	2	6	17948	17953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796532
596	NC_012169	AAC	2	6	17958	17963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
597	NC_012169	GCA	2	6	17982	17987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
598	NC_012169	AGC	2	6	17996	18001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532

< Previous 12Next >