MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 1084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	T	6	6	26	31	0 %	100 %	0 %	0 %	224984010
2	NC_012166	AGA	2	6	32	37	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984010
3	NC_012166	GGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984010
4	NC_012166	ACA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012166	A	6	6	143	148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012166	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012166	TAT	2	6	183	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012166	TAA	3	9	189	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012166	TTTA	2	8	231	238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012166	CTA	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012166	ATA	2	6	290	295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012166	TTA	2	6	358	363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012166	T	8	8	420	427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012166	TAT	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012166	A	6	6	465	470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012166	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012166	ATTAA	2	10	552	561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012166	AT	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012166	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012166	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012166	TAG	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012166	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012166	AAT	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
24	NC_012166	ATA	2	6	704	709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
25	NC_012166	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
26	NC_012166	ATTTTG	2	12	783	794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984011
27	NC_012166	AAG	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984011
28	NC_012166	GGAT	2	8	850	857	25 %	25 %	50 %	0 %	224984011
29	NC_012166	AT	3	6	856	861	50 %	50 %	0 %	0 %	224984011
30	NC_012166	ATG	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
31	NC_012166	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	224984011
32	NC_012166	A	8	8	922	929	100 %	0 %	0 %	0 %	224984011
33	NC_012166	ATAG	2	8	965	972	50 %	25 %	25 %	0 %	224984011
34	NC_012166	ATG	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
35	NC_012166	TTGAT	2	10	1092	1101	20 %	60 %	20 %	0 %	224984011
36	NC_012166	AAT	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
37	NC_012166	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012166	ATTT	2	8	1139	1146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012166	AGA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012166	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012166	AAAAT	2	10	1196	1205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012166	GAT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012166	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012166	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012166	TAAT	2	8	1359	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012166	A	7	7	1376	1382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012166	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012166	A	7	7	1402	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012166	A	7	7	1419	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012166	TTAA	2	8	1437	1444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012166	A	6	6	1448	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012166	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012166	AT	3	6	1515	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012166	AT	3	6	1552	1557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012166	CT	3	6	1559	1564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012166	TTTTTA	2	12	1590	1601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012166	A	6	6	1616	1621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012166	ACA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012166	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012166	AATT	2	8	1749	1756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012166	TGAT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012166	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012166	AGG	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012166	ATTTT	2	10	1854	1863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012166	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012166	CAAC	2	8	1969	1976	50 %	0 %	0 %	50 %	224984012
67	NC_012166	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984012
68	NC_012166	A	7	7	2135	2141	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
69	NC_012166	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	224984013
70	NC_012166	TA	3	6	2199	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	224984013
71	NC_012166	AAAC	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	224984013
72	NC_012166	A	9	9	2237	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	224984013
73	NC_012166	TCAA	2	8	2246	2253	50 %	25 %	0 %	25 %	224984013
74	NC_012166	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984013
75	NC_012166	GTTT	2	8	2333	2340	0 %	75 %	25 %	0 %	224984014
76	NC_012166	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984014
77	NC_012166	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984014
78	NC_012166	TCT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984014
79	NC_012166	A	6	6	2464	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012166	AAC	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012166	ATTTTT	4	24	2517	2540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012166	TAT	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012166	GAG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012166	TAA	2	6	2629	2634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
85	NC_012166	CAAA	2	8	2642	2649	75 %	0 %	0 %	25 %	224984015
86	NC_012166	CAA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
87	NC_012166	A	9	9	2711	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
88	NC_012166	TCAA	2	8	2786	2793	50 %	25 %	0 %	25 %	224984015
89	NC_012166	ACT	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
90	NC_012166	ATTA	2	8	2840	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
91	NC_012166	CTA	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
92	NC_012166	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
93	NC_012166	ACA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
94	NC_012166	TAA	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
95	NC_012166	AG	3	6	2942	2947	50 %	0 %	50 %	0 %	224984015
96	NC_012166	AGAA	2	8	2952	2959	75 %	0 %	25 %	0 %	224984015
97	NC_012166	AAAT	2	8	2991	2998	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
98	NC_012166	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
99	NC_012166	TAA	3	9	3037	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
100	NC_012166	ATA	2	6	3048	3053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
101	NC_012166	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
102	NC_012166	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
103	NC_012166	A	6	6	3074	3079	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
104	NC_012166	AAACTA	2	12	3095	3106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984015
105	NC_012166	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
106	NC_012166	CTTC	2	8	3147	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	224984015
107	NC_012166	AGA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
108	NC_012166	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
109	NC_012166	AAT	2	6	3245	3250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
110	NC_012166	A	6	6	3277	3282	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
111	NC_012166	AAAAAT	2	12	3301	3312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984015
112	NC_012166	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
113	NC_012166	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
114	NC_012166	A	7	7	3408	3414	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
115	NC_012166	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
116	NC_012166	A	6	6	3464	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
117	NC_012166	ACA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
118	NC_012166	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
119	NC_012166	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
120	NC_012166	TAAA	2	8	3585	3592	75 %	25 %	0 %	0 %	224984015
121	NC_012166	A	7	7	3594	3600	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
122	NC_012166	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
123	NC_012166	CAA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
124	NC_012166	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
125	NC_012166	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	224984015
126	NC_012166	TTAA	2	8	3689	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	224984015
127	NC_012166	A	9	9	3736	3744	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
128	NC_012166	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
129	NC_012166	TCA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984016
130	NC_012166	A	6	6	3784	3789	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
131	NC_012166	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984016
132	NC_012166	AT	3	6	3811	3816	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
133	NC_012166	TA	3	6	3839	3844	50 %	50 %	0 %	0 %	224984016
134	NC_012166	A	8	8	3865	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
135	NC_012166	A	7	7	3908	3914	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
136	NC_012166	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984016
137	NC_012166	TATAT	2	10	4055	4064	40 %	60 %	0 %	0 %	224984016
138	NC_012166	A	6	6	4078	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
139	NC_012166	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
140	NC_012166	AGAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	25 %	0 %	224984016
141	NC_012166	ATAA	2	8	4138	4145	75 %	25 %	0 %	0 %	224984016
142	NC_012166	A	6	6	4144	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	224984016
143	NC_012166	ATGG	2	8	4245	4252	25 %	25 %	50 %	0 %	224984016
144	NC_012166	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
145	NC_012166	AGG	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984017
146	NC_012166	TGAT	2	8	4360	4367	25 %	50 %	25 %	0 %	224984017
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291	NC_012166	TAA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012166	GAT	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012166	TA	3	6	8818	8823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012166	TAA	2	6	8829	8834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012166	AAAAT	2	10	8847	8856	80 %	20 %	0 %	0 %	224984024
296	NC_012166	A	6	6	8863	8868	100 %	0 %	0 %	0 %	224984024
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323	NC_012166	AAT	2	6	10019	10024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984025
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421	NC_012166	AAT	2	6	12804	12809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012166	CAAC	2	8	12819	12826	50 %	0 %	0 %	50 %	224984033
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425	NC_012166	T	7	7	12992	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	224984033
426	NC_012166	TA	3	6	13048	13053	50 %	50 %	0 %	0 %	224984033
427	NC_012166	AAAC	2	8	13060	13067	75 %	0 %	0 %	25 %	224984033
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