MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	GT	3	6	6	11	0 %	50 %	50 %	0 %	224586488
2	NC_012131	TAG	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586488
3	NC_012131	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	224586488
4	NC_012131	AGA	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586488
5	NC_012131	TAT	2	6	212	217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586488
6	NC_012131	AC	3	6	265	270	50 %	0 %	0 %	50 %	224586488
7	NC_012131	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	AAAAG	2	10	372	381	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012131	GAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586489
10	NC_012131	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586489
11	NC_012131	AAT	2	6	539	544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586489
12	NC_012131	AGAAA	2	10	626	635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012131	A	7	7	644	650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012131	TATTTA	2	12	698	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
15	NC_012131	TAT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
16	NC_012131	TTCATT	2	12	815	826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224586490
17	NC_012131	AAT	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
18	NC_012131	CTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
19	NC_012131	ACA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586490
20	NC_012131	TCT	2	6	960	965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
21	NC_012131	TTG	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586490
22	NC_012131	TAA	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
23	NC_012131	AT	3	6	1194	1199	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
24	NC_012131	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
25	NC_012131	TAA	2	6	1243	1248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
26	NC_012131	AGT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
27	NC_012131	T	6	6	1278	1283	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
28	NC_012131	TA	3	6	1313	1318	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
29	NC_012131	A	7	7	1325	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
30	NC_012131	TGC	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586490
31	NC_012131	ACT	2	6	1394	1399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
32	NC_012131	TTG	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586490
33	NC_012131	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
34	NC_012131	AAT	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
35	NC_012131	AAAT	2	8	1510	1517	75 %	25 %	0 %	0 %	224586490
36	NC_012131	TAT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
37	NC_012131	TATT	2	8	1635	1642	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
38	NC_012131	T	7	7	1697	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
39	NC_012131	TAT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
40	NC_012131	T	6	6	1767	1772	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
41	NC_012131	T	6	6	1814	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
42	NC_012131	A	7	7	1823	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
43	NC_012131	TAG	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
44	NC_012131	TTA	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
45	NC_012131	TTTC	2	8	1903	1910	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
46	NC_012131	GTA	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
47	NC_012131	T	6	6	1956	1961	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
48	NC_012131	TAA	2	6	1978	1983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
49	NC_012131	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
50	NC_012131	TCTTT	2	10	2047	2056	0 %	80 %	0 %	20 %	224586490
51	NC_012131	T	7	7	2054	2060	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
52	NC_012131	ATT	2	6	2156	2161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
53	NC_012131	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
54	NC_012131	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
55	NC_012131	TAA	2	6	2218	2223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586490
56	NC_012131	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
57	NC_012131	TGA	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
58	NC_012131	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
59	NC_012131	T	6	6	2277	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
60	NC_012131	T	7	7	2294	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
61	NC_012131	TA	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
62	NC_012131	TAT	3	9	2320	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
63	NC_012131	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
64	NC_012131	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586490
65	NC_012131	CTTT	2	8	2379	2386	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
66	NC_012131	CTT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
67	NC_012131	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	224586490
68	NC_012131	T	6	6	2462	2467	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
69	NC_012131	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
70	NC_012131	TTA	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
71	NC_012131	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
72	NC_012131	TAG	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586490
73	NC_012131	TAT	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
74	NC_012131	CTTT	2	8	3228	3235	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
75	NC_012131	TCA	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586490
76	NC_012131	TCT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
77	NC_012131	GCAA	2	8	3366	3373	50 %	0 %	25 %	25 %	224586490
78	NC_012131	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
79	NC_012131	ATTT	2	8	3454	3461	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
80	NC_012131	TTC	2	6	3491	3496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
81	NC_012131	AAG	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586490
82	NC_012131	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
83	NC_012131	ATT	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
84	NC_012131	ATT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
85	NC_012131	TTA	2	6	3774	3779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
86	NC_012131	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
87	NC_012131	CTT	2	6	3846	3851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586490
88	NC_012131	TA	3	6	3860	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	224586490
89	NC_012131	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	224586490
90	NC_012131	ATT	3	9	3893	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
91	NC_012131	AT	3	6	3922	3927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012131	AACTA	2	10	3939	3948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012131	TA	3	6	3947	3952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012131	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012131	TA	3	6	3979	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
96	NC_012131	AT	3	6	4011	4016	50 %	50 %	0 %	0 %	224586491
97	NC_012131	AATTT	2	10	4031	4040	40 %	60 %	0 %	0 %	224586491
98	NC_012131	T	7	7	4047	4053	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
99	NC_012131	ATT	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586491
100	NC_012131	CTA	2	6	4084	4089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586491
101	NC_012131	TAT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586491
102	NC_012131	T	8	8	4111	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
103	NC_012131	TAA	2	6	4125	4130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586491
104	NC_012131	T	7	7	4136	4142	0 %	100 %	0 %	0 %	224586491
105	NC_012131	TAA	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012131	T	6	6	4345	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	224586492
107	NC_012131	TAC	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
108	NC_012131	GCT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586492
109	NC_012131	CAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
110	NC_012131	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586492
111	NC_012131	T	6	6	4573	4578	0 %	100 %	0 %	0 %	224586492
112	NC_012131	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012131	TAA	2	6	4640	4645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012131	ATT	2	6	4646	4651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012131	TTA	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012131	TTAAAT	2	12	4711	4722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012131	AT	3	6	4818	4823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012131	A	6	6	4848	4853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012131	ACAA	2	8	4889	4896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012131	A	6	6	4900	4905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012131	AGC	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012131	TAC	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012131	T	7	7	4942	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012131	T	6	6	5019	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012131	TTAC	2	8	5030	5037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012131	AAT	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012131	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012131	TAA	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012131	AAT	3	9	5122	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012131	A	6	6	5132	5137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012131	TTTAA	2	10	5214	5223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012131	ACTT	2	8	5310	5317	25 %	50 %	0 %	25 %	224586493
133	NC_012131	CTT	2	6	5322	5327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586493
134	NC_012131	AAT	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586493
135	NC_012131	CCT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586493
136	NC_012131	A	7	7	5495	5501	100 %	0 %	0 %	0 %	224586493
137	NC_012131	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	224586494
138	NC_012131	T	6	6	5553	5558	0 %	100 %	0 %	0 %	224586494
139	NC_012131	TATT	2	8	5594	5601	25 %	75 %	0 %	0 %	224586494
140	NC_012131	TCT	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586494
141	NC_012131	AAT	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586494
142	NC_012131	T	7	7	5647	5653	0 %	100 %	0 %	0 %	224586494
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411	NC_012131	AGA	2	6	14819	14824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
412	NC_012131	A	7	7	14826	14832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_012131	TGA	3	9	14880	14888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_012131	ATAAA	2	10	14909	14918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012131	GAAA	2	8	14925	14932	75 %	0 %	25 %	0 %	224586513
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418	NC_012131	AGC	2	6	15006	15011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586513
419	NC_012131	AAAC	2	8	15037	15044	75 %	0 %	0 %	25 %	224586513
420	NC_012131	AAAC	2	8	15076	15083	75 %	0 %	0 %	25 %	224586513
421	NC_012131	AAG	2	6	15092	15097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586513
422	NC_012131	TTGG	2	8	15103	15110	0 %	50 %	50 %	0 %	224586513
423	NC_012131	AAG	2	6	15167	15172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586513
424	NC_012131	AGAT	2	8	15182	15189	50 %	25 %	25 %	0 %	224586513
425	NC_012131	ATA	2	6	15193	15198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586513
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427	NC_012131	TAAT	2	8	15219	15226	50 %	50 %	0 %	0 %	224586513
428	NC_012131	T	7	7	15293	15299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012131	TGT	2	6	15301	15306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012131	TAAT	2	8	15318	15325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_012131	TA	3	6	15359	15364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012131	ATT	2	6	15417	15422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012131	GAA	2	6	15459	15464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012131	AT	3	6	15468	15473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012131	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012131	TAC	2	6	15638	15643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_012131	AGAT	2	8	15646	15653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012131	AGA	2	6	15661	15666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012131	ATAG	2	8	15681	15688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012131	A	6	6	15738	15743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012131	TAA	2	6	15755	15760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_012131	ATT	2	6	15764	15769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012131	AAT	2	6	15797	15802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012131	TAG	3	9	15817	15825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_012131	TAT	2	6	15842	15847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_012131	AAC	2	6	15848	15853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_012131	TGT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_012131	A	6	6	15898	15903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_012131	T	6	6	15990	15995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012131	A	6	6	16023	16028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012131	AT	3	6	16052	16057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012131	T	6	6	16069	16074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012131	TAATGA	2	12	16098	16109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586514
454	NC_012131	A	6	6	16116	16121	100 %	0 %	0 %	0 %	224586514
455	NC_012131	GAA	3	9	16165	16173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586514
456	NC_012131	AGA	2	6	16188	16193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586514
457	NC_012131	CTT	2	6	16195	16200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586514
458	NC_012131	A	6	6	16223	16228	100 %	0 %	0 %	0 %	224586514
459	NC_012131	TGA	2	6	16260	16265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586514
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461	NC_012131	ATAAA	2	10	16301	16310	80 %	20 %	0 %	0 %	224586514
462	NC_012131	A	7	7	16368	16374	100 %	0 %	0 %	0 %	224586514
463	NC_012131	CGG	2	6	16408	16413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_012131	CAA	2	6	16441	16446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586515
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498	NC_012131	A	7	7	17528	17534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_012131	CT	3	6	17551	17556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_012131	AGGT	2	8	17616	17623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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