MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola BCc plasmid pLeu-BCc

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011878	A	6	6	8	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
2	NC_011878	ATT	2	6	16	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
3	NC_011878	ACT	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
4	NC_011878	A	6	6	80	85	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
5	NC_011878	TAGCTT	2	12	92	103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219882536
6	NC_011878	A	6	6	195	200	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
7	NC_011878	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
8	NC_011878	ATTT	2	8	290	297	25 %	75 %	0 %	0 %	219882536
9	NC_011878	TCT	2	6	322	327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219882536
10	NC_011878	A	9	9	333	341	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
11	NC_011878	AAT	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882536
12	NC_011878	A	7	7	387	393	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
13	NC_011878	TAT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
14	NC_011878	ACT	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
15	NC_011878	TAC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
16	NC_011878	A	7	7	541	547	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
17	NC_011878	A	6	6	573	578	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
18	NC_011878	ATT	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
19	NC_011878	TGC	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882536
20	NC_011878	AGA	2	6	723	728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882536
21	NC_011878	TTA	2	6	731	736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
22	NC_011878	TAAA	2	8	848	855	75 %	25 %	0 %	0 %	219882536
23	NC_011878	A	6	6	867	872	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
24	NC_011878	TCA	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
25	NC_011878	A	6	6	915	920	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
26	NC_011878	A	6	6	924	929	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
27	NC_011878	ATT	2	6	937	942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
28	NC_011878	ATT	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
29	NC_011878	AGC	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882536
30	NC_011878	CAT	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
31	NC_011878	A	7	7	1027	1033	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
32	NC_011878	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	219882536
33	NC_011878	A	6	6	1099	1104	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
34	NC_011878	T	6	6	1141	1146	0 %	100 %	0 %	0 %	219882536
35	NC_011878	A	6	6	1147	1152	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
36	NC_011878	CAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882536
37	NC_011878	AGA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882536
38	NC_011878	TCAA	2	8	1197	1204	50 %	25 %	0 %	25 %	219882536
39	NC_011878	AT	3	6	1227	1232	50 %	50 %	0 %	0 %	219882536
40	NC_011878	ACC	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219882536
41	NC_011878	AT	3	6	1300	1305	50 %	50 %	0 %	0 %	219882536
42	NC_011878	TAAA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	219882536
43	NC_011878	A	7	7	1344	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
44	NC_011878	ATT	2	6	1402	1407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
45	NC_011878	ATT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
46	NC_011878	TAA	2	6	1521	1526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882536
47	NC_011878	A	7	7	1550	1556	100 %	0 %	0 %	0 %	219882536
48	NC_011878	T	9	9	1568	1576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011878	ATT	2	6	1583	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011878	A	7	7	1611	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
51	NC_011878	A	6	6	1663	1668	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
52	NC_011878	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882537
53	NC_011878	TAT	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
54	NC_011878	A	6	6	1752	1757	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
55	NC_011878	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
56	NC_011878	GTTA	2	8	1869	1876	25 %	50 %	25 %	0 %	219882537
57	NC_011878	ATGT	2	8	1901	1908	25 %	50 %	25 %	0 %	219882537
58	NC_011878	TTA	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
59	NC_011878	A	6	6	2006	2011	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
60	NC_011878	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
61	NC_011878	T	6	6	2068	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	219882537
62	NC_011878	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
63	NC_011878	ATT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
64	NC_011878	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
65	NC_011878	AT	3	6	2244	2249	50 %	50 %	0 %	0 %	219882537
66	NC_011878	A	6	6	2254	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
67	NC_011878	A	7	7	2261	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
68	NC_011878	A	7	7	2274	2280	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
69	NC_011878	TA	3	6	2314	2319	50 %	50 %	0 %	0 %	219882537
70	NC_011878	AAT	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882537
71	NC_011878	A	6	6	2335	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
72	NC_011878	AAAG	2	8	2384	2391	75 %	0 %	25 %	0 %	219882537
73	NC_011878	A	7	7	2415	2421	100 %	0 %	0 %	0 %	219882537
74	NC_011878	TG	3	6	2439	2444	0 %	50 %	50 %	0 %	219882537
75	NC_011878	T	9	9	2449	2457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011878	T	18	18	2462	2479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011878	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011878	T	8	8	2512	2519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011878	ATTTT	2	10	2524	2533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011878	TAT	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011878	T	8	8	2546	2553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011878	T	9	9	2569	2577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011878	T	17	17	2579	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011878	T	6	6	2604	2609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011878	A	8	8	2610	2617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011878	A	8	8	2633	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011878	CTT	2	6	2650	2655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011878	A	20	20	2682	2701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011878	AT	3	6	2707	2712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011878	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011878	GAA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882538
92	NC_011878	A	9	9	2779	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
93	NC_011878	TTC	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219882538
94	NC_011878	AAG	2	6	2840	2845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882538
95	NC_011878	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
96	NC_011878	A	6	6	2872	2877	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
97	NC_011878	A	8	8	2952	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
98	NC_011878	TATTT	2	10	2988	2997	20 %	80 %	0 %	0 %	219882538
99	NC_011878	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219882538
100	NC_011878	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882538
101	NC_011878	AAC	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882538
102	NC_011878	T	6	6	3079	3084	0 %	100 %	0 %	0 %	219882538
103	NC_011878	ATTT	2	8	3086	3093	25 %	75 %	0 %	0 %	219882538
104	NC_011878	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
105	NC_011878	A	7	7	3147	3153	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
106	NC_011878	AATT	2	8	3194	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	219882538
107	NC_011878	AT	3	6	3208	3213	50 %	50 %	0 %	0 %	219882538
108	NC_011878	A	6	6	3231	3236	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
109	NC_011878	A	8	8	3247	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
110	NC_011878	A	6	6	3299	3304	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
111	NC_011878	A	10	10	3339	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
112	NC_011878	T	6	6	3350	3355	0 %	100 %	0 %	0 %	219882538
113	NC_011878	GA	3	6	3396	3401	50 %	0 %	50 %	0 %	219882538
114	NC_011878	TTA	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
115	NC_011878	TTTG	2	8	3522	3529	0 %	75 %	25 %	0 %	219882538
116	NC_011878	TGA	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219882538
117	NC_011878	T	6	6	3606	3611	0 %	100 %	0 %	0 %	219882538
118	NC_011878	ATT	2	6	3615	3620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
119	NC_011878	GGT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219882538
120	NC_011878	A	6	6	3657	3662	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
121	NC_011878	ATT	3	9	3699	3707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
122	NC_011878	A	6	6	3728	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
123	NC_011878	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	219882538
124	NC_011878	TAA	2	6	3866	3871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882538
125	NC_011878	ACT	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882539
126	NC_011878	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
127	NC_011878	AT	3	6	3918	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	219882539
128	NC_011878	ATT	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
129	NC_011878	A	8	8	4013	4020	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
130	NC_011878	CAA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882539
131	NC_011878	A	7	7	4101	4107	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
132	NC_011878	TAA	2	6	4132	4137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
133	NC_011878	A	6	6	4136	4141	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
134	NC_011878	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
135	NC_011878	GTT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219882539
136	NC_011878	TAC	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882539
137	NC_011878	A	9	9	4397	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
138	NC_011878	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	219882539
139	NC_011878	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
140	NC_011878	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219882539
141	NC_011878	TAA	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
142	NC_011878	A	8	8	4499	4506	100 %	0 %	0 %	0 %	219882539
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144	NC_011878	ATT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.