MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_011835	CAG	2	6	1918946	1918951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684017
43002	NC_011835	CCG	2	6	1918953	1918958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684017
43003	NC_011835	CAT	2	6	1918984	1918989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684017
43004	NC_011835	GGT	2	6	1918996	1919001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684017
43005	NC_011835	CAT	2	6	1919066	1919071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684017
43006	NC_011835	GCG	2	6	1919091	1919096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684017
43007	NC_011835	CGA	2	6	1919164	1919169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684017
43008	NC_011835	AGGC	2	8	1919228	1919235	25 %	0 %	50 %	25 %	219684017
43009	NC_011835	CACCG	2	10	1919251	1919260	20 %	0 %	20 %	60 %	219684018
43010	NC_011835	GCT	2	6	1919301	1919306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43011	NC_011835	GAG	2	6	1919371	1919376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684018
43012	NC_011835	ACG	2	6	1919386	1919391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43013	NC_011835	GCC	2	6	1919404	1919409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43014	NC_011835	TCC	2	6	1919461	1919466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684018
43015	NC_011835	AAC	2	6	1919494	1919499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684018
43016	NC_011835	CGC	2	6	1919649	1919654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43017	NC_011835	CTGC	2	8	1919683	1919690	0 %	25 %	25 %	50 %	219684018
43018	NC_011835	GAG	2	6	1919695	1919700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684018
43019	NC_011835	GC	3	6	1919765	1919770	0 %	0 %	50 %	50 %	219684018
43020	NC_011835	CGA	2	6	1919886	1919891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43021	NC_011835	GCGG	2	8	1919910	1919917	0 %	0 %	75 %	25 %	219684018
43022	NC_011835	CCG	2	6	1920089	1920094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43023	NC_011835	GCC	2	6	1920172	1920177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43024	NC_011835	ACG	2	6	1920212	1920217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43025	NC_011835	GAT	2	6	1920331	1920336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684018
43026	NC_011835	CCG	2	6	1920347	1920352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43027	NC_011835	GGC	2	6	1920432	1920437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684018
43028	NC_011835	AGG	2	6	1920455	1920460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684018
43029	NC_011835	CCG	2	6	1920479	1920484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43030	NC_011835	CTG	2	6	1920553	1920558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43031	NC_011835	CGC	2	6	1920594	1920599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43032	NC_011835	AGG	2	6	1920617	1920622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684018
43033	NC_011835	GCG	2	6	1920680	1920685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684018
43034	NC_011835	ATG	2	6	1920686	1920691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684018
43035	NC_011835	ACC	3	9	1920709	1920717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684018
43036	NC_011835	ACA	2	6	1920739	1920744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684018
43037	NC_011835	CA	3	6	1920775	1920780	50 %	0 %	0 %	50 %	219684018
43038	NC_011835	TGC	2	6	1920812	1920817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43039	NC_011835	GCA	2	6	1920827	1920832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43040	NC_011835	CGGG	2	8	1920836	1920843	0 %	0 %	75 %	25 %	219684018
43041	NC_011835	CAA	2	6	1920867	1920872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684018
43042	NC_011835	CGA	2	6	1920906	1920911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43043	NC_011835	GCTG	2	8	1920977	1920984	0 %	25 %	50 %	25 %	219684018
43044	NC_011835	ACG	2	6	1920992	1920997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43045	NC_011835	GCT	2	6	1921005	1921010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43046	NC_011835	GC	3	6	1921040	1921045	0 %	0 %	50 %	50 %	219684018
43047	NC_011835	GCC	2	6	1921051	1921056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43048	NC_011835	GACT	2	8	1921094	1921101	25 %	25 %	25 %	25 %	219684018
43049	NC_011835	CCA	2	6	1921106	1921111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684018
43050	NC_011835	CGT	2	6	1921119	1921124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43051	NC_011835	CCTAC	2	10	1921164	1921173	20 %	20 %	0 %	60 %	219684018
43052	NC_011835	TCG	2	6	1921192	1921197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43053	NC_011835	CCG	2	6	1921249	1921254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684018
43054	NC_011835	CAC	2	6	1921302	1921307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684018
43055	NC_011835	CAC	3	9	1921362	1921370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684018
43056	NC_011835	TCG	2	6	1921378	1921383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43057	NC_011835	TCA	3	9	1921415	1921423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684018
43058	NC_011835	TGC	2	6	1921430	1921435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43059	NC_011835	AAG	2	6	1921471	1921476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684018
43060	NC_011835	CGA	2	6	1921482	1921487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684018
43061	NC_011835	TCA	2	6	1921516	1921521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43062	NC_011835	CTG	2	6	1921572	1921577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43063	NC_011835	GCC	2	6	1921581	1921586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43064	NC_011835	CAC	2	6	1921592	1921597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43065	NC_011835	GAT	2	6	1921631	1921636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43066	NC_011835	CGG	2	6	1921664	1921669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43067	NC_011835	GCT	3	9	1921767	1921775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43068	NC_011835	ATC	2	6	1921789	1921794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684019
43069	NC_011835	TCT	2	6	1921895	1921900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684019
43070	NC_011835	CTC	2	6	1921915	1921920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684019
43071	NC_011835	GAA	2	6	1921938	1921943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684019
43072	NC_011835	GCG	2	6	1922032	1922037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684019
43073	NC_011835	CAG	2	6	1922038	1922043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43074	NC_011835	CCG	2	6	1922081	1922086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43075	NC_011835	TGC	2	6	1922123	1922128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43076	NC_011835	GGCTT	2	10	1922144	1922153	0 %	40 %	40 %	20 %	219684019
43077	NC_011835	GCGT	2	8	1922174	1922181	0 %	25 %	50 %	25 %	219684019
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43081	NC_011835	CCA	2	6	1922441	1922446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684019
43082	NC_011835	GC	3	6	1922480	1922485	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
43083	NC_011835	TCA	2	6	1922501	1922506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684019
43084	NC_011835	CTT	2	6	1922511	1922516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684019
43085	NC_011835	TCG	2	6	1922518	1922523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
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43087	NC_011835	GCT	2	6	1922559	1922564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43088	NC_011835	GGTG	2	8	1922571	1922578	0 %	25 %	75 %	0 %	219684019
43089	NC_011835	CTGC	2	8	1922625	1922632	0 %	25 %	25 %	50 %	219684019
43090	NC_011835	TCGC	2	8	1922688	1922695	0 %	25 %	25 %	50 %	219684019
43091	NC_011835	GTTCAT	2	12	1922697	1922708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219684019
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43094	NC_011835	TCG	2	6	1922834	1922839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
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43098	NC_011835	ACTC	2	8	1922963	1922970	25 %	25 %	0 %	50 %	219684019
43099	NC_011835	GTG	2	6	1923043	1923048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684019
43100	NC_011835	CAT	2	6	1923105	1923110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684019
43101	NC_011835	CCG	2	6	1923185	1923190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43102	NC_011835	GCACG	2	10	1923227	1923236	20 %	0 %	40 %	40 %	219684019
43103	NC_011835	GCC	2	6	1923249	1923254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43104	NC_011835	TC	3	6	1923272	1923277	0 %	50 %	0 %	50 %	219684019
43105	NC_011835	C	6	6	1923285	1923290	0 %	0 %	0 %	100 %	219684019
43106	NC_011835	GCC	2	6	1923297	1923302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43107	NC_011835	CCG	2	6	1923310	1923315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43108	NC_011835	CCTG	2	8	1923330	1923337	0 %	25 %	25 %	50 %	219684019
43109	NC_011835	GAATC	2	10	1923461	1923470	40 %	20 %	20 %	20 %	219684019
43110	NC_011835	CAC	2	6	1923557	1923562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684019
43111	NC_011835	GAG	2	6	1923568	1923573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684019
43112	NC_011835	CG	3	6	1923614	1923619	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
43113	NC_011835	AAC	2	6	1923640	1923645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684019
43114	NC_011835	CGC	2	6	1923687	1923692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43115	NC_011835	TGC	2	6	1923719	1923724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43116	NC_011835	GCT	2	6	1923726	1923731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43117	NC_011835	ACG	2	6	1923734	1923739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43118	NC_011835	CGT	2	6	1923750	1923755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43119	NC_011835	TCC	2	6	1923811	1923816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219684019
43120	NC_011835	CTCGC	2	10	1923868	1923877	0 %	20 %	20 %	60 %	219684019
43121	NC_011835	ATC	2	6	1923887	1923892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684019
43122	NC_011835	GGC	2	6	1923937	1923942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684019
43123	NC_011835	CGCC	2	8	1923998	1924005	0 %	0 %	25 %	75 %	219684019
43124	NC_011835	ACG	2	6	1924010	1924015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43125	NC_011835	GCCG	2	8	1924067	1924074	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
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43130	NC_011835	GCT	2	6	1924191	1924196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684019
43131	NC_011835	CGC	2	6	1924416	1924421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684019
43132	NC_011835	GCCG	2	8	1924563	1924570	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
43133	NC_011835	GAAC	2	8	1924611	1924618	50 %	0 %	25 %	25 %	219684019
43134	NC_011835	GCGT	2	8	1924664	1924671	0 %	25 %	50 %	25 %	219684019
43135	NC_011835	CG	3	6	1924691	1924696	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
43136	NC_011835	CAC	3	9	1924701	1924709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684019
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43142	NC_011835	CG	3	6	1924883	1924888	0 %	0 %	50 %	50 %	219684019
43143	NC_011835	CAC	3	9	1924893	1924901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684019
43144	NC_011835	GAG	2	6	1924906	1924911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684019
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43154	NC_011835	AAG	2	6	1925266	1925271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684019
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43158	NC_011835	ACC	2	6	1925398	1925403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684019
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43160	NC_011835	AAT	2	6	1925719	1925724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43161	NC_011835	ACAGC	2	10	1925756	1925765	40 %	0 %	20 %	40 %	219684020
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43169	NC_011835	CGG	2	6	1926017	1926022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684020
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43183	NC_011835	CCG	2	6	1926816	1926821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43184	NC_011835	GAT	2	6	1926839	1926844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684021
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43223	NC_011835	TCG	2	6	1928151	1928156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684021
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43225	NC_011835	GGC	2	6	1928278	1928283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684022
43226	NC_011835	CG	3	6	1928310	1928315	0 %	0 %	50 %	50 %	219684022
43227	NC_011835	TCG	2	6	1928379	1928384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684022
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43233	NC_011835	CGA	2	6	1928643	1928648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684022
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43349	NC_011835	GC	3	6	1933425	1933430	0 %	0 %	50 %	50 %	219684027
43350	NC_011835	CGG	3	9	1933478	1933486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684027
43351	NC_011835	CTC	2	6	1933551	1933556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43352	NC_011835	GTG	2	6	1933629	1933634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43353	NC_011835	CGC	2	6	1933677	1933682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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