MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_011835	TGA	2	6	1829256	1829261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683955
41003	NC_011835	CGG	2	6	1829268	1829273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683955
41004	NC_011835	TTG	2	6	1829333	1829338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683955
41005	NC_011835	A	6	6	1829474	1829479	100 %	0 %	0 %	0 %	219683955
41006	NC_011835	GGAA	2	8	1829529	1829536	50 %	0 %	50 %	0 %	219683955
41007	NC_011835	GTCC	2	8	1829587	1829594	0 %	25 %	25 %	50 %	219683955
41008	NC_011835	GTC	2	6	1829666	1829671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683955
41009	NC_011835	ATT	2	6	1829708	1829713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219683955
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41012	NC_011835	GAT	2	6	1829789	1829794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41013	NC_011835	A	6	6	1829896	1829901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41014	NC_011835	TTTA	2	8	1829959	1829966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41015	NC_011835	CAG	2	6	1830003	1830008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41016	NC_011835	T	6	6	1830041	1830046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41017	NC_011835	TTG	2	6	1830136	1830141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683956
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41019	NC_011835	CTTT	2	8	1830246	1830253	0 %	75 %	0 %	25 %	219683956
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41039	NC_011835	T	7	7	1831080	1831086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41042	NC_011835	GGC	2	6	1831302	1831307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41043	NC_011835	AGG	2	6	1831334	1831339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41047	NC_011835	GGA	2	6	1831519	1831524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41087	NC_011835	ACG	2	6	1833426	1833431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41091	NC_011835	CTTC	2	8	1833917	1833924	0 %	50 %	0 %	50 %	219683958
41092	NC_011835	CAG	2	6	1833957	1833962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683958
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41098	NC_011835	TCCA	2	8	1834149	1834156	25 %	25 %	0 %	50 %	219683958
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41102	NC_011835	CGA	2	6	1834366	1834371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683958
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41109	NC_011835	CCGT	2	8	1834562	1834569	0 %	25 %	25 %	50 %	219683958
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41112	NC_011835	TGGA	2	8	1834719	1834726	25 %	25 %	50 %	0 %	219683958
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41118	NC_011835	AAG	2	6	1835052	1835057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683958
41119	NC_011835	TCG	2	6	1835086	1835091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683958
41120	NC_011835	AGC	2	6	1835125	1835130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683958
41121	NC_011835	CCT	2	6	1835309	1835314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683958
41122	NC_011835	CTG	2	6	1835385	1835390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683958
41123	NC_011835	CAA	2	6	1835402	1835407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683958
41124	NC_011835	TGC	2	6	1835449	1835454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683958
41125	NC_011835	CCA	2	6	1835482	1835487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683958
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41130	NC_011835	CGC	3	9	1835633	1835641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683958
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41132	NC_011835	GTC	2	6	1835712	1835717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683958
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41140	NC_011835	CA	3	6	1836256	1836261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41141	NC_011835	CCCATA	2	12	1836273	1836284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41142	NC_011835	ATC	2	6	1836396	1836401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41143	NC_011835	CAT	2	6	1836440	1836445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683959
41144	NC_011835	GTG	2	6	1836474	1836479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683959
41145	NC_011835	GTG	2	6	1836489	1836494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683959
41146	NC_011835	CGG	2	6	1836535	1836540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683959
41147	NC_011835	GCAG	2	8	1836542	1836549	25 %	0 %	50 %	25 %	219683959
41148	NC_011835	CTC	2	6	1836570	1836575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683959
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41150	NC_011835	TGC	2	6	1836589	1836594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683959
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41152	NC_011835	CAG	2	6	1836660	1836665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683959
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41155	NC_011835	TGC	2	6	1836805	1836810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683959
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41157	NC_011835	GGT	2	6	1836875	1836880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683959
41158	NC_011835	TCA	2	6	1836913	1836918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683959
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41163	NC_011835	CCG	2	6	1837104	1837109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683959
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41171	NC_011835	CGA	2	6	1837334	1837339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683959
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41173	NC_011835	AAG	2	6	1837389	1837394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683959
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41175	NC_011835	TGGTC	2	10	1837478	1837487	0 %	40 %	40 %	20 %	219683959
41176	NC_011835	TCA	2	6	1837537	1837542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683959
41177	NC_011835	TCC	2	6	1837560	1837565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683959
41178	NC_011835	CGATCC	2	12	1837634	1837645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683959
41179	NC_011835	GCA	2	6	1837646	1837651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683959
41180	NC_011835	TCG	2	6	1837819	1837824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683959
41181	NC_011835	CGTGTT	2	12	1837907	1837918	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219683959
41182	NC_011835	CAT	2	6	1838051	1838056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683959
41183	NC_011835	TG	3	6	1838204	1838209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41184	NC_011835	GGA	2	6	1838245	1838250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41185	NC_011835	TCG	2	6	1838352	1838357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683960
41186	NC_011835	AGA	2	6	1838358	1838363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683960
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41190	NC_011835	GCG	2	6	1838541	1838546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683960
41191	NC_011835	GAG	2	6	1838597	1838602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683960
41192	NC_011835	GCTC	2	8	1838611	1838618	0 %	25 %	25 %	50 %	219683960
41193	NC_011835	GCT	2	6	1838665	1838670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683960
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41213	NC_011835	CGT	3	9	1839394	1839402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683960
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41218	NC_011835	A	6	6	1839499	1839504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41219	NC_011835	GGT	2	6	1839693	1839698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683961
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41223	NC_011835	GCT	2	6	1839967	1839972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683961
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41225	NC_011835	C	6	6	1840040	1840045	0 %	0 %	0 %	100 %	219683961
41226	NC_011835	ACCGA	2	10	1840060	1840069	40 %	0 %	20 %	40 %	219683961
41227	NC_011835	ACC	2	6	1840090	1840095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683961
41228	NC_011835	GTG	2	6	1840103	1840108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683961
41229	NC_011835	TG	3	6	1840107	1840112	0 %	50 %	50 %	0 %	219683961
41230	NC_011835	TGC	2	6	1840171	1840176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683961
41231	NC_011835	CCA	3	9	1840194	1840202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683961
41232	NC_011835	GCC	2	6	1840208	1840213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683961
41233	NC_011835	GGC	2	6	1840466	1840471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683961
41234	NC_011835	CTC	2	6	1840495	1840500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683961
41235	NC_011835	GCGT	2	8	1840561	1840568	0 %	25 %	50 %	25 %	219683961
41236	NC_011835	AAT	2	6	1840610	1840615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219683961
41237	NC_011835	CGG	2	6	1840621	1840626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683961
41238	NC_011835	CGG	2	6	1840689	1840694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683961
41239	NC_011835	G	6	6	1840693	1840698	0 %	0 %	100 %	0 %	219683961
41240	NC_011835	GTG	2	6	1840712	1840717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683961
41241	NC_011835	CAT	2	6	1840768	1840773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683961
41242	NC_011835	GCC	2	6	1840832	1840837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683961
41243	NC_011835	TGTTC	2	10	1840932	1840941	0 %	60 %	20 %	20 %	219683961
41244	NC_011835	ACTCAT	2	12	1840942	1840953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683961
41245	NC_011835	ATCGT	2	10	1840954	1840963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41246	NC_011835	TCA	2	6	1841227	1841232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683962
41247	NC_011835	CTCAT	2	10	1841252	1841261	20 %	40 %	0 %	40 %	219683962
41248	NC_011835	CAT	2	6	1841275	1841280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683962
41249	NC_011835	GCAG	2	8	1841308	1841315	25 %	0 %	50 %	25 %	219683962
41250	NC_011835	GGC	2	6	1841371	1841376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683962
41251	NC_011835	GCG	2	6	1841410	1841415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683962
41252	NC_011835	ACA	2	6	1841424	1841429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683962
41253	NC_011835	TGA	2	6	1841538	1841543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683962
41254	NC_011835	GATG	2	8	1841644	1841651	25 %	25 %	50 %	0 %	219683962
41255	NC_011835	CTG	2	6	1841669	1841674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683962
41256	NC_011835	CTT	2	6	1841677	1841682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683962
41257	NC_011835	ATT	2	6	1841684	1841689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219683962
41258	NC_011835	CTGCA	2	10	1841698	1841707	20 %	20 %	20 %	40 %	219683962
41259	NC_011835	CAC	2	6	1841713	1841718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683962
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41261	NC_011835	CAT	4	12	1841821	1841832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683962
41262	NC_011835	GC	3	6	1841942	1841947	0 %	0 %	50 %	50 %	219683962
41263	NC_011835	ATC	2	6	1841948	1841953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683962
41264	NC_011835	CTG	2	6	1841966	1841971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683962
41265	NC_011835	TG	3	6	1841976	1841981	0 %	50 %	50 %	0 %	219683962
41266	NC_011835	CATCGG	2	12	1841992	1842003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219683962
41267	NC_011835	CGTG	2	8	1842060	1842067	0 %	25 %	50 %	25 %	219683962
41268	NC_011835	TGGC	2	8	1842095	1842102	0 %	25 %	50 %	25 %	219683962
41269	NC_011835	TTC	2	6	1842122	1842127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683962
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41271	NC_011835	GCC	2	6	1842218	1842223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683962
41272	NC_011835	TCT	2	6	1842249	1842254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683962
41273	NC_011835	CAG	3	9	1842290	1842298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683962
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41275	NC_011835	CGC	2	6	1842358	1842363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683962
41276	NC_011835	TCGC	2	8	1842489	1842496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41277	NC_011835	CATGAG	2	12	1842544	1842555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219683963
41278	NC_011835	TG	4	8	1842621	1842628	0 %	50 %	50 %	0 %	219683963
41279	NC_011835	CGA	2	6	1842630	1842635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683963
41280	NC_011835	GCC	2	6	1842639	1842644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683963
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41284	NC_011835	GCT	2	6	1842886	1842891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683963
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41287	NC_011835	CTG	2	6	1842976	1842981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683963
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41290	NC_011835	TCG	2	6	1843067	1843072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683963
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41301	NC_011835	CCAC	2	8	1843466	1843473	25 %	0 %	0 %	75 %	219683963
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41331	NC_011835	CA	3	6	1845130	1845135	50 %	0 %	0 %	50 %	219683964
41332	NC_011835	CGG	2	6	1845158	1845163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683964
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41334	NC_011835	ATC	2	6	1845208	1845213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683964
41335	NC_011835	CG	3	6	1845260	1845265	0 %	0 %	50 %	50 %	219683964
41336	NC_011835	GAT	2	6	1845313	1845318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683964
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41339	NC_011835	TGA	2	6	1845546	1845551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683965
41340	NC_011835	CCCT	2	8	1845599	1845606	0 %	25 %	0 %	75 %	219683965
41341	NC_011835	GTA	2	6	1845622	1845627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683965
41342	NC_011835	GTG	2	6	1845655	1845660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683965
41343	NC_011835	ATGC	2	8	1845696	1845703	25 %	25 %	25 %	25 %	219683965
41344	NC_011835	GTC	2	6	1845842	1845847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683965
41345	NC_011835	GGA	2	6	1845889	1845894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683965
41346	NC_011835	GCT	2	6	1845953	1845958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683965
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41348	NC_011835	GT	3	6	1845992	1845997	0 %	50 %	50 %	0 %	219683965
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41456	NC_011835	CTT	2	6	1851970	1851975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683969
41457	NC_011835	GTCG	2	8	1852004	1852011	0 %	25 %	50 %	25 %	219683969
41458	NC_011835	ACGA	2	8	1852020	1852027	50 %	0 %	25 %	25 %	219683969
41459	NC_011835	GAT	2	6	1852034	1852039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683969
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41469	NC_011835	CGA	2	6	1852536	1852541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41471	NC_011835	CCTA	2	8	1852614	1852621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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