MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_011835	GCGT	2	8	1782471	1782478	0 %	25 %	50 %	25 %	219683912
40002	NC_011835	ACGA	2	8	1782560	1782567	50 %	0 %	25 %	25 %	219683912
40003	NC_011835	GCC	2	6	1782568	1782573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683912
40004	NC_011835	GCC	2	6	1782581	1782586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683912
40005	NC_011835	TGT	2	6	1782606	1782611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683912
40006	NC_011835	G	6	6	1782617	1782622	0 %	0 %	100 %	0 %	219683912
40007	NC_011835	CGA	2	6	1782684	1782689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683912
40008	NC_011835	ATC	2	6	1782712	1782717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683912
40009	NC_011835	GGC	2	6	1782774	1782779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683912
40010	NC_011835	TCT	2	6	1782780	1782785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683912
40011	NC_011835	GGT	2	6	1782814	1782819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683912
40012	NC_011835	TCC	2	6	1782839	1782844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683912
40013	NC_011835	GCT	2	6	1782854	1782859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683912
40014	NC_011835	CCG	2	6	1783001	1783006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40015	NC_011835	T	6	6	1783038	1783043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40016	NC_011835	CGC	2	6	1783044	1783049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40017	NC_011835	GCG	2	6	1783057	1783062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40018	NC_011835	GAT	2	6	1783104	1783109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40019	NC_011835	TCG	2	6	1783111	1783116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40020	NC_011835	CCT	2	6	1783223	1783228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40021	NC_011835	CCTAA	2	10	1783246	1783255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40022	NC_011835	TCA	2	6	1783284	1783289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40023	NC_011835	TCA	2	6	1783307	1783312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40024	NC_011835	CGA	3	9	1783326	1783334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40025	NC_011835	GCC	2	6	1783340	1783345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40026	NC_011835	TTG	2	6	1783411	1783416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40027	NC_011835	GATG	2	8	1783570	1783577	25 %	25 %	50 %	0 %	219683913
40028	NC_011835	CTT	2	6	1783637	1783642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683913
40029	NC_011835	GA	3	6	1783836	1783841	50 %	0 %	50 %	0 %	219683913
40030	NC_011835	CCTTCA	2	12	1783867	1783878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219683913
40031	NC_011835	ATCG	2	8	1783931	1783938	25 %	25 %	25 %	25 %	219683913
40032	NC_011835	TCG	2	6	1783968	1783973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40033	NC_011835	CCTT	2	8	1783992	1783999	0 %	50 %	0 %	50 %	219683913
40034	NC_011835	GTT	3	9	1784021	1784029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683913
40035	NC_011835	TGG	2	6	1784053	1784058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683913
40036	NC_011835	GAC	2	6	1784117	1784122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40037	NC_011835	TGCCGT	2	12	1784155	1784166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40038	NC_011835	TCG	3	9	1784176	1784184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40039	NC_011835	GCG	2	6	1784211	1784216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683913
40040	NC_011835	GGT	2	6	1784297	1784302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683913
40041	NC_011835	TCGG	2	8	1784397	1784404	0 %	25 %	50 %	25 %	219683913
40042	NC_011835	TGC	2	6	1784446	1784451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40043	NC_011835	CAT	2	6	1784452	1784457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683913
40044	NC_011835	GCT	2	6	1784506	1784511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
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40046	NC_011835	GACC	2	8	1784675	1784682	25 %	0 %	25 %	50 %	219683913
40047	NC_011835	CTG	3	9	1784750	1784758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40048	NC_011835	GTG	2	6	1784790	1784795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683913
40049	NC_011835	GC	3	6	1784803	1784808	0 %	0 %	50 %	50 %	219683913
40050	NC_011835	GAA	2	6	1784816	1784821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683913
40051	NC_011835	ACG	2	6	1784853	1784858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683913
40052	NC_011835	TGC	2	6	1784937	1784942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40053	NC_011835	CCA	2	6	1785063	1785068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40054	NC_011835	TTC	2	6	1785197	1785202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40055	NC_011835	GCC	2	6	1785208	1785213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40056	NC_011835	CTT	2	6	1785249	1785254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683914
40057	NC_011835	CCT	2	6	1785266	1785271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683914
40058	NC_011835	AAC	2	6	1785304	1785309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683914
40059	NC_011835	ACGATG	2	12	1785486	1785497	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219683914
40060	NC_011835	GGT	2	6	1785513	1785518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683914
40061	NC_011835	CCG	2	6	1785557	1785562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683914
40062	NC_011835	CGA	2	6	1785608	1785613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683914
40063	NC_011835	CTC	2	6	1785624	1785629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683914
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40065	NC_011835	TTG	2	6	1785850	1785855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683914
40066	NC_011835	GCCGCA	2	12	1785859	1785870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219683914
40067	NC_011835	GCG	2	6	1785895	1785900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683914
40068	NC_011835	GCCT	2	8	1785939	1785946	0 %	25 %	25 %	50 %	219683914
40069	NC_011835	CGA	2	6	1785998	1786003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683914
40070	NC_011835	GTG	2	6	1786029	1786034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683914
40071	NC_011835	AAG	2	6	1786044	1786049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683914
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40073	NC_011835	CGT	2	6	1786073	1786078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683914
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40075	NC_011835	CA	3	6	1786167	1786172	50 %	0 %	0 %	50 %	219683914
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40083	NC_011835	TGA	2	6	1786469	1786474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683914
40084	NC_011835	TCGT	2	8	1786522	1786529	0 %	50 %	25 %	25 %	219683914
40085	NC_011835	GCAC	2	8	1786547	1786554	25 %	0 %	25 %	50 %	219683914
40086	NC_011835	CCT	2	6	1786592	1786597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683914
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40088	NC_011835	CTG	2	6	1786770	1786775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683914
40089	NC_011835	GCA	2	6	1786799	1786804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683914
40090	NC_011835	GA	3	6	1786812	1786817	50 %	0 %	50 %	0 %	219683914
40091	NC_011835	GGA	2	6	1786842	1786847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683914
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40094	NC_011835	CAT	2	6	1786982	1786987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40095	NC_011835	CAA	2	6	1786999	1787004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40099	NC_011835	GTT	2	6	1787203	1787208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683915
40100	NC_011835	TTG	2	6	1787225	1787230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683915
40101	NC_011835	ATT	2	6	1787296	1787301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219683915
40102	NC_011835	CTCA	2	8	1787323	1787330	25 %	25 %	0 %	50 %	219683915
40103	NC_011835	AGC	2	6	1787348	1787353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683915
40104	NC_011835	CGC	2	6	1787385	1787390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683915
40105	NC_011835	TGC	2	6	1787406	1787411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683915
40106	NC_011835	CAGCTG	2	12	1787454	1787465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219683915
40107	NC_011835	CGT	2	6	1787467	1787472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683915
40108	NC_011835	CTG	2	6	1787481	1787486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683915
40109	NC_011835	CGA	2	6	1787622	1787627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40110	NC_011835	CGG	2	6	1787634	1787639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40111	NC_011835	ACC	2	6	1787645	1787650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40112	NC_011835	TTG	2	6	1787660	1787665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40113	NC_011835	CGT	2	6	1787757	1787762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40114	NC_011835	TTG	2	6	1787783	1787788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40115	NC_011835	TCG	2	6	1787816	1787821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40117	NC_011835	ATC	2	6	1787893	1787898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40118	NC_011835	TCT	2	6	1787916	1787921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40119	NC_011835	TCT	2	6	1787925	1787930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40121	NC_011835	TCT	2	6	1787955	1787960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40122	NC_011835	TGT	2	6	1788120	1788125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40123	NC_011835	TGC	2	6	1788153	1788158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40240	NC_011835	GAA	2	6	1794129	1794134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40243	NC_011835	CAT	2	6	1794375	1794380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683922
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40473	NC_011835	CCT	2	6	1804414	1804419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40475	NC_011835	CCT	2	6	1804492	1804497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40477	NC_011835	GCG	2	6	1804538	1804543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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