MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_011835	GAC	2	6	1666082	1666087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37502	NC_011835	GACC	2	8	1666130	1666137	25 %	0 %	25 %	50 %	219683811
37503	NC_011835	GCG	2	6	1666269	1666274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683811
37504	NC_011835	TGGTC	2	10	1666316	1666325	0 %	40 %	40 %	20 %	219683811
37505	NC_011835	GAT	2	6	1666338	1666343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683811
37506	NC_011835	CGT	2	6	1666370	1666375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683811
37507	NC_011835	GAC	2	6	1666400	1666405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683811
37508	NC_011835	TCT	2	6	1666451	1666456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683811
37509	NC_011835	CGT	2	6	1666499	1666504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683811
37510	NC_011835	CGA	2	6	1666577	1666582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683811
37511	NC_011835	GCG	2	6	1666797	1666802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683811
37512	NC_011835	CCGTCG	2	12	1666846	1666857	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219683811
37513	NC_011835	TTG	2	6	1666989	1666994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37514	NC_011835	ATG	2	6	1666998	1667003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37515	NC_011835	TGAA	2	8	1667038	1667045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37516	NC_011835	ACA	2	6	1667066	1667071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683812
37517	NC_011835	AAAG	2	8	1667089	1667096	75 %	0 %	25 %	0 %	219683812
37518	NC_011835	ATCT	2	8	1667159	1667166	25 %	50 %	0 %	25 %	219683812
37519	NC_011835	TTCGG	2	10	1667177	1667186	0 %	40 %	40 %	20 %	219683812
37520	NC_011835	GCC	2	6	1667303	1667308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683812
37521	NC_011835	TCG	2	6	1667352	1667357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37522	NC_011835	CGG	2	6	1667383	1667388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683812
37523	NC_011835	TGC	2	6	1667403	1667408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37524	NC_011835	CGC	2	6	1667425	1667430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683812
37525	NC_011835	TCG	2	6	1667474	1667479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37526	NC_011835	CAT	2	6	1667530	1667535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683812
37527	NC_011835	GCT	2	6	1667542	1667547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37528	NC_011835	CAT	2	6	1667554	1667559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683812
37529	NC_011835	CGT	2	6	1667560	1667565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37530	NC_011835	GGC	2	6	1667566	1667571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683812
37531	NC_011835	TGC	2	6	1667641	1667646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37532	NC_011835	CGC	3	9	1667788	1667796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683812
37533	NC_011835	ATC	2	6	1667813	1667818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683812
37534	NC_011835	GCT	2	6	1667827	1667832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683812
37535	NC_011835	GCC	2	6	1667873	1667878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683812
37536	NC_011835	CGG	2	6	1667901	1667906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683812
37537	NC_011835	GGC	2	6	1668158	1668163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37538	NC_011835	ACC	2	6	1668198	1668203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37539	NC_011835	GAT	2	6	1668265	1668270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37540	NC_011835	GCT	2	6	1668272	1668277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37541	NC_011835	CTC	2	6	1668285	1668290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37542	NC_011835	TGC	2	6	1668299	1668304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37543	NC_011835	ATG	2	6	1668341	1668346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37544	NC_011835	GGA	2	6	1668440	1668445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683813
37545	NC_011835	CCT	2	6	1668503	1668508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683813
37546	NC_011835	GC	3	6	1668541	1668546	0 %	0 %	50 %	50 %	219683813
37547	NC_011835	GAA	2	6	1668588	1668593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683813
37548	NC_011835	GGC	2	6	1668603	1668608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683813
37549	NC_011835	CAT	2	6	1668635	1668640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683813
37550	NC_011835	TCG	2	6	1668724	1668729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683813
37551	NC_011835	GC	3	6	1668766	1668771	0 %	0 %	50 %	50 %	219683813
37552	NC_011835	CAA	2	6	1668821	1668826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683813
37553	NC_011835	ATCA	2	8	1668858	1668865	50 %	25 %	0 %	25 %	219683813
37554	NC_011835	G	6	6	1668924	1668929	0 %	0 %	100 %	0 %	219683813
37555	NC_011835	TTC	3	9	1668955	1668963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683813
37556	NC_011835	GGT	2	6	1669140	1669145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683813
37557	NC_011835	GTT	2	6	1669167	1669172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683813
37558	NC_011835	ACGGCG	2	12	1669183	1669194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219683813
37559	NC_011835	G	6	6	1669199	1669204	0 %	0 %	100 %	0 %	219683813
37560	NC_011835	CG	3	6	1669218	1669223	0 %	0 %	50 %	50 %	219683813
37561	NC_011835	GTT	2	6	1669248	1669253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683813
37562	NC_011835	GCC	2	6	1669269	1669274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683813
37563	NC_011835	GCT	2	6	1669277	1669282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683813
37564	NC_011835	TACA	2	8	1669317	1669324	50 %	25 %	0 %	25 %	219683813
37565	NC_011835	GGC	2	6	1669326	1669331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683813
37566	NC_011835	GC	3	6	1669367	1669372	0 %	0 %	50 %	50 %	219683813
37567	NC_011835	TCGG	2	8	1669423	1669430	0 %	25 %	50 %	25 %	219683813
37568	NC_011835	TCG	2	6	1669468	1669473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683813
37569	NC_011835	TG	3	6	1669536	1669541	0 %	50 %	50 %	0 %	219683813
37570	NC_011835	CGC	2	6	1669554	1669559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683813
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37572	NC_011835	CCA	2	6	1669613	1669618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683813
37573	NC_011835	ATGG	2	8	1669684	1669691	25 %	25 %	50 %	0 %	219683813
37574	NC_011835	ACC	3	9	1669771	1669779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683813
37575	NC_011835	CGTC	2	8	1669885	1669892	0 %	25 %	25 %	50 %	219683813
37576	NC_011835	ACC	2	6	1669981	1669986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683813
37577	NC_011835	AATG	2	8	1670001	1670008	50 %	25 %	25 %	0 %	219683813
37578	NC_011835	CCT	2	6	1670030	1670035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683813
37579	NC_011835	TCGG	2	8	1670066	1670073	0 %	25 %	50 %	25 %	219683813
37580	NC_011835	GTC	2	6	1670077	1670082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683813
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37583	NC_011835	CGT	2	6	1670210	1670215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683814
37584	NC_011835	CAT	2	6	1670221	1670226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683814
37585	NC_011835	ACGATC	2	12	1670249	1670260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219683814
37586	NC_011835	CCA	2	6	1670304	1670309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683814
37587	NC_011835	CATCA	2	10	1670323	1670332	40 %	20 %	0 %	40 %	219683814
37588	NC_011835	GCCA	2	8	1670375	1670382	25 %	0 %	25 %	50 %	219683814
37589	NC_011835	GCT	2	6	1670392	1670397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683814
37590	NC_011835	AGC	2	6	1670522	1670527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683814
37591	NC_011835	GGC	2	6	1670677	1670682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683814
37592	NC_011835	CCG	3	9	1670699	1670707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683814
37593	NC_011835	ATG	2	6	1670759	1670764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683814
37594	NC_011835	ACC	2	6	1671023	1671028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683814
37595	NC_011835	ATC	2	6	1671182	1671187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683814
37596	NC_011835	GCAT	2	8	1671233	1671240	25 %	25 %	25 %	25 %	219683814
37597	NC_011835	CTGA	2	8	1671250	1671257	25 %	25 %	25 %	25 %	219683814
37598	NC_011835	ACG	2	6	1671291	1671296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683814
37599	NC_011835	CGC	2	6	1671306	1671311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683814
37600	NC_011835	CAG	2	6	1671331	1671336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37601	NC_011835	AC	3	6	1671351	1671356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37602	NC_011835	TCA	2	6	1671429	1671434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683815
37603	NC_011835	GCCG	2	8	1671501	1671508	0 %	0 %	50 %	50 %	219683815
37604	NC_011835	GCC	2	6	1671517	1671522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683815
37605	NC_011835	CAA	2	6	1671617	1671622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683815
37606	NC_011835	GGC	2	6	1671642	1671647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683815
37607	NC_011835	ATC	2	6	1671691	1671696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683815
37608	NC_011835	AGC	2	6	1671745	1671750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683815
37609	NC_011835	AGTG	2	8	1671831	1671838	25 %	25 %	50 %	0 %	219683815
37610	NC_011835	ATG	2	6	1671892	1671897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683815
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37612	NC_011835	CGA	2	6	1671962	1671967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683815
37613	NC_011835	ACC	2	6	1672045	1672050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683815
37614	NC_011835	GAAC	2	8	1672103	1672110	50 %	0 %	25 %	25 %	219683815
37615	NC_011835	CCT	2	6	1672145	1672150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683815
37616	NC_011835	GTG	2	6	1672210	1672215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683815
37617	NC_011835	CGA	2	6	1672241	1672246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683815
37618	NC_011835	TGCG	2	8	1672268	1672275	0 %	25 %	50 %	25 %	219683815
37619	NC_011835	TGA	2	6	1672291	1672296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683815
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37622	NC_011835	GCC	2	6	1672384	1672389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683816
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37733	NC_011835	TCG	2	6	1677329	1677334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683822
37734	NC_011835	ACG	2	6	1677356	1677361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683822
37735	NC_011835	TGG	2	6	1677402	1677407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683822
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37743	NC_011835	TGA	2	6	1677696	1677701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683822
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37767	NC_011835	GAG	2	6	1678798	1678803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683823
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37805	NC_011835	GATGC	2	10	1680661	1680670	20 %	20 %	40 %	20 %	219683825
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37832	NC_011835	GGC	2	6	1682276	1682281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683826
37833	NC_011835	CTC	2	6	1682282	1682287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683826
37834	NC_011835	TGG	2	6	1682320	1682325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683826
37835	NC_011835	ACGCC	2	10	1682329	1682338	20 %	0 %	20 %	60 %	219683826
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37837	NC_011835	ACCAC	2	10	1682461	1682470	40 %	0 %	0 %	60 %	219683826
37838	NC_011835	GCC	2	6	1682529	1682534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683826
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37843	NC_011835	TGA	2	6	1682653	1682658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683826
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37845	NC_011835	CCT	2	6	1682782	1682787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683826
37846	NC_011835	ATG	2	6	1682826	1682831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683826
37847	NC_011835	GAT	2	6	1682930	1682935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683826
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37849	NC_011835	GCTT	2	8	1682972	1682979	0 %	50 %	25 %	25 %	219683826
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