MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_011835	TCA	2	6	1591138	1591143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683738
36003	NC_011835	CGG	2	6	1591171	1591176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683738
36004	NC_011835	CCGA	2	8	1591350	1591357	25 %	0 %	25 %	50 %	219683738
36005	NC_011835	GC	3	6	1591471	1591476	0 %	0 %	50 %	50 %	219683738
36006	NC_011835	GCGG	2	8	1591541	1591548	0 %	0 %	75 %	25 %	219683738
36007	NC_011835	GCCT	2	8	1591632	1591639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36008	NC_011835	AC	3	6	1591681	1591686	50 %	0 %	0 %	50 %	219683739
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36010	NC_011835	GCT	2	6	1591891	1591896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36011	NC_011835	GGA	2	6	1591976	1591981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683739
36012	NC_011835	CGA	2	6	1592065	1592070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36013	NC_011835	CGA	2	6	1592119	1592124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36014	NC_011835	GCC	2	6	1592189	1592194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683739
36015	NC_011835	CGC	2	6	1592215	1592220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683739
36016	NC_011835	TGC	2	6	1592229	1592234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36017	NC_011835	CGT	2	6	1592301	1592306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36018	NC_011835	GC	3	6	1592342	1592347	0 %	0 %	50 %	50 %	219683739
36019	NC_011835	CTC	2	6	1592417	1592422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683739
36020	NC_011835	TCG	2	6	1592441	1592446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683739
36021	NC_011835	TGC	2	6	1592457	1592462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36022	NC_011835	CGG	2	6	1592491	1592496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36023	NC_011835	GAG	2	6	1592511	1592516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36024	NC_011835	CCT	2	6	1592528	1592533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36025	NC_011835	GC	3	6	1592647	1592652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36026	NC_011835	AGG	2	6	1592697	1592702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36027	NC_011835	TGG	2	6	1592767	1592772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683740
36028	NC_011835	AACGC	2	10	1592792	1592801	40 %	0 %	20 %	40 %	219683740
36029	NC_011835	GAG	2	6	1592806	1592811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683740
36030	NC_011835	GTC	2	6	1592861	1592866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683740
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36032	NC_011835	TCA	2	6	1592891	1592896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683740
36033	NC_011835	TGCC	2	8	1592917	1592924	0 %	25 %	25 %	50 %	219683740
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36052	NC_011835	GAT	2	6	1593522	1593527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683740
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36054	NC_011835	TGG	2	6	1593638	1593643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683740
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36062	NC_011835	GGTG	2	8	1594011	1594018	0 %	25 %	75 %	0 %	219683740
36063	NC_011835	GCTG	2	8	1594053	1594060	0 %	25 %	50 %	25 %	219683740
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36067	NC_011835	GA	3	6	1594193	1594198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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36089	NC_011835	TCG	2	6	1595185	1595190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683742
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36095	NC_011835	GCATCG	2	12	1595479	1595490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219683742
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36101	NC_011835	CTG	2	6	1595720	1595725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683742
36102	NC_011835	CG	3	6	1595761	1595766	0 %	0 %	50 %	50 %	219683742
36103	NC_011835	GCAA	2	8	1595784	1595791	50 %	0 %	25 %	25 %	219683742
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36108	NC_011835	CGG	2	6	1596073	1596078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36109	NC_011835	GAC	2	6	1596090	1596095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36112	NC_011835	GATT	2	8	1596144	1596151	25 %	50 %	25 %	0 %	219683743
36113	NC_011835	GA	3	6	1596194	1596199	50 %	0 %	50 %	0 %	219683743
36114	NC_011835	GCGTTC	2	12	1596414	1596425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683743
36115	NC_011835	GT	3	6	1596614	1596619	0 %	50 %	50 %	0 %	219683743
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36117	NC_011835	CAG	2	6	1596664	1596669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683743
36118	NC_011835	GAC	2	6	1596958	1596963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683743
36119	NC_011835	TCAA	2	8	1597021	1597028	50 %	25 %	0 %	25 %	219683743
36120	NC_011835	CG	3	6	1597105	1597110	0 %	0 %	50 %	50 %	219683743
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36132	NC_011835	GC	3	6	1597795	1597800	0 %	0 %	50 %	50 %	219683743
36133	NC_011835	G	10	10	1597830	1597839	0 %	0 %	100 %	0 %	219683743
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36139	NC_011835	GC	3	6	1598166	1598171	0 %	0 %	50 %	50 %	219683744
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36147	NC_011835	GCA	2	6	1598712	1598717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683745
36148	NC_011835	CG	3	6	1598811	1598816	0 %	0 %	50 %	50 %	219683745
36149	NC_011835	CAG	2	6	1598842	1598847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683745
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36153	NC_011835	GTA	2	6	1599100	1599105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683745
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36228	NC_011835	TGA	2	6	1602478	1602483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683748
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36232	NC_011835	GC	3	6	1602801	1602806	0 %	0 %	50 %	50 %	219683748
36233	NC_011835	GTG	2	6	1602843	1602848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683748
36234	NC_011835	ACG	2	6	1602874	1602879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683748
36235	NC_011835	CGC	2	6	1602919	1602924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36236	NC_011835	CGA	2	6	1602961	1602966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36245	NC_011835	TGC	2	6	1603355	1603360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683749
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36262	NC_011835	GCA	2	6	1604255	1604260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683750
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36333	NC_011835	AT	3	6	1607795	1607800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36334	NC_011835	TGT	2	6	1607853	1607858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36335	NC_011835	GTTC	2	8	1607871	1607878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36336	NC_011835	GAA	2	6	1607879	1607884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36337	NC_011835	CATGG	2	10	1607919	1607928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36338	NC_011835	CATGG	2	10	1608040	1608049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36339	NC_011835	CCA	3	9	1608080	1608088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36342	NC_011835	CAT	2	6	1608216	1608221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683753
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36347	NC_011835	GTG	2	6	1608458	1608463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683753
36348	NC_011835	GTG	2	6	1608466	1608471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683753
36349	NC_011835	GAC	2	6	1608481	1608486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683753
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36467	NC_011835	ACG	3	9	1614996	1615004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683758
36468	NC_011835	CCG	2	6	1615027	1615032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683758
36469	NC_011835	TCGAAC	2	12	1615050	1615061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219683758
36470	NC_011835	GCT	2	6	1615072	1615077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683758
36471	NC_011835	CAT	2	6	1615081	1615086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683758
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36474	NC_011835	GCA	2	6	1615129	1615134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683758
36475	NC_011835	GCC	2	6	1615136	1615141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683758
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36479	NC_011835	ATC	2	6	1615361	1615366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683758
36480	NC_011835	CGA	2	6	1615402	1615407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683758
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36483	NC_011835	TGC	2	6	1615535	1615540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36484	NC_011835	CTG	2	6	1615570	1615575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36485	NC_011835	ACG	2	6	1615610	1615615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36486	NC_011835	TCT	2	6	1615616	1615621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683759
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36488	NC_011835	TGC	2	6	1615637	1615642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36489	NC_011835	CGGGG	2	10	1615713	1615722	0 %	0 %	80 %	20 %	219683759
36490	NC_011835	AC	3	6	1615766	1615771	50 %	0 %	0 %	50 %	219683759
36491	NC_011835	CGG	2	6	1615814	1615819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683759
36492	NC_011835	TCC	2	6	1615867	1615872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683759
36493	NC_011835	G	6	6	1615929	1615934	0 %	0 %	100 %	0 %	219683759
36494	NC_011835	GCA	2	6	1616049	1616054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36495	NC_011835	TCG	2	6	1616069	1616074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683759
36496	NC_011835	GGC	3	9	1616085	1616093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683759
36497	NC_011835	ATG	2	6	1616134	1616139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683759
36498	NC_011835	CGATG	2	10	1616271	1616280	20 %	20 %	40 %	20 %	219683759
36499	NC_011835	TGG	2	6	1616295	1616300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683759
36500	NC_011835	GGA	2	6	1616304	1616309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683759

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