MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_011835	GAT	2	6	1444479	1444484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683621
33002	NC_011835	CG	3	6	1444487	1444492	0 %	0 %	50 %	50 %	219683621
33003	NC_011835	CGGT	2	8	1444520	1444527	0 %	25 %	50 %	25 %	219683621
33004	NC_011835	CCT	2	6	1444625	1444630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683621
33005	NC_011835	GGT	2	6	1444683	1444688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33006	NC_011835	CGA	2	6	1444754	1444759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33007	NC_011835	TCG	2	6	1444789	1444794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33008	NC_011835	GTC	2	6	1444806	1444811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33009	NC_011835	AAC	2	6	1444849	1444854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683621
33010	NC_011835	GCC	2	6	1444866	1444871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33011	NC_011835	TGG	2	6	1444925	1444930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33012	NC_011835	TCG	2	6	1445212	1445217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33013	NC_011835	CGC	2	6	1445274	1445279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33014	NC_011835	ACC	2	6	1445302	1445307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683621
33015	NC_011835	GGT	3	9	1445379	1445387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33016	NC_011835	CCA	2	6	1445411	1445416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683621
33017	NC_011835	CCG	2	6	1445423	1445428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33018	NC_011835	GCC	2	6	1445445	1445450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33019	NC_011835	GGC	2	6	1445469	1445474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683621
33020	NC_011835	TTG	2	6	1445509	1445514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683621
33021	NC_011835	TGAG	2	8	1445558	1445565	25 %	25 %	50 %	0 %	219683621
33022	NC_011835	CTG	2	6	1445595	1445600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33023	NC_011835	GGC	2	6	1445625	1445630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683621
33024	NC_011835	GA	3	6	1445656	1445661	50 %	0 %	50 %	0 %	219683621
33025	NC_011835	CGA	2	6	1445663	1445668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33026	NC_011835	TTCCA	2	10	1445680	1445689	20 %	40 %	0 %	40 %	219683621
33027	NC_011835	CGG	2	6	1445747	1445752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683621
33028	NC_011835	TCG	2	6	1445767	1445772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33029	NC_011835	CGT	2	6	1445846	1445851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33030	NC_011835	TC	3	6	1445897	1445902	0 %	50 %	0 %	50 %	219683621
33031	NC_011835	GGCA	2	8	1445957	1445964	25 %	0 %	50 %	25 %	219683621
33032	NC_011835	CGG	2	6	1445971	1445976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683621
33033	NC_011835	TG	3	6	1446056	1446061	0 %	50 %	50 %	0 %	219683621
33034	NC_011835	GCC	2	6	1446081	1446086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33035	NC_011835	GCC	2	6	1446108	1446113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33036	NC_011835	GGT	2	6	1446221	1446226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33037	NC_011835	TGACC	2	10	1446236	1446245	20 %	20 %	20 %	40 %	219683621
33038	NC_011835	GAG	2	6	1446274	1446279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683621
33039	NC_011835	GGT	2	6	1446294	1446299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33040	NC_011835	GCC	2	6	1446426	1446431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683621
33041	NC_011835	GGTGG	2	10	1446468	1446477	0 %	20 %	80 %	0 %	219683621
33042	NC_011835	TCC	2	6	1446565	1446570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683621
33043	NC_011835	TCG	2	6	1446574	1446579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33044	NC_011835	TTC	2	6	1446598	1446603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683621
33045	NC_011835	TCG	2	6	1446655	1446660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
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33048	NC_011835	CGT	2	6	1446716	1446721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33049	NC_011835	GTG	2	6	1446754	1446759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33050	NC_011835	GGC	2	6	1446761	1446766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683621
33051	NC_011835	TGG	2	6	1446809	1446814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683621
33052	NC_011835	G	6	6	1446953	1446958	0 %	0 %	100 %	0 %	219683621
33053	NC_011835	TC	3	6	1446980	1446985	0 %	50 %	0 %	50 %	219683621
33054	NC_011835	GTC	3	9	1447050	1447058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33055	NC_011835	CGGT	2	8	1447100	1447107	0 %	25 %	50 %	25 %	219683621
33056	NC_011835	TGA	2	6	1447121	1447126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683621
33057	NC_011835	CG	3	6	1447152	1447157	0 %	0 %	50 %	50 %	219683621
33058	NC_011835	CTC	2	6	1447284	1447289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683621
33059	NC_011835	TGA	2	6	1447316	1447321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683621
33060	NC_011835	GTT	2	6	1447329	1447334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683621
33061	NC_011835	TTCG	2	8	1447365	1447372	0 %	50 %	25 %	25 %	219683621
33062	NC_011835	GCT	2	6	1447376	1447381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683621
33063	NC_011835	CTT	2	6	1447404	1447409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683621
33064	NC_011835	AAT	2	6	1447455	1447460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33065	NC_011835	GC	3	6	1447550	1447555	0 %	0 %	50 %	50 %	219683622
33066	NC_011835	GAT	2	6	1447615	1447620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683622
33067	NC_011835	CGG	2	6	1447634	1447639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683622
33068	NC_011835	TCG	2	6	1447718	1447723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683622
33069	NC_011835	CTC	2	6	1447756	1447761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683622
33070	NC_011835	CGA	2	6	1447773	1447778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683622
33071	NC_011835	TCG	2	6	1447847	1447852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683622
33072	NC_011835	CTC	2	6	1447855	1447860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683622
33073	NC_011835	CGT	3	9	1447890	1447898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683622
33074	NC_011835	TGA	2	6	1447899	1447904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683622
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33079	NC_011835	CG	3	6	1448103	1448108	0 %	0 %	50 %	50 %	219683622
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33082	NC_011835	CGG	2	6	1448193	1448198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683622
33083	NC_011835	TGC	2	6	1448297	1448302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33084	NC_011835	CAA	2	6	1448313	1448318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33085	NC_011835	CCAAC	2	10	1448340	1448349	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33086	NC_011835	ACT	2	6	1448431	1448436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683623
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33088	NC_011835	GC	3	6	1448467	1448472	0 %	0 %	50 %	50 %	219683623
33089	NC_011835	GC	3	6	1448489	1448494	0 %	0 %	50 %	50 %	219683623
33090	NC_011835	TCG	2	6	1448496	1448501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683623
33091	NC_011835	GCG	2	6	1448534	1448539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683623
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33095	NC_011835	GCGG	2	8	1448788	1448795	0 %	0 %	75 %	25 %	219683623
33096	NC_011835	G	6	6	1448794	1448799	0 %	0 %	100 %	0 %	219683623
33097	NC_011835	CCT	2	6	1448926	1448931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683623
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33099	NC_011835	CGC	2	6	1448980	1448985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683623
33100	NC_011835	CAC	2	6	1449014	1449019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683623
33101	NC_011835	TGCC	2	8	1449022	1449029	0 %	25 %	25 %	50 %	219683623
33102	NC_011835	CGA	2	6	1449070	1449075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683623
33103	NC_011835	GAT	2	6	1449083	1449088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683623
33104	NC_011835	CGG	2	6	1449163	1449168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683623
33105	NC_011835	CAC	2	6	1449173	1449178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683623
33106	NC_011835	GAG	2	6	1449195	1449200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683623
33107	NC_011835	GCC	2	6	1449243	1449248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683623
33108	NC_011835	CGAATT	2	12	1449274	1449285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219683623
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33111	NC_011835	GCG	2	6	1449312	1449317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683623
33112	NC_011835	CAC	2	6	1449371	1449376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683623
33113	NC_011835	GCG	2	6	1449555	1449560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683623
33114	NC_011835	CCT	2	6	1449598	1449603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683623
33115	NC_011835	CA	3	6	1449806	1449811	50 %	0 %	0 %	50 %	219683624
33116	NC_011835	AGC	2	6	1449816	1449821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683624
33117	NC_011835	CGC	2	6	1449824	1449829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683624
33118	NC_011835	TGG	2	6	1449971	1449976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683624
33119	NC_011835	AG	3	6	1450003	1450008	50 %	0 %	50 %	0 %	219683624
33120	NC_011835	AGC	2	6	1450043	1450048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683624
33121	NC_011835	CGT	2	6	1450107	1450112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683624
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33123	NC_011835	CGGC	2	8	1450137	1450144	0 %	0 %	50 %	50 %	219683624
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33127	NC_011835	GCTG	2	8	1450283	1450290	0 %	25 %	50 %	25 %	219683624
33128	NC_011835	CCAT	2	8	1450307	1450314	25 %	25 %	0 %	50 %	219683624
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33132	NC_011835	CAT	2	6	1450455	1450460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683624
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33142	NC_011835	AGC	2	6	1451074	1451079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683625
33143	NC_011835	TGA	2	6	1451081	1451086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683625
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33145	NC_011835	GCA	2	6	1451132	1451137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683625
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33152	NC_011835	TGC	2	6	1451398	1451403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683625
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33174	NC_011835	CG	3	6	1452323	1452328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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33181	NC_011835	CGAGG	2	10	1452640	1452649	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33182	NC_011835	CGC	2	6	1452692	1452697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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33186	NC_011835	TGG	2	6	1452815	1452820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33187	NC_011835	CATGCG	2	12	1452840	1452851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33221	NC_011835	CAA	2	6	1454094	1454099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33222	NC_011835	CAT	2	6	1454205	1454210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683628
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33229	NC_011835	TTCGC	2	10	1454469	1454478	0 %	40 %	20 %	40 %	219683628
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33231	NC_011835	TCA	2	6	1454585	1454590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683628
33232	NC_011835	CTA	2	6	1454619	1454624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683628
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33234	NC_011835	CGT	2	6	1454709	1454714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683628
33235	NC_011835	GAC	2	6	1454758	1454763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683628
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33240	NC_011835	TCG	2	6	1455056	1455061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683628
33241	NC_011835	TCCG	2	8	1455069	1455076	0 %	25 %	25 %	50 %	219683628
33242	NC_011835	GAC	2	6	1455112	1455117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683628
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33246	NC_011835	CGA	2	6	1455489	1455494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683628
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33253	NC_011835	TCGA	2	8	1455823	1455830	25 %	25 %	25 %	25 %	219683628
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33263	NC_011835	AGG	2	6	1456449	1456454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33294	NC_011835	CAGT	2	8	1457935	1457942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33310	NC_011835	CA	3	6	1458735	1458740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33311	NC_011835	CGAAT	2	10	1458819	1458828	40 %	20 %	20 %	20 %	219683631
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33331	NC_011835	AG	3	6	1459538	1459543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33332	NC_011835	ATA	2	6	1459552	1459557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33333	NC_011835	TA	3	6	1459568	1459573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33334	NC_011835	ACT	2	6	1459614	1459619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683632
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33337	NC_011835	TCG	2	6	1459753	1459758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683632
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33340	NC_011835	ACG	2	6	1459954	1459959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683632
33341	NC_011835	CGT	2	6	1459991	1459996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683632
33342	NC_011835	GGCGAG	2	12	1460106	1460117	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219683632
33343	NC_011835	CGA	2	6	1460135	1460140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683632
33344	NC_011835	GCGG	2	8	1460202	1460209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33345	NC_011835	GAA	2	6	1460245	1460250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33346	NC_011835	TCG	2	6	1460282	1460287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683633
33347	NC_011835	CTT	2	6	1460343	1460348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683633
33348	NC_011835	CGC	2	6	1460380	1460385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683633
33349	NC_011835	GCGTG	2	10	1460411	1460420	0 %	20 %	60 %	20 %	219683633
33350	NC_011835	GCAT	2	8	1460485	1460492	25 %	25 %	25 %	25 %	219683633
33351	NC_011835	ACG	2	6	1460542	1460547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683633
33352	NC_011835	TTCA	2	8	1460622	1460629	25 %	50 %	0 %	25 %	219683633
33353	NC_011835	GT	3	6	1460632	1460637	0 %	50 %	50 %	0 %	219683633
33354	NC_011835	GGC	2	6	1460651	1460656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683633
33355	NC_011835	GAT	2	6	1460691	1460696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683633
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33357	NC_011835	GAAT	2	8	1460826	1460833	50 %	25 %	25 %	0 %	219683634
33358	NC_011835	GACC	2	8	1460964	1460971	25 %	0 %	25 %	50 %	219683634
33359	NC_011835	GTG	2	6	1460992	1460997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683634
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33363	NC_011835	TGCG	2	8	1461218	1461225	0 %	25 %	50 %	25 %	219683634
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33381	NC_011835	ATG	2	6	1461982	1461987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683634
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33444	NC_011835	ATCGA	2	10	1465067	1465076	40 %	20 %	20 %	20 %	219683635
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33447	NC_011835	GATC	2	8	1465192	1465199	25 %	25 %	25 %	25 %	219683635
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33450	NC_011835	TGA	2	6	1465356	1465361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683635
33451	NC_011835	GAA	2	6	1465412	1465417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683635
33452	NC_011835	GGC	2	6	1465626	1465631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683636
33453	NC_011835	TCA	2	6	1465742	1465747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683636
33454	NC_011835	GGC	2	6	1465768	1465773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683636
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33457	NC_011835	TAC	2	6	1465858	1465863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683636
33458	NC_011835	GGT	2	6	1465879	1465884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683636
33459	NC_011835	GGGAG	2	10	1465909	1465918	20 %	0 %	80 %	0 %	219683636
33460	NC_011835	CGC	2	6	1466019	1466024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683636
33461	NC_011835	TCGGT	2	10	1466060	1466069	0 %	40 %	40 %	20 %	219683636
33462	NC_011835	TCA	2	6	1466075	1466080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683636
33463	NC_011835	GAA	2	6	1466193	1466198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683636
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33465	NC_011835	GCC	2	6	1466302	1466307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683636
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33493	NC_011835	CGGT	2	8	1467779	1467786	0 %	25 %	50 %	25 %	219683638
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