MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_011835	CGC	2	6	1419643	1419648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32502	NC_011835	GTAT	2	8	1419817	1419824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_011835	TCGAC	2	10	1419863	1419872	20 %	20 %	20 %	40 %	219683601
32504	NC_011835	GCG	2	6	1419905	1419910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683601
32505	NC_011835	CGGT	2	8	1419913	1419920	0 %	25 %	50 %	25 %	219683601
32506	NC_011835	CAT	2	6	1419969	1419974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683601
32507	NC_011835	TCT	2	6	1419995	1420000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683601
32508	NC_011835	ACC	2	6	1420039	1420044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683601
32509	NC_011835	GCGA	2	8	1420060	1420067	25 %	0 %	50 %	25 %	219683601
32510	NC_011835	GGC	2	6	1420119	1420124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683601
32511	NC_011835	GAG	2	6	1420135	1420140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683601
32512	NC_011835	TCT	2	6	1420259	1420264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683601
32513	NC_011835	GCGA	2	8	1420270	1420277	25 %	0 %	50 %	25 %	219683601
32514	NC_011835	CAC	2	6	1420341	1420346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683601
32515	NC_011835	GCG	2	6	1420398	1420403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683601
32516	NC_011835	CAGG	2	8	1420416	1420423	25 %	0 %	50 %	25 %	219683601
32517	NC_011835	GA	3	6	1420489	1420494	50 %	0 %	50 %	0 %	219683601
32518	NC_011835	AAGGA	2	10	1420504	1420513	60 %	0 %	40 %	0 %	219683601
32519	NC_011835	CTG	2	6	1420545	1420550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683601
32520	NC_011835	GAA	2	6	1420572	1420577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683601
32521	NC_011835	ACG	2	6	1420594	1420599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683601
32522	NC_011835	GC	3	6	1420684	1420689	0 %	0 %	50 %	50 %	219683601
32523	NC_011835	ACC	2	6	1420741	1420746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683601
32524	NC_011835	GAA	2	6	1420822	1420827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683601
32525	NC_011835	TG	3	6	1420926	1420931	0 %	50 %	50 %	0 %	219683601
32526	NC_011835	ACC	2	6	1420942	1420947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683601
32527	NC_011835	CCT	2	6	1420967	1420972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683601
32528	NC_011835	CCA	2	6	1421104	1421109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683601
32529	NC_011835	TCGTTG	2	12	1421131	1421142	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219683601
32530	NC_011835	GCC	2	6	1421160	1421165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683601
32531	NC_011835	CGG	2	6	1421171	1421176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683601
32532	NC_011835	GTT	2	6	1421178	1421183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683601
32533	NC_011835	C	6	6	1421260	1421265	0 %	0 %	0 %	100 %	219683601
32534	NC_011835	GC	3	6	1421419	1421424	0 %	0 %	50 %	50 %	219683601
32535	NC_011835	GCG	2	6	1421483	1421488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683601
32536	NC_011835	CACG	2	8	1421511	1421518	25 %	0 %	25 %	50 %	219683601
32537	NC_011835	GACCA	2	10	1421523	1421532	40 %	0 %	20 %	40 %	219683601
32538	NC_011835	GCC	2	6	1421550	1421555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683601
32539	NC_011835	GC	3	6	1421594	1421599	0 %	0 %	50 %	50 %	219683601
32540	NC_011835	CAG	2	6	1421625	1421630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683601
32541	NC_011835	GT	3	6	1421670	1421675	0 %	50 %	50 %	0 %	219683601
32542	NC_011835	CT	3	6	1421693	1421698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32543	NC_011835	CCG	2	6	1421702	1421707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32544	NC_011835	TAT	2	6	1421775	1421780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32545	NC_011835	ATCA	2	8	1421800	1421807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32546	NC_011835	AC	3	6	1421849	1421854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32547	NC_011835	CG	3	6	1421887	1421892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32548	NC_011835	GCGA	2	8	1421980	1421987	25 %	0 %	50 %	25 %	219683602
32549	NC_011835	ATC	3	9	1422124	1422132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683602
32550	NC_011835	GCCGGT	2	12	1422133	1422144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219683602
32551	NC_011835	GCC	2	6	1422148	1422153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683602
32552	NC_011835	TGG	2	6	1422167	1422172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683602
32553	NC_011835	GCT	2	6	1422240	1422245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683602
32554	NC_011835	GGC	2	6	1422265	1422270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683602
32555	NC_011835	ACG	2	6	1422283	1422288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683602
32556	NC_011835	ACG	2	6	1422350	1422355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683602
32557	NC_011835	CGA	2	6	1422387	1422392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683602
32558	NC_011835	CGG	2	6	1422442	1422447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683603
32559	NC_011835	CTG	2	6	1422461	1422466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32560	NC_011835	TCG	2	6	1422486	1422491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32561	NC_011835	ATG	2	6	1422512	1422517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683603
32562	NC_011835	ACG	2	6	1422618	1422623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32563	NC_011835	CTG	2	6	1422746	1422751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32564	NC_011835	TCA	2	6	1422786	1422791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683603
32565	NC_011835	TGA	2	6	1422964	1422969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683603
32566	NC_011835	TCG	2	6	1422999	1423004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32567	NC_011835	GAT	2	6	1423046	1423051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683603
32568	NC_011835	ACA	2	6	1423089	1423094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683603
32569	NC_011835	CGG	2	6	1423116	1423121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683603
32570	NC_011835	GC	3	6	1423139	1423144	0 %	0 %	50 %	50 %	219683603
32571	NC_011835	CG	4	8	1423171	1423178	0 %	0 %	50 %	50 %	219683603
32572	NC_011835	CA	3	6	1423263	1423268	50 %	0 %	0 %	50 %	219683603
32573	NC_011835	CATG	2	8	1423315	1423322	25 %	25 %	25 %	25 %	219683603
32574	NC_011835	ACAG	2	8	1423546	1423553	50 %	0 %	25 %	25 %	219683603
32575	NC_011835	GCT	2	6	1423554	1423559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683603
32576	NC_011835	TTG	2	6	1423564	1423569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683603
32577	NC_011835	GAC	2	6	1423668	1423673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683604
32578	NC_011835	CAG	2	6	1423686	1423691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683604
32579	NC_011835	GCA	2	6	1423802	1423807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683604
32580	NC_011835	CGG	2	6	1423829	1423834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683604
32581	NC_011835	CCATCA	2	12	1423835	1423846	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219683604
32582	NC_011835	CGTGT	2	10	1423856	1423865	0 %	40 %	40 %	20 %	219683604
32583	NC_011835	GATC	2	8	1423880	1423887	25 %	25 %	25 %	25 %	219683604
32584	NC_011835	CGAG	2	8	1423891	1423898	25 %	0 %	50 %	25 %	219683604
32585	NC_011835	TGCCG	2	10	1423980	1423989	0 %	20 %	40 %	40 %	219683604
32586	NC_011835	CATG	2	8	1424072	1424079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32587	NC_011835	GCA	2	6	1424183	1424188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683605
32588	NC_011835	CTGC	2	8	1424198	1424205	0 %	25 %	25 %	50 %	219683605
32589	NC_011835	GGGC	2	8	1424295	1424302	0 %	0 %	75 %	25 %	219683605
32590	NC_011835	GAT	2	6	1424314	1424319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683605
32591	NC_011835	GCAA	2	8	1424336	1424343	50 %	0 %	25 %	25 %	219683605
32592	NC_011835	CTT	3	9	1424392	1424400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683605
32593	NC_011835	GCGA	2	8	1424456	1424463	25 %	0 %	50 %	25 %	219683605
32594	NC_011835	GTG	2	6	1424477	1424482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683605
32595	NC_011835	GTC	2	6	1424500	1424505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683605
32596	NC_011835	GCC	2	6	1424546	1424551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683605
32597	NC_011835	CATG	2	8	1424601	1424608	25 %	25 %	25 %	25 %	219683605
32598	NC_011835	TGCG	2	8	1424619	1424626	0 %	25 %	50 %	25 %	219683605
32599	NC_011835	ATG	2	6	1424639	1424644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683605
32600	NC_011835	GTT	2	6	1424704	1424709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683605
32601	NC_011835	CAGC	2	8	1424719	1424726	25 %	0 %	25 %	50 %	219683605
32602	NC_011835	CG	3	6	1424778	1424783	0 %	0 %	50 %	50 %	219683605
32603	NC_011835	CTC	2	6	1424794	1424799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683605
32604	NC_011835	CGC	2	6	1424802	1424807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683605
32605	NC_011835	GCCTT	2	10	1424834	1424843	0 %	40 %	20 %	40 %	219683605
32606	NC_011835	CTGCAC	2	12	1424872	1424883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683605
32607	NC_011835	CTCAT	2	10	1424909	1424918	20 %	40 %	0 %	40 %	219683605
32608	NC_011835	CGCTT	2	10	1424933	1424942	0 %	40 %	20 %	40 %	219683605
32609	NC_011835	CTT	2	6	1424971	1424976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683605
32610	NC_011835	GGT	2	6	1424980	1424985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683605
32611	NC_011835	CAC	2	6	1425022	1425027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683605
32612	NC_011835	GCT	2	6	1425045	1425050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683605
32613	NC_011835	CCT	2	6	1425066	1425071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683605
32614	NC_011835	GGT	3	9	1425172	1425180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683605
32615	NC_011835	CGT	2	6	1425259	1425264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683605
32616	NC_011835	CGC	2	6	1425282	1425287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683605
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32850	NC_011835	ATC	2	6	1437215	1437220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683614
32851	NC_011835	GTT	2	6	1437221	1437226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683614
32852	NC_011835	TGCG	2	8	1437448	1437455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32853	NC_011835	TGG	2	6	1437516	1437521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32854	NC_011835	GTGGGG	2	12	1437565	1437576	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	219683615
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32865	NC_011835	TCAAC	2	10	1438213	1438222	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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32869	NC_011835	TGA	2	6	1438366	1438371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32873	NC_011835	CAAAT	2	10	1438614	1438623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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